CYTH2

CYTH2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1PBV, 1R8M, 1R8Q, 1R8S, 1S9D, 4JMI, 4JMO, 4JWL, 4JXH, 4L5M, 4Z21
Идентификаторы
Псевдонимы	CYTH2 , ARNO, CTS18, CTS18.1, PSCD2, PSCD2L, SEC7L, Sec7p-L, Sec7p-подобный, цитогезин 2, цитогезин-2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602488; МГИ : 1334255; Гомологен : 32116; Генные карты : CYTH2; OMA :CYTH2 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 19 (человек)
Конец	48,482,314 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	45,464,005 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	ганглионарное возвышение; ; левое яичко; ; правое яичко; ; фронтальный полюс; ; правая доля щитовидной железы; ; левая доля щитовидной железы; ; парафлоккулус мозжечка; ; Район Бродмана 10; ; средняя лобная извилина; ; желудочковая зона;
	Верх выражен в
	нервный слой сетчатки; ; ганглионарное возвышение; ; медиальное ганглиозное возвышение; ; желудочковая зона; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; нервная трубка; ; сперматид; ; семенной каналец; ; верхняя лобная извилина; ; гранулоцит;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание инозитола 1,4,5 трифосфата; связывание белков; активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов; связывание липидов;
Клеточный компонент	цитоплазма; конус роста; плазматическая мембрана; проекция клетки; мембрана; мембрана Гольджи; цитозоль; адгезивное соединение; двуклеточный плотный контакт; клеточный переход;
Биологический процесс	регуляция передачи сигнала белка ARF; эндоцитоз; организация актинового цитоскелета;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	9266
	19158
	ENSG00000105443
	ENSMUSG00000003269
	Q99418
	Р63034
	NM_004228 ; NM_017457
	NM_001112701 ; NM_011181
	NP_004219 ; NP_059431
	NP_001106171 ; NP_035311
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Цитогезин-2 — это белок , который у людей кодируется геном CYTH2 . [ ^5]^[6]^[7]

Функция

Цитогезин-2 (CYTH2), ранее известный как Pleckstrin homology, Sec7 и coiled/coil domains 2 (PSCD2), является членом семейства цитогезинов. Члены этого семейства имеют идентичную структурную организацию, которая состоит из N-концевого мотива coiled-coil, центрального домена Sec7 и домена C-концевой pleckstrin homology (PH). Мотив coiled-coil участвует в гомодимеризации, домен Sec7 содержит активность белка обмена гуанин-нуклеотидов (GEP), а домен PH взаимодействует с фосфолипидами и отвечает за ассоциацию CYTH с мембранами. Члены этого семейства, по-видимому, опосредуют регуляцию сортировки белков и мембранного трафика. CYTH2 проявляет активность GEP in vitro с ARF1, ARF3 и ARF6. Белок CYTH2 на 83% гомологичен CYTH1. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что CYTH2 взаимодействует с Arrestin beta 2 ^[8] и Arrestin beta 1 ^[8] .

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000105443 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000003269 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Kolanus W, Nagel W, Schiller B, Zeitlmann L, Godar S, Stockinger H, Seed B (сентябрь 1996 г.). "Связывание альфа-L-бета-2-интегрина/LFA-1 с ICAM-1, индуцированное цитогезином-1, цитоплазматической регуляторной молекулой". Cell . 86 (2): 233– 42. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80095-1 . PMID 8706128. S2CID 18390795.
^ Chardin P, Paris S, Antonny B, Robineau S, Béraud-Dufour S, Jackson CL, Chabre M (1996). "Человеческий фактор обмена для ARF содержит домены Sec7- и плекстрин-гомологии". Nature . 384 (6608): 481– 4. Bibcode :1996Natur.384..481C. doi :10.1038/384481a0. PMID 8945478. S2CID 4361989.
^ ab "Ген Entrez: гомология плекстрина PSCD2, домены Sec7 и спирально-спиральные 2 (цитогезин-2)".
^ ab Claing A, Chen W, Miller WE, Vitale N, Moss J, Premont RT, Lefkowitz RJ (ноябрь 2001 г.). "опосредованная бета-аррестином активация фактора 6 АДФ-рибозилирования и эндоцитоз бета-2-адренергических рецепторов". J. Biol. Chem . 276 (45): 42509– 13. doi : 10.1074/jbc.M108399200 . PMID 11533043.

