N-концевой домен терпенсинтазы
| Терпеновый_синтезатор | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 (+)-борнилдифосфатсинтаза: комплекс с мг и продуктом | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Терпеновый_синтезатор | ||||||||
| Пфам | ПФ01397 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001906 | ||||||||
| СКОП2 | 5eau / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии этот домен белка принадлежит к семейству терпенсинтаз (TPS). Его роль заключается в синтезе терпенов , которые являются частью первичного метаболизма , таких как стерины и каротин , а также частью вторичного метаболизма. В этой статье мы сосредоточимся на N-концевом домене белка TPS.
Функция
Терпенсинтазы играют роль в производстве важных молекул в метаболизме, эти молекулы являются частью большой группы, называемой терпеноидами . В частности, N-концевой домен имеет особенность активного центра копалилдифосфатсинтазы (CPS). [1]
Структура
N-концевой домен образует альфа-ствол, аналогичный таковому у эпиаристолохенсинтазы сесквитерпенциклазы. [2]
Сохранение
Последовательности, содержащие этот домен белка , принадлежат к семейству терпенсинтаз . Было предложено обозначить это семейство генов как tps (терпенсинтазы). Сравнение последовательностей выявило сходство между монотерпеновыми (C 10 ) синтазами, сесквитерпеновыми (C 15 ) синтазами и дитерпеновыми (C 20 ) синтазами. На основе филогении они были разделены на шесть подгрупп, называемых Tpsa-Tpsf . [3]
- Tpsa включает в себя ветиспиридиенсинтазу . [4]
- Tpsb включает (-)-лимоненсинтазу . [5]
- Tpsc включает копалилдифосфатсинтазу ( кауренсинтазу А ). [6]
- Tpsd включает таксадиенсинтазу , [7] пиненсинтазу , [8] и мирценсинтазу . [9]
- Tpse включает энт-кауренсинтазу B. [ 10]
- Tpsf включает S-линалоолсинтазу . [11] У гриба Phaeosphaeria sp. (штамм L487) синтез энт-каурена из геранилгеранилдофосфата стимулируется одним бифункциональным белком . [12]
Смотрите также
Терпенсинтаза C-концевой домен
Ссылки
- ^ Chen F, Tholl D, Bohlmann J, Pichersky E (2011). «Семейство терпеновых синтазы в растениях: среднее по размеру семейство генов для специализированного метаболизма, которое сильно диверсифицировано по всему королевству». Plant J . 66 (1): 212– 29. doi : 10.1111/j.1365-313X.2011.04520.x . PMID 21443633.
- ^ Whittington DA, Wise ML, Urbansky M, Coates RM, Croteau RB, Christianson DW (2002). «Борнилдифосфатсинтаза: структура и стратегия манипулирования карбокатионами терпеноидциклазой». Proc Natl Acad Sci USA . 99 (24): 15375– 80. Bibcode : 2002PNAS...9915375W. doi : 10.1073/pnas.232591099 . PMC 137724. PMID 12432096 .
- ^ Bohlmann J, Steele CL, Croteau R (август 1997 г.). «Монотерпеновые синтазы из пихты большой (Abies grandis). Выделение кДНК, характеристика и функциональная экспрессия мирценсинтазы, (-)-(4S)-лимоненсинтазы и (-)-(1S,5S)-пиненсинтазы». J. Biol. Chem . 272 (35): 21784– 92. doi : 10.1074/jbc.272.35.21784 . PMID 9268308.
- ^ [1], 5-эпи-аристолохенсинтаза, [2] и (+)-дельта-кадиненсинтаза SWISSPROT
- ^ Hyatt, DC; Youn, B.; Zhao, Y.; Santhamma, B.; Coates, RM; Croteau, RB; Kang, C. (2007). "Предшественник 4S-лимоненсинтазы - Mentha spicata (Spearmint)". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (13). Uniprot.org: 5360– 5. doi : 10.1073 /pnas.0700915104 . PMC 1838495. PMID 17372193. Получено 02.08.2012 .
- ^ Ait-Ali, T.; Swain, SM; Reid, JB; Sun, T.; Kamiya, Y. (1997). "Энт-копалилдифосфатсинтаза, предшественник хлоропластов - Pisum sativum (садовый горошек)". The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology . 11 (3). Uniprot.org: 443–54 . doi : 10.1046/j.1365-313X.1997.11030443.x . PMID 9107034. Получено 02.08.2012 .
- ^ Wildung, MR; Croteau, R. (1996). "Таксадиенсинтаза - Taxus brevifolia (тихоокеанский тис)". Журнал биологической химии . 271 (16). Uniprot.org: 9201– 4. doi : 10.1074/jbc.271.16.9201 . PMID 8621577. S2CID 3191132. Получено 02.08.2012 .
- ^ "Пиненсинтаза, предшественник хлоропластов - Abies grandis (пихта великая)". Uniprot.org . Получено 2012-08-02 .
- ^ "Мирценсинтаза, предшественник хлоропластов - Abies grandis (пихта великая)". Uniprot.org . Получено 2012-08-02 .
- ^ Ямагучи, С.; Сайто, Т.; Абэ, Х.; Ямане, Х.; Мурофуши, Н.; Камия, Й. (1996). "Энт-каур-16-ен синтаза, предшественник хлоропластов - Cucurbita maxima (тыква)". The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology . 10 (2). Uniprot.org: 203– 13. doi :10.1046/j.1365-313X.1996.10020203.x. PMID 8771778. Получено 02.08.2012 .
- ^ "Линалоолсинтаза - Clarkia concinna (Красные ленты)". Uniprot.org . Получено 2012-08-02 .
- ^ Kawaide H, Imai R, Sassa T, Kamiya Y (август 1997 г.). "Ent-кауренсинтаза из грибка Phaeosphaeria sp. L487. Выделение кДНК, характеристика и бактериальная экспрессия бифункциональной дитерпенциклазы в биосинтезе грибкового гиббереллина". J. Biol. Chem . 272 (35): 21706– 12. doi : 10.1074/jbc.272.35.21706 . PMID 9268298.
