Т-комплекс 1

TCP1
Идентификаторы
Псевдонимы	TCP1 , CCT-альфа, CCT1, CCTa, D6S230E, TCP-1-альфа, T-комплекс 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 186980; МГИ : 98535; гомологен : 5656; Генные карты : TCP1; OMA :TCP1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 6 (человек)
Конец	159,789,703 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	13,143,954 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	гонада; ; ганглионарное возвышение; ; левое яичко; ; правое яичко; ; желудочковая зона; ; левый яичник; ; слизистая оболочка желудка; ; правый яичник; ; тело поджелудочной железы; ; кожа живота;
	Верх выражен в
	сперматид; ; сперматоцит; ; яичко; ; линза; ; генитальный бугорок; ; эпибласт; ; хвост эмбриона; ; нервная трубка; ; Средний мозг; ; желудочковая зона;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ; ; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; связывание белков; Связывание АТФ; связывание убиквитин-протеинлигазы; активность шаперона фолдинга белка; Связывание развернутого белка; Связывание РНК;
Клеточный компонент	цитоплазма; тело клетки; цитозоль; центросома; аппарат Гольджи; перицентриолярный материал; миелиновая оболочка; центр организации микротрубочек; рецепторный комплекс зоны пеллюцида; гетерохроматин; акросомальная везикула; шаперонин-содержащий Т-комплекс; микротрубочка; внеклеточная экзосома; цитоскелет;
Биологический процесс	сборка тубулинового комплекса; положительная регуляция локализации белка в теле Кахаля; позитивная регуляция установления локализации белка на теломере; Локализация scaRNA в тельце Кахаля; регуляция процесса апоптоза макрофагов; стабилизация белка; позитивная регуляция поддержания теломер посредством теломеразы; транспорт токсинов; сворачивание белка; позитивная регуляция активности теломеразы; транслокация пептидов или белков в цитоплазму клетки-хозяина; положительная регуляция локализации теломеразной РНК в теле Кахаля; связывание сперматозоидов с zona pellucida; 'de novo' сворачивание белка; сворачивание белка, опосредованное шапероном; сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-12;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6950
	21454
	ENSG00000120438
	ENSMUSG00000068039
	P17987
	P11983
	NM_030752 ; NM_001008897
	NM_001290712 ; NM_013686
	NP_001008897 ; NP_110379
	NP_001277641 ; NP_038714
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

У людей ген T-комплекса 1 , он же TCP1 , кодирует белок TCP-1 ^[a] , он же субъединица альфа белка 1 T-комплекса. ^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген кодирует молекулярный шаперон, который является членом комплекса TRiC . Этот комплекс состоит из двух идентичных сложенных колец, каждое из которых содержит восемь различных белков. Развернутые полипептиды входят в центральную полость комплекса и сворачиваются АТФ-зависимым образом. Комплекс сворачивает различные белки, включая актин и тубулин. Были охарактеризованы альтернативные транскрипционные варианты сплайсинга этого гена, кодирующие различные изоформы. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что T-комплекс 1 взаимодействует с PPP4C ^[8]^[9] и HDAC3 . ^[10] CCT также напрямую взаимодействует с лектиновым типом окисленного рецептора ЛПНП-1 (LOX-1), в то время как его лиганд окисленный липопротеин низкой плотности (OxLDL) диссоциирует CCT от LOX-1 . ^[11]

Примечания

^ Термин « TCP-1 » по-разному расшифровывается как «T-комплексный белок 1» и «полипептид 1 без хвоста». «T-комплекс» — это то же самое, что и комплекс без хвоста , локус CCT, связанный с длиной хвоста у мышей.

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000120438 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000068039 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фонатч К, Градл Г, Рагуссис Дж, Циглер А (октябрь 1987 г.). «Присвоение локуса TCP1 длинному плечу человеческой хромосомы 6 методом гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet . 45 (2): 109– 12. doi :10.1159/000132439. PMID 3476253.
^ Willison K, Kelly A, Dudley K, Goodfellow P, Spurr N, Groves V, Gorman P, Sheer D, Trowsdale J (ноябрь 1987 г.). «Человеческий гомолог гена t-комплекса мыши, TCP1, расположен на хромосоме 6, но не рядом с регионом HLA». EMBO J . 6 (7): 1967–74 . doi :10.1002/j.1460-2075.1987.tb02459.x. PMC 553584 . PMID 3653076.
^ ab "Ген Энтреза: TCP1 t-комплекс 1".
^ Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (октябрь 2008 г.). "PP4R4/KIAA1622 образует новый стабильный цитозольный комплекс с фосфопротеинфосфатазой 4". J. Biol. Chem . 283 (43): 29273– 84. doi : 10.1074/jbc.M803443200 . PMC 2662017. PMID 18715871 .
^ Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (ноябрь 2005 г.). «Новый, эволюционно консервативный комплекс протеинфосфатазы, участвующий в чувствительности к цисплатину». Mol. Cell. Proteomics . 4 (11): 1725– 40. doi : 10.1074/mcp.M500231-MCP200 . PMID 16085932.
^ Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (декабрь 2002 г.). «Сборка комплекса репрессии SMRT–гистондеацетилаза 3 требует кольцевого комплекса TCP-1». Genes Dev . 16 (24): 3130– 5. doi :10.1101/gad.1037502. PMC 187500. PMID 12502735 .
^ Bakthavatsalam D, Soung RH, Tweardy DJ, Chiu W, Dixon RA, Woodside DG (июнь 2014 г.). «Комплекс TCP-1, содержащий шаперонин, напрямую связывается с цитоплазматическим доменом рецептора LOX-1». FEBS Lett . 588 (13): 2133– 40. doi :10.1016/j.febslet.2014.04.049. PMC 4100626. PMID 24846140 .

