Парабуркхольдерия
Род бактерий

Парабуркхольдерия
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Псевдомонадоты
Сорт:Бетапротеобактерии
Заказ:Буркхольдериевые
Семья:Буркхольдериевые
Род:Парабуркхолдерия
Савана и др . 2014 год

Paraburkholderia — это род Pseudomonadota , представляющий собой грамотрицательные , слегка изогнутые палочки , подвижные с помощью жгутиков . Сообщалось, что они колонизируют эндофитные ткани гибридной ели ( Picea glauca x engelmannii ) и сосны скрученной широкохвойной с сильным потенциалом для биологической фиксации азота и стимуляции роста растений. [1] [2] [3] В отличие отвидов Burkholderia , представители Paraburkholderia обычно не связаны с инфицированием человека. Представители Paraburkholderia образуют монофилетическую кладу в пределах семейства Burkholderiaceae , что побудило их выделить в качестве рода, независимого от видов Burkholderia , в сочетании с обнаружением надежных консервативных сигнатурных инделей , которые являются уникальными для видов Paraburkholderia и отсутствуют у представителей рода Burkholderia . [4] Эти CSI отличают род от всех других бактерий. Кроме того, CSI, которые, как было обнаружено, являются общими для видов Burkholderia , отсутствуют у видов Paraburkholderia , что свидетельствует об отдельных линиях. [5]

Сохранившиеся сигнатурные индели также были обнаружены в пределах рода Paraburkholderia . [4] Эти CSI параллельны филогенетическим анализам, которые указывают на две монофилетические клады внутри рода; одна клада содержит неназванные и Candidatus Paraburkholderia, в то время как другая клада включает экологические Paraburkholderia , обычно используемые в сельскохозяйственных целях. [6] CSI были обнаружены эксклюзивными для каждой из этих клад и не были обнаружены специфичными для какой-либо другой комбинации видов Paraburkholderia , что обеспечивает дополнительный уровень филогенетического разрешения в пределах уровня рода. [4] [5]

Разновидность

Paraburkholderia включает следующие виды: [4] [7]

