Транспортин 1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ТНПО1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыТНПО1 , ИПО2, КПНБ2, МИП, МИП1, ТРН, Транспортин 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 602901; МГИ : 2681523; гомологен : 5358; Генные карты : TNPO1; ОМА :TNPO1 – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

3842

238799

Ансамбль

ENSG00000083312

ENSMUSG00000009470

UniProt

Q92973

Q8BFY9

РефСек (мРНК)

NM_002270
NM_153188

NM_001048267
NM_178716

RefSeq (белок)

NP_001041732
NP_848831

Местоположение (UCSC)Хр 5: 72.82 – 72.92 МбХр 13: 98.98 – 99.06 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Транспортин-1 (или импортин-β 2 ) — это белок , который у людей кодируется геном TNPO1 . [ 5] [6] [7]

Функция

Этот белок является кариоферином , который взаимодействует с последовательностью ядерной локализации для нацеливания ядерных белков на ядро. Классический комплекс рецептора кариоферина, такой как комплекс, который использует Importin-β1 (кодируемый геном KPNB1 ), является гетеродимером альфа-субъединицы, которая распознает сигнал ядерной локализации, и бета-субъединицы, которая прикрепляет комплекс к нуклеопоринам. Однако Transportin-1 может напрямую связываться с белками-грузами и может не нуждаться в альфа-субъединице импортина для этого. [8]

Предполагается, что транспортин-1 использует тот же принципиальный механизм для осуществления ядерного транспорта, что и другие импортины. Он опосредует стыковку с комплексом ядерной поры посредством связывания с нуклеопорином и впоследствии транслоцируется через пору с помощью механизма, требующего энергии. Затем в ядре Ran связывается с Transportin-1, он диссоциирует от груза, и Transportin-1 реэкспортируется из ядра в цитоплазму, где гидролиз GTP высвобождает Ran. Затем Transportin-1 свободен для связывания нового груза.

Кроме того, транспортин-1 участвует в содействии транспорту белков в первичную ресничку . [9] Считается, что функция транспортина-1 в этом случае аналогична переносу белков в ядро ​​через ядерную пору. Транспортин-1 связывает груз, а затем помогает этому грузу пройти через пору в основании реснички. Ran и нуклеопорины также участвуют в этом механизме. [10]

Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные белки. [7]

Цели

Транспортин 1 (TRN1) является частью неклассического пути ядерного импорта. В сочетании с каскадом гидролиза RanGTP TRN1 действует для импорта ряда белков в ядро ​​клеток. Эти мишени обычно содержат мотив PY, также известный как сигнал ядерной локализации M9. Хорошо описанные примеры включают hnRNP A1 . [11]

Тип грузовых белков, которые транспортин 1 может переносить в ядро, включает РНК-связывающие белки (такие как hnRNP A1 и hnRNP F), а также рибосомальные белки. [12]

Клиническое значение

TRN1 участвует в патогенезе двух нейродегенеративных заболеваний, а именно бокового амиотрофического склероза и лобно-височной деменции . [13]

