TYRP1
Фермент
TYRP1
Идентификаторы
ПсевдонимыTYRP1 , CAS2, CATB, GP75, OCA3, TRP, TRP1, TYRP, b-протеин, белок 1, родственный тирозиназе
Внешние идентификаторыОМИМ : 115501; МГИ : 98881; гомологен : 464; Генные карты : TYRP1; OMA :TYRP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

7306

22178

Ансамбль

ENSG00000107165

ENSMUSG00000005994

UniProt

Р17643

Р07147

RefSeq (мРНК)

NM_000550

НМ_001282014
НМ_001282015
НМ_031202

RefSeq (белок)

NP_000541

НП_001268943
НП_001268944
НП_112479

Местоположение (UCSC)Хр 9: 12.69 – 12.71 МбХр 4: 80,75 – 80,77 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 1, родственный тирозиназе , также известный как TYRP1 , представляет собой межмембранный фермент , который у людей кодируется геном TYRP1 . [ 5] [6]

Функция

Tyrp1 — это меланоцит -специфический генный продукт, участвующий в синтезе меланина в меланосомах . [7] Большинство Tyrp1 обладают оксидазной активностью 5,6-дигидроксииндол-2-карбоновой кислоты (меланогенного промежуточного продукта). [8] Каталитическая функция Tyrp1 в человеческих меланоцитах менее ясна. Tyrp1 участвует в стабилизации белка тирозиназы и модулировании его каталитической активности. [7] Tyrp1 также участвует в поддержании структуры меланосом и влияет на пролиферацию меланоцитов и гибель меланоцитов. [9] Меланоциты происходят из нервного гребня и мигрируют в лежащую выше эпидермальную эктодерму развивающегося организма, которая формирует кожу и волосы. [10] Таким образом, Tyrp1 влияет на экспрессию меланина, особенно в коже и волосах организма.

Ген Tyrp1 также имеет некодирующую функцию, которая косвенно способствует пролиферации клеток опухоли меланомы, особенно при высокой экспрессии в клетке. [11] мРНК Tyrp1 взаимодействует с miR-16 и влияет на его способность подавлять гены, участвующие в образовании клеток меланомы. [11]

Клиническое значение

Мутации в гене Tyrp1 у мышей связаны с коричневой шерстью , а в гене TYRP1 у человека — с окулокутантным альбинизмом типа 3 (OCA3). [9] Аллель TYRP1, распространенный у жителей Соломоновых Островов, приводит к светлым волосам. Хотя фенотип похож на североевропейские светлые волосы, этот аллель не встречается у европейцев. [12] [13] Более позднее исследование, Ju et al. 2020, показало, что аллель TYRP1 был выбран в европейской популяции. [14]

Исследование Нортона и соавторов 2016 года показало, что TYRP1 не связан со светлым цветом волос у меланезийцев, поскольку многие популяции в Океании не имеют аллелей TYRP1, но все равно демонстрируют светлую пигментацию; исследование показывает, что дополнительные неизвестные аллели способствуют фенотипу светлой пигментации у меланезийцев. [15]

Изменения гена Tyrp1 отвечают за некоторые из различных фенотипов внешнего вида кожи и шерсти у разных животных. У далматинцев черный цвет пятен по сравнению с «печеночным» обусловлен генетической изменчивостью гена TYRP1. [16] Определенная делеция в гене Tyrp1 домашней китайско-тибетской свиньи приводит к «коричневой окраске» кожи и шерсти свиньи в отличие от «черного» фенотипа дикого типа. [17] У карпа цвета Оуцзян мутации гена Tyrp1 повлияли на выражение «серого» или «коричневого» фенотипического цвета чешуи. [18]

Повышенные уровни экспрессии гена Tyrp1 также связаны с неблагоприятным исходом для пациентов, страдающих меланомой. [11] Роль Tyrp1 в прогрессировании меланомы была определена путем сравнения линий клеток «нокаута», которые имеют неактивный Tyrp1, с клетками с нормальным и высокоэкспрессированным Tyrp1. [11] Такие исследования дают представление о возможном клиническом использовании и лечении меланомы посредством регуляции экспрессии Tyrp1 в клетках. [11]

Регулирование

Экспрессия TYRP1 регулируется фактором транскрипции, ассоциированным с микрофтальмией (MITF). [19] [20]

