МЕД1
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
МЕД1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыMED1 , CRSP1, CRSP200, DRIP205, DRIP230, PBP, PPARBP, PPARGBP, RB18A, TRAP220, TRIP2, субъединица 1 комплекса медиатора
Внешние идентификаторыОМИМ : 604311; МГИ : 1100846; гомологен : 21002; Генные карты : MED1; OMA :MED1 – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

5469

19014

Ансамбль

ENSG00000125686

ENSMUSG00000018160

UniProt

Q15648

Q925J9

РефСек (мРНК)

NM_004774

NM_001080118
NM_013634
NM_134027
NM_001361950
NM_001361951

RefSeq (белок)

NP_004765

NP_001073587
NP_038662
NP_598788
NP_001348879
NP_001348880

Местоположение (UCSC)Хр 17: 39,4 – 39,45 МбХр 11: 98.04 – 98.08 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Медиатор субъединицы 1 транскрипции РНК-полимеразы II, также известный как DRIP205 или Trap220, является субъединицей комплекса Медиатора и представляет собой белок , который у человека кодируется геном MED1 . [5] [6] [7] MED1 функционирует как коактиватор ядерного рецептора .

Семейство белков
Мед1
Идентификаторы
СимволМед1
ПфамПФ10744
ИнтерПроIPR019680
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Функция

Активация транскрипции гена — многоступенчатый процесс, который запускается факторами, распознающими участки транскрипционного энхансера в ДНК . Эти факторы работают с коактиваторами для прямой транскрипционной инициации аппаратом РНК-полимеразы II . Медиатор белка субъединицы 1 транскрипции РНК-полимеразы II является субъединицей комплекса CRSP (кофактор, необходимый для активации SP1 ), который, наряду с TFIID , необходим для эффективной активации SP1. Этот белок также является компонентом других мультисубъединичных комплексов [например, белков, ассоциированных с рецептором тиреоидного гормона -(TR-), которые взаимодействуют с TR и облегчают функцию TR на матрицах ДНК в сочетании с факторами инициации и кофакторами]. Он также регулирует p53 -зависимый апоптоз и необходим для адипогенеза . Известно, что этот белок обладает способностью к самоолигомеризации. [7]

Взаимодействия

Было показано, что MED1 взаимодействует с:

