WDR90

Белок 90, содержащий повторы WD, — это белок , который у людей кодируется геном WDR90 (16p13.3). ^[1] Этот человеческий белок состоит из 1750 аминокислот и имеет молекулярную массу 187,7 кДа. ^[2] Он содержит несколько доменов повторов WD40 и один домен неизвестной функции. ^[3] Этот белок сохраняется вплоть до беспозвоночных. ^[4] Было обнаружено, что белки, содержащие повторяющиеся домены трансдуцина WD, играют роль в различных функциях, начиная от передачи сигнала и регуляции транскрипции и заканчивая контролем клеточного цикла , аутофагией и апоптозом . ^[5]

В геноме человека WDR90 охватывает пары оснований 649363-667833 и имеет последовательность мРНК длиной 5250 нуклеотидов . Этот ген состоит из 41 экзона и кодирует белок из 1750 аминокислот у людей.

Этот человеческий ген расположен в положительной цепи ДНК на хромосоме 16 в позиции 16p13.3. ^[1] Фланговые последовательности на положительной цепи включают FAM195A и RHOT2 . ^[3]

Псевдонимы для WDR90 включают: C16orf15, C16orf16, C16orf17, C16orf18, C16orf19 и KIAA1924. ^[1]

Был найден один человеческий паралог для WDR90. Этот паралог известен как WDR16. Согласно UniProtKB/Swiss-Prot, WDR16 может играть существенную роль в росте или выживании гепатоцеллюлярной карциномы . Этот белок у людей имеет длину 620 аминокислот. ^{[6] [7]}

Ортологи белка WDR90 были обнаружены сохраняющимися вплоть до отдельных беспозвоночных . ^[8] У млекопитающих было обнаружено три сохраняющихся домена: DUF667 (местоположение 3-124) и два повтора WD40 (местоположения 697-991 и 1155-1549). ^[3]

Человеческий белок WDR90 имеет массу 287,7 кДа и изоэлектрическую точку 6,584. Существует домен неизвестной функции, называемый DUF667, который сохраняется в 30 предсказанных изоформах. ^[9]

Предполагается, что WDR90 является сильно фосфорилированным белком. ^[10]

Есть три домена, которые повторяются на протяжении всей человеческой последовательности. ^[11]

Предполагается, что структура белка de novo WDR90 у людей будет содержать бета-слои , бета-повороты и случайные спирали . ^[12]

Человеческий белок WDR90 использует 7-лопастной бета-пропеллер, что указывает на семейство повторов WD40 . Эта структура была предсказана со 100% уверенностью программой предсказания структур Phyre2.

Наиболее значимыми белками, взаимодействующими с человеческим WDR90, по прогнозам, являются UTY , KDM6B, SETD1B и ASH2L . ^[13] Эти белки в основном встречаются как модификаторы гистонов .

Было предсказано, что промотор WDR90 у людей имеет домены для факторов транскрипции: ARNT , AP-1 , MYB и Cis2His2 . ^[14]

Уровни экспрессии человеческого WDR90, по-видимому, относительно составные в низких уровнях, с его самыми высокими уровнями в лимфатических узлах и тимусе . ^{[15] [16]} Экспрессия WDR90 в развитии является самой высокой на стадиях бластоцисты и плода. Экспрессия заметно отсутствует на неонатальных и младенческих стадиях, затем возвращается в ювенильном возрасте и сохраняется в течение всей взрослой жизни. ^[16]

Функция WDR90 у людей не очень хорошо известна. Учитывая его широкую экспрессию во многих тканях, его связи с белками суперсемейства WD40, содержащими домен, и известные взаимодействия белков, он может играть роль в модификации гистонов , везикулярном транспорте или регуляции транскрипции . ^{[13] [15] [16]}

• Бэйн, Розмари А.Л. и др. «Молекулярное профилирование яичек человека выявляет строгую специфическую для пути регуляцию экспрессии РНК после подавления гонадотропина и лечения прогестагеном». Журнал андрологии 29.4 (2008): 389-403.
• Кокс, Д.М. и М.Г. Батлер. «Дистальная частичная трисомия 15q26 и частичная моносомия 16p13.3 у 36-летнего мужчины с клиническими признаками обеих хромосомных аномалий». Цитогенетические и геномные исследования (2015).
• Хуан, Чи-Чэн и др. «Конкурентные генные сигнатуры для рака груди у китайцев хань». PLoS ONE 8.10 (2013): e76421.
• Якобсен, Лис и др. «Новые асимметрично локализующиеся компоненты человеческих центросом, идентифицированные с помощью дополнительных методов протеомики». Журнал EMBO 30.8 (2011): 1520-1535.
• Лауверис, Бернард и др. «Метод определения и классификации ревматических состояний». Заявка на патент США 12/528,615.
• Ринк, Лори и др. «Сигнатуры экспрессии генов и реакция на мезилат иматиниба в желудочно-кишечной стромальной опухоли». Molecular Cancer Therapeutics 8.8 (2009): 2172-2182.
• Янагисава, Хару-аки и др. «Станция, Техас 77843, США. Сокращения: DMT, дублетная микротрубочка; IJ, внутреннее соединение».