Шаблон обсуждения:Инфобокс фермент

Запрос на полузащищенное редактирование от 24 сентября 2014 г.

Пожалуйста, измените запись BRENDA на ссылку BRENDA, которая устарела. Ach brenda (обсуждение) 09:49, 24 сентября 2014 (UTC) [ ответить ]

Готово Stickee (обсуждение) 01:09, 25 сентября 2014 (UTC) [ ответить ]


Пожалуйста, измените AmiGO на AmiGO, ссылка устарела Momeara ( обсуждение ) 18:04, 15 января 2015 (UTC) [ ответить ]

Выполнено{{U| Технический 13 }} ( etc ) 22:41, 15 января 2015 (UTC) [ ответить ]

Обсуждение отношения к{{Информационный бокс белок}}

Обсуждение Википедии:WikiProject Molecular and Cell Biology#Infobox for энзим против белка DMacks ( обсуждение ) 14:59, 3 апреля 2017 (UTC) [ ответить ]

Не могли бы вы добавить ссылку PDBj в структуры PDB (data12)? Описание должно быть следующим:

[https://pdbj.org/mine/sql?query=SELECT+pdbid+FROM+entity+WHERE+entity.pdbx_ec%3D%27{{{EC_number}}}%27 PDBj]

Cudo29 (обсуждение) 07:18, 5 апреля 2018 (UTC) [ ответить ]

Текущая ссылка не работает.
Извините, еще один момент — почему требуется номер EC? Не всем ферментам обязательно должен быть присвоен номер EC.
Еще один момент, не по теме, но, может быть, вы могли бы помочь. Есть новый класс EC 7. Это означает, что многие ферменты были переназначены, и поэтому их номера EC должны быть изменены каким-то BOT. Может ли кто-нибудь помочь с этим?
-- HlTo CZ (обсуждение) 08:42, 22 марта 2019 (UTC) [ ответить ]

Я обновил ссылку на номер EC (первая ссылка в инфобоксе), чтобы она снова работала. Есть ли список номеров EC, которые были переведены в класс EC 7? При наличии списка должно быть просто заставить бота обновить эти инфобоксы. Большинство связанных баз данных доступны для поиска по номеру EC, поэтому, если у вас есть номер EC, ссылаться на эти базы данных намного проще. Номер EC не является строго обязательным, но если он доступен, остальные ссылки инфобокса автоматически активируются. Без номера EC ни одна из этих ссылок не отображается. Boghog ( talk ) 16:32, 22 марта 2019 (UTC) [ ответить ]
Согласно BRENDA, похоже, что ферменты категории EC 3.6.3 переносятся в транслоказы EC 7.-.-.-. Boghog ( обсуждение ) 06:47, 23 марта 2019 (UTC) [ ответ ]
Первый фермент EC 7, Ag+-экспортирующая АТФаза , теперь перемещен в EC 7.2.2.15. Я заметил, что ссылка BRENDA, например, не работает. Похоже, что не все внешние базы данных еще обновлены. Boghog ( talk ) 07:57, 23 марта 2019 (UTC) [ ответить ]

Исправь, амиго

  • Измените ссылку AMIGO с http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/go.cgi?query={{{GO_code}}}&view=details на http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:{{{GO_code}}} Artoria 2e5 🌉 20:53, 4 мая 2019 (UTC) [ ответить ]
  •  Исправлено в этой правке. Спасибо, что указали на проблему. Ура. Boghog ( обсуждение ) 11:01, 5 мая 2019 (UTC) [ ответить ]

Запрос на редактирование защищен шаблоном от 22 января 2020 г.

Пожалуйста, измените [[PRIAM фермент-специфические профили|PRIAM]] на [[PRIAM фермент-специфические профили|PRIAM]], чтобы исключить ненужное перенаправление. Colonies Chris ( обсуждение ) 21:58, 22 января 2020 (UTC) Colonies Chris ( обсуждение ) 21:58, 22 января 2020 (UTC) [ ответ ]

 Готово - FlightTime ( открытый канал ) 22:23, 22 января 2020 (UTC) [ ответить ]
Спасибо. Colonies Chris ( обсуждение ) 09:06, 23 января 2020 (UTC) [ ответить ]

Запрос на редактирование защищен шаблоном 19 декабря 2020 г.

Ссылка NiceZyme плохая. Заменить

| label8 = [[ExPASy]]| data8 = {{#if:{{{EC_number|}}}| [http://www.expasy.org/enzyme/{{{EC_number}}} NiceZyme view] }}

с

| label8 = [[ExPASy]]| data8 = {{#if:{{{EC_number|}}}| [https://enzyme.expasy.org/EC/{{{EC_number}}} NiceZyme view] }}

Artoria 2e5 🌉 15:27, 19 декабря 2020 (UTC) [ ответить ]

 Сделано wub "?!" 13:24, 20 декабря 2020 (UTC) [ ответить ]
@ Artoria2e5 и The wub : Недавно я, возможно, зашел на страницу Template:Infobox_enzyme/testcases и попытался получить доступ к некоторым внешним ссылкам шаблона в веб-браузере. Возможно, я размышлял (среди прочего) о том, существуют ли какие-либо HTTP-URL-адреса, которые перенаправляли бы на HTTPS-URL-адрес. Еще я ввел некоторые внешние ссылки шаблона, по одной за раз, в инструмент httpstatus, чтобы посмотреть, сгенерирует ли URL-адрес одно или несколько перенаправлений. Особый интерес представляет то, генерирует ли URL-адрес одно или несколько перенаправлений HTTP 301 (перемещено навсегда). Недавно я изменил шаблон на использование HTTPS при генерации ссылки ExPASy. --Elegie ( talk ) 09:31, 23 декабря 2020 (UTC) [ ответить ]

Запрос на редактирование защищен шаблоном 1 мая 2021 г.

