ТГС1

ТГС1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3EGI, 3GDH
Идентификаторы
Псевдонимы	TGS1 , NCOA6IP, PIMT, PIPMT, триметилгуанозинсинтаза 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 606461; МГИ : 2151797; гомологен : 32608; Генные карты : TGS1; OMA :TGS1 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 8 (человек)
Конец	55,826,445 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	3,616,619 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	сухожилие двуглавой мышцы плеча; ; ооцит; ; вторичный ооцит; ; Ахиллово сухожилие; ; сосок; ; хвост придатка яичка; ; пилорус; ; внутренний бледный шар; ; мозговое вещество почки; ; корпус придатка яичка;
	Верх выражен в
	хвост эмбриона; ; мыщелок; ; кучевые ячейки; ; генитальный бугорок; ; мочеточник; ; примитивная черта; ; шишковидная железа; ; почечное тельце; ; ямка; ; брюшная стенка;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность метилтрансферазы; трансферазная активность; Активность РНК-триметилгуанозинсинтазы; связывание белков; Активность РНК-метилтрансферазы;
Клеточный компонент	цитоплазма; тело Кахаля; нуклеоплазма; ядрышко; малый ядерный рибонуклеопротеиновый комплекс; ядро; внеклеточное пространство; цитозоль;
Биологический процесс	регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; транскрипция, ДНК-шаблон; сплайсосомная сборка snRNP; метилирование; РНК-кэппинг 7-метилгуанозина; гиперметилирование 7-метилгуанозина; биогенез рибонуклеопротеинового комплекса; Метилирование РНК; регуляция липидного обмена веществ;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	96764
	116940
	ENSG00000137574
	ENSMUSG00000028233
	Q96RS0
	Q923W1
	НМ_024831 ; НМ_001317902 ; НМ_001363184
	NM_054089
	НП_001304831 ; НП_079107 ; НП_001350113
	NP_473430
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Триметилгуанозинсинтаза — это фермент , который у человека кодируется геном TGS1 . [ ^5]^[6]^[7]

Взаимодействия

Было показано, что TGS1 взаимодействует с:

CREB-связывающий белок , ^[8] и
ЭЭД , ^[9]
ЭП300 , ^[8]
MED1 , ^[8] и
NCOA6 . ^[5]^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000137574 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028233 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab Zhu Y, Qi C, Cao WQ, Yeldandi AV, Rao MS, Reddy JK (август 2001 г.). «Клонирование и характеристика PIMT, белка с доменом метилтрансферазы, который взаимодействует с функцией коактиватора ядерного рецептора PRIP и усиливает ее». Proc Natl Acad Sci USA . 98 (18): 10380–5. Bibcode :2001PNAS...9810380Z. doi : 10.1073/pnas.181347498 . PMC 56969 . PMID 11517327.
^ Mouaikel J, Verheggen C, Bertrand E, Tazi J, Bordonné R (май 2002 г.). «Гиперметилирование структуры кэпа как дрожжевых snRNA, так и snoRNA требует консервативной метилтрансферазы, которая локализуется в ядрышке». Mol Cell . 9 (4): 891–901. doi : 10.1016/S1097-2765(02)00484-7 . PMID 11983179.
^ "Ген Entrez: гомолог триметилгуанозинсинтазы TGS1 (S. cerevisiae)".
^ abcd Misra P, Qi C, Yu S, Shah SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (май 2002 г.). "Взаимодействие PIMT с транскрипционными коактиваторами CBP, p300 и дифференциальная роль PBP в регуляции транскрипции". J. Biol. Chem . 277 (22): 20011–9. doi : 10.1074/jbc.M201739200 . PMID 11912212.
^ Enünlü I, Pápai G, Cserpán I, Udvardy A, Jeang KT, Boros I (сентябрь 2003 г.). «Различные изоформы белка, взаимодействующего с PRIP, с доменом метилтрансферазы/триметилгуанозинсинтазой, локализуются в цитоплазме и ядре». Biochem. Biophys. Res. Commun . 309 (1): 44–51. doi :10.1016/s0006-291x(03)01514-6. PMID 12943661.

