Aliivibrio fischeri
Виды бактерий

Aliivibrio fischeri
Aliivibrio fischeri светится на чашке Петри
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Псевдомонадоты
Сорт:Гаммапротеобактерии
Заказ:Вибрионы
Семья:Вибрионовые
Род:Алиивибрио
Разновидность:
А. фишери
Биномиальное имя
Aliivibrio fischeri
( Бейеринк , 1889) Урбанчик и др. 2007 г.
Синонимы [1]

Aliivibrio fischeri (ранее Vibrio fischeri ) — грамотрицательная палочковидная бактерия ,встречающаяся по всему миру в морской среде. [2] Эта бактерия наиболее эффективно растет в воде с концентрацией соли около 20 г/л и при температуре от 24 до 28 °C. [3] Этот вид непатогенен [3] и обладает биолюминесцентными свойствами. Он встречается преимущественно в симбиозе с различными морскими животными, такими как гавайский бобтейл . Он гетеротрофен , оксидаза-положителен и подвижен с помощью пучка полярных жгутиков . [4] Свободноживущиеклетки A. fischeri выживают за счет разлагающегося органического вещества . Бактерия является ключевым исследовательским организмом для изучения микробной биолюминесценции , кворум-сенсорики и симбиоза бактерий и животных. [5] Он назван в честь Бернхарда Фишера , немецкого микробиолога. [6]

Aliivibrio fischeri — это семейство Vibrionaceae . Это семейство бактерий, как правило, имеет адаптивный метаболизм, который может приспосабливаться к различным обстоятельствам. Эта гибкость может способствовать способности A. fischeri выживать как в одиночку, так и в симбиотических отношениях. [7]

Сравнение рибосомной РНК привело к переклассификации этого вида из рода Vibrio в недавно созданный Aliivibrio в 2007 году. [8] Изменение признано как действительная публикация , и согласно Списку названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN), правильным названием . [9] Однако изменение названия не было принято большинством исследователей, которые по-прежнему публикуют название Vibrio fischeri . [ требуется ссылка ]

Геном

Геном A. fischeri был полностью секвенирован в 2004 году и состоит из двух хромосом , одной поменьше и одной побольше. Хромосома 1 имеет 2,9 миллиона пар оснований (Мбн), а хромосома 2 имеет 1,5 Мбн, в результате чего общий геном составляет 4,4 Мбн. [10]

A. fischeri имеет самое низкое содержание G+C из 27 видов Vibrio , но все еще связан с видами с более высокой патогенностью, такими как V. cholerae . Геном A. fischeri также несет мобильные генетические элементы . [11] Точные функции этих элементов в A. fischeri до конца не изучены. Однако известно, что они приобретают новые гены, которые связаны с вирулентностью и устойчивостью к экологическим стрессам в других бактериальных геномах. [12]

Некоторые штаммы A. fischeri, такие как штамм ES114, содержат плазмиду. Плазмида в штамме ES114 называется pES100 и, скорее всего, используется для целей конъюгации. Эта цель была определена на основе последовательности гена 45,8 т.п.н., большая часть которой кодирует систему секций типа IV. Способность к предварительной конъюгации может быть полезна как для полезных, так и для патогенных штаммов, поскольку она позволяет осуществлять обмен ДНК. [13]

Есть данные, что геном A. fischeri включает кластеры генов пилей. Эти кластеры кодируют множество различных видов пилей , которые выполняют различные функции. У этого вида есть пили, используемые для патогенеза, подергивания подвижности, плотной адгезии и токсин-корегуляции и многого другого. [13]

Экология

Гавайский бобтейл-кальмар , его фотофоры заселены Aliivibrio fischeri

A. fischeri распространены по всему миру в умеренных и субтропических морских средах . [14] Их можно найти свободно плавающими в океанах, а также связанными с морскими животными, осадками и разлагающимися веществами. [14] A. fischeri были наиболее изучены как симбионты морских животных, включая кальмаров рода Euprymna и Sepiola , у которых A. fischeri можно найти в световых органах кальмаров . [14] Эта связь была лучше всего охарактеризована у гавайского бобтейла ( Euprymna scolopes ). A. fischeri — единственный вид бактерий, населяющих световой орган кальмара, [15] несмотря на окружающую среду, полную других бактерий. [7]

