Гаплогруппа E-V38
Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
Гаплогруппа E-V38 (бывшая E3a / E1b1a)
Возможное время происхождения41 400 лет до н.э. [1]
Возраст коалесценции39 200 лет до н.э. [1]
Возможное место происхожденияВосточная Африка [2] [3]
ПредокЭ-П2
ПотомкиЭ-М2 , Э-М329
Определение мутацийЛ222.1, В38, В100

Гаплогруппа E-V38 , также известная как E1b1a-V38 , является основной гаплогруппой ДНК Y-хромосомы человека . E-V38 в основном распространена в Африке . E-V38 имеет две базальные ветви, E-M329 и E-M2 . [2] [a] [b] E-M329 — это субклад, в основном встречающийся в Восточной Африке . [2] E-M2 — преобладающий субклад в Западной Африке , Центральной Африке , Южной Африке и регионе Великих африканских озер ; он также встречается с умеренной частотой в Северной Африке , Западной Азии и Южной Европе .

Происхождение

Открытие двух SNP (V38 и V100) Тромбеттой и др. (2011) значительно переопределило филогенетическое дерево E-V38. Это привело авторов к предположению, что E-V38 мог возникнуть в Восточной Африке. V38 присоединяется к E -M2, аффилированному с Западной Африкой , и E-M329, аффилированному с Северо-Восточной Африкой, с более ранним общим предком, который, как и E-P2, также мог возникнуть в Восточной Африке . [2] Нижестоящий SNP E-M180 мог возникнуть во влажной южно-центральной сахарской саванне/пастбищах Северной Африки между 14 000 и 10 000 лет назад. [4] [5] [6] [7] Согласно Вуду и др. (2005) и Розе и др. (2007), такие перемещения населения изменили ранее существовавшее популяционное хромосомное разнообразие Y в Центральной , Южной и Юго-Восточной Африке , заменив предыдущие частоты гаплогрупп (гаплогруппы A и B-M60 ) в этих областях на ныне доминирующие линии E1b1a1 . Однако следы более ранних жителей можно наблюдать сегодня в этих регионах по наличию гаплогрупп Y ДНК A1a , A1b, A2, A3 и B-M60 , которые распространены в определенных популяциях, таких как мбути и койсаны . [8] [9] [10] Шрайнер и др. (2018) аналогичным образом предполагают, что гаплогруппа E1b1a-V38 пересекла Зеленую Сахару с востока на запад около 19 000 лет назад, где E1b1a1-M2, возможно, впоследствии возникла в Западной Африке или Центральной Африке . Шрайнер и др. (2018) также прослеживает это движение через мутацию серповидноклеточной анемии , которая, вероятно, возникла в период Зеленой Сахары. [3]

Древняя ДНК

Гад и др. (2021) указывают, что древнеегипетские мумии Рамсеса III и Неизвестного человека E, возможно, Пентавера , несли гаплогруппу E1b1a-V38. [11]

В Кабесу-да-Аморейра, в Португалии , среди куч ракушек между XVI и XVIII веками нашей эры был похоронен раб из Западной Африки , который, возможно, был родом из прибрежного региона Сенегамбии в Гамбии , Мавритании или Сенегале и имел гаплогруппы E1b1a и L3b1a . [12]

Распределение

Частота и разнообразие E-V38 наиболее высоки в Западной Африке. В пределах Африки E-V38 демонстрирует клинальное распределение с запада на восток, а также с юга на север. Другими словами, частота гаплогруппы уменьшается по мере продвижения от западной и южной Африки к восточной и северной частям Африки. [13]

Субклады

Э-М2

E1b1a1 определяется маркерами DYS271/M2/SY81, M291, P1/PN1, P189, P293, V43 и V95. E-M2 — это разнообразная гаплогруппа со множеством ветвей.