Взаимодействия

Было показано, что TYRP1 взаимодействует с GIPC1 . [21]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000107165 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000005994 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ EntrezGene 7306
  6. ^ Box NF, Wyeth JR, Mayne CJ, O'Gorman LE, Martin NG, Sturm RA (январь 1998 г.). «Полное исследование последовательности и полиморфизма гена TYRP1 человека, кодирующего белок 1, связанный с тирозиназой». Mammalian Genome . 9 (1): 50–53 . doi :10.1007/s003359900678. PMID  9434945. S2CID  10020827.
  7. ^ ab Kobayashi T, Imokawa G, Bennett DC, Hearing VJ (ноябрь 1998 г.). "Стабилизация тирозиназы с помощью Tyrp1 (белок коричневого локуса)". Журнал биологической химии . 273 (48): 31801– 31805. doi : 10.1074/jbc.273.48.31801 . PMID  9822646.
  8. ^ Хименес-Сервантес C, Солано F, Кобаяши T, Урабе K, Хеаринг VJ, Лозано JA, Гарсия-Боррон JC (июль 1994). "Новая ферментативная функция в меланогенном пути. Активность оксидазы 5,6-дигидроксииндол-2-карбоновой кислоты тирозиназного белка-1 (TRP1)". Журнал биологической химии . 269 (27): 17993– 18000. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32408-0 . PMID  8027058.
  9. ^ ab Sarangarajan R, Boissy RE (декабрь 2001 г.). "Tyrp1 и окулокутанный альбинизм типа 3". Pigment Cell Research . 14 (6): 437– 444. doi : 10.1034/j.1600-0749.2001.140603.x . PMID  11775055.
  10. ^ Mayer TC (сентябрь 1973 г.). «Миграционный путь клеток нервного гребня в кожу эмбрионов мышей». Developmental Biology . 34 (1): 39– 46. doi :10.1016/0012-1606(73)90337-0. PMID  4595498.
  11. ^ abcde Жило Д., Миго М., Башло Л., Журне Ф., Рожье А., Донну-Фурне Э. и др. (ноябрь 2017 г.). «Некодирующая функция мРНК TYRP1 способствует росту меланомы» (PDF) . Природная клеточная биология . 19 (11): 1348–1357 . doi : 10.1038/ncb3623. PMID  28991221. S2CID  23539385.
  12. ^ Bhanoo SN (3 мая 2012 г.). «Еще одна генетическая причуда Соломоновых островов: светлые волосы». The New York Times . Получено 3 мая 2012 г.
  13. ^ Kenny EE, Timpson NJ, Sikora M, Yee MC, Moreno-Estrada A, Eng C и др. (май 2012 г.). «Меланезийские светлые волосы вызваны изменением аминокислоты в TYRP1». Science . 336 (6081): 554. Bibcode :2012Sci...336..554K. doi :10.1126/science.1217849. PMC 3481182 . PMID  22556244. 
  14. ^ Ju, Dan; Mathieson, Iain (21 декабря 2020 г.). «Эволюция вариаций, связанных с пигментацией кожи, в Западной Евразии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 118 (1). doi : 10.1073/pnas.2009227118 . PMC 7817156. PMID  33443182 . 
  15. ^ Norton HL, Hanna M, Werren E, Friedlaender J (май 2016 г.). «ОНП rs387907171 в TYRP1 не связан со светлым цветом волос на острове Бугенвиль». American Journal of Human Biology . 28 (3): 431– 435. doi :10.1002/ajhb.22795. PMID  26450459. S2CID  13727757.
  16. ^ Cargill EJ, Famula TR, Schnabel RD, Strain GM, Murphy KE (июль 2005 г.). «Цвет пятен далматина: доказательства сцепления в поддержку гена TYRP1». BMC Veterinary Research . 1 (1): 1. doi : 10.1186/1746-6148-1-1 . PMC 1192828. PMID  16045797 . 
  17. ^ Ren J, Mao H, Zhang Z, Xiao S, Ding N, Huang L (май 2011 г.). «Делеция 6 пар оснований в гене TYRP1 вызывает фенотип коричневой окраски у китайских местных свиней». Наследственность . 106 (5): 862– 868. doi :10.1038/hdy.2010.129. PMC 3186233. PMID  20978532 . 
  18. ^ Chen H, Wang J, Du J, Mandal BK, Si Z, Xu X и ​​др. (август 2021 г.). «Анализ недавно дублированных генов TYRP1 и их влияние на образование черных пятен у карпа обыкновенного цвета Oujiang (Cyprinus carpio var. color)». Animal Genetics . 52 (4): 451– 460. doi :10.1111/age.13071. PMID  33939849. S2CID  233720032.
  19. ^ Fang D, Tsuji Y, Setaluri V (июль 2002 г.). «Избирательная регуляция гена семейства тирозиназ TYRP1 путем ингибирования активности фактора транскрипции меланоцитов, MITF». Nucleic Acids Research . 30 (14): 3096–3106 . doi :10.1093/nar/gkf424. PMC 135745. PMID  12136092 . 
  20. ^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO и др. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF, идентифицированные с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Pigment Cell & Melanoma Research . 21 (6): 665– 676. doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . PMID  19067971.
  21. ^ Liu TF, Kandala G, Setaluri V (сентябрь 2001 г.). «PDZ-доменный белок GIPC взаимодействует с цитоплазматическим хвостом меланосомального мембранного белка gp75 (тирозиназный белок-1)». Журнал биологической химии . 276 (38): 35768– 35777. doi : 10.1074/jbc.M103585200 . PMID  11441007.