Симбиоз с гавайским кальмаром-бобтейлом

Колонизация A. fischeri светового органа гавайского кальмара-бобтейла ( Euprymna scolopes [16] ) в настоящее время изучается как простая модель мутуалистического симбиоза, поскольку он содержит только два вида, и A. fischeri можно культивировать в лаборатории и генетически модифицировать. Aliivibrio fischeri использует хитин в качестве основного источника углерода и азота в своем симбиозе с гавайским кальмаром-бобтейлом. В световом органе кальмара A. fischeri расщепляет хитин на N-ацетилглюкозамин (GlcNAc), который действует как питательное вещество и хемоаттрактант , направляя колонизацию. Хитиназы облегчают этот распад, в то время как регуляторный белок NagC контролирует экспрессию генов для использования хитина и GlcNAc. Бактерии метаболизируют GlcNAc посредством ферментации или дыхания, поддерживая энергетические потребности и биолюминесценцию, которые имеют решающее значение для мутуалистических отношений с кальмаром. [7] Этот мутуалистический симбиоз обеспечивает A. fischeri питательными веществами и защищенной средой, а также помогает кальмару избегать хищников с помощью биолюминесценции.

A. fischeri обеспечивает свечение, колонизируя световой орган гавайского кальмара-бобтейла, [17] который находится на его брюшной стороне. [7] Орган светится ночью, обеспечивая кальмару камуфляж от противоосвещения . Световые органы некоторых кальмаров содержат отражающие пластины, которые усиливают и направляют производимый свет, благодаря белкам, известным как рефлектины . Они регулируют интенсивность света в соответствии с интенсивностью света морской поверхности ниже. [17] Эта стратегия не позволяет кальмару отбрасывать тень на дно океана, помогая ему избегать хищников во время кормления. [7] [17] Популяция A. fischeri поддерживается суточным циклом. Около 90% A. fischeri выбрасываются кальмаром каждое утро в процессе, известном как «выброс». 10% бактерий, оставшихся в кальмаре, пополняют бактериальную популяцию перед следующей ночью. [7]

A. fischeri горизонтально приобретаются молодыми кальмарами из окружающей среды. Предполагается, что вентиляция является источником, из которого колонизируются недавно вылупившиеся кальмары. Эта колонизация вызывает изменения в развитии и морфологии в световом органе кальмара, который является полупрозрачным. [7] [17] Морфологические изменения, производимые A. fischeri, не происходят, когда микроб не может люминесцировать, такие как уменьшение количества пор в световом органе. Кроме того, если колонизация A. fischeri резко удаляется антибиотиками, мерцательный эпителий светового органа регрессирует. [16] Эти изменения показывают, что биолюминесценция действительно необходима для симбиоза.

В процессе колонизации реснитчатые клетки в фотофорах животных (светопроизводящих органах) выборочно втягивают симбиотические бактерии. Эти клетки создают микротоки, которые в сочетании со слизью [16] способствуют росту симбионтов и активно отторгают любых конкурентов. Бактерии вызывают гибель реснитчатых клеток, как только световой орган достаточно колонизирован. [17]

Биолюминесценция

Биолюминесценция A. fischeri вызвана транскрипцией оперона lux и последующей трансляцией белков lux, которые производят свет. Этот процесс индуцируется через зависимое от популяции ощущение кворума . [2] Популяция A. fischeri должна достичь оптимального уровня, чтобы активировать оперон lux и стимулировать производство света. Циркадный ритм контролирует экспрессию света, где свечение намного ярче днем ​​и тусклее ночью, что требуется для маскировки. [18]