Э-М329

E1b1a2 определяется мутацией SNP M329. [c] E-M329 в основном встречается в Восточной Африке . [2] E-M329 также часто встречается в Юго-Западной Эфиопии , особенно среди населения, говорящего на омотском языке . [14] [15]

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименования для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремящегося прежде всего быть своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)(α)(β)(γ)(δ)(ε)(ζ)(η)YCC 2002 (Полное письмо)YCC 2005 (Полный текст)YCC 2008 (Полный текст)YCC 2010r (Лучшее письмо)ИСООГГ 2006ИСООГГ 2007ИСООГГ 2008ИСООГГ 2009ИСООГГ 2010ИСООГГ 2011ИСООГГ 2012
Е-П2921III3А13Eu3Н2БЕ*ЭЭЭЭЭЭЭЭЭЭ
Э-М3321III3А13Eu3Н2БЕ1*Е1Е1аЕ1аЕ1Е1Е1аЕ1аЕ1аЕ1аЕ1а
Э-М4421III3А13Eu3Н2БЕ1аЕ1аЕ1а1Е1а1Е1аЕ1аЕ1а1Е1а1Е1а1Е1а1Е1а1
Э-М7521III3А13Eu3Н2БЕ2аЕ2Е2Е2Е2Е2Е2Е2Е2Е2Е2
Э-М5421III3А13Eu3Н2БЕ2бЕ2бЕ2бЕ2б1-------
Э-П225III414Eu3Н2БЕ3*Е3Е1бЕ1б1Е3Е3Е1б1Е1б1Е1б1Е1б1Е1б1
Э-М28III515Эу2Н2БЕ3а*Е3аЕ1б1Е1б1аЕ3аЕ3аЕ1б1аЕ1б1аЕ1б1аЕ1б1а1Е1б1а1
Э-М588III515Эу2Н2БЕ3а1Е3а1Е1б1а1Е1б1а1Е3а1Е3а1Е1б1а1Е1б1а1Е1б1а1Е1б1а1а1аЕ1б1а1а1а
Э-М116.28III515Эу2Н2БЕ3а2Е3а2Е1б1а2Е1б1а2Е3а2Е3а2Е1б1а2Е1б1а2E1ba12удаленныйудаленный
Э-М1498III515Эу2Н2БЕ3а3Е3а3Е1б1а3Е1б1а3Е3а3Е3а3Е1б1а3Е1б1а3Е1б1а3Е1б1а1а1сЕ1б1а1а1с
Э-М1548III515Эу2Н2БЕ3а4Е3а4Е1б1а4Е1б1а4Е3а4Е3а4Е1б1а4Е1б1а4Е1б1а4E1b1a1a1g1cE1b1a1a1g1c
Э-М1558III515Эу2Н2БЕ3а5Е3а5Е1б1а5Е1б1а5Е3а5Е3а5Е1б1а5Е1б1а5Е1б1а5Е1б1а1а1дЕ1б1а1а1д
Э-М108III515Эу2Н2БЕ3а6Е3а6Е1б1а6Е1б1а6Е3а6Е3а6Е1б1а6Е1б1а6Е1б1а6Е1б1а1а1еЕ1б1а1а1е
Э-М3525III414Еу4Н2БЕ3б*Е3бЕ1б1б1Е1б1б1Е3б1Е3б1Е1б1б1Е1б1б1Е1б1б1удаленныйудаленный
Э-М7825III414Еу4Н2БЕ3б1*Е3б1Е1б1б1аЕ1б1б1а1E3b1aE3b1aЕ1б1б1аЕ1б1б1аЕ1б1б1аЕ1б1б1а1Е1б1б1а1
Э-М14825III414Еу4Н2БE3b1aE3b1aЕ1б1б1а3аЕ1б1б1а1с1Е3б1а3аЕ3б1а3аЕ1б1б1а3аЕ1б1б1а3аЕ1б1б1а3аЕ1б1б1а1с1Е1б1б1а1с1
Э-М8125III414Еу4Н2БЕ3б2*Е3б2Е1б1б1бЕ1б1б1б1E3b1bE3b1bЕ1б1б1бЕ1б1б1бЕ1б1б1бЕ1б1б1б1Е1б1б1б1а
Э-М10725III414Еу4Н2БЕ3б2аЕ3б2аЕ1б1б1б1Е1б1б1б1аЕ3б1б1Е3б1б1Е1б1б1б1Е1б1б1б1Е1б1б1б1Е1б1б1б1аЕ1б1б1б1а1
Э-М16525III414Еу4Н2БE3b2bE3b2bЕ1б1б1б2Е1б1б1б1б1Е3б1б2Е3б1б2Е1б1б1б2аЕ1б1б1б2аЕ1б1б1б2аЕ1б1б1б2аЕ1б1б1б1а2а
Э-М12325III414Еу4Н2БЕ3б3*Е3б3Е1б1б1сЕ1б1б1сE3b1cE3b1cЕ1б1б1сЕ1б1б1сЕ1б1б1сЕ1б1б1сЕ1б1б1б2а
Э-М3425III414Еу4Н2БЕ3б3а*Е3б3аЕ1б1б1к1Е1б1б1к1E3b1c1E3b1c1Е1б1б1к1Е1б1б1к1Е1б1б1к1Е1б1б1к1Е1б1б1б2а1
Э-М13625III414Еу4Н2БE3ba1Е3б3а1Е1б1б1к1аЕ1б1б1к1а1E3b1c1aE3b1c1aЕ1б1б1к1а1Е1б1б1к1а1Е1б1б1к1а1Е1б1б1к1а1Е1б1б1б2а1а1

