ZBTB33

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ZBTB33
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыZBTB33 , ZNF-kaiso, ZNF348, цинковый палец и домен BTB, содержащий 33
Внешние идентификаторыOMIM : 300329; MGI : 1927290; HomoloGene : 4931; GeneCards : ZBTB33; OMA :ZBTB33 - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_006777
NM_001184742

NM_001079513
NM_020256

RefSeq (белок)

NP_001171671
NP_006768

NP_001072981
NP_064652

Местоположение (UCSC)Хр X: 120,25 – 120,26 МбХр X: 37.28 – 37.29 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Транскрипционный регулятор Kaiso — это белок , который у людей кодируется геном ZBTB33 . [5] Этот ген кодирует транскрипционный регулятор с бимодальной ДНК-связывающей специфичностью, который связывается с метилированным CGCG, а также с неметилированным консенсусным сайтом связывания KAISO TCCTGCNA. Белок содержит N-концевой домен POZ/BTB и 3 C-концевых мотива цинковых пальцев. Он рекрутирует комплекс репрессора N-CoR для стимуляции деацетилирования гистонов и формирования репрессивных структур хроматина в промоторах целевых генов. Он может способствовать репрессии целевых генов сигнального пути Wnt, а также может активировать транскрипцию подмножества целевых генов путем рекрутирования катенина дельта-2 (CTNND2). Его взаимодействие с катенином дельта-1 (CTNND1) ингибирует связывание как с метилированной, так и с неметилированной ДНК. Он также напрямую взаимодействует с ядерным импортным рецептором Importin-α2 (также известным как кариоферин альфа2 или RAG когорта 1), который может опосредовать ядерный импорт этого белка. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, кодирующие тот же белок. [6]

НАЗВАННЫЙ доктором Джульеттой Дэниелс, ген KAISO был назван в честь музыки «калипсо», популярной на Карибах, в Тринидаде и Тобаго и т. д.

Взаимодействия

Было показано, что ZBTB33 взаимодействует с HDAC3 [7] , корепрессором ядерного рецептора 1 [7] и CTNND1 [8] .

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000177485 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000048047 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Entrez: цинковый палец ZBTB33 и домен BTB, содержащий 33».
  6. ^ "ZBTB33 цинковый палец и домен BTB, содержащий 33 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 22.03.2016 .
  7. ^ ab Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (сентябрь 2003 г.). "N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через связывающий белок CpG Kaiso". Molecular Cell . 12 (3): 723– 34. doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . PMID  14527417.
  8. ^ Daniel JM, Reynolds AB (май 1999). «Катенин p120(ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции цинкового пальца домена BTB/POZ». Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3614– 23. doi : 10.1128 /mcb.19.5.3614. PMC 84161. PMID  10207085. 

Дальнейшее чтение

  • Daniel JM, Reynolds AB (май 1999). «Катенин p120(ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции цинкового пальца домена BTB/POZ». Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3614– 23. doi :10.1128/mcb.19.5.3614. PMC  84161. PMID  10207085 .
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Research . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
  • Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсакс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б. , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК  311072 . PMID  11230166.
  • Прохорчук А, Хендрих Б, Йоргенсен Х, Рузов А, Вильм М, Георгиев Г, Бёрд А, Прохорчук Е (июль 2001 г.). «Катенин-партнер p120 Кайсо представляет собой зависимый от метилирования ДНК репрессор транскрипции». Гены и развитие . 15 (13): 1613– 8. doi :10.1101/gad.198501. ПМК  312733 . ПМИД  11445535.
  • Daniel JM, Ireton RC, Reynolds AB (июнь 2001 г.). «Моноклональные антитела к Kaiso: новый фактор транскрипции и белок, связывающий p120ctn». Гибридома . 20 (3): 159– 66. doi : 10.1089/027245701750293484. PMID  11461664.
  • Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (сентябрь 2003 г.). "N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через связывающий метил CpG белок Kaiso". Molecular Cell . 12 (3): 723–34 . doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . PMID  14527417.
  • Kondapalli J, Flozak AS, Albuquerque ML (март 2004 г.). «Ламинарное напряжение сдвига дифференциально модулирует экспрессию генов катенина p120, фактора транскрипции Kaiso и сосудистого эндотелиального кадгерина в эндотелиальных клетках коронарных артерий человека». Журнал биологической химии . 279 (12): 11417– 24. doi : 10.1074/jbc.M306057200 . PMID  14699141.
  • Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования . 14 (10Б): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. ПМК  528930 . ПМИД  15489336.
  • Kim SW, Park JI, Spring CM, Sater AK, Ji H, Otchere AA, Daniel JM, McCrea PD (декабрь 2004 г.). «Неканонические сигналы Wnt модулируются транскрипционным репрессором Kaiso и p120-катенином». Nature Cell Biology . 6 (12): 1212– 20. doi :10.1038/ncb1191. PMID  15543138. S2CID  19404686.
  • Ruzov A, Dunican DS, Prokhortchouk A, Pennings S, Stancheva I, Prokhortchouk E, Meehan RR (декабрь 2004 г.). «Kaiso — это геномный репрессор транскрипции, необходимый для развития амфибий». Development . 131 (24): 6185– 94. doi : 10.1242/dev.01549 . hdl : 20.500.11820/1328870e-099c-4bbd-8061-06b8b21f25ef . PMID  15548582.
  • Келли КФ, Отчере АА, Грэм М, Дэниел ДжМ (декабрь 2004 г.). «Ядерный импорт транскрипционного регулятора BTB/POZ Kaiso». Журнал клеточной науки . 117 (ч. 25): 6143–52 . doi :10.1242/jcs.01541. PMID  15564377. S2CID  17008036.
  • Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (январь 2005 г.). "Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках". Nature Biotechnology . 23 (1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
  • Soubry A, van Hengel J, Parthoens E, Colpaert C, Van Marck E, Waltregny D, Reynolds AB, van Roy F (март 2005 г.). «Экспрессия и ядерная локализация транскрипционного репрессора Kaiso регулируются микроокружением опухоли». Cancer Research . 65 (6): 2224– 33. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-2020 . PMID  15781635.
  • Spring CM, Kelly KF, O'Kelly I, Graham M, Crawford HC, Daniel JM (май 2005 г.). «Катенин p120ctn ингибирует транскрипционную репрессию Kaiso целевого гена бета-катенина/TCF матрилизина». Experimental Cell Research . 305 (2): 253– 65. doi :10.1016/j.yexcr.2005.01.007. PMID  15817151.
  • Arányi T, Faucheux BA, Khalfallah O, Vodjdani G, Biguet NF, Mallet J, Meloni R (июль 2005 г.). «Тканеспецифическое метилирование гена тирозингидроксилазы человека выявляет новые регуляторные элементы в первом экзоне». Journal of Neurochemistry . 94 (1): 129– 39. doi : 10.1111/j.1471-4159.2005.03173.x . PMID  15953356.
  • Дефосс П.А., Келли К.Ф., Филион Дж.Дж., Перес-Торрадо Р., Магдинье Ф., Менони Х., Нордгаард К.Л., Дэниел Дж.М., Гилсон Э. (декабрь 2005 г.). «Фактор связывания CTC-блокатора энхансеров человека взаимодействует с фактором транскрипции Kaiso». Журнал биологической химии . 280 (52): 43017– 23. doi : 10.1074/jbc.M510802200 . ПМИД  16230345.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ZBTB33&oldid=1193873722"