Остреококк
| Остреококк | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Клад : | Зелёные растения |
| Разделение: | Хлорофитовые |
| Сорт: | Мамиеллофовые |
| Заказ: | Мамиеллалес |
| Семья: | Bathycoccaceae |
| Род: | Остреококк C. Courties & M.-J. Кретьенно-Дине (1995) |
| Разновидность | |
| |
Ostreococcus — род одноклеточных коккоидных или сферических зеленых водорослей, принадлежащих к классу Mamiellophyceae . Включает в себя видных членов мирового сообщества пикопланктона , играющего центральную роль в океаническом цикле углерода .
История
Первый представитель рода, O. tauri , был обнаружен в 1994 году в ходе исследования пикопланктона в лагуне Тау Куртисом и Кретьено-Дине с использованием проточной цитометрии . [1] Одноклеточные фотосинтезирующие организмы, как правило, поддаются изучению с использованием проточной цитометрии из-за автофлуоресценции, обеспечиваемой хлорофиллом и другими флуорофорами, используемыми клетками для сбора и контроля солнечного света, что позволяет изучать такие пигменты без какого-либо окрашивания клеток. Различные присутствующие пигменты можно различать и идентифицировать на основе клетки за клеткой с использованием проточной цитометрии, что позволяет исследователям выводить различные виды, присутствующие в образце, и помогать классифицировать любые новые обнаруженные виды. [2] O. tauri был немедленно помещен в класс Prasinophyceae на основе наличия характерных пигментов хлорофилла и родственных Chlorophyceae каротиноидов [1] , а также ультраструктуры клеток, и его положение было позже подтверждено анализом его 18S рДНК . [3] Молекулярный филогенетический анализ, основанный на последовательности 18S рДНК, привел к определению нового класса, Mamiellophyceae, который содержит виды Ostreococcus , и поместил их в семейство Bathycoccaceae . [4] Mamiellophyceae представляют собой одну из наиболее экологически успешных групп эукариотических фотосинтезирующих пикопланктеров в морской и, вероятно, также пресноводной среде. Метагеномные [5] и метабаркодирующие [6] исследования выявили присутствие других членов рода Ostreococcus во многих океанических регионах. На сегодняшний день описано четыре различных вида: O. tauri , O. lucimarinus , [7] O. mediterraneus [8] и O spp. RCC809. [9]
Анатомия
Род содержит самые маленькие известные свободноживущие эукариотические виды, со средним размером 0,8 мкм. [1] Ультраструктура клеток этого рода до сих пор характеризовалась замечательной простотой, представляя собой кокковидные клетки без клеточной стенки и содержащие один хлоропласт , одну митохондрию и одно тельце Гольджи , а также его ядро . [1] Доступна последовательность генома трех членов этого рода: ядерный геном O. tauri RCC4221 размером 13 Мб, опубликованный в 2006 году [10] и обновленный в 2014 году; [11] O. lucimarinus CCMP2514 [7] и штамм RCC809. [9] Проекты метаболических сетей этих двух видов Ostreococcus были реконструированы из базы данных KEGG , термодинамически ограничены, элементно сбалансированы и функционально оценены в 2012 году. [12]
Ссылки
- ^ abcd Куртис С, Вакер А, Трусселье М, Лотье Дж, Кретьенно-Дине МЖ, Неве Дж, Мачадо С, Клаустр Х (1994). «Маленький эукариотический организм». Природа . 370 (255): 255. Бибкод :1994Natur.370..255C. дои : 10.1038/370255a0 . S2CID 4321127.
- ^ Дэйви, Х.М. и Келл, Д.Б. (1996) «Проточная цитометрия и сортировка клеток гетерогенных микробных популяций: важность анализа отдельных клеток» Microbiological Reviews 60 (4): 641-696
- ^ Кортис, К. и др. (1998). «Филогенетический анализ и размер генома Ostreococcus tauri (Chlorophyta, Prasinophyceae)» J. Phycol. 34 (5): 844-849.
- ^ Marin B, Melkonian M. (2010). Молекулярная филогения и классификация класса Mamiellophyceae. nov. (Chlorophyta) на основе сравнения последовательностей оперонов рРНК, кодируемых ядерным и пластидным кодированием. Protist . 161(2) :304-36. doi :10.1016/j.protis.2009.10.002
- ^ Пигано Г., Моро Х. (2007). Скрининг метагенома Саргассова моря для данных по исследованию эволюции генома у Ostreococcus . Ген . 406 :184-90 doi :10.1016/j.gene.2007.09.015
- ^ Демир-Хилтон Э. и др . (2011). Глобальные закономерности распределения отдельных клад фотосинтетического пикоэукариота Ostreococcus . ISME J. 5 (7) :1095-107. doi :10.1038/ismej.2010.209
- ^ ab Крошечный эукариот Ostreococcus обеспечивает геномное понимание парадокса видообразования планктона. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки 104 : 7705–7710. doi : 10.1073/pnas.0611046104
- ^ Subirana L, et al. (2013). Морфология, пластичность генома и филогения в роде ostreococcus раскрывают криптический вид, O. mediterraneus sp. nov. (Mamiellales, Mamiellophyceae). Protist . 164(5) :643-59. doi :10.1016/j.protis.2013.06.002
- ^ ab "Главная - Ostreococcus sp. RCC809".
- ^ Дерелл, Э. и др. (2006). «Анализ генома наименьшего свободноживущего эукариота Ostreococcus tauri раскрывает множество уникальных особенностей» Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки 103 : 11647-52.
- ^ Бланк-Матье Р. и др. (2014). Улучшенный геном модельной морской водоросли Ostreococcus tauri раскрывается путем оценки сборок Illumina de novo. BMC Genomics . 15 :1103. doi :10.1186/1471-2164-15-1103
- ^ Krumholz EW, Yang H, Weisenhorn P, Henry CS, Libourel IG (2012). «Реконструкция метаболической сети генома пиководоросли Ostreococcus». Журнал экспериментальной ботаники . 63 (6): 2353–2362 . doi : 10.1093/jxb/err407 . PMID 22207618.