Дальнейшее чтение

Misra P, Qi C, Yu S, Shah SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (2002). "Взаимодействие PIMT с транскрипционными коактиваторами CBP, p300 и дифференциальная роль PBP в регуляции транскрипции". J. Biol. Chem . 277 (22): 20011–9. doi : 10.1074/jbc.M201739200 . PMID 11912212.
Verheggen C, Lafontaine DL, Samarsky D, Mouaikel J, Blanchard JM, Bordonné R, Bertrand E (2002). «Млекопитающие и дрожжевые U3 snoRNP созревают в специфических и связанных ядерных компартментах». EMBO J . 21 (11): 2736–45. doi :10.1093/emboj/21.11.2736. PMC 126019 . PMID 12032086.
Wang Y, Han KJ, Pang XW, Vaughan HA, Qu W, Dong XY, Peng JR, Zhao HT, Rui JA, Leng XS, Cebon J, Burgess AW, Chen WF (2002). «Крупномасштабная идентификация антигенов, ассоциированных с гепатоцеллюлярной карциномой человека, с помощью аутоантител». J. Immunol . 169 (2): 1102–9. doi : 10.4049/jimmunol.169.2.1102 . PMID 12097419.
Surapureddi S, Yu S, Bu H, Hashimoto T, Yeldandi AV, Kashireddy P, Cherkaoui-Malki M, Qi C, Zhu YJ, Rao MS, Reddy JK (2002). «Идентификация комплекса кофакторов, взаимодействующих с транскрипционно активным рецептором, активируемым пролифератором пероксисом α, в печени крысы и характеристика PRIC285 как коактиватора». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (18): 11836–41. Bibcode :2002PNAS...9911836S. doi : 10.1073/pnas.182426699 . PMC 129355 . PMID 12189208.
Krackhardt AM, Witzens M, Harig S, Hodi FS, Zauls AJ, Chessia M, Barrett P, Gribben JG (2002). «Идентификация опухолеассоциированных антигенов при хроническом лимфоцитарном лейкозе с помощью SEREX». Кровь . 100 (6): 2123–31. doi : 10.1182/blood-2002-02-0513 . PMID 12200376.
Mouaikel J, Narayanan U, Verheggen C, Matera AG, Bertrand E, Tazi J, Bordonné R (2004). «Взаимодействие между гиперметилазой колпачка малой ядерной РНК и белком спинальной мышечной атрофии, выживание двигательного нейрона». EMBO Rep . 4 (6): 616–22. doi :10.1038/sj.embor.embor863. PMC 1319203. PMID 12776181 .
Enünlü I, Pápai G, Cserpán I, Udvardy A, Jeang KT, Boros I (2003). «Различные изоформы белка, взаимодействующего с PRIP, с доменом метилтрансферазы/триметилгуанозинсинтазой локализуются в цитоплазме и ядре». Biochem. Biophys. Res. Commun . 309 (1): 44–51. doi :10.1016/S0006-291X(03)01514-6. PMID 12943661.
Watkins NJ, Lemm I, Ingelfinger D, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Lührmann R (2005). «Сборка и созревание U3 snoRNP в нуклеоплазме в большом динамическом мультипротеиновом комплексе». Mol. Cell . 16 (5): 789–98. doi :10.1016/j.molcel.2004.11.012. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-EB89-8 . PMID 15574333.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y, Kim MR, Byun SS, Jeon YJ, Kim JM, Song KS, Noh SM, Kim S, Yoo HS, Kim YS, Kim NS (2006). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Mamm. Genome . 16 (12): 942–54. doi :10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.

Эта статья о гене на 8-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000137574 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028233 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11517327-5] Zhu Y, Qi C, Cao WQ, Yeldandi AV, Rao MS, Reddy JK (август 2001 г.). «Клонирование и характеристика PIMT, белка с доменом метилтрансферазы, который взаимодействует с функцией коактиватора ядерного рецептора PRIP и усиливает ее». Proc Natl Acad Sci USA . 98 (18): 10380–5. Bibcode :2001PNAS...9810380Z. doi : 10.1073/pnas.181347498 . PMC 56969 . PMID 11517327.

[pmid11983179-6] Mouaikel J, Verheggen C, Bertrand E, Tazi J, Bordonné R (май 2002 г.). «Гиперметилирование структуры кэпа как дрожжевых snRNA, так и snoRNA требует консервативной метилтрансферазы, которая локализуется в ядрышке». Mol Cell . 9 (4): 891–901. doi : 10.1016/S1097-2765(02)00484-7 . PMID 11983179.

[entrez-7] "Ген Entrez: гомолог триметилгуанозинсинтазы TGS1 (S. cerevisiae)".

[pmid11912212-8] Misra P, Qi C, Yu S, Shah SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (май 2002 г.). "Взаимодействие PIMT с транскрипционными коактиваторами CBP, p300 и дифференциальная роль PBP в регуляции транскрипции". J. Biol. Chem . 277 (22): 20011–9. doi : 10.1074/jbc.M201739200 . PMID 11912212.

[pmid12943661-9] Enünlü I, Pápai G, Cserpán I, Udvardy A, Jeang KT, Boros I (сентябрь 2003 г.). «Различные изоформы белка, взаимодействующего с PRIP, с доменом метилтрансферазы/триметилгуанозинсинтазой, локализуются в цитоплазме и ядре». Biochem. Biophys. Res. Commun . 309 (1): 44–51. doi :10.1016/s0006-291x(03)01514-6. PMID 12943661.