Термоанаэробактер

Род бактерий

Термоанаэробактер
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Бациллота
Сорт:Клостридии
Заказ:Термоанаэробактериальные
Семья:Термоанаэробактериальные
Род:Термоанаэробактер
Вигель и Люнгдал, 1982 г.
Типовой вид
Термоанаэробактер этаноликус
Вигель и Льюнгдаль 1982
Разновидность

См. текст

Синонимы
  • Ацетогениум Ли и Вулф 1983
  • Термоанаэробиум Зейкус, Хегге и Андерсон 1983
  • Термобактериоиды Бен-Бассат и Зейкус, 1983 г.

Thermoanaerobacter — род в типе Bacillota ( Бактерии ). [1] Представители этого рода являются термофильными и анаэробными , некоторые из них ранее были описаны как виды Clostridium и представители ныне устаревших родов Acetogenium и Thermobacteroides [2] [3]

Этимология

Название Thermoanaerobacter происходит от:
греческого прилагательного thermos (θερμός) , горячий; греческого префикса an (ἄν) , не; греческого существительного aer, aeros (ἀήρ, ἀέρος) , воздух; неолатинского существительного мужского рода bacter , номинально означающего «стержень», но на самом деле означающего бактерию, стержень; неолатинского существительного мужского рода Thermoanaerobacter , стержень, который растет в отсутствие воздуха при повышенных температурах. [4]

Разновидность

Род включает 15 видов, а именно [4]

Три бывших члена этого рода, T. subterraneus , T. tengcongensis и T. yonseiensis , были переклассифицированы как подвиды Caldanaerobacter subterraneus [19]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [20] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [21].

LTP на основе 16S рРНК _08_2023 [22] [23] [24]120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [25] [26] [27]

