Транскрипционный регулятор Kaiso — это белок , который у людей кодируется геном ZBTB33 . [5] Этот ген кодирует транскрипционный регулятор с бимодальной ДНК-связывающей специфичностью, который связывается с метилированным CGCG, а также с неметилированным консенсусным сайтом связывания KAISO TCCTGCNA. Белок содержит N-концевой домен POZ/BTB и 3 C-концевых мотива цинковых пальцев. Он рекрутирует комплекс репрессора N-CoR для стимуляции деацетилирования гистонов и формирования репрессивных структур хроматина в промоторах целевых генов. Он может способствовать репрессии целевых генов сигнального пути Wnt, а также может активировать транскрипцию подмножества целевых генов путем рекрутирования катенина дельта-2 (CTNND2). Его взаимодействие с катенином дельта-1 (CTNND1) ингибирует связывание как с метилированной, так и с неметилированной ДНК. Он также напрямую взаимодействует с ядерным импортным рецептором Importin-α2 (также известным как кариоферин альфа2 или RAG когорта 1), который может опосредовать ядерный импорт этого белка. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, кодирующие тот же белок. [6]
НАЗВАННЫЙ доктором Джульеттой Дэниелс, ген KAISO был назван в честь музыки «калипсо», популярной на Карибах, в Тринидаде и Тобаго и т. д.
^ ab Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (сентябрь 2003 г.). "N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через связывающий белок CpG Kaiso". Molecular Cell . 12 (3): 723– 34. doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . PMID 14527417.
^ Daniel JM, Reynolds AB (май 1999). «Катенин p120(ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции цинкового пальца домена BTB/POZ». Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3614– 23. doi : 10.1128 /mcb.19.5.3614. PMC 84161. PMID 10207085.
Дальнейшее чтение
Daniel JM, Reynolds AB (май 1999). «Катенин p120(ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции цинкового пальца домена BTB/POZ». Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3614– 23. doi :10.1128/mcb.19.5.3614. PMC 84161. PMID 10207085 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Research . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсакс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б. , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК 311072 . PMID 11230166.
Прохорчук А, Хендрих Б, Йоргенсен Х, Рузов А, Вильм М, Георгиев Г, Бёрд А, Прохорчук Е (июль 2001 г.). «Катенин-партнер p120 Кайсо представляет собой зависимый от метилирования ДНК репрессор транскрипции». Гены и развитие . 15 (13): 1613– 8. doi :10.1101/gad.198501. ПМК 312733 . ПМИД 11445535.
Daniel JM, Ireton RC, Reynolds AB (июнь 2001 г.). «Моноклональные антитела к Kaiso: новый фактор транскрипции и белок, связывающий p120ctn». Гибридома . 20 (3): 159– 66. doi : 10.1089/027245701750293484. PMID 11461664.
Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (сентябрь 2003 г.). "N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через связывающий метил CpG белок Kaiso". Molecular Cell . 12 (3): 723–34 . doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . PMID 14527417.
Kondapalli J, Flozak AS, Albuquerque ML (март 2004 г.). «Ламинарное напряжение сдвига дифференциально модулирует экспрессию генов катенина p120, фактора транскрипции Kaiso и сосудистого эндотелиального кадгерина в эндотелиальных клетках коронарных артерий человека». Журнал биологической химии . 279 (12): 11417– 24. doi : 10.1074/jbc.M306057200 . PMID 14699141.
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования . 14 (10Б): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. ПМК 528930 . ПМИД 15489336.
Kim SW, Park JI, Spring CM, Sater AK, Ji H, Otchere AA, Daniel JM, McCrea PD (декабрь 2004 г.). «Неканонические сигналы Wnt модулируются транскрипционным репрессором Kaiso и p120-катенином». Nature Cell Biology . 6 (12): 1212– 20. doi :10.1038/ncb1191. PMID 15543138. S2CID 19404686.
Ruzov A, Dunican DS, Prokhortchouk A, Pennings S, Stancheva I, Prokhortchouk E, Meehan RR (декабрь 2004 г.). «Kaiso — это геномный репрессор транскрипции, необходимый для развития амфибий». Development . 131 (24): 6185– 94. doi : 10.1242/dev.01549 . hdl : 20.500.11820/1328870e-099c-4bbd-8061-06b8b21f25ef . PMID 15548582.
Келли КФ, Отчере АА, Грэм М, Дэниел ДжМ (декабрь 2004 г.). «Ядерный импорт транскрипционного регулятора BTB/POZ Kaiso». Журнал клеточной науки . 117 (ч. 25): 6143–52 . doi :10.1242/jcs.01541. PMID 15564377. S2CID 17008036.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (январь 2005 г.). "Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках". Nature Biotechnology . 23 (1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Soubry A, van Hengel J, Parthoens E, Colpaert C, Van Marck E, Waltregny D, Reynolds AB, van Roy F (март 2005 г.). «Экспрессия и ядерная локализация транскрипционного репрессора Kaiso регулируются микроокружением опухоли». Cancer Research . 65 (6): 2224– 33. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-2020 . PMID 15781635.
Spring CM, Kelly KF, O'Kelly I, Graham M, Crawford HC, Daniel JM (май 2005 г.). «Катенин p120ctn ингибирует транскрипционную репрессию Kaiso целевого гена бета-катенина/TCF матрилизина». Experimental Cell Research . 305 (2): 253– 65. doi :10.1016/j.yexcr.2005.01.007. PMID 15817151.
Arányi T, Faucheux BA, Khalfallah O, Vodjdani G, Biguet NF, Mallet J, Meloni R (июль 2005 г.). «Тканеспецифическое метилирование гена тирозингидроксилазы человека выявляет новые регуляторные элементы в первом экзоне». Journal of Neurochemistry . 94 (1): 129– 39. doi : 10.1111/j.1471-4159.2005.03173.x . PMID 15953356.
Дефосс П.А., Келли К.Ф., Филион Дж.Дж., Перес-Торрадо Р., Магдинье Ф., Менони Х., Нордгаард К.Л., Дэниел Дж.М., Гилсон Э. (декабрь 2005 г.). «Фактор связывания CTC-блокатора энхансеров человека взаимодействует с фактором транскрипции Kaiso». Журнал биологической химии . 280 (52): 43017– 23. doi : 10.1074/jbc.M510802200 . ПМИД 16230345.