Семейство белков

Эта запись представляет субъединицу Med1 комплекса Mediator. Med1 является частью субмодуля Med9 комплекса Srb/Med. Это одна из трех субъединиц, необходимых для жизнеспособности всего организма через ее роль в решениях о судьбе клеток, направленных на окружающую среду. [21]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000125686 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000018160 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Zhu Y, Qi C, Jain S, Rao MS, Reddy JK (ноябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика PBP, белка, который взаимодействует с рецептором, активируемым пролифератором пероксисом». J Biol Chem . 272 ​​(41): 25500– 6. doi : 10.1074/jbc.272.41.25500 . PMID  9325263.
  6. ^ Zhu Y, Qi C, Jain S, Le Beau MM, Espinosa R, Atkins GB, Lazar MA, Yeldandi AV, Rao MS, Reddy JK (октябрь 1999 г.). «Усиление и сверхэкспрессия гена белка, связывающего рецепторы, активируемые пролифераторами пероксисом (PBP/PPARBP), при раке груди». Proc Natl Acad Sci USA . 96 (19): 10848– 53. Bibcode :1999PNAS...9610848Z. doi : 10.1073/pnas.96.19.10848 . PMC 17971 . PMID  10485914. 
  7. ^ ab "Ген Энтреза: PPARBP PPAR-связывающий белок".
  8. ^ Wang Q, Sharma D, Ren Y, Fondell JD (ноябрь 2002 г.). «Корегуляторная роль комплекса TRAP-медиатора в экспрессии генов, опосредованной андрогеновым рецептором». J. Biol. Chem . 277 (45): 42852– 8. doi : 10.1074/jbc.M206061200 . PMID  12218053.
  9. ^ ab Ito M, Yuan CX, Malik S, Gu W, Fondell JD, Yamamura S, Fu ZY, Zhang X, Qin J, Roeder RG (март 1999). «Идентичность комплексов TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Mol. Cell . 3 (3): 361– 70. doi : 10.1016/s1097-2765(00)80463-3 . PMID  10198638.
  10. ^ ab Китагава Х, Фудзики Р, Ёсимура К, Мезаки Ю, Уэмацу Ю, Мацуи Д, Огава С, Унно К, Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Исими Ю, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С (июнь 2003 г.). «Комплекс ремоделирования хроматина WINAC нацеливает ядерный рецептор на промоторы и нарушается при синдроме Вильямса». Клетка . 113 (7): 905–17 . doi : 10.1016/s0092-8674(03)00436-7 . ПМИД  12837248.
  11. ^ ab Kang YK, Guermah M, Yuan CX, Roeder RG (март 2002 г.). «Комплекс коактиватора TRAP/Mediator напрямую взаимодействует с рецепторами эстрогена альфа и бета через субъединицу TRAP220 и напрямую усиливает функцию рецептора эстрогена in vitro». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (5): 2642– 7. Bibcode :2002PNAS...99.2642K. doi : 10.1073/pnas.261715899 . PMC 122401 . PMID  11867769. 
  12. ^ Zilliacus J, Holter E, Wakui H, Tazawa H, Treuter E, Gustafsson JA (апрель 2001 г.). «Регуляция активности глюкокортикоидных рецепторов с помощью 14—3-3-зависимой внутриклеточной релокализации корепрессора RIP140». Mol. Endocrinol . 15 (4): 501– 11. doi : 10.1210/mend.15.4.0624 . PMID  11266503.