Научные публикации

В создании дерева YCC приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.

  • α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
  • β Андерхилл 2000
  • γ Молот 2001
  • δ Карафет 2001
  • ε Семино 2000
  • ζ Вс 1999
  • η Капелли 2001

Филогенетические деревья

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве Консорциума Y-хромосомы (YCC) 2008 года [16] , дереве гаплогруппы E Y-ДНК ISOGG [5] и последующих опубликованных исследованиях.

  • E1b1a (L222.1, V38, V100)
    • E1b1a1 (DYS271/M2/SY81, M291, P1/PN1, P189, P293, V43, V95, Z1101, Z1107, Z1116, Z1120, Z1122, Z1123, Z1124, Z1125, Z1127, Z1130, Z1133)
    • E1b1a2 (М329)

Смотрите также

В Викицитатнике есть цитаты, связанные с гаплогруппой E-V38 .

Генетика

Y-ДНК E субклады

Y-ДНК остовное дерево

Примечания

  1. ^ E-M329 ранее был известен как E1b1c и E1b1*
  2. ^ E-M2 ранее был известен как E3a и E1b1a
  3. ^ E-M329 ранее был известен как E1b1c.

Ссылки

  1. ^ ab "E-V38 YTree".
  2. ^ abcde Trombetta, Beniamino; Fulvio Cruciani; Daniele Sellitto; Rosaria Scozzari (6 января 2011 г.). MacAulay, Vincent (ред.). "Новая топология человеческой Y-хромосомной гаплогруппы E1b1 (E-P2), выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов". PLOS ONE . ​​6 (1): e16073. Bibcode :2011PLoSO...616073T. doi : 10.1371/journal.pone.0016073 . PMC 3017091 . PMID  21253605. 
  3. ^ ab Shriner, Daniel; Rotimi, Charles (2018). «Гаплотипы, основанные на последовательности всего генома, выявляют единое происхождение аллеля серпа во время влажной фазы голоцена». American Journal of Human Genetics . 102 (4). Am J Hum Genet: 547– 556. doi : 10.1016/j.ajhg.2018.02.003. PMC 5985360. PMID  29526279. 
  4. ^ "E-V43 YTree".
  5. ^ ab Международное общество генетической генеалогии (3 февраля 2010 г.). "Y-ДНК гаплогруппа E и ее субклады – 2010" . Получено 17 декабря 2010 г.
  6. ^ Адамс, Джонатан. «Африка за последние 150 000 лет». Архивировано из оригинала 1 мая 2006 года . Получено 26 января 2011 года .
  7. ^ Монтано, Валерия; Джанмарко Ферри; Вероника Маркари; Кьяра Батини; Окори Аньяеле; Джованни Дестро-Бисол; Дэвид Комас (1 июля 2011 г.). «Расширение банту пересмотрело новый анализ вариации Y-хромосомы в Центральной Западной Африке». Молекулярная экология . 20 (13): 2693– 2708. doi :10.1111/j.1365-294X.2011.05130.x. PMID  21627702. S2CID  9951365.
  8. ^ Роза, Александра; Каролина Орнелас; Марк А. Джоблинг; Антонио Брем; Ричард Виллемс (27 июля 2007 г.). «Разнообразие Y-хромосомы в популяции Гвинеи-Бисау: многоэтническая перспектива». BMC Evolutionary Biology . 7 : 124. doi : 10.1186/1471-2148-7-124 . PMC 1976131. ​​PMID  17662131 . 
  9. ^ Вуд, Элизабет Т; Дэрин А. Стовер, Кристофер Эрет, Джованни Дестро-Бисол, Габриэлла Спедини, Говард Маклеод, Лесли Луи, Майк Бамшад, Беверли И. Штрассманн, Химла Судьялл и Майкл Ф. Хаммер (27 апреля 2005 г.). «Контрастные паттерны вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: доказательства демографических процессов, обусловленных полом». Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867– 876. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . PMID  15856073.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  10. ^ Андерхилл, Пенсильвания; Пассарино Дж., Лин А.А., Шен П., Мирасон Лар М., Фоли Р.А., Офнер П.Дж., Кавалли-Сфорца Л.Л. (январь 2001 г.). «Филогеография бинарных гаплотипов Y-хромосомы и происхождение современных человеческих популяций». Анналы генетики человека . 65 (1): 43–62 . doi : 10.1046/j.1469-1809.2001.6510043.x . PMID  11415522. S2CID  9441236.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  11. ^ Гад, Йехия З. и др. (2021). «Выводы из анализа древней ДНК египетских человеческих мумий: ключи к болезням и родству». Молекулярная генетика человека . 30 (R1): R24 – R28 . doi : 10.1093/hmg/ddaa223 . ISSN  0964-6906. OCLC  8681412353. PMID  33059357. S2CID  222824170.