Бактериальная система люциферин - люцифераза кодируется набором генов, называемых опероном lux . У A. fischeri пять таких генов ( luxCDABEG ) были идентифицированы как активные в излучении видимого света, а два гена ( luxR и luxI ) участвуют в регуляции оперона . Несколько внешних и внутренних факторов, по-видимому, либо индуцируют , либо ингибируют транскрипцию этого набора генов и вызывают или подавляют излучение света . [ необходима цитата ]

A. fischeri — один из многих видов бактерий, которые обычно образуют симбиотические отношения с морскими организмами. [19] Морские организмы содержат бактерии, которые используют биолюминесценцию, чтобы находить партнеров, отпугивать хищников, привлекать добычу или общаться с другими организмами. [20] В свою очередь, организм, в котором живут бактерии, обеспечивает бактерии богатой питательными веществами средой. [21] Оперон lux — это 9-килобазный фрагмент генома A. fischeri , который контролирует биолюминесценцию посредством каталитической активности фермента люциферазы. [22] Этот оперон имеет известную последовательность гена luxCDAB(F)E , где luxA и luxB кодируют белковые субъединицы фермента люциферазы, а luxCDE кодирует комплекс редуктазы жирных кислот , который производит жирные кислоты , необходимые для механизма люциферазы. [22] luxC кодирует фермент ацилредуктазу, luxD кодирует ацилтрансферазу , а luxE производит белки, необходимые для фермента ацилпротеинсинтетазы. Люцифераза производит синий/зеленый свет посредством окисления восстановленного флавинмононуклеотида и длинноцепочечного альдегида двухатомным кислородом . Реакция суммируется следующим образом: [23]

FMNH2 + O2 + R -CHO → FMN + R-COOH + H2O + свет.

Восстановленный флавинмононуклеотид (FMNH) обеспечивается геном fre , также называемым luxG . У A. fischeri он находится непосредственно рядом с luxE (давая luxCDABE-fre ) от 1042306 до 1048745. [24]

Для получения альдегида, необходимого в реакции выше, необходимы три дополнительных фермента. Жирные кислоты, необходимые для реакции, извлекаются из пути биосинтеза жирных кислот ацилтрансферазой. Ацилтрансфераза реагирует с ацил- АПБ, чтобы высвободить R-COOH, свободную жирную кислоту. R-COOH восстанавливается двухферментной системой до альдегида. Реакция выглядит следующим образом: [21]

R-COOH + АТФ + НАДФН → R-CHO + AMP + PP + НАДФ + .

Определение кворума

Ощущение кворума у ​​Aliivibrio fischeri  [25]
Зеленые пятиугольники обозначают аутоиндуктор AHL, который производит LuxI (3OC6-гомосерин лактон). Регулятор транскрипции, LuxR, модулирует экспрессию AHL-синтазы, LuxI и lux-оперона, что приводит к люциферазно-опосредованной эмиссии света

Одной из основных систем, которая контролирует биолюминесценцию посредством регуляции оперона lux , является кворум-сенсинг , консервативный механизм во многих видах микроорганизмов, который регулирует экспрессию генов в ответ на концентрацию бактерий. Кворум-сенсинг функционирует посредством производства аутоиндуктора , обычно небольшой органической молекулы, отдельными клетками. По мере увеличения популяции клеток уровни аутоиндукторов увеличиваются, и специфические белки, которые регулируют транскрипцию генов, связываются с этими аутоиндукторами, изменяя экспрессию генов. Эта система позволяет микробным клеткам «общаться» между собой и координировать поведение, такое как люминесценция, которая требует большого количества клеток для получения заметного эффекта. [25]

