Полинуклеотидфосфорилаза
| Полинуклеотидфосфорилаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура тримера PNPase из Streptomyces antibioticus . PDB 1e3p. [1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.7.7.8 | ||||||||
| Номер CAS | 9014-12-4 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Полинуклеотидфосфорилаза ( PNPase ) — это бифункциональный фермент с фосфоролитической 3'-5' экзорибонуклеазной активностью и 3'-концевой олигонуклеотидполимеразной активностью. [2] То есть, он разбирает цепь РНК, начиная с 3' конца и продвигаясь к 5' концу. [1] Он также синтезирует длинные, высоко гетерополимерные хвосты in vivo . Он объясняет все наблюдаемое остаточное полиаденилирование в штаммах Escherichia coli, у которых отсутствует нормальный фермент полиаденилирования. [1] Обнаруженная Марианной Грюнберг-Манаго, работавшей в лаборатории Северо Очоа в 1955 году, РНК-полимеризационная активность PNPase изначально считалась ответственной за ДНК-зависимый синтез матричной РНК, что было опровергнуто к концу 1950-х годов. [3] [4]
Он участвует в обработке и деградации мРНК у бактерий, растений [5] и животных. [6]
У людей фермент кодируется геном PNPT1 . В активной форме белок образует кольцевую структуру, состоящую из трех молекул PNPase. Каждая молекула PNPase состоит из двух доменов PH РНКазы , домена связывания РНК S1 и домена K-гомологии . Белок присутствует в бактериях , а также в хлоропластах [2] и митохондриях [7] некоторых эукариотических клеток. У эукариот и архей существует структурно и эволюционно связанный комплекс, называемый экзосомным комплексом . [7]
Та же аббревиатура ( ПНФаза ) используется также для другого, в остальном не связанного фермента — пуриннуклеозидфосфорилазы .
| Человеческая ПНФаза I | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||
| Символ | ПНПАЗЕ | ||||||
| Альтернативные символы | PNPase, OLD35, старый-35 | ||||||
| ген NCBI | 87178 | ||||||
| HGNC | 23166 | ||||||
| ОМИМ | 610316 | ||||||
| ПДБ | 1E3P | ||||||
| РефСек | NM_033109 | ||||||
| UniProt | Q8TCS8 | ||||||
| Другие данные | |||||||
| Номер ЕС | 2.7.7.8 | ||||||
| Локус | Хр. 2 стр. 15 | ||||||
| |||||||
Ссылки
- ^ abc Symmons MF, Jones GH, Luisi BF (ноябрь 2000 г.). «Дублированная складка — структурная основа каталитической активности, процессивности и регуляции полинуклеотидфосфорилазы». Структура . 8 (11): 1215– 26. doi : 10.1016/S0969-2126(00)00521-9 . PMID 11080643.
- ^ ab Yehudai-Resheff S, Hirsh M, Schuster G (август 2001 г.). «Полинуклеотидфосфорилаза функционирует как экзонуклеаза и как поли(А)полимераза в хлоропластах шпината». Molecular and Cellular Biology . 21 (16): 5408– 16. doi :10.1128/MCB.21.16.5408-5416.2001. PMC 87263 . PMID 11463823.
- ^ Грюнберг-Манаго М., Ортис П.Дж., Очоа С. (апрель 1956 г.). «Ферментативный синтез полинуклеотидов. I. Полинуклеотидфосфорилаза azotobacter vinelandii». Biochimica et Biophysica Acta . 20 (1): 269– 85. doi :10.1016/0006-3002(56)90286-4. PMID 13315374.
- ^ Furth JJ, Hurwitz J, Anders M (август 1962 г.). «Роль дезоксирибонуклеиновой кислоты в синтезе рибонуклеиновой кислоты. I. Очистка и свойства полимеразы рибонуклеиновой кислоты» (PDF) . Журнал биологической химии . 237 (8): 2611– 9. doi : 10.1016/S0021-9258(19)73796-X . PMID 13895983.
- ^ Yehudai-Resheff S, Zimmer SL, Komine Y, Stern DB (март 2007 г.). «Интеграция метаболизма нуклеиновых кислот хлоропластов в ответ на дефицит фосфата у Chlamydomonas reinhardtii». The Plant Cell . 19 (3): 1023–38 . doi : 10.1105 /tpc.106.045427. PMC 1867357. PMID 17351118.
- ^ Sarkar D, Fisher PB (май 2006 г.). «Человеческая полинуклеотидфосфорилаза (hPNPase old-35): фермент деградации РНК с плейотрофными биологическими эффектами» (PDF) . Cell Cycle . 5 (10): 1080– 4. doi : 10.4161/cc.5.10.2741 . PMID 16687933. S2CID 42371805.
- ^ ab Schilders G, van Dijk E, Raijmakers R, Pruijn GJ (2006). Клеточная и молекулярная биология экзосомы: как создать или разрушить РНК . International Review of Cytology. Vol. 251. pp. 159–208. doi : 10.1016/S0074-7696(06)51005-8. ISBN 9780123646552. PMID 16939780.
Внешние ссылки
- Полинуклеотид+фосфорилаза в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