Взаимодействия

Было показано, что транспортин 1 взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000083312 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000009470 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Pollard VW, Michael WM, Nakielny S, Siomi MC, Wang F, Dreyfuss G (декабрь 1996 г.). «Новый путь импорта ядерного белка, опосредованный рецептором». Cell . 86 (6): 985–94. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80173-7 . PMID  8808633. S2CID  15666255.
  6. ^ Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (июнь 1997 г.). «Karyopherin beta2 mediates nuclear import of a mRNA binding protein». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (10): 5055–60. Bibcode :1997PNAS...94.5055B. doi : 10.1073/pnas.94.10.5055 . PMC 24630 . PMID  9144189. 
  7. ^ ab «Ген Энтрез: транспортин 1 TNPO1» .
  8. ^ RA Fridell (1997). Ядерный импорт hnRNP A1 опосредован новым клеточным кофактором, связанным с кариоферином-бета . Journal of Cell Science 1997 110: 1325-1331;
  9. ^ Toby W. Hurd (2011). Локализация пигментного ретинита 2 в ресничках регулируется Importin β2 . J Cell Sci 2011 124: 718-726; doi: 10.1242/jcs.070839
  10. ^ Kee HL (2012). Барьер проницаемости с исключением размера и нуклеопорины характеризуют комплекс цилиарных пор, который регулирует транспорт в реснички. . Nat. Cell Biol. 2012 Mar 4;14(4):431-7. doi: 10.1038/ncb2450.
  11. ^ Дорманн Д., Родде Р., Эдбауэр Д., Бентманн Э., Фишер И., Хруша А., Тан М.Е., Маккензи И.Р., Капелл А., Шмид Б., Нойманн М., Хаас С. (август 2010 г.). «Мутации, связанные с БАС, слитые с саркомой (FUS), нарушают ядерный импорт, опосредованный транспортином». ЭМБО Дж . 29 (16): 2841–57. дои : 10.1038/emboj.2010.143. ПМЦ 2924641 . ПМИД  20606625. 
  12. ^ Энн-Кристин Стрём (2001). Импортин-бета-подобные ядерные транспортные рецепторы . Genome Biol. 2001; 2(6): обзоры3008.1–обзоры3008.9.
  13. ^ Brelstaff J, Lashley T, Holton JL, Lees AJ, Rossor MN , Bandopadhyay R, Revesz T (ноябрь 2011 г.). «Транспортин1: маркер FTLD-FUS». Acta Neuropathol . 122 (5): 591–600. doi :10.1007/s00401-011-0863-6. PMID  21847626. S2CID  5913873.
  14. ^ Cai Y, Miao SY, Wang LF (октябрь 2001 г.). «[Определение места связывания специфичного для яичек нуклеопорина BS-63 с транспортином (кароферин бета 2) и доказательство их сочетания in vitro]». Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Bao (на китайском языке). 23 (5): 462–6. PMID  12905863.
  15. ^ Chook YM, Blobel G (май 1999). "Структура ядерного транспортного комплекса кариоферин-бета2-Ran x GppNHp". Nature . 399 (6733): 230–7. Bibcode :1999Natur.399..230C. doi :10.1038/20375. PMID  10353245. S2CID  4413233.
  16. ^ Shamsher MK, Ploski J, Radu A (октябрь 2002 г.). «Кариоферин бета 2B участвует в экспорте мРНК из ядра». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (22): 14195–9. Bibcode :2002PNAS...9914195S. doi : 10.1073/pnas.212518199 . PMC 137860 . PMID  12384575. 