В A. fischeri есть две основные системы восприятия кворума, каждая из которых реагирует на немного отличающиеся среды. Первая система обычно называется системой lux , так как она закодирована в опероне lux и использует аутоиндуктор 3OC6-HSL. [26] Белок LuxI синтезирует этот сигнал, который впоследствии высвобождается из клетки. Этот сигнал, 3OC6-HSL, затем связывается с белком LuxR, который регулирует экспрессию многих различных генов, но наиболее заметно повышение регуляции генов, участвующих в люминесценции. [27] Вторая система, обычно называемая системой ain , использует аутоиндуктор C8-HSL, который вырабатывается белком AinS. Подобно системе lux , аутоиндуктор C8-HSL увеличивает активацию LuxR. Кроме того, C8-HSL связывается с другим регулятором транскрипции, LitR, что дает системам ain и lux кворумного зондирования несколько разные генетические цели внутри клетки. [28]

Различные генетические цели систем ain и lux имеют важное значение, поскольку эти две системы реагируют на различные клеточные среды. Система ain регулирует транскрипцию в ответ на клеточные среды с промежуточной плотностью клеток, производя более низкие уровни люминесценции и даже регулируя метаболические процессы, такие как переключение ацетата. [29] Напротив, система lux quorum sensing возникает в ответ на высокую плотность клеток, производя высокие уровни люминесценции и регулируя транскрипцию дополнительных генов, включая QsrP, RibB и AcfA. [30] Обе системы ain и lux quorum sensing необходимы для колонизации кальмара и регулируют множественные факторы колонизации у бактерий. [27]

Активация оперона lux с помощью LuxR и LuxI в Aliivibrio fischeri  [31] [32]
(A) При низкой плотности клеток аутоиндукторы (3OC6-HSL – красные точки), продуцируемые LuxI, диффундируют через клеточную мембрану в среду роста
(B) По мере продолжения роста клеток аутоиндукторы в среде начинают накапливаться в ограниченной среде. Можно обнаружить очень низкую интенсивность света.
(C) Когда в среде накопилось достаточно аутоиндукторов, они могут повторно войти в клетку, где они напрямую связывают белок LuxR, чтобы активировать экспрессию luxICDABEG.
(D) Высокие уровни аутоиндукторов активируют люминесцентную систему A. fischeri . Можно обнаружить высокую интенсивность света.

Исследовательские приложения

A. fischeri имеет широкое применение в экотоксикологии и исследованиях окружающей среды. Его биолюминесценция наблюдается в богатых кислородом средах и, таким образом, он чувствителен к токсичным веществам. [33] Снижение светового излучения используется в биопробах, таких как тест Microtox для оценки качества воды. [34] Он играет ключевую роль в изучении эффектов химических смесей, помогая выявлять синергические или антагонистические токсические взаимодействия. [35] В биотехнологии его светопродуцирующий механизм используется для разработки биосенсоров , которые обнаруживают загрязнители окружающей среды в режиме реального времени, что делает его ценным инструментом в мониторинге загрязнения и исследованиях очистки воды. [36] Анализы ингибирования биолюминесценции A. fischeri можно использовать для измерения органических растворителей , тяжелых металлов , [37] полициклических ароматических углеводородов (ПАУ), пестицидов , [38] и общих нефтяных углеводородов (TPH). [39] Адаптация бактерий к конкурентной морской среде, где они могут производить уникальные биоактивные соединения, также может позиционировать их как полезные организмы для открытия новых антибиотиков из морских источников. [36]

Естественная трансформация

Естественная бактериальная трансформация — это адаптация для переноса ДНК из одной индивидуальной клетки в другую. Естественная трансформация, включая поглощение и включение экзогенной ДНК в геном реципиента , была продемонстрирована в A. fischeri . [40] Этот процесс индуцируется хитогексаозой и, вероятно, регулируется генами tfoX и tfoY . Естественная трансформация A. fischeri способствует быстрому переносу мутантных генов между штаммами и обеспечивает ценный инструмент для экспериментальной генетической манипуляции в этом виде. [ необходима цитата ]

