В химической номенклатуре дескриптор — это нотационный префикс, помещаемый перед систематическим названием вещества , который описывает конфигурацию или стереохимию молекулы . [1] Некоторые из перечисленных дескрипторов не следует использовать в публикациях , поскольку они больше не соответствуют рекомендациям ИЮПАК . Стереодескрипторы часто используются в сочетании с локантами для четкой и однозначной идентификации химической структуры .
Дескрипторы, обычно размещаемые в начале систематического названия, при алфавитной сортировке не учитываются.
См.: цис–транс-изомерия
Дескрипторы цис (лат. cis, по эту сторону ) [2] и транс (лат. trans, по ту сторону ) [3] используются в различных контекстах для описания химических конфигураций: [4] [5]
В органической структурной химии конфигурация двойной связи может быть описана с помощью цис и транс , в случае, если она имеет простую схему замещения только с двумя остатками. Положение двух остатков относительно друг друга в разных точках кольцевой системы или более крупной молекулы также может быть описано с помощью цис и транс, если конфигурация структуры жесткая и не допускает простой инверсии.
В химии неорганических комплексов дескрипторы цис и транс используются для характеристики позиционных изомеров в октаэдрических комплексах с конфигурацией A 2 B 4 X или квадратных плоских комплексах с конфигурацией A 2 B 2 X.
Типографское представление цис- и транс-элементов осуществляется курсивом и строчными буквами.
Цис / транс номенклатура не является однозначной для более высокозамещенных двойных связей и в настоящее время в значительной степени заменена номенклатурой ( E ) /( Z ). [6]
См.: обозначение E - Z
Дескрипторы ( E ) (от немецкого entgegen , «напротив») и ( Z ) (от немецкого zusammen , «вместе») используются для предоставления отдельного описания модели замещения для алкенов , кумуленов или других систем с двойной связью, таких как оксимы . [7]
Для атрибуции ( E ) или ( Z ) основано на относительном положении двух заместителей наивысшего приоритета, находящихся по обе стороны двойной связи, в то время как приоритет основан на номенклатуре CIP. Номенклатура ( E )/( Z ) может быть применена к любым системам двойных связей (включая гетероатомы ), но не к замещенным кольцевым системам . Дескрипторы ( E ) и ( Z ) всегда пишутся с заглавной буквы, набираются курсивом и заключаются в скобки, которые устанавливаются как обычные, как дополнительные локанты или запятые.
о -Крезол | м -Крезол | п -Крезол |
Сокращение o - (сокращение от орто , от греч. orthós — вертикальный, прямой), [8] m - ( мета , от греч. (приблизительно) — между) [9] и p - ( пара , от греч. pará — примыкающий, сбоку) [10] описывают три возможных позиционных изомера двух заместителей в бензольном кольце . Обычно это два независимых одиночных заместителя, но в случае конденсированных кольцевых систем также упоминается орто -конденсация, если только в названии не рассматривается схема замещения, как в [2.2]парациклофане . В текущей систематической номенклатуре o -, m - и p - часто заменяются с использованием локантов ( 1,2-диметилбензол вместо о -ксилола).
о- , м- и п- (пишется орто- , мета- и пара- ) пишутся строчными буквами и курсивом.
2- эндо -бром-7 -син -фтор- бицикло[2.2.1]гептан | 2- экзо -бром-7- син -фтор- бицикло[2.2.1]гептан |
2- эндо -бром-7- анти -фтор- бицикло[2.2.1]гептан | 2- экзо -бром-7- анти -фтор- бицикло[2.2.1]гептан |
exo (от греч. = снаружи) [11] или endo (от греч. endon = внутри) [12] обозначает относительную конфигурацию мостиковых бициклических соединений. Положение заместителя в главном кольце относительно самого короткого мостика имеет решающее значение для назначения экзо или эндо (согласно ИЮПАК: мост с наивысшими локантными цифрами [13] в мостиковой кольцевой системе). Заместитель, который должен быть классифицирован, приписывается дескриптором экзо , если он обращен к мостику. Он имеет эндо- конфигурацию, если он обращен от мостика. Если два разных заместителя расположены на одном и том же атоме С, назначение экзо / эндо основывается на заместителе с более высоким приоритетом в соответствии с правилами CIP.