Дальнейшее чтение

  • Букринский МИ, Хаффар ОК (1997). "Ядерный импорт ВИЧ-1: в поисках лидера". Front. Biosci . 2 (4): d578-87. doi : 10.2741/A213 . PMID  9366553.
  • Букринский М.И., Хаффар О.К. (1998). «Ядерный импорт ВИЧ-1: матричный белок снова в центре внимания, на этот раз вместе с Vpr». Mol. Med . 4 (3): 138–43. doi :10.1007/BF03401911. PMC  2230352. PMID  9562972 .
  • Букринский МИ, Шарова Н, Демпси МП, Стэнвик ТЛ, Букринская АГ, Хаггерти С, Стивенсон М (1992). "Активный ядерный импорт преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека типа 1". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 89 (14): 6580–4. Bibcode :1992PNAS...89.6580B. doi : 10.1073/pnas.89.14.6580 . PMC  49545 . PMID  1631159.
  • Moroianu J, Hijikata M, Blobel G, Radu A (1995). "Гетеродимеры кариоферина альфа 1 бета и альфа 2 бета млекопитающих: субъединица альфа 1 или альфа 2 связывает сигнал ядерной локализации, а субъединица бета взаимодействует с нуклеопоринами, содержащими пептидный повтор". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (14): 6532–6. Bibcode :1995PNAS...92.6532M. doi : 10.1073/pnas.92.14.6532 . PMC  41552 . PMID  7604027.
  • Букринский МИ, Хаггерти С, Демпси МП, Шарова Н, Аджубель А, Шпиц Л, Льюис П, Голдфарб Д, Эмерман М, Стивенсон М (1993). «Сигнал ядерной локализации в белке матрицы ВИЧ-1, который управляет инфекцией неделящихся клеток». Nature . 365 (6447): 666–9. Bibcode :1993Natur.365..666B. doi :10.1038/365666a0. PMC  9524217 . PMID  8105392. S2CID  25678.
  • Michael WM, Choi M, Dreyfuss G (1995). «Сигнал ядерного экспорта в hnRNP A1: сигнально-опосредованный, зависящий от температуры путь экспорта ядерного белка». Cell . 83 (3): 415–22. doi : 10.1016/0092-8674(95)90119-1 . PMID  8521471. S2CID  615927.
  • Nakielny S, Siomi MC, Siomi H, Michael WM, Pollard V, Dreyfuss G (1996). «Транспортин: ядерный транспортный рецептор нового пути импорта ядерного белка». Exp. Cell Res . 229 (2): 261–6. doi : 10.1006/excr.1996.0369 . PMID  8986607.
  • Fridell RA, Truant R, Thorne L, Benson RE, Cullen BR (1997). «Ядерный импорт hnRNP A1 опосредован новым клеточным кофактором, связанным с кариоферином-бета». J. Cell Sci . 110 (11): 1325–31. doi :10.1242/jcs.110.11.1325. PMID  9202393.
  • Gallay P, Hope T, Chin D, Trono D (1997). "Инфекция ВИЧ-1 неделящихся клеток через распознавание интегразы путем импортина/кариоферина". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (18): 9825–30. Bibcode :1997PNAS...94.9825G. doi : 10.1073/pnas.94.18.9825 . PMC  23276 . PMID  9275210.
  • Siomi MC, Eder PS, Kataoka N, Wan L, Liu Q, Dreyfuss G (1997). «Транспортин-опосредованный ядерный импорт гетерогенных ядерных белков RNP». J. Cell Biol . 138 (6): 1181–92. doi :10.1083/jcb.138.6.1181. PMC  2132560. PMID  9298975 .
  • Henderson BR, Percipalle P (1997). "Взаимодействие между ВИЧ Rev и факторами ядерного импорта и экспорта: сигнал ядерной локализации Rev опосредует специфическое связывание с человеческим импортином-бета". J. Mol. Biol . 274 (5): 693–707. doi :10.1006/jmbi.1997.1420. PMID  9405152.
  • Эфтимиадис А., Бриггс Л.Дж., Янс Д.А. (1998). «Последовательность ядерной локализации Tat ВИЧ-1 придает новые свойства ядерного импорта». J. Biol. Chem . 273 (3): 1623–8. doi : 10.1074/jbc.273.3.1623 . PMID  9430704.
  • Водичка МА, Кепп ДМ, Сильвер ПА, Эмерман М (1998). "ВИЧ-1 Vpr взаимодействует с ядерным транспортным путем, способствуя инфицированию макрофагов". Genes Dev . 12 (2): 175–85. doi :10.1101/gad.12.2.175. PMC 316441.  PMID 9436978  .
  • Popov S, Rexach M, Zybarth G, Reiling N, Lee MA, Ratner L, Lane CM, Moore MS, Blobel G, Bukrinsky M (1998). «Вирусный белок R регулирует ядерный импорт преинтеграционного комплекса ВИЧ-1». EMBO J . 17 (4): 909–17. doi :10.1093/emboj/17.4.909. PMC  1170440 . PMID  9463369.
  • Попов С., Рексач М., Ратнер Л., Блобель Г., Букринский М. (1998). «Вирусный белок R регулирует стыковку преинтеграционного комплекса ВИЧ-1 с комплексом ядерной поры». J. Biol. Chem . 273 (21): 13347–52. doi : 10.1074/jbc.273.21.13347 . PMID  9582382.
  • Фушье РА, Мейер БЕ, Саймон ДЖХ, Фишер У, Олбрайт А.В., Гонсалес-Скарано Ф, Малим МХ (1998). «Взаимодействие белка Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1 с комплексом ядерной поры». J. Virol . 72 (7): 6004–13. doi :10.1128 / JVI.72.7.6004-6013.1998. PMC  110405. PMID  9621063.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Transportin_1&oldid=1191424328"