Состояние микробов

В 2014 году сенатор штата Гавайи Гленн Вакай представил законопроект SB3124, предлагающий Aliivibrio fischeri в качестве государственного микроба Гавайев . [41] Законопроект конкурировал с законопроектом, выступающим за то, чтобы Flavobacterium akiainvivens получил такое же обозначение; в конечном итоге ни один из законопроектов не был принят. В 2017 году аналогичный законопроект, аналогичный первоначальному законопроекту 2013 года о F. akiainvivens , был представлен в Палату представителей Гавайев Айзеком Чоем [42] и в Сенат Гавайев Брайаном Танигучи , но A. fischeri не фигурировал ни в этом, ни в каких-либо более поздних предложениях. [43]

Список синонимов

  • Achromobacter fischeri (Beijerinck 1889) Bergey et al. 1930 год
  • Bacillus fischeri (Бейеринк, 1889 г.) Тревизан, 1889 г.
  • Bacteriumphosphorescens indigenus (Эйзенберг 1891) Честер 1897
  • Эйнхаймишер лейхтбацилла Фишера 1888 г.
  • Microspira fischeri (Бейеринк, 1889 г.) Честер, 1901 г.
  • Microspira marina (Рассел, 1892 г.) Мигула, 1900 г.
  • Фотобактерия fischeri Beijerinck 1889 г.
  • Vibrio noctiluca Weisglass and Skreb 1963 [1]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab "Aliivibrio fischeri". Таксономия NCBI . Бетесда, Мэриленд: Национальный центр биотехнологической информации . Получено 6 декабря 2017 г. Другие названия: синоним банка генов: Vibrio fischeri (Beijerinck 1889) Lehmann and Neumann 1896 (Утвержденные списки 1980 г.) синоним: Vibrio noctiluca Weisglass and Skreb 1963 синоним: Photobacterium fischeri Beijerinck 1889 синоним: Microspira marina (Russell 1892) Migula 1900 синоним: Microspira fischeri (Beijerinck 1889) Chester 1901 синоним: Einheimischer Leuchtbacillus Fischer 1888 синоним: Bacillus фосфоресценс indigenus Eisenberg 1891 синоним: Bacillus fischeri (Beijerinck 1889) Trevisan 1889 синоним: Achromobacter fischeri (Beijerinck) 1889) Бергей и др. 1930
  2. ^ ab Madigan M, Martinko J, ред. (2005). Brock Biology of Microorganisms (11-е изд.). Prentice Hall. ISBN 978-0-13-144329-7.
  3. ^ ab Christensen DG, Visick KL (июнь 2020 г.). "Vibrio fischeri: лабораторное культивирование, хранение и общие фенотипические анализы". Current Protocols in Microbiology . 57 (1): e103. doi : 10.1002/cpmc.103. ISSN  1934-8525. PMC 7337994. PMID 32497392  . 
  4. ^ Bergey DH (1994). Holt JG (ред.). Руководство Bergey по детерминантной бактериологии (9-е изд.). Балтимор: Williams & Wilkins.
  5. ^ Holt JG, ред. (1994). Руководство Берджи по детерминантной бактериологии (9-е изд.). Williams & Wilkins. ISBN 978-0-683-00603-2.
  6. ^ Garrity GM (2005). "The Proteobacteria, Часть B: The Gammaproteobacteria". Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том 2. Нью-Йорк: Springer. ISBN 0-387-24144-2.
  7. ^ abcdefg Dunn AK (2012-01-01), Poole RK (ред.), "Метаболизм Vibrio fischeri", Достижения в микробной физиологии , Достижения в бактериальной респираторной физиологии, 61 , Academic Press: 37– 68, doi : 10.1016/B978-0-12-394423-8.00002-0, ISBN 978-0-12-394423-8, PMID  23046951 , получено 2024-11-08