  13. ^ Хиттельман А.Б., Бураков Д., Иньигес-Луи Х.А., Фридман Л.П., Гарабедян М.Дж. (октябрь 1999 г.). «Дифференциальная регуляция активации транскрипции глюкокортикоидных рецепторов посредством белков, связанных с AF-1». ЭМБО Дж . 18 (19): 5380– 8. doi :10.1093/emboj/18.19.5380. ПМК 1171607 . ПМИД  10508170. 
  14. ^ Maeda Y, Rachez C, Hawel L, Byus CV, Freedman LP, Sladek FM (июль 2002 г.). «Полиамины модулируют взаимодействие между ядерными рецепторами и белком, взаимодействующим с рецептором витамина D 205». Mol. Endocrinol . 16 (7): 1502– 10. doi : 10.1210/mend.16.7.0883 . PMID  12089346.
  15. ^ Malik S, Wallberg AE, Kang YK, Roeder RG (август 2002 г.). "TRAP/SMCC/зависимая от медиатора активация транскрипции из ДНК и хроматиновых матриц сиротским ядерным рецептором гепатоцитарного ядерного фактора 4". Mol. Cell. Biol . 22 (15): 5626– 37. doi :10.1128/mcb.22.15.5626-5637.2002. PMC 133960 . PMID  12101254. 
  16. ^ Frade R, Balbo M, Barel M (декабрь 2000 г.). «RB18A, ген которого локализован на хромосоме 17q12-q21.1, регулирует трансактивирующую активность p53 in vivo». Cancer Res . 60 (23): 6585– 9. PMID  11118038.
  17. ^ Drané P, Barel M, Balbo M, Frade R (декабрь 1997 г.). «Идентификация RB18A, нового регуляторного белка p53 массой 205 кДа, который имеет общие антигенные и функциональные свойства с p53». Oncogene . 15 (25): 3013– 24. doi : 10.1038/sj.onc.1201492 . PMID  9444950.
  18. ^ Wallberg AE, Yamamura S, Malik S, Spiegelman BM, Roeder RG (ноябрь 2003 г.). «Координация ремоделирования хроматина, опосредованного p300, и функции TRAP/медиатора через коактиватор PGC-1alpha». Mol. Cell . 12 (5): 1137– 49. doi : 10.1016/s1097-2765(03)00391-5 . PMID  14636573.
  19. ^ Misra P, Qi C, Yu S, Shah SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (май 2002 г.). «Взаимодействие PIMT с транскрипционными коактиваторами CBP, p300 и дифференциальная роль PBP в регуляции транскрипции». J. Biol. Chem . 277 (22): 20011– 9. doi : 10.1074/jbc.M201739200 . PMID  11912212.
  20. ^ Yuan CX, Ito M, Fondell JD, Fu ZY, Roeder RG (июль 1998 г.). «Компонент TRAP220 комплекса коактиватора белка, ассоциированного с рецептором тиреоидного гормона (TRAP), напрямую взаимодействует с ядерными рецепторами в зависимости от лиганда». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (14): 7939– 44. Bibcode :1998PNAS...95.7939Y. doi : 10.1073/pnas.95.14.7939 . PMC 20908 . PMID  9653119. 
  21. ^ Boube M, Joulia L, Cribbs DL, Bourbon HM (июль 2002 г.). «Доказательства наличия медиатора регуляции транскрипции РНК-полимеразы II, сохранившиеся от дрожжей до человека». Cell . 110 (2): 143–51 . doi : 10.1016 / s0092-8674 ( 02)00830-9 . PMID  12150923. S2CID  771362.