  12. ^ Пейротео-Стьерна, Рита; и др. (21 февраля 2022 г.). «Мультидисциплинарное расследование выявило человека западноафриканского происхождения, похороненного в португальской мезолитической куче раковины четыре столетия назад». Журнал археологической науки: отчеты . 42 : 103370. doi : 10.1016/j.jasrep.2022.103370 . OCLC  1337974923. S2CID  247045502.
  13. ^ Luis, JR; DJRowold (март 2004 г.). «Левант против Африканского Рога: доказательства двунаправленных коридоров человеческих миграций». Американский журнал генетики человека . 74 (3): 532– 544. doi : 10.1086/382286. PMC 1182266. PMID 14973781  . 
  14. ^ Пластер и др. Y-ДНК E субклады
  15. ^ CA, Plaster (28.09.2011). «Изменение в Y-хромосоме, митохондриальной ДНК и метках идентичности в Эфиопии». discovery.ucl.ac.uk . Получено 27.06.2018 .
  16. ^ Карафет, Татьяна М.; Фернандо Л. Мендес; Моника Б. Мейлерман; Питер А. Андерхилл; Стивен Л. Зегура; Майкл Ф. Хаммер (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение древа гаплогруппы Y-хромосомы человека». Genome Research . 18 (5): 830– 838. doi :10.1101/gr.7172008. PMC 2336805 . PMID  18385274. 

Источники таблиц преобразования

  • Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; et al. (февраль 2001 г.). «Преимущественно коренное отцовское наследие для австронезийско-говорящих народов островной Юго-Восточной Азии и Океании». The American Journal of Human Genetics . 68 (2): 432– 443. doi : 10.1086/318205 . PMC  1235276. PMID  11170891.
  • Хаммер, Майкл Ф.; Карафет, Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и др. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосомы человека». Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203 . doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . PMID  11420360.
  • Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новые применения новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62 , doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6, PMID  10904265
  • Каладжиева, Люба; Калафель, Франческ; Джоблинг, Марк А; Ангеличева, Дора; и др. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у Vlax Roma, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК». Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . ПМИД  11313742.
  • Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и др. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы». Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615– 628. doi : 10.1086/323299 . PMC  1235490. PMID  11481588 .
  • Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: перспектива хромосомы AY», Science , 290 (5494): 1155– 9, Bibcode : 2000Sci...290.1155S, doi : 10.1126/science.290.5494.1155, PMID  11073453
  • Су, Бин; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; и др. (декабрь 1999 г.). «Доказательства миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода на основе Y-хромосомы». Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718– 1724. doi : 10.1086/302680 . PMC  1288383. PMID  10577926 .
  • Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Линь, Элис А.; Джин, Ли; и др. (ноябрь 2000 г.). «Изменение последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Nature Genetics . 26 (3): 358– 361. doi :10.1038/81685. PMID  11062480. S2CID  12893406.
  • Проект FTDNA гаплогруппы E1b1a
  • Распространение E1b1a/E3a в Африке
  • Распространение гаплогруппы E3a, от National Geographic
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Haplogroup_E-V38&oldid=1266940109"