Ссылки

  1. ^ Puri A, Padda KP, Chanway CP (01.01.2020). «Могут ли встречающиеся в природе эндофитные азотфиксирующие бактерии гибридной белой ели поддерживать рост деревьев бореального леса на почвах с чрезвычайно низким содержанием питательных веществ?». Soil Biology and Biochemistry . 140 : 107642. doi : 10.1016/j.soilbio.2019.107642. ISSN  0038-0717.
  2. ^ Puri A, Padda KP, Chanway CP (15.12.2018). «Доказательства наличия эндофитных диазотрофных бактерий в сосне скрученной широкохвойной и гибридных белых елях, растущих на почвах с различным содержанием питательных веществ в регионе Западный Чилкотин Британской Колумбии, Канада». Forest Ecology and Management . 430 : 558–565 . doi :10.1016/j.foreco.2018.08.049. ISSN  0378-1127. S2CID  92247486.
  3. ^ Puri A, Padda KP, Chanway CP (2020-08-26). «Поддержание роста деревьев Pinaceae в условиях ограниченного содержания питательных веществ с помощью полезных для растений бактерий». PLOS ONE . 15 (8): e0238055. Bibcode : 2020PLoSO..1538055P. doi : 10.1371/journal.pone.0238055 . PMC 7449467. PMID  32845898 . 
  4. ^ abcd Sawana A, Adeolu M, Gupta RS (2014). "Молекулярные сигнатуры и филогеномный анализ рода Burkholderia: предложение о разделении этого рода на исправленный род Burkholderia, содержащий патогенные организмы, и новый род Paraburkholderia gen. nov., содержащий виды окружающей среды". Frontiers in Genetics . 5 : 429. doi : 10.3389/fgene.2014.00429 . PMC 4271702. PMID  25566316 . 
  5. ^ ab Gupta RS (июль 2016 г.). «Влияние геномики на понимание эволюции и классификации микроорганизмов: важность взглядов Дарвина на классификацию». FEMS Microbiology Reviews . 40 (4): 520–53 . doi : 10.1093/femsre/fuw011 . PMID  27279642.
  6. ^ Эстрада-де-лос-Сантос П., Винуэса П., Мартинес-Агилар Л., Хирш А.М., Кабальеро-Мелладо Дж. (июль 2013 г.). «Филогенетический анализ видов буркхолдерий путем анализа мультилокусных последовательностей». Современная микробиология . 67 (1): 51–60 . doi : 10.1007/s00284-013-0330-9. PMID  23404651. S2CID  14190412.
  7. ^ Oren A, Garrity GM (сентябрь 2017 г.). «Список новых названий и новых комбинаций, ранее эффективно, но не валидно опубликованных». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 67 (9): 3140– 3143. doi :10.1099/ijs.0.000317. PMC 5817221 . PMID  28891789. 
  8. ^ ab Paulitsch F, Dall'Agnol RF, Delamuta JR, Ribeiro RA, da Silva Batista JS, Hungria M (2020). "Paraburkholderia atlantica sp. nov. и Paraburkholderia franconis sp. nov., два новых азотфиксирующих клубеньковых вида, выделенных из почв атлантических лесов в Бразилии". Arch Microbiol . 202 (6): 1369– 1380. doi :10.1007/s00203-020-01843-w. PMID  32166359. S2CID  212682253.
  9. ^ ab Wilhelm RC, Cyle KT, Martinez CE, Karasz DC, Newman JD, Buckley DH (август 2020 г.). «Paraburkholderia solitsugae sp. nov. и Paraburkholderia elongata sp. nov., бактерии, разлагающие фенольную кислоту, выделенные из лесной почвы, и исправленное описание Paraburkholderia madseniana». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (9): 5093– 5105. doi : 10.1099/ijsem.0.004387 . PMID  32809929.
  10. ^ Паулич Ф, Фузинатто Д.Р., Маркон Деламута-младший, Аугусто Рибейро Р., да Силва Батиста Х.С., Хунгрия М. (2019). «Paraburkholderia guartelaensis sp. nov., азотфиксирующий вид, выделенный из клубеньков Mimosa Gymnas в экотоне, который считается горячей точкой биоразнообразия в Бразилии». Арка Микробиол . 201 (10): 1435–1446 . doi :10.1007/s00203-019-01714-z. PMID  31428824. S2CID  201058116.
  11. ^ Wilhelm RC, Murphy SJ, Feriancek NM, Karasz DC, DeRito CM, Newman JD, Buckley DH (март 2020 г.). "Paraburkholderia madseniana sp. nov., бактерия, разлагающая фенольную кислоту, выделенная из кислой лесной почвы". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (3): 2137– 2146. doi : 10.1099/ijsem.0.004029 . PMID  32027304.
  12. ^ ab Beukes CW, Steenkamp ET, van Zyl E, Avontuur J, Chan WY, Hassen AI и др. (сентябрь 2019 г.). « Paraburkholderia strydomiana sp. nov. и Paraburkholderia steynii sp. nov.: Ризобиальные симбионты бобовых финбос Hypocalyptus sophoroides ». Антони ван Левенгук . 112 (9): 1369–1385 . doi :10.1007/s10482-019-01269-5. hdl : 2263/71241 . PMID  31053961. S2CID  143432118.
  13. ^ Мавима Л., Бекес К.В., Палмер М., Де Мейер С.Э., Джеймс Е.К., Малук М., Гросс Э., Буэно дос Рейс Ф., Авонтуур Дж.Р., Чан Вайоминг, Вентер С.Н., Стенкамп И.Т. (2020). «Paraburkholderia youngii sp. nov. и 'Paraburkholderia atlantica' - ризобии, связанные с бразильской и мексиканской мимозой, которые ранее были известны как Paraburkholderia tuberum sv. mimosae». Syst Appl Микробиол . дои : 10.1016/j.syapm.2020.126152. hdl : 2263/83117 . PMID  33276286. S2CID  227295923.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Paraburkholderia&oldid=1234581824"