Трепонема
Род бактерий

Трепонема
Спирохеты «Treponema pallidum»
Спирохеты Treponema pallidum
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Спирохеты
Сорт:Спирохетия
Заказ:Спирохеты
Семья:Трепонемовые
Род:Трепонема
Шаудинн, 1905 г., исправление. Абт, Гёкер и Кленк 2013 г.
Типовой вид
Бледная трепонема
(Шаудин и Хоффманн 1905) Шаудин 1905
Виды [1]

См. текст

Синонимы
  • " Спиронема " Вильмин 1905 г. не Клебс 1892 г. не Леже и Гессен 1922 г. не Рафинеск 1838 г. не Хохст. 1842 г. не Линдли 1840 г. не Мик 1864 г.
  • « Микроспиронема » Стайлз и Пфендер 1905

Treponema — род спиралевидных бактерий. Основным видом трепонем, патогенных для человека, является Treponema pallidum , подвиды которого вызывают такие заболевания, как сифилис , беджель и фрамбезия . Treponema carateum является причиной пинты . [2] Treponema paraluiscuniculi связана с сифилисом у кроликов . [3] Treponema succinifaciens была обнаружена в микробиоме кишечника традиционных сельских популяций людей. [4]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [5] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [1]

LTP на основе 16S рРНК _10_2024 [6] [7] [8]120 маркерных белков на основе GTDB 09-RS220 [9] [10] [11]
Трепонемовые

Gracilinema Caldarium (Pohlschröder, Leschine & Canale-Parola 1995) Brune et al. 2022 год

Zuelzera stenostrepta (Zuelzer 1912) Brune et al. 2022 год

Breznakiella homolactica Song et al. 2022 год

Treponema primitia Graber, Leadbetter & Breznak, 2004 г.

Helmutkoenigia isoptericolens (Dröge et al. 2008) Brune et al. 2022 год

Leadbettera azotonutricia (Graber et al. 2004) Brune et al. 2022

Brucepastera parasyntrophica Сонг и др. 2023

Teretinema zuelzerae (Canale-Parola 1980) Song et al. 2023 год

Трепонема

T. средний Умемото и др. 1997

T. phagedenis (Noguchi 1912) Brumpt 1922 ex Kuhnert et al. 2020 год

T. pedis Эванс и др. 2009

T. denticola (Flügge 1886) Brumpt 1925 ex Chan et al. 1993 год

T. putidum Вайс и др. 2004

SS
Трепонема

Т. brennaborense Schrank et al. 1999 год

Т. lecitinolyticum Wyss et al. 1999 год

T. maltophilum Вайс и др. 1996

Т. ruminis Newbrook et al. 2017 год

Т. saccharophilum Paster & Canale-Parola 1986 г.

T. rectale Стэйтон и др. 2017

Т. peruense Belkhou et al. 2021 год

T. succinifaciens Cwyk и Canale-Parola 1981

Т. berlinense Nordhoff et al. 2005 г.

T. pectinovorum Смиберт и Бурмейстер 1983

Т. Брайанти Стэнтон и Канале-Парола, 1980 г.

T. porcinum Nordhoff et al. 2005 г.

Т. amylovorum Wyss et al. 1997 год

Т. parvum Wyss et al. 2001 нон Добелл 1912

Т. Сокранский

Т. с. Паредис Смайберт, Джонсон и Рэнни, 1984 г.

T. s. buccale Smibert, Johnson & Ranney 1984

Т. с. сокранский Смиберт, Джонсон и Рэнни, 1984 г.

Видовая группа 2
Breznakiellaceae
Трепонемовые

Brucepastera parasyntrophica

Teretinema zuelzerae

« Ca. Avitreponema avistercoris» Gilroy et al. 2021 год

Трепонема

Т. педис

Т. дентикола

Т. путадум

Т. средний

" T. vincentii " (Бланшар, 1906 г.) Брампт, 1922 г., экс Смайберт, 1984 г.

