Фактор трилистника 2

ТФФ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2ДЙЗ, 2ДЗ0, 2ДЗ1
Идентификаторы
Псевдонимы	TFF2 , SML1, SP, фактор трилистника 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 182590; МГИ : 1306805; гомологен : 3956; Генные карты : TFF2; OMA :TFF2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 21 (человек)
Конец	42,350,997 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	31,363,256 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	протоковая клетка поджелудочной железы; ; слизистая оболочка желудка; ; пилорус; ; желчный пузырь; ; тело желудка; ; гонада; ; двенадцатиперстная кишка; ; глазное дно; ; островок Лангерганса; ; кардиа;
	Верх выражен в
	слизистая клетка желудка; ; эпителий желудка; ; пилорический отдел желудка; ; двенадцатиперстная кишка; ; островок Лангерганса; ; трахея; ; желчный пузырь; ; респираторный эпителий; ; обонятельный эпителий; ; эмбрион;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белков; Связывание рецептора хемокина CXCR4;
Клеточный компонент	внеклеточная область; внеклеточное пространство;
Биологический процесс	заживление ран; поддержание желудочно-кишечного эпителия; отрицательная регуляция секреции желудочной кислоты; опосредованный хемокинами сигнальный путь;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	7032
	21785
	ENSG00000160181
	ENSMUSG00000024028
	Q03403
	Q03404 ; Q9QX97
	NM_005423
	NM_009363
	NP_005414
	NP_033389
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Фактор трилистника 2 — это белок , который у людей кодируется геном TFF2 . [ ^5]^[6]^[7]

Члены семейства трилистников характеризуются наличием по крайней мере одной копии мотива трилистника , домена из 40 аминокислот, который содержит три консервативных дисульфида . Они являются стабильными секреторными белками, экспрессируемыми в слизистой оболочке желудочно-кишечного тракта . Их функции не определены, но они могут защищать слизистую оболочку от повреждений, стабилизировать слой слизи и влиять на заживление эпителия . Кодируемый белок ингибирует секрецию желудочной кислоты . Этот ген и два других родственных гена-члена семейства трилистников находятся в кластере на хромосоме 21. [ ^7]

Связывание гликанов

Все человеческие факторы трилистника являются лектинами , которые специфически взаимодействуют с дисахаридом GlcNAc -α-1,4- Gal . ^[8] Этот дисахарид является необычным гликотопом, который, как известно, существует только на больших, сильно гликозилированных муцинах в слизистой оболочке. Сшивая муцины посредством двухвалентного связывания этого гликотопа, факторы трилистника затем способны обратимо модулировать толщину и вязкость слизи. ^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000160181 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024028 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Tomasetto C, Rockel N, Mattei MG, Fujita R, Rio MC (сентябрь 1992 г.). «Ген, кодирующий человеческий спазмолитический белок (SML1/hSP), находится в 21q 22.3, физически связан с гомологичным геном-маркером рака груди BCEI/pS2». Genomics . 13 (4): 1328– 30. doi :10.1016/0888-7543(92)90059-2. PMID 1505966.
^ Gott P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (май 1997). "Пептиды клевера человека: геномная структура в 21q22.3 и координированная экспрессия". Eur J Hum Genet . 4 (6): 308– 15. doi :10.1159/000472224. PMID 9043862. S2CID 25235589.
^ ab "Ген Энтреза: фактор клеточного листа 2 TFF2 (спазмолитический белок 1)".
^ ab Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (май 2020 г.). «Факторы трилистника обладают лектиновой активностью, которая определяет их роль в слизи». Nature Communications . 11 (1): 2265. Bibcode :2020NatCo..11.2265J. doi : 10.1038/s41467-020-16223-7 . PMC 7221086 . PMID 32404934.