Т. thermocopriae

T. mathranii alimentarius Карлье, Бонн и Бедора-Фор, 2007 г.

T. mathranii mathranii Ларсен, Нильсен и Аринг, 1998 г.

Т. италикус

Т. пентосацеус

Т. сульфурный

Т. uzonensis

Т. кивуи

T. brockii Lactieticus Cayol et al. 1995 год

Т. псевдоэтаноликус

Т. брокки

T. b. brockii (Зейкус и др. 1983) Ли и др. 1993

Т. б. finnii (Schmid et al. 1986) Cayol et al. 1995 год

Т. сидерофилус

Т. wiegelii

Т. сульфурофилус

Т. ацетоэтиловый

Т. этаноликус

Т. термогидросульфурикус

Т. кивуи

Т. uzonensis

T. pseudethanolicus (включая T. brockii )

T. thermocopriae (включая T. italicus и T. mathranii )

Т. wiegelii

T. ethanolicus (включая T. siderophilus и T. thermohydrosulfuricus )

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Классификация рода Thermoanaerobacter в LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот со стоянием в номенклатуре (LPSN) перемещается в DSMZ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
  2. ^ Коллинз, MD; Лоусон, PA; Виллемс, A; и др. (1994). «Филогения рода Clostridium: предложение пяти новых родов и одиннадцати новых видов». Int. J. Syst. Bacteriol . 44 (4): 812–26. doi : 10.1099/00207713-44-4-812 . PMID  7981107.
  3. ^ ab Rainey, FA; Stackebrandt, E. (1993). «Перенос типового вида рода Thermobacteroides в род Thermoanaerobacter как Thermoanaerobacter acetoethylicus (Ben-Bassat and Zeikus 1981) comb. nov., описание Coprothermobacter gen. nov. и переклассификация Thermobacteroides proteolyticus как Coprothermobacter proteolyticus (Ollivier et al. 1985) comb. nov». Int. J. Syst. Bacteriol . 43 (4): 857–859. doi : 10.1099/00207713-43-4-857 .
  4. ^ ab Thermoanaerobacter в LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот со стойкой в ​​номенклатуре (LPSN) перемещается в DSMZ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
  5. ^ Zeikus, JG; Hegge, PW; Anderson, MA (1979). «Thermoanaerobium brockii gen. nov. and sp. nov., новая хемоорганотрофная, кальдоактивная, анаэробная бактерия». Архивы микробиологии . 122 (1): 41–48. doi :10.1007/BF00408044.
  6. ^ ab Lee, YE; Jain, MK; Lee, C.; Lowe, SE; Zeikus, JG (1993). «Таксономическое различие сахаролитических термофильных анаэробов: описание Thermoanaerobacterium xylanolyticum gen. nov., sp. nov. и Thermoanaerobacterium saccharolyticum gen. nov., sp. nov.; переклассификация Thermoanaerobium brockii, Clostridium thermosulfurogenes и Clostridium thermohydrosulfuricum E100-69 как Thermoanaerobacter brockii comb. nov., Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes comb. nov. и Thermoanaerobacter thermohydrosulfuricus comb. nov. соответственно; и перенос Clostridium thermohydrosulfuricum 39E в Thermoanaerobacter ethanolicus». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 43 (1): 41–51. doi :10.1099/00207713-43-1-41.
  7. ^ Wiegel, JR; Ljungdahl, LG (1981). «Thermoanaerobacter ethanolicus gen. Nov., spec. Nov., новая, экстремально термофильная, анаэробная бактерия». Архивы микробиологии . 128 (4): 343–348. doi :10.1007/BF00405910.
  8. ^ Козиановски, Г.; Канганелла, Ф.; Рейни, ФА; Хиппе, Х.; Антраникян, Г. (1997). «Очистка и характеристика термостабильных пектат-лиаз из недавно выделенной термофильной бактерии Thermoanaerobacter italicus sp. Nov». Extremophiles . 1 (4): 171–182. doi :10.1007/s007920050031. PMID  9680298.
  9. ^ ab Коллинз, MD; Лоусон, PA; Виллемс, A.; Кордова, JJ; Фернандес-Гарайзабаль, J.; Гарсия, P.; Кай, J.; Хиппе, H.; Фэрроу, JAE (1994). «Филогения рода Clostridium: предложение о пяти новых родах и одиннадцати новых комбинациях видов». Международный журнал систематической бактериологии . 44 (4): 812–826. doi : 10.1099/00207713-44-4-812 . ISSN  0020-7713. PMID  7981107.
  10. ^ Ларсен, Л.; Нильсен, П.; Аринг, Б.К. (1997). «Thermoanaerobacter mathranii sp. nov., этанол-продуцирующая, чрезвычайно термофильная анаэробная бактерия из горячего источника в Исландии». Архивы микробиологии . 168 (2): 114–119. doi :10.1007/s002030050476. PMID  9238102.
  11. ^ «Список новых названий и новых комбинаций, ранее эффективно, но недействительно опубликованных». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (ч. 1): 1. 2007. doi : 10.1099/ijs.0.64923-0 . PMID  17220429.
  12. ^ Томас, А. Ф.; Каракашев, Д.; Ангелидаки, И. (2013). «Thermoanaerobacter pentosaceus sp. nov., анаэробная, чрезвычайно термофильная, высокоэтанольная бактерия, выделенная из бытовых отходов». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 63 (7): 2396–2404. doi :10.1099/ijs.0.045211-0. PMID  23178727.
  13. ^ Onyenwoke, RU; Kevbrin, VV; Lysenko, AM; Wiegel, J. (2007). "Thermoanaerobacter pseudethanolicus sp. nov., термофильный гетеротрофный анаэроб из Йеллоустонского национального парка". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (10): 2191–2193. doi : 10.1099/ijs.0.65051-0 . PMID  17911280.
  14. ^ Слободкин, А.И.; Турова, Т.П.; Кузнецов, Б.Б.; Кострикина, Н.А.; Черных, Н.А.; Бонч-Осмоловская, Е.А. (1999). "Thermoanaerobacter siderophilus sp. nov., новая диссимиляторная Fe(III)-восстанавливающая, анаэробная, термофильная бактерия". Международный журнал систематической бактериологии . 49 (4): 1471–1478. doi : 10.1099/00207713-49-4-1471 . PMID  10555328.
  15. ^ Ли, Y. -J.; Дашти, M.; Прейндж, A.; Рейни, FA; Роде, M.; Уитман, WB; Вигель, J. (2007). "Thermoanaerobacter sexualigignens sp. nov., анаэробная термофильная бактерия, которая восстанавливает 1 M тиосульфата до элементарной серы и переносит 90 mM сульфита". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (7): 1429–1434. doi : 10.1099/ijs.0.64748-0 . PMID  17625170.
  16. ^ Бонч-Осмоловская, Е.А.; Мирошниченко, М.Л.; Черных, Н.А.; Кострикина, Н.А.; Пикута, Е.В.; Рейни, ФА (1997). «Восстановление элементарной серы умеренно термофильными органотрофными бактериями и описание Thermoanaerobacter spermophilus sp. nov». Микробиология . 66 : 483–489.
  17. ^ Вагнер, ID; Чжао, В.; Чжан, CL; Романек, CS; Роде, М.; Вигель, Дж. (2008). «Thermoanaerobacter uzonensis sp. nov., анаэробная термофильная бактерия, выделенная из горячего источника в кальдере Узон, Камчатка, Дальний Восток России». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (11): 2565–2573. дои : 10.1099/ijs.0.65343-0 . ПМИД  18984694.
  18. ^ Кук, GM; Рейни, FA; Патель, BKC; Морган, HW (1996). «Характеристика нового облигатно анаэробного термофила, Thermoanaerobacter wiegelii sp. nov». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 46 (1): 123–127. doi : 10.1099/00207713-46-1-123 . PMID  8573487.
  19. ^ Fardeau, M.; Salinas, M.; L'Haridon, S.; Jeanthon, C.; Verhé, F.; Cayol, J.; Patel, B.; Garcia, J.; Ollivier, B. (2004). «Выделение из нефтяных резервуаров новых термофильных анаэробов, филогенетически связанных с Thermoanaerobacter subterraneus: переназначение T. subterraneus, Thermoanaerobacter yonseiensis, Thermoanaerobacter tengcongensis и Carboxydibrachium pacificum в Caldanaerobacter subterraneus gen. nov., sp. nov., comb. nov. как четыре новых подвида». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 54 (2): 467–474. doi : 10.1099/ijs.0.02711-0 . PMID  15023962.
  20. ^ JP Euzéby. "Thermoanaerobacter". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 09.09.2022 .
  21. ^ Sayers; et al. "Thermoanaerobacter". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2022-09-09 .
  22. ^ "The LTP" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  23. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 20 ноября 2023 г.
  24. ^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF) . Получено 20 ноября 2023 г.
  25. ^ "GTDB release 08-RS214". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  26. ^ "bac120_r214.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  27. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Thermoanaerobacter&oldid=1218580094"