Дальнейшее чтение

Meacci E, Tsai SC, Adamik R, Moss J, Vaughan M (1997). "Цитогезин-1, цитозольный белок обмена гуаниновых нуклеотидов для фактора рибозилирования АДФ". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (5): 1745– 8. Bibcode :1997PNAS...94.1745M. doi : 10.1073/pnas.94.5.1745 . PMC 19987 . PMID 9050849.
Frank S, Upender S, Hansen SH, Casanova JE (1998). "ARNO — это фактор обмена гуаниновых нуклеотидов для фактора рибозилирования АДФ 6". J. Biol. Chem . 273 (1): 23– 7. doi : 10.1074/jbc.273.1.23 . PMID 9417041.
Mossessova E, Gulbis JM, Goldberg J (1998). "Структура домена фактора обмена гуаниновых нуклеотидов Sec7 человеческого arno и анализ взаимодействия с ARF GTPase". Cell . 92 (3): 415– 23. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80933-2 . PMID 9476900. S2CID 8093935.
Шерфилс Ж, Менетре Ж, Матье М, Ле Бра Ж, Робино С, Беро-Дюфур С, Антонни Б, Шарден П (1998). «Структура домена Sec7 фактора обмена Arf ARNO». Природа . 392 (6671): 101–5 . Бибкод : 1998Natur.392..101C. дои : 10.1038/32210. PMID 9510256. S2CID 4334627.
Venkateswarlu K, Oatey PB, Tavaré JM, Cullen PJ (1998). «Инсулинозависимая транслокация ARNO в плазматическую мембрану адипоцитов требует фосфатидилинозитол 3-киназы». Curr. Biol . 8 (8): 463– 6. Bibcode : 1998CBio....8..463V. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70181-2 . PMID 9550703. S2CID 12974067.
Kim HS (1998). «Присвоение гена PSCD2L человека cts18.1 полосе q13 хромосомы 19 с использованием панели гибридного картирования радиации». Cytogenet. Cell Genet . 83 ( 1– 2): 43. doi :10.1159/000015163. PMID 9925920. S2CID 31220052.
Santy LC, Frank SR, Hatfield JC, Casanova JE (1999). "Регулирование обмена нуклеотидов ARNO электростатическим переключателем домена PH". Curr. Biol . 9 (20): 1173– 6. Bibcode : 1999CBio....9.1173S. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80019-6 . PMID 10531036. S2CID 17664498.
Ogasawara M, Kim SC, Adamik R, Togawa A, Ferrans VJ, Takeda K, Kirby M, Moss J, Vaughan M (2000). "Сходства в функциях и структуре генов цитогезина-4 и цитогезина-1, белков обмена гуаниновых нуклеотидов для факторов АДФ-рибозилирования". J. Biol. Chem . 275 (5): 3221– 30. doi : 10.1074/jbc.275.5.3221 . PMID 10652308.
Smith JS, Tachibana I, Pohl U, Lee HK, Thanarajasingam U, Portier BP, Ueki K, Ramaswamy S, Billings SJ, Mohrenweiser HW, Louis DN, Jenkins RB (2000). «Карта транскриптов области супрессора опухолей глиомы 19q-плеча хромосомы». Genomics . 64 (1): 44– 50. doi :10.1006/geno.1999.6101. PMID 10708517.
Витале Н., Пачеко-Родригес Г., Ферранс В.Дж., Рименшнайдер В., Мосс Дж., Воган М. (2000). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитогезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». Ж. Биол. Хим . 275 (28): 21331–9 . doi : 10.1074/jbc.M909642199 . ПМИД 10748148.
Macia E, Paris S, Chabre M (2000). «Связывание PH и многоосновных C-концевых доменов ARNO с фосфоинозитидами и кислыми липидами». Биохимия . 39 (19): 5893–901 . doi :10.1021/bi992795w. PMID 10801341.
Lee SY, Pohajdak B (2000). "N-концевое нацеливание факторов обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) на факторы рибозилирования АДФ (ARF) в аппарате Гольджи". J. Cell Sci . 113 (11): 1883– 9. doi :10.1242/jcs.113.11.1883. PMID 10806099.
Claing A, Chen W, Miller WE, Vitale N, Moss J, Premont RT, Lefkowitz RJ (2001). "опосредованная бета-аррестином активация фактора 6 АДФ-рибозилирования и эндоцитоз бета-2-адренергических рецепторов". J. Biol. Chem . 276 (45): 42509– 13. doi : 10.1074/jbc.M108399200 . PMID 11533043.
Kitano J, Kimura K, Yamazaki Y, Soda T, Shigemoto R, Nakajima Y, Nakanishi S (2002). "Тамалин, белок, содержащий домен PDZ, связывает образование белкового комплекса метаботропных рецепторов глутамата группы 1 и цитогезинов фактора обмена гуаниновых нуклеотидов". J. Neurosci . 22 (4): 1280– 9. doi : 10.1523/JNEUROSCI.22-04-01280.2002 . PMC 6757580 . PMID 11850456.
Mansour M, Lee SY, Pohajdak B (2002). "N-концевой спиральный домен семейства цитогезина/ARNO факторов обмена гуаниновых нуклеотидов взаимодействует с белком-скаффолдером CASP". J. Biol. Chem . 277 (35): 32302– 9. doi : 10.1074/jbc.M202898200 . PMID 12052827.
Buchet-Poyau K, Mehenni H, Radhakrishna U, Antonarakis SE (2002). «Поиск второго локуса синдрома Пейтца-Егерса: исключение генов STK13, PRKCG, KLK10 и PSCD2 на хромосоме 19 и гена STK11IP на хромосоме 2». Cytogenet. Genome Res . 97 ( 3– 4): 171– 8. doi : 10.1159/000066620. PMID 12438709. S2CID 36446950.
Huh M, Han JH, Lim CS, Lee SH, Kim S, Kim E, Kaang BK (2003). «Регуляция нейритогенеза и синаптической передачи msec7-1, фактором обмена гуаниновых нуклеотидов, в культивируемых нейронах Aplysia». J. Neurochem . 85 (1): 282– 5. doi : 10.1046/j.1471-4159.2003.01718.x . PMID 12641750. S2CID 35888745.