Дальнейшее чтение

Advenier C, Lagente V, Boichot E (1997). «Роль антагонистов рецепторов тахикинина в профилактике гиперреактивности бронхов, воспаления дыхательных путей и кашля». Eur. Respir. J . 10 (8): 1892–906 . doi : 10.1183/09031936.97.10081892 . PMID 9272936.
Langer G, Jagla W, Behrens-Baumann W и др. (2002). «Глазные TFF-пептиды: новые секреторные продукты, связанные со слизью, конъюнктивальных бокаловидных клеток». Слезная железа, слезная пленка и синдромы сухого глаза 3. Достижения экспериментальной медицины и биологии. Т. 506. С. 313– 6. doi :10.1007/978-1-4615-0717-8_44. ISBN 978-1-4613-5208-2. PMID 12613926.
Tomasetto C, Rio MC, Gautier C и др. (1990). "hSP, домен-дуплицированный гомолог белка pS2, ко-экспрессируется с pS2 в желудке, но не в карциноме молочной железы". EMBO J . 9 (2): 407– 14. doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb08125.x. PMC 551681 . PMID 2303034.
Bhogal N, Donnelly D, Findlay JB (1994). "Сайт связывания лиганда рецептора нейрокинина 2. Сайт-направленный мутагенез и идентификация остатков связывания нейрокинина A в рецепторе нейрокинина 2 человека". J. Biol. Chem . 269 (44): 27269– 74. doi : 10.1016/S0021-9258(18)46979-7 . PMID 7961636.
Hanby AM, Poulsom R, Singh S, et al. (1993). «Спазмолитический полипептид является основным антральным пептидом: распределение пептидов трилистника, человеческого спазмолитического полипептида и pS2 в желудке». Гастроэнтерология . 105 (4): 1110– 6. doi : 10.1016/0016-5085(93)90956-d . PMID 8405856.
Itoh H, Tomita M, Uchino H и др. (1996). «cDNA клонирование пептида pS2 крысы и экспрессия пептидов трилистника при колите, вызванном уксусной кислотой». Biochem. J . 318 (3): 939– 44. doi :10.1042/bj3180939. PMC 1217708 . PMID 8836141.
May FE, Westley BR (1997). «Тесная физическая связь генов, кодирующих белок pNR-2/pS2 и человеческий спазмолитический белок (hSP)». Hum. Genet . 99 (3): 303–7 . doi :10.1007/s004390050362. PMID 9050913. S2CID 22603186.
Seib T, Blin N, Hilgert K и др. (1997). «Три человеческих трилистника гена TFF1, TFF2 и TFF3 расположены в области 55 кб на хромосоме 21q22.3». Genomics . 40 (1): 200– 2. doi :10.1006/geno.1996.4511. PMID 9070946.
Kayademir T, Silva Edos S, Pusch C и др. (1998). «Новый тандемный повтор из 25 пар оснований в гене человеческого трилистника TFF2 в 21q22.3: полиморфизм и эволюция млекопитающих». Eur. J. Hum. Genet . 6 (2): 121– 8. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200166 . PMID 9781055.
Брунеллески С., Бордин Г., Коланджело Д., Виано И. (1999). «Тахикининовые рецепторы на человеческих моноцитах: их участие в ревматоидном артрите». Нейропептиды . 32 (3): 215– 23. doi :10.1016/S0143-4179(98)90040-3. PMID 10189055. S2CID 40222022.
May FE, Semple JI, Newton JL, Westley BR (2000). «Человеческий белок трилистника с двумя доменами, TFF2, гликозилируется in vivo в желудке». Gut . 46 (4): 454– 9. doi :10.1136/gut.46.4.454. PMC 1727891 . PMID 10716671.
Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК человеческой хромосомы 21». Nature . 405 (6784): 311– 9. Bibcode :2000Natur.405..311H. doi : 10.1038/35012518 . PMID 10830953.
Berry A, Scott HS, Kudoh J, et al. (2001). «Уточненная локализация аутосомно-рецессивного несиндромного локуса глухоты DFNB10 с использованием 34 новых микросателлитных маркеров, геномной структуры и исключения шести известных генов в регионе». Genomics . 68 (1): 22– 9. doi :10.1006/geno.2000.6253. PMID 10950923.
Булитта К.Дж., Флеминг Дж.В., Рейчоудхури Р. и др. (2002). «Для автоиндукции промотора трилистника 2 (TFF2) требуется элемент, действующий выше по потоку цис». Biochem. Biophys. Res. Commun . 293 (1): 366–74 . doi :10.1016/S0006-291X(02)00199-7. PMID 12054609.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Hu GY, Yu BP, Dong WG и др. (2003). «Экспрессия TFF2 и инфекции Helicobacter pylori при канцерогенезе слизистой оболочки желудка». World J. Gastroenterol . 9 (5): 910– 4. doi : 10.3748/wjg.v9.i5.910 . PMC 4611396. PMID 12717829 .

Эта статья о гене на 21-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000160181 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024028 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1505966-5] Tomasetto C, Rockel N, Mattei MG, Fujita R, Rio MC (сентябрь 1992 г.). «Ген, кодирующий человеческий спазмолитический белок (SML1/hSP), находится в 21q 22.3, физически связан с гомологичным геном-маркером рака груди BCEI/pS2». Genomics . 13 (4): 1328– 30. doi :10.1016/0888-7543(92)90059-2. PMID 1505966.

[pmid9043862-6] Gott P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (май 1997). "Пептиды клевера человека: геномная структура в 21q22.3 и координированная экспрессия". Eur J Hum Genet . 4 (6): 308– 15. doi :10.1159/000472224. PMID 9043862. S2CID 25235589.

[entrez-7] "Ген Энтреза: фактор клеточного листа 2 TFF2 (спазмолитический белок 1)".

[Järvå_2020-8] Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (май 2020 г.). «Факторы трилистника обладают лектиновой активностью, которая определяет их роль в слизи». Nature Communications . 11 (1): 2265. Bibcode :2020NatCo..11.2265J. doi : 10.1038/s41467-020-16223-7 . PMC 7221086 . PMID 32404934.