Т-образная рука
Т -плечо или Т-петля — это специализированная область на молекуле тРНК , которая действует как особый участок распознавания для рибосомы для формирования комплекса тРНК-рибосома во время биосинтеза белка или трансляции (биология) .
Т-образный рычаг состоит из двух компонентов: Т-образного стержня и Т-образной петли.
- Т-стебель состоит из ряда парных нуклеотидов, обычно 5 пар, но иногда их может быть всего 1 или даже 6. [1] [2]
- T-петля также часто известна как плечо TΨC из-за присутствия остатков риботимидина (T/m5U), псевдоуридина и цитидина . Она сворачивается в уникальный структурный элемент, состоящий из сложенных оснований в U-образном повороте, который теперь называется «мотивом T-петли». [3]
- В археях m5U заменяется на N1-метилпсевдоуридин (m1Ψ). Считается, что модификация m5U/m1Ψ в позиции 54 увеличивает структурную стабильность. [4]
Организмы с Т-петлей, лишенные тРНК, демонстрируют гораздо более низкий уровень аминоацилирования и связывания EF-Tu , чем организмы, имеющие нативную тРНК. [ необходима цитата ]
Мотив T-петли был идентифицирован как повсеместный структурный элемент в ряде некодирующих РНК. [3] По крайней мере один другой пример T-петли, обнаруженный в рРНК, также несет модификацию m5U. [5]
Ссылки
- ^ Ланг, Б. Франц; Лавров, Деннис; Бек, Наташа; Штейнберг, Сергей В. (2012). «Структура митохондриальной тРНК, идентичность и эволюция генетического кода». В Bullerwell, Charles E. (ред.). Organelle Genetics . Berlin: Springer. стр. 431– 474. doi :10.1007/978-3-642-22380-8_17. ISBN 9783642223792.
- ^ Дирхаймер, Г.; Кейт, Г.; Дюма, П.; Вестхоф, Э. (1995). «Первичная, вторичная и третичная структуры тРНК». Ин Зёлль, Дитер; РаджБхандари, Уттам (ред.). тРНК: структура, биосинтез и функции . Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. С. 93–126 . doi : 10.1128/9781555818333.ch8. ISBN 9781555810733.
- ^ ab Chan, CW; Chetnani, B; Mondragón, A (сентябрь 2013 г.). «Структура и функция структурного мотива T-петли в некодирующих РНК». Wiley Interdisciplinary Reviews. РНК . 4 (5): 507– 22. doi :10.1002/wrna.1175. PMC 3748142. PMID 23754657 .
- ^ Wurm JP, Griese M, Bahr U, Held M, Heckel A, Karas M и др. (март 2012 г.). «Идентификация фермента, ответственного за N1-метилирование псевдоуридина 54 в архейных тРНК». РНК . 18 (3): 412– 420. doi :10.1261/rna.028498.111. PMC 3285930 . PMID 22274954.
Напротив, у большинства архей эта позиция занята другим гипермодифицированным нуклеотидом: изостерическим N1-метилированным псевдоуридином
- ^ Powell, CA; Minczuk, M (апрель 2020 г.). «TRMT2B отвечает за метилирование m(5)U как тРНК, так и рРНК в митохондриях человека». RNA Biology . 17 (4): 451– 462. doi :10.1080 / 15476286.2020.1712544. PMC 7237155. PMID 31948311.
