Вентральный передний гомеобокс 1 — это белок , который у людей кодируется геном VAX1 . [ 5] [6] [7]
Функция
Этот ген, по-видимому, влияет на развитие переднего мозга у людей. Он также присутствует у мышей и лягушек Xenopus , что предполагает длительную эволюционную историю, и у этих организмов его экспрессия ограничена передним мозгом, зрительными и обонятельными областями. [8]
Ген VAX1 является фактором транскрипции , который имеет гомеодомен , расположенный в позиции аминокислот 100-159, и богатую Ala область, расположенную в позиции аминокислот 216-253 гена. Исследования экспрессии на мышах показывают, что он экспрессируется в нёбе , колобоме в зрительной системе, базальном теленцефалоне , зрительном стебле и зрительных полях глаза, где он экспрессируется вместе с генами Shh и Bmp4 . [8] [9] [10]
Клиническое значение
Сообщалось, что у мышей с гомозиготными мутациями VAX1 наблюдаются черепно-лицевые пороки развития, включая волчью пасть . [11]
Исследования ассоциаций по всему геному ( GWAS ) выявили значимые ассоциации между несиндромными расщелинами и однонуклеотидными полиморфизмами в гене VAX1. [12] [13] Исследования репликации подтвердили эти ассоциации в различных группах населения [14] [15]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000148704 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000006270 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Hallonet M, Hollemann T, Wehr R, Jenkins NA, Copeland NG, Pieler T, Gruss P (август 1998 г.). «Vax1 — это новый ген, содержащий гомеобокс, экспрессируемый в развивающейся передней вентральной части переднего мозга». Development . 125 (14): 2599– 610. doi :10.1242/dev.125.14.2599. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-FCE1-A . PMID 9636075.
^ Барбьери А.М., Лупо Г., Бульфоне А., Андреаццоли М., Мариани М., Фужерусс Ф., Консалес Г.Г., Борсани Г., Бекманн Дж.С., Барсакки Г., Баллабио А., Банфи С. (октябрь 1999 г.). «Генеобокс vax2 контролирует формирование паттерна дорсовентральной оси глаза». Proc Natl Acad Sci США . 96 (19): 10729– 34. Бибкод : 1999PNAS...9610729B. дои : 10.1073/pnas.96.19.10729 . ЧВК 17951 . ПМИД 10485894.
^ ab Hallonet M, Hollemann T, Wehr R, Jenkins NA, Copeland NG, Pieler T, Gruss P (июль 1998 г.). «Vax1 — это новый ген, содержащий гомеобокс, экспрессируемый в развивающейся передней вентральной части переднего мозга». Development . 125 (14): 2599– 610. doi :10.1242/dev.125.14.2599. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-FCE1-A . PMID 9636075.
^ Zhao L, Saitsu H, Sun X, Shiota K, Ishibashi M (2010). «Sonic hedgehog участвует в формировании вентрального глазного бокала, ограничивая экспрессию Bmp4 дорсальным доменом». Mech. Dev . 127 ( 1– 2): 62– 72. doi : 10.1016/j.mod.2009.10.006. hdl : 2433/120557 . PMID 19854269. S2CID 14409164.
^ Bertuzzi S, Hindges R, Mui SH, O'Leary DD, Lemke G (декабрь 1999 г.). «Гомеодоменный белок Vax1 необходим для направления аксонов и формирования основных путей в развивающемся переднем мозге». Genes Dev . 13 (23): 3092– 105. doi :10.1101/gad.13.23.3092. PMC 317177. PMID 10601035 .
^ Hallonet M, Hollemann T, Pieler T, Gruss P (декабрь 1999 г.). «Vax1, новый ген, содержащий гомеобокс, направляет развитие базального переднего мозга и зрительной системы». Genes Dev . 13 (23): 3106– 14. doi :10.1101/gad.13.23.3106. PMC 317183. PMID 10601036 .
^ Mangold E, Ludwig KU, Birnbaum S и др. (январь 2010 г.). «Исследование ассоциаций по всему геному выявляет два локуса восприимчивости к несиндромной расщелине губы с расщелиной неба или без нее». Nat. Genet . 42 (1): 24– 6. doi : 10.1038/ng.506 . PMID 20023658.
^ Beaty TH, Murray JC, Marazita ML и др. (июнь 2010 г.). «Исследование ассоциаций генома расщелины губы с расщелиной неба и без нее выявляет варианты риска вблизи MAFB и ABCA4». Nat. Genet . 42 (6): 525– 9. doi :10.1038/ng.580. PMC 2941216 . PMID 20436469.
^ Никопензиус Т., Бирнбаум С., Людвиг К. У. и др. (июнь 2010 г.). «Локус восприимчивости к несиндромной расщелине губы с расщелиной неба или без нее на хромосоме 10q25 создает риск у эстонских пациентов». Eur. J. Oral Sci . 118 (3): 317– 9. doi :10.1111/j.1600-0722.2010.00741.x. PMID 20572868.
^ Rojas-Martinez A, Reutter H, Chacon-Camacho O, et al. (Июль 2010). «Генетические факторы риска несиндромной расщелины губы с расщелиной неба или без нее в популяции Мезоамерики: доказательства наличия IRF6 и вариантов в 8q24 и 10q25». Birth Defects Res. A . 88 (7): 535– 7. doi :10.1002/bdra.20689. PMID 20564431.
Дальнейшее чтение
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV и др. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ человеческой хромосомы 10». Nature . 429 (6990): 375– 81. Bibcode :2004Natur.429..375D. doi : 10.1038/nature02462 . PMID 15164054.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
