Сплайсосомная РНК U5
| Сплайсосомная РНК U5 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности U5 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | У5 |
| Рфам | РФ00020 |
| Другие данные | |
| Тип РНК | Ген ; мяРНК ; сплайсинг |
| Домены | Эукариоты |
| ИДТИ | GO:0000351 GO:0000353 GO:0005682 GO:0046540 |
| ТАК | SO:0000395 |
| Структуры PDB | ПДБе |
U5 snRNA — это малая ядерная РНК (snRNA), которая участвует в сплайсинге РНК в качестве компонента сплайсосомы . Она образует U5 snRNP ( малый ядерный рибонуклеопротеин ), связываясь с несколькими белками, включая Prp8 — самый большой и наиболее консервативный белок в сплайсосоме, Brr2 — геликазу, необходимую для активации сплайсосомы, Snu114 и 7 белков Sm. [1] U5 snRNA образует коаксиально сложенную серию спиралей, которые выступают в активный центр сплайсосомы. [2] [3] Петля 1, которая закрывает эту серию спиралей, образует 4-5 пар оснований с 5'-экзоном во время двух химических реакций сплайсинга. [4] [5] Это взаимодействие, по-видимому, особенно важно на втором этапе сплайсинга, лигировании экзонов. [6]
Ссылки
- ^ Stevens SW, Barta I, Ge HY, Moore RE, Young MK, Lee TD, Abelson J (ноябрь 2001 г.). «Биохимический и генетический анализ малых ядерных рибонуклеопротеинов U5, U6 и U4/U6 x U5 из Saccharomyces cerevisiae». РНК . 7 (11): 1543–53. PMC 1370197. PMID 11720284 .
- ^ Нгуен Т.Х., Галей В.П., Бай XC, Савва К.Г., Ньюман А.Дж., Шерес С.Х., Нагай К. (июль 2015 г.). «Архитектура сплайсосомного три-мяРНП U4/U6.U5». Природа . 523 (7558): 47–52. Бибкод : 2015Natur.523...47N. дои : 10.1038/nature14548. ПМК 4536768 . ПМИД 26106855.
- ^ Yan C, Hang J, Wan R, Huang M, Wong CC, Shi Y (сентябрь 2015 г.). «Структура дрожжевой сплайсосомы при разрешении 3,6 ангстрема». Science . 349 (6253): 1182–91. Bibcode :2015Sci...349.1182Y. doi :10.1126/science.aac7629. PMID 26292707. S2CID 22194712.
- ^ Newman AJ, Norman C (февраль 1992). «U5 snRNA взаимодействует с экзонными последовательностями в 5' и 3' сайтах сплайсинга». Cell . 68 (4): 743–54. doi :10.1016/0092-8674(92)90149-7. PMID 1739979. S2CID 3328508.
- ^ Sontheimer EJ, Steitz JA (декабрь 1993 г.). «Малые ядерные РНК U5 и U6 как компоненты активного сайта сплайсосомы». Science . 262 (5142): 1989–96. Bibcode :1993Sci...262.1989S. doi :10.1126/science.8266094. PMID 8266094.
- ^ O'Keefe RT, Norman C, Newman AJ (август 1996 г.). «Инвариантная последовательность петли 1 мяРНК U5 необязательна для первого каталитического шага сплайсинга пре-мРНК в дрожжах». Cell . 86 (4): 679–89. doi : 10.1016/s0092-8674(00)80140-3 . PMID 8752221. S2CID 17484887.
Дальнейшее чтение
- Zwieb C (январь 1997). "База данных uRNA". Nucleic Acids Research . 25 (1): 102–3. doi :10.1093/nar/25.1.102. PMC 146409. PMID 9016512 .
- Thomas J, Lea K, Zucker-Aprison E, Blumenthal T (май 1990 г.). «Сплайсеосомные мяРНК Caenorhabditis elegans». Nucleic Acids Research . 18 (9): 2633–42. doi :10.1093/nar/18.9.2633. PMC 330746. PMID 2339054 .
Внешние ссылки
- Страница для сплайсосомальной РНК U5 в Rfam
 | Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