Если мостиковая бициклическая система несет заместитель в самом коротком мостике, экзо- или эндо -дескриптор не может быть использован для его назначения. Такие изомеры классифицируются с помощью син- / анти -обозначения. [13] Если заместитель, который должен быть назначен, указывает на кольцо с наибольшим числом сегментов, он имеет син- конфигурацию (от греч. syn = вместе). [14] В противном случае ему присваивается анти- дескриптор (греч. anti = против). [15] Если оба кольца обладают равным числом сегментов, выбирается кольцо с наиболее значимым заместителем в соответствии с правилами CIP.
Использование син и анти для обозначения конфигурации двойных связей в настоящее время устарело, особенно в случае альдоксимов и гидразонов, полученных из альдегидов . Здесь соединения были обозначены как син -конфигурированные, когда альдегид H и O (оксима) или N (гидразона) были выровнены в цис -положении. Эти соединения теперь описываются номенклатурой ( E )/( Z ). Альдоксимы и гидразоны, классифицированные как син , поэтому теперь описываются как ( E )-конфигурированные. [14]
Когда речь идет о диастереомерах, син и анти используются для описания групп на тех же или противоположных участках в зигзагообразной проекции, см. Диастереомер#Син / анти
Син и анти всегда пишутся строчными буквами и курсивом, локанты (если используются) ставятся перед словом и разделяются дефисами.
Термины fac (от лат. facies , «внешняя грань») [16] и mer (от «меридиональный») [17] могут указывать на расположение трех идентичных лигандов вокруг центрального атома в октаэдрических комплексах. Сегодня эта номенклатура считается устаревшей, но все еще допустима. [18] [19] Префикс fac описывает ситуацию, когда три идентичных лиганда занимают три вершины треугольной поверхности октаэдра. В конфигурации mer три лиганда охватывают плоскость , в которой расположен центральный атом.
Перед именем комплекса ставятся префиксы fac и mer , набранные строчными буквами курсивом.
Префиксы n (нормальный), iso (от греч. ísos = равный), [20] neo (греч. néos = молодой, новый) [21] и cyclo (греч. kyklos = круг) [22] в основном используются для описания расположения атомов, обычно атомов углерода в углеродном скелете. n , iso и neo больше не используются в систематической номенклатуре, но по-прежнему часто встречаются в тривиальных названиях и в лабораторном жаргоне.
Префикс n описывает углеродный скелет с прямой цепью без разветвлений, тогда как iso описывает разветвленный скелет, без указания каких-либо дополнительных деталей. В более общем смысле iso — это соединение, которое изомерно соединению n (соединение, в котором отдельные атомы или атомные группы перегруппированы)
neo — неспецифический термин для «новых», обычно синтетически полученных веществ или изомеров давно известных n соединений или природных веществ (например, неоментол, полученный из ментола , или неоабиетиновая кислота из абиетиновой кислоты ). Согласно ИЮПАК, neo рекомендуется только в неопентане или неопентиловом остатке. [23] [24]
cyclo — часто используемый префикс для всех циклических и гетероциклических соединений. Во многих собственных названиях химических веществ cyclo используется не как префикс, а как непосредственная часть названия, например, в циклогексане или циклооктатетраене.
В то время как n , iso и neo пишутся строчными и курсивными буквами, для cyclo это имеет место только в неорганических соединениях. [25] В органических соединениях «cyclo» часто используется как компонент имени, не разделяется дефисом и также учитывается при алфавитной сортировке.
Префиксы sec и tert используются для указания окружения заместителя в молекуле. Таким образом, описывается не точное положение заместителя, а только схема замещения соседнего атома (обычно атома углерода). В n- бутаноле группа OH присоединена к первичному атому углерода, во sec -бутаноле — к вторичному атому углерода, а в tert -бутаноле — к третичному атому углерода.