T. pallidum (Schaudinn & Hoffmann 1905) Schaudinn 1905 [вкл. Treponema paraluiscuniculi (Jacobsthal 1920) Smibert 1974 ]

Т. phagedenis

SS

« Ca. Gallitreponema excrementavium» Gilroy et al. 2021 год

Трепонема

« Ca. Treponema faecavium» Gilroy et al. 2021 год

Трепонема бреннаборенсе

« Ca. Treponema excrementipullorum» Gilroy et al. 2021 год

Трепонема парвум

Трепонема брайанти

Трепонема свиная

Трепонема Сокранского

Treponema socranskii буккале

Treponema socranskii paredis

Трепонема ректальная

Трепонема перуанская

Т. succinifaciens

Трепонема берлинская

Трепонема гребневидная

Трепонема руминис

Трепонема сахарофильная

« Treponema zioleckii » Пикнова и др. 2008 год

Видовая группа 2
SS

Нераспределенные виды трепонем :

  • « Ca. T. caballi» Гилрой и др. 2022 год
  • T. calligyrum Ногучи 1913
  • T. carateum Brumpt 1939 ( трепонема , вызывающая пинту )
  • « Ca.T.equi » Gilroy et al. 2022 г. нет (Новий и Напп 1906 г.) Ногучи 1928 г.
  • « Ca. T. equifaecale» Гилрой и др. 2022
  • « Ca. T. внутриклеточный» Ohkuma et al. 2015 исправлен. Орен и др. 2020 год
  • " T. legeri " (Дюбоск и Лебайи, 1912 г.) Зульцер, 1925 г.
  • " Т. macrodentium " Ногучи 1912 г.
  • « Ca. T. merdequi» Гилрой и др. 2022 год
  • Т. paraluisleporis Lumeij et al. 1994 год
  • Т. Пертеню (Кастеллани, 1905 г.) Кастеллани и Чалмерс, 1910 г.
  • T. refringens (Шаудинн и Хофманн, 1905) Кастеллани и Чалмерс
  • " Ca. T. scatequi" Гилрой и др. 2022
  • " T. scoliodonta " (Hoffmann 1920) Ногучи 1928 бывший Смиберт 1984
  • « Т. stenella » Балик и др. 2023 год
  • « Ca. T. suis» Молбак и др. 2006 г. нон Куюмгиев и Спасова 1967 г.
  • « Ca.T.teratonymphae » Noda et al. 2018 год
  • « Т. тримеродонта » (Хоффманн, 1920 г.) Прево, 1940 г.

Виды Treponema hyodysenteriae и Treponema innocens были реклассифицированы в Brachyspira hyodysenteriae и Brachyspira innocens . [12]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Sayers; et al. "Treponema". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2023-03-20 .
  2. ^ Antal GM, Lukehart SA, Meheus AZ (январь 2002 г.). «Эндемические трепонематозы». Microbes Infect . 4 (1): 83– 94. doi :10.1016/S1286-4579(01)01513-1. PMID  11825779.
  3. ^ Harper KN, Liu H, Ocampo PS и др. (август 2008 г.). «Последовательность гена белка кислотного повтора (arp) отличает венерические подвиды Treponema pallidum от невенерических, и ген развился под сильным положительным отбором в подвиде, вызывающем сифилис». FEMS Immunol. Med. Microbiol . 53 (3): 322– 32. doi : 10.1111/j.1574-695X.2008.00427.x . PMID  18554302.
  4. ^ Angelakis E, Bachar D, Yasir M, Musso D, Djossou F, Gaborit B и др. (январь 2019 г.). «Виды Treponema обогащают микробиоту кишечника традиционного сельского населения, но отсутствуют у городских жителей». Новые микробы и новые инфекции . 27 : 14–21 . doi :10.1016/j.nmni.2018.10.009. PMC 6276622. PMID  30555706 . (В настоящее время эта статья вызывает обеспокоенность , см. doi :10.1016/j.nmni.2024.101401, PMID  38799921, Retraction Watch . Если это преднамеренная ссылка на такую ​​статью, замените на . ){{expression of concern|...}}{{expression of concern|...|intentional=yes}}
  5. ^ JP Euzéby. "Treponema". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 2023-03-20 .
  6. ^ "The LTP" . Получено 10 декабря 2024 г. .
  7. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 10 декабря 2024 г. .
  8. ^ "LTP_10_2024 Release Notes" (PDF) . Получено 10 декабря 2024 г. .
  9. ^ "GTDB release 09-RS220". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  10. ^ "bac120_r220.sp_labels". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  11. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  12. ^ Стэнтон ТБ, Дженсен Н.С., Кейси Т.А., Тордофф Л.А., Дьюхерст Ф.Е., Пастер Б.Дж. (январь 1991 г.). «Реклассификация Treponema hyodysenteriae и Treponema innocens в новый род Serpula gen. nov., как Serpula hyodysenteriae com. nov. и Serpula innocens com. nov.». Межд. Дж. Сист. Бактериол . 41 (1): 50–8 . doi : 10.1099/00207713-41-1-50 . ПМИД  1704792.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Treponema&oldid=1271593575"