  8. ^ Urbanczyk H, Ast JC, Higgins MJ, Carson J, Dunlap PV (декабрь 2007 г.). «Реклассификация Vibrio fischeri, Vibrio logei, Vibrio salmonicida и Vibrio wodanis как Aliivibrio fischeri gen. nov., comb. nov., Aliivibrio logei comb. nov., Aliivibrio salmonicida comb. nov. и Aliivibrio wodanis comb. nov». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (ч. 12): 2823– 2829. doi : 10.1099/ijs.0.65081-0 . PMID  18048732.
  9. ^ "Вид: Aliivibrio fischeri" . lpsn.dsmz.de.​
  10. ^ Papaioannou KK, Hollensteiner J, Witte JK, Poehlein A, Daniel R (15.12.2022). Newton IL (ред.). "Полная последовательность генома типового штамма Aliivibrio fischeri DSM 507". Объявления о ресурсах по микробиологии . 11 (12): e0080122. doi :10.1128/mra.00801-22. ISSN  2576-098X. PMC 9753721. PMID 36354313  . 
  11. ^ Ruby EG, Urbanowski M, Campbell J, Dunn A, Faini M, Gunsalus R и др. (февраль 2005 г.). «Полная последовательность генома Vibrio fischeri: симбиотическая бактерия с патогенными конгенерами». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (8): 3004–3009 . Bibcode : 2005PNAS..102.3004R. doi : 10.1073 /pnas.0409900102 . PMC 549501. PMID  15703294. 
  12. ^ Septer AN, Visick KL (май 2024 г.). O'Toole G (ред.). «Освещая путь: как модельный микроб Vibrio fischeri раскрывает сложность «простейших» форм жизни Земли». Журнал бактериологии . 206 (5): e0003524. doi :10.1128/jb.00035-24. PMC 11112999. PMID 38695522  . 
  13. ^ ab Ruby EG, Urbanowski M, Campbell J, Dunn A, Faini M, Gunsalus R и др. (2005-02-22). "Полная последовательность генома Vibrio fischeri: симбиотическая бактерия с патогенными конгенерами". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (8): 3004–3009 . Bibcode : 2005PNAS..102.3004R. doi : 10.1073 /pnas.0409900102 . ISSN  0027-8424. PMC 549501. PMID  15703294. 
  14. ^ abc McFall-Ngai MJ (2014). «Значение микробов в развитии животных: уроки симбиоза кальмара и вибриона». Annual Review of Microbiology . 68 : 177– 194. doi : 10.1146/annurev-micro-091313-103654. PMC 6281398. PMID  24995875 . 
  15. ^ Norsworthy AN, Visick KL (ноябрь 2013 г.). «Gimme shelter: how Vibrio fischeri successful navigations an animal's multiple environments». Frontiers in Microbiology . 4 : 356. doi : 10.3389/fmicb.2013.00356 . PMC 3843225. PMID  24348467 . 
  16. ^ abc Nyholm SV, McFall-Ngai MJ (октябрь 2021 г.). «Длительный симбиоз: как гавайский бобтейл находит и удерживает своего биолюминесцентного бактериального партнера». Nature Reviews Microbiology . 19 (10): 666– 679. doi :10.1038/s41579-021-00567-y. ISSN  1740-1526. PMC 8440403. PMID 34089010  . 
  17. ^ abcde Jones BW, Нисигути МК (2004). «Контриллюминация у гавайского кальмара-кубика, Euprymna scolopes Berry (Mollusca: Cephalopoda)» (PDF) . Морская биология . 144 (6): 1151–1155 . Бибкод : 2004MarBi.144.1151J. дои : 10.1007/s00227-003-1285-3. S2CID  86576334.
  18. ^ Мияширо Т, Руби ЭГ (июнь 2012 г.). «Проливая свет на регуляцию биолюминесценции у Vibrio fischeri». Молекулярная микробиология . 84 (5): 795– 806. doi :10.1111/j.1365-2958.2012.08065.x. ISSN  0950-382X. PMC 3359415. PMID 22500943  . 
