Семовирус
Род вирусов
Семовирус
Классификация вирусов Редактировать эту классификацию
(без рейтинга):Вирус
Область :Рибовирус
Королевство:Параннавиры
Тип:Artverviricota
Сорт:Ревтравирицеты
Заказ:Ortervirales
Семья:Belpaoviridae
Род:Семовирус
Разновидность

См. текст

Semotivirus — единственный род вирусов в семействе Belpaoviridae (ранее входивший в семейство Metaviridae ). [1] Виды существуют как ретротранспозоны в геноме эукариотического хозяина. Транспозоны BEL/pao встречаются только у животных. Semotivirus — единственный род, признанный в настоящее время, описание рода соответствует описанию семейства Belpaoviridae. [2]

Классификация

Единственный род в семействе, Semotivirus, ранее был включен в семейство Metaviridae, но был удален из-за его парафилетической связи с другими родами Metaviridae. Существует большая вероятность того, что в будущем к семейству Belpaoviridae будет добавлено больше видов и родов, учитывая разнообразие belpaoviridae, которое уже признано. Порядок домена Pol семейств Belpaoviridae, Metaviridae и Retroviridae одинаков в пределах порядка Ortervirales , однако интеграза либо отсутствует в случае Caulimoviridae , либо расположена выше домена протеазы в случае Pseudoviridae . [3]

Род состоит из ретротранспозонов с длинными концевыми повторами (LTR), также называемых вирусами обратной транскриптазы, инфицирующими метазоа. [4]

Состав

Геномное расположение членов семейства Belpaoviridae похоже на расположение ретротранспозонов с длинными концевыми повторами (LTR) семейства Metaviridae. [5] Весь геном составляет 4,2–10 кб, и от одного до трех генов (pol, env и gag) фланкированы LTR размером 0,2–1,2 кб. [ 6] Некодирующая область, которая представляет собой начальный сегмент обратно транскрибированного генома, расположена ниже 5′-LTR. За ней следует сайт связывания праймера из 18 нуклеотидов, который комплементарен определенной области внутри 3′-конца тРНК хозяина Arg или тРНК Gly .

Синтез провирусной цепи ДНК начинается с полипуринового тракта длиной около 10 нт, расположенного выше 3′-LTR. Полипротеины Gag и Pol могут кодироваться одним непрерывным геном или двумя перекрывающимися генами. [7] Эти гены кодируют домены капсида и нуклеокапсида, а также домены протеазы, обратной транскриптазы (RT), рибонуклеазы H и интегразы.

Репликация

Мало информации известно о морфологии вирионов belpaovirids. Морфология вирионов semotivirus плохо изучена. Однако belpaovirids, скорее всего, реплицируются путем формирования вирусоподобных частиц (VLP), как это делают ретровириды, метавириды и псевдовириды, поскольку они кодируют полипротеин Gag с доменами нуклеокапсида и капсидного белка, гомологичными таковым у других членов порядка Ortervirales. [8] [9] У некоторых belpaovirids присутствует ген , подобный env , однако его точная роль до сих пор неизвестна. [10]

Хотя детали репликации не очень хорошо известны, считается, что она напоминает репликацию членов семейства Metaviridae, [11] в которых ОТ опосредует преобразование полного транскрипта в dsDNA, которая включается в геном хозяина белком интегразы. После того, как интегрированный провирус транскрибируется хозяином РНК-полимеразой II, создаются новые вирусные РНК, которые соответствующие ферменты хозяина кэпируют и полиаденилируют. Попав в цитоплазму клетки-хозяина , эти свежие вирусные РНК транслируются в незрелые VLP с помощью Gag и Pol. Созревание VLP является конечным результатом протеолитической обработки полипротеинов вирусной протеазой. Затем новые вирусные РНК подвергаются обратной транскрипции с помощью ОТ в молекулы dsDNA, которые затем отправляются обратно в ядро ​​и вставляются в новые места в геноме клетки-хозяина. [12]

ОТ: Обратная транскрипаза.

VLPS: вирусоподобная частица.

LTR : Длинный концевой повтор.

Разновидность

Полноразмерные геномные архитектуры репрезентативных семотивирусов.

Род содержит следующие виды: [13]

  • Вирус Anopheles gambiae Moose
  • Antheraea semotivirus Тами
  • Вирус Ascaris lumbricoides Tas
  • вирус Bombyx mori Pao
  • Вирус Caenorhabditis elegans Cer13
  • вирус Drosophila melanogaster Bel
  • вирус Drosophila melanogaster Roo
  • Дрозофила семотивирус Макс
  • Вирус ниндзя Drosophila simulans
  • Шистосома семотивирус Синдбад
  • вирус Takifugu rubripes Suzu