Дальнейшее чтение

  • Sarangarajan R, Boissy RE (декабрь 2001 г.). «Tyrp1 и окулокутанный альбинизм типа 3». Pigment Cell Research . 14 (6): 437– 444. doi : 10.1034/j.1600-0749.2001.140603.x . PMID  11775055.
  • Lowings P, Yavuzer U, Goding CR (август 1992 г.). «Положительные и отрицательные элементы регулируют меланоцит-специфический промотор». Молекулярная и клеточная биология . 12 (8): 3653– 3662. doi :10.1128/MCB.12.8.3653. PMC  364632. PMID  1321344 .
  • Shibata K, Takeda K, Tomita Y, Tagami H, Shibahara S (апрель 1992 г.). «Нижележащая область гена белка, связанного с тирозиназой человека, усиливает его промоторную активность». Biochemical and Biophysical Research Communications . 184 (2): 568– 575. doi :10.1016/0006-291X(92)90627-W. PMID  1575733.
  • Murty VV, Bouchard B, Mathew S, Vijayasaradhi S, Houghton AN (май 1992). «Присвоение локуса TYRP (коричневого) человека участку хромосомы 9p23 методом нерадиоактивной гибридизации in situ». Genomics . 13 (1): 227– 229. doi :10.1016/0888-7543(92)90228-K. PMID  1577487.
  • Colman MA, Shibahara S, Kwon B, Jenkins T, Ramsay M (февраль 1991 г.). "Двухаллельный XbaI RFLP в локусе каталазы 2". Nucleic Acids Research . 19 (4): 960. doi :10.1093/nar/19.4.960-a. PMC  333744. PMID  1673236 .
  • Halaban R, Moellmann G (июнь 1990 г.). «Гены пигментации блокусов мыши и человека кодируют гликопротеин (gp75) с каталазной активностью». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4809– 4813. Bibcode : 1990PNAS...87.4809H. doi : 10.1073 /pnas.87.12.4809 . PMC  54207. PMID  1693779.
  • Abbott C, Jackson IJ, Carritt B, Povey S (октябрь 1991 г.). «Человеческий гомолог гена brown мыши картируется на коротком плече хромосомы 9 и расширяет известную область гомологии с хромосомой 4 мыши». Genomics . 11 (2): 471– 473. doi :10.1016/0888-7543(91)90160-G. PMID  1769662.
  • Chintamaneni CD, Ramsay M, Colman MA, Fox MF, Pickard RT, Kwon BS (июль 1991 г.). «Картирование гена CAS2 человека, гомолога локуса brown (b) мыши, на хромосоме 9p22-pter человека». Biochemical and Biophysical Research Communications . 178 (1): 227– 235. doi :10.1016/0006-291X(91)91803-K. PMID  1906272.
  • Urquhart A (октябрь 1991 г.). "Карбоксильный конец человеческого тирозиназоподобного белка (TYRL): более тесная гомология с мышиным белком, чем сообщалось ранее". Nucleic Acids Research . 19 (20): 5803. doi :10.1093/nar/19.20.5803. PMC  329017 . PMID  1945866.
  • Cohen T, Muller RM, Tomita Y, Shibahara S (май 1990). "Нуклеотидная последовательность кДНК, кодирующей белок, связанный с тирозиназой человека". Nucleic Acids Research . 18 (9): 2807– 2808. doi :10.1093/nar/18.9.2807. PMC  330768. PMID  2111010 .
  • Виджаясарадхи С., Бушар Б., Хоутон АН. (апрель 1990 г.). «Меланомный антиген gp75 — человеческий гомолог генного продукта мышиного локуса b (brown)». Журнал экспериментальной медицины . 171 (4): 1375– 1380. doi :10.1084/jem.171.4.1375. PMC 2187848.  PMID 2324688  .
