РГПД5

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
РГПД5
Идентификаторы
ПсевдонимыRGPD5 , BS-63, BS63, HEL161, RGP5, RANBP2-подобный и домен GRIP, содержащий 5, RANBP2-подобный и домен GRIP, содержащий 5
Внешние идентификаторыОМИМ : 612708; МГИ : 894323; гомологен : 87808; Генные карты : RGPD5; OMA :RGPD5 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_005054
NM_032260

NM_011240

RefSeq (белок)

NP_005045
NP_115636

NP_035370

Местоположение (UCSC)Хр 2: 109,79 – 109,86 МбХр 10: 58.28 – 58.33 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 5, содержащий домен RANBP2 и GRIP, представляет собой белок , который у людей кодируется геном RGPD5 . [5] [6] [7]

RAN — это небольшой GTP-связывающий белок суперсемейства RAS, который связан с ядерной мембраной и, как полагают, контролирует множество клеточных функций посредством взаимодействия с другими белками. Этот ген имеет высокую степень идентичности последовательности с RANBP2, большим RAN-связывающим белком, локализованным на цитоплазматической стороне комплекса ядерной поры. Считается, что этот член семейства генов RANBP2 возник в результате дупликации на 3 Мб дистальнее RANBP2. Для этого локуса наблюдался альтернативный сплайсинг, и описаны два варианта. Предполагается дополнительный сплайсинг, но полная последовательность для дальнейших транскриптов не была определена. [7]

Взаимодействия

Было показано, что RGPD5 взаимодействует с транспортином 1. [8 ]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000015568 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000003226 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Ciccarelli FD, von Mering C, Suyama M, Harrington ED, Izaurralde E, Bork P (март 2005 г.). «Сложные геномные перестройки приводят к новой функции генов приматов». Genome Research . 15 (3): 343–51 . doi :10.1101/gr.3266405. PMC 551560. PMID  15710750 . 
  6. ^ Hillier LW, Graves TA, Fulton RS, Fulton LA, Pepin KH, Minx P, et al. (Апрель 2005). «Создание и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Nature . 434 (7034): 724– 31. Bibcode :2005Natur.434..724H. doi : 10.1038/nature03466 . PMID  15815621.
  7. ^ ab "Ген Entrez: RGPD5 RANBP2-подобный и домен GRIP, содержащий 5".
  8. ^ Cai Y, Miao SY, Wang LF (октябрь 2001 г.). «[Определение места связывания специфичного для яичек нуклеопорина BS-63 с транспортином (кароферин бета 2) и доказательство их сочетания in vitro]». Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae . 23 (5): 462– 6. PMID  12905863.

Дальнейшее чтение

  • Cai Y, Miao SY, Wang LF (октябрь 2001 г.). «[Определение места связывания специфичного для яичек нуклеопорина BS-63 с транспортином (кароферин бета 2) и доказательство их сочетания in vitro]». Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae . 23 (5): 462– 6. PMID  12905863.
  • Cai Y, Gao Y, Sheng Q, Miao S, Cui X, Wang L, Zong S, Koide SS (январь 2002 г.). «Характеристика и потенциальная функция нового специфичного для яичек нуклеопорина BS-63». Molecular Reproduction and Development . 61 (1): 126– 34. doi :10.1002/mrd.1139. PMID  11774384. S2CID  23631919.
  • Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Дж, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блёкер Х, Бауэрсакс С, Блюм Х, Лаубер Дж, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б, Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК  311072 . PMID  11230166.
  • Wang LF, Zhu HD, Miao SY, Cao DF, Wu YW, Zong SD, Koide SS (1999). «Молекулярное клонирование и характеристика нового специфического для яичек гена, связанного с нуклеопорином». Архивы андрологии . 42 (2): 71– 84. doi : 10.1080/014850199262904 . PMID  10101573.
  • Nothwang HG, Rensing C, Kübler M, Denich D, Brandl B, Stubanus M, Haaf T, Kurnit D, Hildebrandt F (февраль 1998 г.). «Идентификация нового гена, связанного с связывающим белком Ran 2 (RANBP2L1), и обнаружение кластера генов на хромосоме человека 2q11-q12». Genomics . 47 (3): 383–92 . doi :10.1006/geno.1997.5119. PMID  9480752.


Получено с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RGPD5&oldid=1142690503"