XRN1 (ген)

XRN1
Идентификаторы
Псевдонимы	XRN1 , SEP1, 5'-3' экзорибонуклеаза 1, Xrn1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 607994; МГИ : 891964; гомологен : 5894; Генные карты : XRN1; OMA :XRN1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 3 (человек)
Конец	142,448,062 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 9 (мышь)
Конец	95,939,856 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верхний выражен в
	эпителиальная клетка поджелудочной железы; ; Ахиллово сухожилие; ; зародышевый эпителий; ; висцеральная плевра; ; париетальная плевра; ; большеберцовая кость; ; клетки костного мозга; ; эпителий десны; ; эндотелиальная клетка; ; конъюнктива века;
	Верхний выражен в
	хвост эмбриона; ; кучевые ячейки; ; Ростральный миграционный поток; ; тимус; ; генитальный бугорок; ; зигота; ; шишковидная железа; ; вторичный ооцит; ; семявыносящий проток; ; гранулоцит;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ДНК; связывание белков; связывание нуклеиновых кислот; активность нуклеазы; экзонуклеазная активность; гидролазная активность; Связывание РНК; Связывание G-квадруплексной РНК; Связывание ДНК с G-квадруплексом; 5'-3' экзорибонуклеазная активность; связывание теломеразной РНК; 5'-3' экзонуклеазная активность;
Клеточный компонент	мембрана; плазматическая мембрана; ядро; цитоплазма; цитозоль; дендрит; тело нейронной клетки; синапс; P-тело;
Биологический процесс	регуляция стабильности мРНК; катаболический процесс рРНК; ядерный надзор за мРНК; катаболический процесс мРНК гистонов; негативная регуляция трансляции; реакция на тестостерон; клеточный ответ на циклогексимид; Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, экзонуклеолитический; клеточный ответ на пуромицин; негативная регуляция поддержания теломер посредством теломеразы; катаболический процесс ядерно-транскрибированной мРНК;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	54464
	24127
	ENSG00000114127
	ENSMUSG00000032410
	Q8IZH2
	P97789
	NM_001042604 ; NM_001282857 ; NM_001282859 ; NM_019001
	NM_011916 ; NM_001311130
	НП_001269786 ; НП_001269788 ; НП_061874
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

5′-3′ экзорибонуклеаза 1 ( Xrn1 ) — это белок , который у людей кодируется геном XRN1 . Xrn1 гидролизует РНК в направлении от 5′ к 3′ . ^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства экзонуклеаз 5′-3′ . Кодируемый белок может быть вовлечен в зависимую от репликации деградацию мРНК гистонов и напрямую взаимодействует с энхансером белка 4 декапирования мРНК . Помимо метаболизма мРНК, аналогичный белок в дрожжах участвует в различных ядерных и цитоплазматических функциях, включая транскрипцию , трансляцию , гомологичную рекомбинацию , мейоз , поддержание теломер и сборку микротрубочек . Мутации в этом гене связаны с остеосаркомой , что позволяет предположить, что кодируемый белок также может играть роль в формировании костей . Альтернативный сплайсинг приводит к появлению множественных вариантов транскриптов.

Смотрите также

Xrn2

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000114127 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032410 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Mullen TE, Marzluff WF (январь 2008 г.). «Деградация мРНК гистонов требует олигоуридилирования с последующим декэпированием и одновременной деградацией мРНК как от 5' до 3', так и от 3' до 5'». Genes & Development . 22 (1): 50–65. doi :10.1101/gad.1622708. PMC 2151014 . PMID 18172165.
^ "Ген Энтреза: 5'-3' экзорибонуклеаза 1".

Дальнейшее чтение

Башкиров VI, Scherthan H, Solinger JA, Buerstedde JM, Heyer WD (февраль 1997 г.). «Мышиная цитоплазматическая экзорибонуклеаза (mXRN1p) с предпочтением тетраплексных субстратов G4». Журнал клеточной биологии . 136 (4): 761–73. doi : 10.1083 /jcb.136.4.761. PMC 2132493. PMID 9049243.
Ingelfinger D, Arndt-Jovin DJ, Lührmann R, Achsel T (декабрь 2002 г.). «Человеческие белки LSm1-7 локализуются вместе с ферментами Dcp1/2 и Xrnl, разрушающими мРНК, в отдельных цитоплазматических фокусах». RNA . 8 (12): 1489–501. doi :10.1017/S1355838202021726. hdl :11858/00-001M-0000-0012-F270-9. PMC 1370355 . PMID 12515382.
Braun JE, Truffault V, Boland A, Huntzinger E, Chang CT, Haas G, Weichenrieder O, Coles M, Izaurralde E (декабрь 2012 г.). «Прямое взаимодействие между DCP1 и XRN1 связывает декеппинг мРНК с 5'-экзонуклеолитической деградацией». Nature Structural & Molecular Biology . 19 (12): 1324–31. doi :10.1038/nsmb.2413. PMID 23142987. S2CID 1134057.
Li Y, Masaki T, Yamane D, McGivern DR, Lemon SM (январь 2013 г.). «Конкурирующие и неконкурирующие активности miR-122 и 5' экзонуклеазы Xrn1 в регуляции репликации вируса гепатита С». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (5): 1881–6. doi : 10.1073/pnas.1213515110 . PMC 3562843. PMID 23248316 .
Li Y, Yamane D, Lemon SM (май 2015 г.). «Изучение роли 5'-экзорибонуклеаз Xrn1 и Xrn2 в ограничении репликации вируса гепатита C». Журнал вирусологии . 89 (9): 4857–65. doi :10.1128/JVI.03692-14. PMC 4403451. PMID 25673723 .
Burgess HM, Mohr I (март 2015 г.). «Клеточная 5'-3' мРНК-экзонуклеаза Xrn1 контролирует накопление двухцепочечной РНК и антивирусные ответы». Cell Host & Microbe . 17 (3): 332–44. doi :10.1016/j.chom.2015.02.003. PMC 4826345 . PMID 25766294.
Ding M, Lin B, Li T, Liu Y, Li Y, Zhou X, Miao M, Gu J, Pan H, Yang F, Li T, Liu XY, Li R (апрель 2015 г.). «Двойная, но противоположная функция регулирования роста miR-204 и ее мишени XRN1 в клетках аденокарциномы простаты и нейроэндокринноподобных клетках рака простаты». Oncotarget . 6 (10): 7686–700. doi :10.18632/oncotarget.3480. PMC 4480709 . PMID 25797256.
Бласко-Морено Б, де Кампос-Мата Л, Бетчер Р, Гарсиа-Мартинес Х, Юнгфляйш Дж, Недиалкова Д.Д., Чаттопадхьяй С, Гас М.Э., Олива Б, Перес-Ортин Х.Е., Лейдель С.А., Чодер М., Диес Дж. (март 2019 г.) ). «Экзонуклеаза Xrn1 активирует транскрипцию и трансляцию мРНК, кодирующих мембранные белки». Природные коммуникации . 21 (10): 1298. Бибкод : 2019NatCo..10.1298B. дои : 10.1038/s41467-019-09199-6. ПМК 6428865 . ПМИД 30899024.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 3 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000114127 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032410 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Mullen TE, Marzluff WF (январь 2008 г.). «Деградация мРНК гистонов требует олигоуридилирования с последующим декэпированием и одновременной деградацией мРНК как от 5' до 3', так и от 3' до 5'». Genes & Development . 22 (1): 50–65. doi :10.1101/gad.1622708. PMC 2151014 . PMID 18172165.

[entrez-6] "Ген Энтреза: 5'-3' экзорибонуклеаза 1".