  • Бокс НФ, Штурм РА (декабрь 1994 г.). "Полиморфизм динуклеотидных повторов в локусе TYRP1 человека". Молекулярная генетика человека . 3 (12): 2270. doi :10.1093/hmg/3.12.2270. PMID  7881448.
  • Orlow SJ, Zhou BK, Chakraborty AK, Drucker M, Pifko-Hirst S, Pawelek JM (август 1994 г.). «Высокомолекулярные формы тирозиназы и связанные с тирозиназой белки: доказательства меланогенного комплекса». Журнал исследовательской дерматологии . 103 (2): 196–201 . doi : 10.1111/1523-1747.ep12392743 . PMID  8040609.
  • Sturm RA, O'Sullivan BJ, Box NF, Smith AG, Smit SE, Puttick ER и др. (сентябрь 1995 г.). «Хромосомная структура локусов TYRP1 и TYRP2 человека и сравнение семейства генов белков, связанных с тирозиназой». Genomics . 29 (1): 24– 34. doi :10.1006/geno.1995.1211. PMID  8530077.
  • Boissy RE, Zhao H, Oetting WS, Austin LM, Wildenberg SC, Boissy YL и др. (июнь 1996 г.). «Мутация и отсутствие экспрессии тирозиназо-связанного белка-1 (TRP-1) в меланоцитах у человека с коричневым окулокутантным альбинизмом: новый подтип альбинизма, классифицируемый как «OCA3»». American Journal of Human Genetics . 58 (6): 1145– 1156. PMC  1915069 . PMID  8651291.
  • Manga P, Kromberg JG, Box NF, Sturm RA, Jenkins T, Ramsay M (ноябрь 1997 г.). «Рыжий окулокутанный альбинизм у южноафриканских чернокожих вызван мутациями в гене TYRP1». American Journal of Human Genetics . 61 (5): 1095– 1101. doi :10.1086/301603. PMC  1716031 . PMID  9345097.
  • Box NF, Wyeth JR, Mayne CJ, O'Gorman LE, Martin NG, Sturm RA (январь 1998 г.). «Полное исследование последовательности и полиморфизма гена TYRP1 человека, кодирующего белок 1, связанный с тирозиназой». Mammalian Genome . 9 (1): 50–53 . doi :10.1007/s003359900678. PMID  9434945. S2CID  10020827.
  • Bertolotto C, Buscà R, Abbe P, Bille K, Aberdam E, Ortonne JP, Ballotti R (февраль 1998 г.). «Различные цис-действующие элементы участвуют в регуляции активности промотора TRP1 и TRP2 циклическим AMP: основная роль M-боксов (GTCATGTGCT) и микрофтальмии». Молекулярная и клеточная биология . 18 (2): 694–702 . doi :10.1128/mcb.18.2.694. PMC  108780. PMID  9447965 .
  • Abe T, Sato M, Tamai M (декабрь 1998 г.). «Дедифференциация ретинального пигментного эпителия по сравнению с пролиферативными мембранами пролиферативной витреоретинопатии». Current Eye Research . 17 (12): 1103– 1109. doi :10.1076/ceyr.17.12.1103.5126. PMID  9872531.
  • Commo S, Bernard BA (август 2000 г.). «Оборот субпопуляции меланоцитов во время цикла роста волос у человека: иммуногистохимическое исследование». Pigment Cell Research . 13 (4): 253– 259. doi :10.1034/j.1600-0749.2000.130407.x. PMID  10952393.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P17643 (оксидаза 5,6-дигидроксииндол-2-карбоновой кислоты) на сайте PDBe-KB .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=TYRP1&oldid=1259860148"