Чтобы исправить ссылку RCSB PDB, используйте следующую строку ссылки 49:

[http://www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=EnzymeClassificationQuery&Enzyme_Classification={{{EC_number}}} RCSB PDB]

следует обновить до этого URL:

[https://www.rcsb.org/search?q=rcsb_polymer_entity.rcsb_ec_lineage.id:{{{EC_number}}}}} RCSB PDB]

bonob ( обсуждение ) 20:24, 1 мая 2021 (UTC) [ ответить ]

 Готово * Pppery * началось... 04:25, 2 мая 2021 (UTC) [ ответить ]

Поскольку ExplorEnz — официальная база данных, курируемая IUBMB (и всегда более актуальная, чем Expasy и т. д.), мне кажется, что ее следует связать с шаблоном фермента. Я не решаюсь сам возиться с шаблоном, так как не хочу нарушать работу тысяч статей, которые его вызывают, и в любом случае, возможно, поскольку он защищен, я не смогу его редактировать, даже если захочу.

Таблица тогда будет иметь ExplorEnz в левом столбце и запись ExplorEnz EC 1.1.1.1 в правом столбце (для алкогольдегидрогеназы). Будет ли это легко реализовать? Athel cb ( talk ) 08:59, 4 июля 2022 (UTC) [ ответить ]

Привет, @ Athel cb : Я только что увидел этот твой запрос. Вскоре после твоего запроса на WT:MOLBIO было похожее обсуждение , я думаю, независимое, если хочешь, вмешайся: WT:MOLBIO#Нужны_нам_два_шаблона_для_внешних_ссылок_на_базы_данных_EC_number?
Я думал, что попробую заняться обеими темами, используя ExplorEnz вместо iubmb.qmul.ac.uk в информационном поле и объединив {{ EnzExplorer }} и {{ EC number }} (в настоящее время указывающие на ExPASy) в шаблон ExplorEnz. bonob ( talk ) 18:42, 24 июля 2022 (UTC) [ ответить ]
Да, я думаю, что это было независимо, но любопытное совпадение, что оба появились более или менее одновременно. В любом случае, спасибо за ссылку на обсуждение WT:MOLBIO , о котором я не знал до сегодняшнего дня. Я добавлю свои комментарии к этому. (Я уже сделал это сегодня утром, но мой браузер завис в середине операции.) Athel cb ( talk ) 08:05, 25 июля 2022 (UTC) [ ответить ]

 Done @ Athel cb : Поскольку ExplorEnz, по-видимому, является текущей официальной базой данных номенклатуры ферментов IUBMB, я изменил внешнюю ссылку идентификатора EC в {{ Infobox genetics }} с https://iubmb.qmul.ac.uk/enzyme/ на https://www.enzyme-database.org/ в этой правке. Также обратите внимание, что согласно Wikipedia:External links , внешние ссылки обычно не следует размещать в тексте статьи. Следовательно, вставка {{ EnzExplorer }} в текст статьи противоречит руководству Wikipedia по стилю. Это также излишне, поскольку ссылка теперь предоставляется в {{ Infobox genetics }} . Ура. Boghog ( talk ) 09:53, 3 августа 2022 (UTC) [ reply ]

Спасибо за работу с информационным полем. Я не знал об этом правиле. Поскольку существует огромное количество страниц, где это нарушается (не только мной, со ссылками на ExplorEnz, но и другими на Expasy, которые уже были там), потребуется некоторое время, чтобы удалить их все. Однако я это сделаю. Athel cb ( talk ) 11:03, 3 августа 2022 (UTC) [ ответить ]
Нет никаких проблем с отдельными страницами ферментов (кроме того, что их огромное количество, с которым нужно иметь дело). Внешние ссылки могут быть удалены. Однако меня больше беспокоят индексные страницы, такие как https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Список_номеров_EC_(EC_4). Здесь вы найдете список из 810 ферментов. Для каждой записи, такой как
* EC 4.2.3.9: аристолохенсинтаза
щелкнув по первой ссылке, вы попадете на соответствующую запись ExplorEnz; вторая (если она есть) перенаправит вас на соответствующую страницу Википедии (если она есть). Удаление первой ссылки значительно усложнит пользователям поиск записи ExplorEnz, и я подозреваю, что многие не будут беспокоиться об этом. Однако важно, чтобы они обращались к актуальной информации, одобренной IUBMB, поэтому это должно быть легко. Поэтому на данный момент, пока администраторы не отправят ударный отряд, я не планирую их удалять. Обратите внимание, что многие из отдельных страниц, похоже, не обновлялись с 2007 года, и что на страницах индекса нет инфобоксов (и нелегко понять, как они могли бы это сделать.) Athel cb ( talk ) 11:33, 3 августа 2022 (UTC) [ ответить ]

Номер CAS

Привет всем, я заметил, что шаблон включает номер CAS для каждого фермента... однако, я не смог найти ни одного фермента с CAS-ссылкой, которая действительно работает. Возможно, нам придется изменить шаблон так, чтобы ссылка была сгенерирована на какую-то другую базу данных (может быть, PubChem?) вместо cas.org, так как это, похоже, не работает. Dh92 ( talk ) 16:19, 3 мая 2023 (UTC) [ ответить ]

Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Template_talk:Infobox_enzyme&oldid=1232086712"