U12 минорная сплайсосомная РНК

РНК-семейство
U12 минорная сплайсосомная РНК
Идентификаторы
СимволУ12
РфамРФ00007
Другие данные
Тип РНКГен ; мяРНК ; сплайсинг
ДоменыЭукариоты
ИДТИGO:0000371 GO:0045131 GO:0005693
ТАКSO:0000399
Структуры PDBПДБе

U12 минорная сплайсосомная РНК образуется из U12 малой ядерной ( мяРНК ) вместе с U4atac / U6atac , U5 и U11 мяРНК и связанными с ними белками, образует сплайсосому , которая расщепляет дивергентный класс малочисленных пре -мРНК интронов . Хотя последовательность U12 сильно отличается от последовательности U2 , эти две функционально аналогичны. [1]

Структура

Опубликована предсказанная вторичная структура РНК U12. [2] Однако показанная здесь альтернативная одиночная шпилька на 3'-конце, по-видимому, лучше соответствует выравниванию расходящихся последовательностей Drosophila melanogaster и Arabidopsis thaliana . [3] Вырезанные последовательности интронов U12 собраны в биологической базе данных, называемой базой данных интронов U12 .

Ссылки

  1. ^ Tarn WY, Steitz JA (апрель 1997 г.). «Сплайсинг пре-мРНК: открытие новой сплайсосомы удваивает сложность». Trends in Biochemical Sciences . 22 (4): 132–7 . doi : 10.1016/S0968-0004(97)01018-9 . PMID  9149533.
  2. ^ Shukla GC, Padgett RA (апрель 1999). «Сохранение функциональных особенностей U6atac и U12 snRNAs между позвоночными и высшими растениями». RNA . 5 (4): 525–38 . doi :10.1017/S1355838299982213. PMC 1369779 . PMID  10199569. 
  3. ^ Otake LR, Scamborova P, Hashimoto C, Steitz JA (февраль 2002 г.). «Расходящаяся сплайсосома типа U12 необходима для сплайсинга пре-мРНК и необходима для развития у Drosophila». Molecular Cell . 9 (2): 439– 46. doi : 10.1016/S1097-2765(02)00441-0 . PMID  11864616.
  • Страница для U12 минорной сплайсосомной РНК в Rfam


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=U12_minor_spliceosomal_RNA&oldid=1226862493"