Эта статья о гене на хромосоме 19 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000105443 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000003269 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8706128-5] Kolanus W, Nagel W, Schiller B, Zeitlmann L, Godar S, Stockinger H, Seed B (сентябрь 1996 г.). "Связывание альфа-L-бета-2-интегрина/LFA-1 с ICAM-1, индуцированное цитогезином-1, цитоплазматической регуляторной молекулой". Cell . 86 (2): 233– 42. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80095-1 . PMID 8706128. S2CID 18390795.

[pmid8945478-6] Chardin P, Paris S, Antonny B, Robineau S, Béraud-Dufour S, Jackson CL, Chabre M (1996). "Человеческий фактор обмена для ARF содержит домены Sec7- и плекстрин-гомологии". Nature . 384 (6608): 481– 4. Bibcode :1996Natur.384..481C. doi :10.1038/384481a0. PMID 8945478. S2CID 4361989.

[entrez-7] "Ген Entrez: гомология плекстрина PSCD2, домены Sec7 и спирально-спиральные 2 (цитогезин-2)".

[pmid11533043-8] Claing A, Chen W, Miller WE, Vitale N, Moss J, Premont RT, Lefkowitz RJ (ноябрь 2001 г.). "опосредованная бета-аррестином активация фактора 6 АДФ-рибозилирования и эндоцитоз бета-2-адренергических рецепторов". J. Biol. Chem . 276 (45): 42509– 13. doi : 10.1074/jbc.M108399200 . PMID 11533043.