ТШЗ3

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ТШЗ3
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTSHZ3 , TSH3, ZNF537, гомеобокс с цинковым пальцем Teashirt 3
Внешние идентификаторыOMIM : 614119; MGI : 2442819; HomoloGene : 10835; GeneCards : TSHZ3; OMA :TSHZ3 - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_020856

NM_172298

RefSeq (белок)

NP_065907

NP_758502

Местоположение (UCSC)Хр 19: 31.15 – 31.35 МбХр 7: 36.4 – 36.47 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Гомолог Teashirt 3 — это белок , который у людей кодируется геном TSHZ3 . [ 5] У мышей это необходимая часть нейронной схемы, которая контролирует дыхание. Ген также является гомологом гена teashirt Drosophila melanogaster , который кодирует фактор транскрипции цинкового пальца, важный для развития туловища. [6]

У мышей с нокаутом Tshz3 не развивается нейронная цепь генератора дыхательного ритма ( RRG ), которая является водителем ритма, создающим колебательный ритм в стволе мозга и контролирующим автономное дыхание. Нейроны RRG присутствуют, но являются аномальными. Эти мыши не выживают, потому что они не инициируют дыхание после рождения. Tshz3 изучается на предмет его связи с дефектами дыхания у младенцев у людей. [7]

TSHZ3 был идентифицирован как критический регион для синдрома, связанного с гетерозиготными делециями в 19q12-q13.11, который включает симптомы расстройства аутистического спектра (РАС), такие как аутистические черты, нарушение речи и умственная отсталость, а также аномалии почечного тракта. Мыши с гетерозиготной делецией Tshz3 ( Tshz3 lacZ /+ ) показывают обогащение ортологов генов, связанных с РАС, в коре головного мозга, функциональные изменения кортикостриатной схемы и аномалии поведения, связанные с РАС. [8]

Постнатальная условная делеция Tshz3 у мышей вызывает поведенческие дефициты, имитирующие РАС, а также аномалии синаптической передачи и пластичности в кортикостриарной цепи. Эти изменения связаны с дисрегуляцией кортикальной экспрессии более 1000 генов, в частности, кодирующих синаптические компоненты, половина из которых имеет человеческие ортологи, вовлеченные в РАС. [9]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000121297 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021217 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ "Entrez Gene: TSHZ3 teashirt family zinc finger 3".
  6. ^ Fasano L, Röder L, Coré N, Alexandre E, Vola C, Jacq B, Kerridge S (январь 1991 г.). «Ген teashirt необходим для развития эмбриональных сегментов туловища Drosophila и кодирует белок с широко расставленными мотивами цинковых пальцев». Cell . 64 (1): 63– 79. doi :10.1016/0092-8674(91)90209-h. PMID  1846092. S2CID  39211509.
  7. ^ Caubit X, Thoby-Brisson M, Voituron N, Filippi P, Bévengut M, Faralli H и др. (Июль 2010 г.). «Teashirt 3 регулирует развитие нейронов, участвующих как в дыхательном ритме, так и в контроле воздушного потока». The Journal of Neuroscience . 30 (28): 9465–76 . doi :10.1523/JNEUROSCI.1765-10.2010. PMC 6632443 . PMID  20631175. *Резюме можно найти в: de Lange C (23 июля 2010 г.). «Один ген может быть ключом к первому вдоху ребенка». New Scientist .
  8. ^ Caubit X, Gubellini P, Andrieux J, Roubertoux PL, Metwaly M, Jacq B и др. (ноябрь 2016 г.). «Делеция TSHZ3 вызывает синдром аутизма и дефекты в нейронах корковой проекции». Nature Genetics . 48 (11): 1359– 1369. doi :10.1038/ng.3681. PMC 5083212 . PMID  27668656. 
  9. ^ Chabbert D, Caubit X, Roubertoux PL, Carlier M, Habermann B, Jacq B и др. (август 2019 г.). «Постнатальная делеция Tshz3 приводит к изменению кортикостриарной функции и поведению, похожему на расстройство аутистического спектра». Биологическая психиатрия . 86 (4): 274–285 . doi : 10.1016/j.biopsych.2019.03.974 . PMID  31060802. S2CID  85532974.

Дальнейшее чтение

  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F и др. (январь 2006 г.). "База данных LIFEdb в 2006 г.". Nucleic Acids Research . 34 (выпуск базы данных): D415-8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC  1347501. PMID  16381901 .
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A и др. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Research . 14 (10B): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC  528930 . PMID  15489336.
  • Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ и др. (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проливает свет на сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку эмбриональных стволовых клеток человека». Nature Biotechnology . 22 (6): 707– 16. doi :10.1038/nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W и др. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кодирующих белок человеческих кДНК». Genome Research . 11 (3): 422– 35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC  311072 . PMID  11230166.
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Research . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
  • Nagase T, Kikuno R, Ishikawa K, Hirosawa M, Ohara O (апрель 2000 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Research . 7 (2): 143–50 . doi : 10.1093/dnares/7.2.143 . PMID  10819331.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q63HK5 (гомолог Teashirt 3) в PDBe-KB .


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=TSHZ3&oldid=1080537250"