Ссылки

  1. ^ Крупович, М; Бломберг, Дж; Гроб, Дж. М.; Дасгупта, я; Фан, Ч; Геринг, А.Д.; Гиффорд, Р; Харрах, Б; Халл, Р; Джонсон, В; Кройце, Дж. Ф.; Линдеманн, Д; Льоренс, К; Локхарт, Б; Майер, Дж; Мюллер, Э; Ольшевский, Н; Паппу, HR; Пуггин, М; Рихерт-Пёггелер, КР; Сабанадзович, С; Санфасон, Х; Шельц, Дж. Э.; Печать, С; Ставолоне, Л; Стой, JP; Тейчени, П.Ю.; Тристем, М; Кунин Е.В.; Кун, Дж. Х. (4 апреля 2018 г.). «Ortervirales: новый вирусный порядок, объединяющий пять семейств вирусов с обратной транскрипцией». Журнал вирусологии . 92 (12). дои : 10.1128/JVI.00515-18. ПМЦ  5974489 . ПМИД  29618642.
  2. ^ "Род: Semotivirus | ICTV". ictv.global . Получено 2024-10-13 .
  3. ^ Льоренс, Карлос; Сориано, Беатрис; Крупович, Март; ICTV Report Consortium (2021). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Pseudoviridae». Журнал общей вирусологии . 102 (3): 001563. doi : 10.1099/jgv.0.001563. ISSN  1465-2099. PMC 8515867. PMID 33528349  . 
  4. ^ Сориано, Беатрис; Крупович, Март; Льоренс, Карлос (2021). «Профиль таксономии вируса ICTV: Belpaoviridae 2021». Журнал общей вирусологии . 102 (11): 001688. doi : 10.1099/jgv.0.001688. ISSN  1465-2099. PMC 8742986. PMID  34761738 . 
  5. ^ Льоренс, Карлос; Сориано, Беатрис; Крупович, Март; ICTV Report Consortium (2020). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Metaviridae». Журнал общей вирусологии . 101 (11): 1131– 1132. doi : 10.1099/jgv.0.001509. ISSN  1465-2099. PMC 7879559. PMID 33048045  . 
  6. ^ Льоренс, К.; Футами Р.; Ковелли, Л.; Домингес-Эскриба, Л.; Виу, Дж. М.; Тамарит, Д.; Агилар-Родригес, Дж.; Висенте-Рипольес, М.; Фустер, Г.; Бернет, врач общей практики; Маумус, Ф.; Муньос-Помер, А.; Семпере, Дж. М.; Латорре, А.; Мойя, А. (29 октября 2010 г.). «Цыганская база данных (GyDB) мобильных генетических элементов: версия 2.0». Исследования нуклеиновых кислот . 39 (База данных): D70 – D74 . дои : 10.1093/nar/gkq1061. ISSN  0305-1048. ПМК 3013669 . ПМИД  21036865.  
  7. ^ Массимилиано Марсано, Рене; Кайцци, Руджеро (2005-09-12). «Полногеномный скрининг ретротранспозонов типа BEL-Pao у Anopheles gambiae с помощью программы LTR_STRUC». Gene . 357 (2): 115– 121. doi :10.1016/j.gene.2005.06.010. ISSN  0378-1119. PMID  16102916.
  8. ^ Крупович, Март; Бломберг, Йонас; Гроб, Джон М.; Дасгупта, Индранил; Фан, Хун; Гиринг, Эндрю Д.; Гиффорд, Роберт; Харрах, Балаж; Халл, Роджер; Джонсон, Велкин; Кройце, Ян Ф.; Линдеманн, Дирк; Льоренс, Карлос; Локхарт, Бен; Майер, Йенс (15 июня 2018 г.). «Ортервирусы: новый порядок вирусов, объединяющий пять семейств вирусов с обратной транскрипцией». Журнал вирусологии . 92 (12). дои : 10.1128/JVI.00515-18. ISSN  0022-538X. ПМЦ 5974489 . ПМИД  29618642. 
  9. ^ Крупович, Март; Кунин, Юджин В. (2017-06-15). «Гомологичные белки капсида свидетельствуют об общем происхождении ретровирусов, каулимовирусов, псевдовирусов и метавирусов». Журнал вирусологии . 91 (12). doi :10.1128/JVI.00210-17. ISSN  0022-538X. PMC 5446648. PMID 28356531  . 
  10. ^ de la Chaux, Nicole; Wagner, Andreas (2011-06-04). "Ретротранспозоны BEL/Pao в геномах метазоа". BMC Evolutionary Biology . 11 (1): 154. Bibcode : 2011BMCEE..11..154D. doi : 10.1186/1471-2148-11-154 . ISSN  1471-2148. PMC 3118150. PMID  21639932 . 
  11. ^ Льоренс, Карлос; Сориано, Беатрис; Крупович, Март; ICTV Report Consortium (2020). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Metaviridae». Журнал общей вирусологии . 101 (11): 1131– 1132. doi : 10.1099/jgv.0.001509. ISSN  1465-2099. PMC 7879559. PMID 33048045  . 
  12. ^ Сориано, Беатрис; Крупович, Март; Льоренс, Карлос (2021). «Профиль таксономии вируса ICTV: Belpaoviridae 2021». Журнал общей вирусологии . 102 (11). doi : 10.1099/jgv.0.001688. PMC 8742986. PMID  34761738 . 
  13. ^ "Virus Taxonomy: 2020 Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Получено 7 июля 2021 г.
  • Frame IG, Cutfield JF, Poulter RTM (2001) Новые BEL-подобные LTR-ретротранспозоны у Fugu rubripes, Caenorhabditis elegans и Drosophila melanogaster. Gene 263(1–2):219–230
  • «Metaviridae». Браузер таксономии NCBI . 186665.
  • Индекс вирусов ICTVdB
  • Описания вирусов растений
  • Данные, связанные с Semotivirus на Wikispecies


Значок заглушки

Эта статья о вирусах — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Semotivirus&oldid=1252002450"