  19. ^ Гириш С., Рави Л. (январь 2023 г.). «Vibrio fischeri в органе света кальмара». В Dharumadurai D (ред.). Микробные симбионты . Academic Press. стр.  511– 520. doi :10.1016/B978-0-323-99334-0.00006-2. ISBN 978-0-323-99334-0.
  20. ^ Widder EA (май 2010 г.). «Биолюминесценция в океане: истоки биологического, химического и экологического разнообразия». Science . 328 (5979): 704– 708. Bibcode :2010Sci...328..704W. doi :10.1126/science.1174269. PMID  20448176. S2CID  2375135.
  21. ^ ab Winfrey MR (1997-01-01). Распутывание ДНК: молекулярная биология для лаборатории. Prentice-Hall. ISBN 978-0-13-270034-4.
  22. ^ ab Meighen EA (март 1991). «Молекулярная биология бактериальной биолюминесценции». Microbiological Reviews . 55 (1): 123– 42. doi :10.1128/mr.55.1.123-142.1991. PMC 372803 . PMID  2030669. 
  23. ^ Сильверман и др., 1984
  24. ^ ГенБанк
  25. ^ ab Waters CM, Bassler BL (2005). «Ощущение кворума: межклеточная коммуникация у бактерий». Annual Review of Cell and Developmental Biology . 21 : 319–346 . doi :10.1146/annurev.cellbio.21.012704.131001. PMID  16212498.
  26. ^ Эберхад А (1981). «Структурная идентификация аутоиндуктора люциферазы Photobacterium fischeri». Биохимия . 20 (9): 2444– 2449. doi :10.1021/bi00512a013. PMID  7236614. Получено 26.04.2020 .
  27. ^ ab Lupp C, Ruby EG (июнь 2005 г.). «Vibrio fischeri использует две системы восприятия кворума для регуляции ранних и поздних факторов колонизации». Журнал бактериологии . 187 (11): 3620–3629 . doi : 10.1128 /JB.187.11.3620-3629.2005 . PMC 1112064. PMID  15901683. 
  28. ^ Lupp C, Urbanowski M, Greenberg EP, Ruby EG (октябрь 2003 г.). «Системы восприятия кворума Vibrio fischeri ain и lux последовательно индуцируют экспрессию генов люминесценции и важны для сохранения в хозяине-кальмаре». Молекулярная микробиология . 50 (1): 319– 331. doi : 10.1046/j.1365-2958.2003.t01-1-03585.x . PMID  14507383.
  29. ^ Studer SV, Mandel MJ, Ruby EG (сентябрь 2008 г.). «AinS quorum sensing регулирует ацетатный переключатель Vibrio fischeri». Журнал бактериологии . 190 (17): 5915– 5923. doi :10.1128/JB.00148-08. PMC 2519518. PMID 18487321  . 
  30. ^ Qin N, Callahan SM, Dunlap PV, Stevens AM (июнь 2007 г.). «Анализ экспрессии гена регулона LuxR во время определения кворума у ​​Vibrio fischeri». Журнал бактериологии . 189 (11): 4127– 4134. doi :10.1128/JB.01779-06. PMC 1913387. PMID 17400743  . 
  31. ^ Li Z, Nair SK (октябрь 2012 г.). «Ощущение кворума: как бактерии могут координировать активность и синхронизировать свой ответ на внешние сигналы?». Protein Science . 21 (10): 1403–1417 . doi :10.1002/pro.2132. PMC 3526984. PMID  22825856 . 
  32. ^ Tanet L, Tamburini C, Baumas C, Garel M, Simon G, Casalot L (2019). «Бактериальная биолюминесценция: эмиссия света в Photobacteriumphosphoreum не находится под контролем кворум-сенсинга». Frontiers in Microbiology . 10 : 365. doi : 10.3389/fmicb.2019.00365 . PMC 6409340. PMID  30886606 .  Материал скопирован из этого источника, который доступен по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International.
  33. ^ Erzinger GS, Schmoeller F, Pinto LH, Américo L, Hemmersbach R, Hauslage J, et al. (2018), «Биолюминесцентные системы в экологических биосенсорах», Bioassays , Elsevier, стр.  241–262 , doi :10.1016/b978-0-12-811861-0.00012-7, ISBN 978-0-12-811861-0, получено 21.11.2024