Дальнейшее чтение

  • Lee JW, Choi HS, Gyuris J, Brent R, Moore DD (1995). «Два класса белков, зависящих либо от наличия, либо от отсутствия гормона щитовидной железы для взаимодействия с рецептором гормона щитовидной железы». Mol. Endocrinol . 9 (2): 243–54 . doi : 10.1210/mend.9.2.7776974 . PMID  7776974.
  • Fondell JD, Ge H, Roeder RG (1996). «Индукция лиганда транскрипционно активного комплекса коактиватора рецептора тиреоидного гормона». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (16): 8329– 33. Bibcode : 1996PNAS...93.8329F. doi : 10.1073/pnas.93.16.8329 . PMC  38670. PMID  8710870 .
  • Drané P, Barel M, Balbo M, Frade R (1998). «Идентификация RB18A, нового регуляторного белка p53 массой 205 кДа, имеющего общие антигенные и функциональные свойства с p53». Oncogene . 15 (25): 3013– 24. doi : 10.1038/sj.onc.1201492 . PMID  9444950.
  • Yuan CX, Ito M, Fondell JD, Fu ZY, Roeder RG (1998). «Компонент TRAP220 комплекса коактиватора белка, ассоциированного с рецептором тиреоидного гормона (TRAP), взаимодействует напрямую с ядерными рецепторами в зависимости от лиганда». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (14): 7939– 44. Bibcode :1998PNAS...95.7939Y. doi : 10.1073/pnas.95.14.7939 . PMC  20908 . PMID  9653119.
  • Ryu S, Zhou S, Ladurner AG, Tjian R (1999). «Транскрипционный кофакторный комплекс CRSP необходим для активности белка, связывающего энхансер Sp1». Nature . 397 (6718): 446– 50. Bibcode :1999Natur.397..446R. doi :10.1038/17141. hdl : 11858/00-001M-0000-0019-A36A-8 . PMID  9989412. S2CID  4405569.
  • Gu W, Malik S, Ito M, Yuan CX, Fondell JD, Zhang X, Martinez E, Qin J, Roeder RG (1999). "Новый человеческий SRB/MED-содержащий кофакторный комплекс, SMCC, участвующий в регуляции транскрипции". Mol. Cell . 3 (1): 97– 108. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80178-1 . PMID  10024883.
  • Ito M, Yuan CX, Malik S, Gu W, Fondell JD, Yamamura S, Fu ZY, Zhang X, Qin J, Roeder RG (1999). «Идентичность комплексов TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Mol. Cell . 3 (3): 361– 70. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80463-3 . PMID  10198638.
  • Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, Bromleigh V, Gamble M, Näär AM, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP (1999). «Лиганд-зависимая активация транскрипции ядерными рецепторами требует комплекса DRIP». Nature . 398 (6730): 824– 8. Bibcode :1999Natur.398..824R. doi :10.1038/19783. PMID  10235266. S2CID  204992765.
  • Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R (1999). «Композитный коактиватор ARC опосредует хроматин-направленную транскрипционную активацию». Nature . 398 (6730): 828– 32. Bibcode :1999Natur.398..828N. doi :10.1038/19789. PMID  10235267. S2CID  23646963.
  • Atkins GB, Hu X, Guenther MG, Rachez C, Freedman LP, Lazar MA (1999). «Коактиваторы для сиротского ядерного рецептора RORalpha». Mol. Endocrinol . 13 (9): 1550– 7. doi : 10.1210/mend.13.9.0343 . PMID  10478845.
  • Rachez C, Gamble M, Chang CP, Atkins GB, Lazar MA, Freedman LP (2000). «Комплекс DRIP и коактиваторы SRC-1/p160 имеют схожие детерминанты связывания с ядерными рецепторами, но представляют собой функционально различные комплексы». Mol. Cell. Biol . 20 (8): 2718– 26. doi :10.1128/MCB.20.8.2718-2726.2000. PMC  85487. PMID  10733574 .
  • Frade R, Balbo M, Barel M (2001). «RB18A, ген которого локализован на хромосоме 17q12-q21.1, регулирует трансактивирующую активность p53 in vivo». Cancer Res . 60 (23): 6585– 9. PMID  11118038.
  • Zilliacus J, Holter E, Wakui H, Tazawa H, Treuter E, Gustafsson JA (2001). «Регуляция активности глюкокортикоидных рецепторов с помощью 14--3-3-зависимой внутриклеточной релокализации корепрессора RIP140». Mol. Endocrinol . 15 (4): 501– 11. doi : 10.1210/mend.15.4.0624 . PMID  11266503.
  • Crawford SE, Qi C, Misra P, Stellmach V, Rao MS, Engel JD, Zhu Y, Reddy JK (2002). «Дефекты сердца, глаза и мегакариоцитов у эмбрионов с нулевым белком, связывающим рецептор активатора пролифератора пероксисом (PBP), указывают на семейство факторов транскрипции GATA». J. Biol. Chem . 277 (5): 3585– 92. doi : 10.1074/jbc.M107995200 . PMID  11724781.
  • Frade R, Balbo M, Barel M (2002). «RB18A регулирует p53-зависимый апоптоз». Oncogene . 21 (6): 861– 6. doi : 10.1038/sj.onc.1205177 . PMID  11840331.
  • Kang YK, Guermah M, Yuan CX, Roeder RG (2002). «Комплекс коактиватора TRAP/Mediator напрямую взаимодействует с рецепторами эстрогена альфа и бета через субъединицу TRAP220 и напрямую усиливает функцию рецептора эстрогена in vitro». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (5): 2642– 7. Bibcode :2002PNAS...99.2642K. doi : 10.1073/pnas.261715899 . PMC  122401 . PMID  11867769.
  • Misra P, Qi C, Yu S, Shah SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (2002). "Взаимодействие PIMT с транскрипционными коактиваторами CBP, p300 и дифференциальная роль PBP в регуляции транскрипции". J. Biol. Chem . 277 (22): 20011– 9. doi : 10.1074/jbc.M201739200 . PMID  11912212.
  • Ge K, Guermah M, Yuan CX, Ito M, Wallberg AE, Spiegelman BM, Roeder RG (2002). «Коактиватор транскрипции TRAP220 необходим для адипогенеза, стимулированного PPAR gamma 2». Nature . 417 (6888): 563– 7. Bibcode :2002Natur.417..563G. doi :10.1038/417563a. PMID  12037571. S2CID  4432077.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR019680
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=MED1&oldid=1227973930"