Термины sec и tert считаются устаревшими и должны использоваться только для незамещенных групп sec-butoxy, sec-butyl [26] [27] или tert-butyl. [28] [27] Существуют различные варианты написания, такие как «sec-butyl», «s-butyl», «sBu» или «bus», которые также считаются устаревшими. [29] [30]
Префикс «спиро», за которым следует дескриптор Фон-Байера, описывает в номенклатуре органических соединений кольцевые системы, связанные только одним общим атомом — спироатомом. Если в молекуле присутствует несколько спироатомов, префикс «спиро» снабжается префиксом («диспиро», «триспиро» и т. д.), соответствующим числу спироатомов. Обычно «спиро» устанавливается как обычно. [31]
Термин катена (лат. «цепь») используется в неорганической номенклатуре [32] для описания линейных, цепочевидных полимеров из идентичных многоатомных единиц. [33] Одним из примеров являются катенатрифосфазены. [34] [35] Родственными соединениями в органической химии являются катенаны .
Обозначение sn означает стереоспецифическую нумерацию и указывает на особый способ нумерации атомов углерода в молекуле на основе глицерина.
См.: Правила приоритета Кана–Ингольда–Прелога
Стереохимические дескрипторы ( R ) (от лат. rectus = правый) и ( S ) (от лат. sinister = левый) [36] используются для описания абсолютной конфигурации стереоцентра (обычно хирального атома углерода). [37] Для этой цели все заместители в стереоцентре имеют приоритет в соответствии с правилами CIP, и заместитель с самым низким приоритетом («D») направлен назад (от направления взгляда). Стереоцентр имеет конфигурацию ( S ), если остальные заместители описывают круг, убывающий по приоритету («A» → «B» → «C») влево. Конфигурация ( R ) присваивается стереоцентру, если направление вращения направлено вправо.
Если одна молекула содержит несколько стереоцентров, локант должен быть помещен перед дескриптором (например, в (1 R , 2 S )-2-амино-1-фенилпропан-1-ол, систематическое обозначение норэфедрина ). Если все стереоцентры сконфигурированы одинаково, наименование локантов может быть опущено в пользу написания «все- R » или «(все- S )».
В типографике ( R ) и ( S ) пишутся заглавными буквами и курсивом; часто предшествующие им пробелы, окружающие круглые скобки и запятые, напротив, пишутся как обычно.
Дескрипторы ( r ) и ( s ) используются для описания абсолютной конфигурации псевдоасимметричных центров. [38] Псевдоасимметрия возникает, когда к одному атому углерода присоединены четыре различных заместителя, два из которых отличаются только своей абсолютной стереохимической конфигурацией. Примерами таких соединений являются мезосоединения , такие как тропановые алкалоиды; исходное соединение — тропин , систематическое название которого (1 R , 3 r , 5 S )-8-метил-8-азабицикло[3.2.1]октан-3-ол. В этой структуре атом C3 — углерод, к которому присоединена гидроксильная группа — является псевдоасимметричным; поэтому стереохимический дескриптор в систематическом названии пишется строчными курсивными буквами, а не заглавными курсивными буквами, как для обычных хиральных атомов.
См.: Проекция Фишера
Стереоскрипторы D - (от лат. dexter, правый) и L - (от лат. laevus, левый) используются для описания конфигурации α-аминокислот и сахаров. [39] Во-первых, трехмерная молекула должна быть преобразована в определенную нотацию как двумерное изображение («проекция Фишера»). [40] Для этого атом C с наивысшим приоритетом в соответствии с обычными правилами номенклатуры располагается сверху, а дальнейшая углеродная цепь располагается вертикально под ним. Хиральный атом C, наиболее удаленный от группы с наивысшим приоритетом, используется для назначения D - или L -. Если остаток, расположенный на этом атоме углерода (обычно группа ОН), указывает влево, молекула происходит из L -ряда. Если остаток указывает вправо, используется дескриптор D -. [41]
Дескрипторы D - и L - пишутся маленькими заглавными буквами и отделяются дефисом от остальной части имени. [42]
Иногда упомянутые выше стереодескрипторы с заглавными буквами D и L ошибочно путают с устаревшими курсивными стереодескрипторами d и l , которые эквивалентны правовращающему и левовращающему оптическому вращению , т. е. (+)- и (−)- стереодескрипторам соответственно.