  34. ^ Backhaus T, Froehner K, Altenburger R, Grimme LH (1997-12-01). "Тестирование токсичности с Vibrio Fischeri: сравнение долгосрочного (24 ч) и краткосрочного (30 мин) биоанализа". Chemosphere . 35 (12): 2925– 2938. Bibcode :1997Chmsp..35.2925B. doi :10.1016/S0045-6535(97)00340-8. ISSN  0045-6535.
  35. ^ dos Santos CR, Rosa e Silva GO, Valias Cd, Santos LV, Amaral MC (2024-10-01). "Экотоксикологическое исследование семи фармацевтически активных соединений: эффекты смеси и оценка экологического риска". Aquatic Toxicology . 275 : 107068. Bibcode : 2024AqTox.27507068D. doi : 10.1016/j.aquatox.2024.107068. ISSN  0166-445X. PMID  39217790.
  36. ^ ab Алессандра Нарцисо, Анна Барра Караччиоло, Паола Гренни, Жасмин Раузео, Луиза Патролекко, Франческа Спатаро, Ливия Мариани, Применение бактериального биоанализа Aliivibrio fischeri для оценки отдельных и смешанных эффектов антибиотиков и меди, FEMS Microbiology Ecology, том 99, выпуск 11, ноябрь 2023 г., fiad125, https://doi.org/10.1093/femsec/fiad125
  37. ^ Fulladosa E, Murat JC, Villaescusa I (2005-02-01). «Исследование токсичности бинарных эквитоксичных смесей металлов с использованием люминесцентных бактерий Vibrio fischeri в качестве биологической мишени». Chemosphere . 58 (5): 551– 557. doi :10.1016/j.chemosphere.2004.08.007. ISSN  0045-6535. PMID  15620748.
  38. ^ Фернандес-Альба А.Р., Эрнандо Гиль М., Лопес Г.Д., Чисти Ю. (январь 2002 г.). «Сравнительная оценка действия пестицидов в люминесцентных биоанализах острой токсичности». Аналитика Химика Акта . 451 (2): 195–202 . doi :10.1016/S0003-2670(01)01422-2.
  39. ^ Мирджани М, Солеймани М, Салари В (2021-01-01). «Оценка токсичности общих нефтяных углеводородов в водной среде с использованием биолюминесцентной бактерии Aliivibrio fischeri». Экотоксикология и экологическая безопасность . 207 : 111554. doi : 10.1016/j.ecoenv.2020.111554 . ISSN  0147-6513. PMID  33254411.
  40. ^ Pollack-Berti A, Wollenberg MS, Ruby EG (август 2010 г.). «Естественная трансформация Vibrio fischeri требует tfoX и tfoY». Environmental Microbiology . 12 (8): 2302– 2311. Bibcode : 2010EnvMi..12.2302P. doi : 10.1111 /j.1462-2920.2010.02250.x. PMC 3034104. PMID  21966921. 
  41. ↑ Cave J (3 апреля 2014 г.). «Гавайи и другие штаты делают ставку на официальные государственные бактерии». Huffington Post . Получено 24 октября 2017 г.
  42. ↑ Choy I (25 января 2017 г.). "HB1217". Законодательное собрание штата Гавайи . Гонолулу, Гавайи: Законодательное собрание штата Гавайи . Получено 22 октября 2017 г.
  43. ^ Танигучи Б. (25 января 2017 г.). «SB1212». Законодательное собрание штата Гавайи . Гонолулу, Гавайи: Законодательное собрание штата Гавайи . Получено 22 октября 2017 г.
  • Светоорганный симбиоз Vibrio fischeri и гавайского кальмара Euprymna scolopes
  • Межклеточная коммуникация и lux-оперон у Vibrio fischeri
  • TED Talks - Бонни Басслер о том, как общаются бактерии Архивировано 26.09.2016 в Wayback Machine
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Aliivibrio_fischeri&oldid=1265828725"