Дальнейшее чтение

Horwich AL, Willison KR (1993). «Сворачивание белка в клетке: функции двух семейств молекулярных шаперонов, hsp 60 и TF55-TCP1». Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci . 339 (1289): 313–25 , обсуждение 325–6. doi :10.1098/rstb.1993.0030. PMID 8098536.
Burston SG, Clarke AR (1997). «Молекулярные шапероны: физические и механистические свойства». Essays Biochem . 29 : 125–36 . PMID 9189717.
Blanché H, Wright LG, Vergnaud G, de Gouyon B, Lauthier V, Silver LM, Dausset J, Cann HM, Spielman RS (1992). "Генетическое картирование трех человеческих гомологов генов мышиного t-комплекса локализует TCP10 в 6q27, на 15 cM дистальнее TCP1 и PLG". Genomics . 12 (4): 826– 8. doi :10.1016/0888-7543(92)90317-L. PMID 1572657.
Dawson SJ, White LA (1992). «Лечение эндокардита, вызванного Haemophilus aphrophilus, ципрофлоксацином». J. Infect . 24 (3): 317– 20. doi :10.1016/S0163-4453(05)80037-4. PMID 1602151.
Yaffe MB, Farr GW, Miklos D, Horwich AL, Sternlicht ML, Sternlicht H (1992). «Комплекс TCP1 является молекулярным шапероном в биогенезе тубулина». Nature . 358 (6383): 245– 8. Bibcode :1992Natur.358..245Y. doi :10.1038/358245a0. PMID 1630491. S2CID 4287521.
Льюис ВА, Хайнс ГМ, Чжэн Д, Сайбил Х, Уиллисон К (1992). «Т-комплексный полипептид-1 является субъединицей гетеромерной частицы в эукариотическом цитозоле». Nature . 358 (6383): 249– 52. Bibcode :1992Natur.358..249L. doi :10.1038/358249a0. PMID 1630492. S2CID 4306360.
Ursic D, Culbertson MR (1991). «Дрожжевой гомолог мышиного Tcp-1 влияет на процессы, опосредованные микротрубочками». Mol. Cell. Biol . 11 (5): 2629– 40. doi :10.1128/mcb.11.5.2629. PMC 360032. PMID 1901944 .
Кирхгофф К., Уиллисон К. (1990). "Нуклеотидная и аминокислотная последовательность человеческого яичек-производного TCP1". Nucleic Acids Res . 18 (14): 4247. doi :10.1093/nar/18.14.4247. PMC 331189. PMID 2377466.
Roobol A, Holmes FE, Hayes NV, Baines AJ, Carden MJ (1995). «Цитоплазматические шаперониновые комплексы проникают в невриты, развивающиеся in vitro, и различаются по субъединичному составу в пределах отдельных клеток». J. Cell Sci . 108 (4): 1477– 88. doi :10.1242/jcs.108.4.1477. PMID 7615668.
Эшворт А (1994). «Два гена ацетил-КоА-ацетилтрансферазы, расположенные в области t-комплекса мышиной хромосомы 17, частично перекрывают гены Tcp-1 и Tcp-1x». Геномика . 18 (2): 195– 8. doi :10.1006/geno.1993.1454. PMID 7904580.
Miklos D, Caplan S, Mertens D, Hynes G, Pitluk Z, Kashi Y, Harrison-Lavoie K, Stevenson S, Brown C, Barrell B (1994). "Первичная структура и функция второго существенного члена гетероолигомерного комплекса шаперонина TCP1 дрожжей, TCP1 beta". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (7): 2743– 7. Bibcode :1994PNAS...91.2743M. doi : 10.1073/pnas.91.7.2743 . PMC 43446 . PMID 7908441.
Chen X, Sullivan DS, Huffaker TC (1994). «Два гена дрожжей, сходных с TCP-1, необходимы для функционирования микротрубочек и актина in vivo». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (19): 9111– 5. Bibcode :1994PNAS...91.9111C. doi : 10.1073/pnas.91.19.9111 . PMC 44757 . PMID 7916460.
Кубота Х., Хайнс Г., Карн А., Эшворт А., Уиллисон К. (1994). «Идентификация шести генов, связанных с Tcp-1, кодирующих дивергентные субъединицы шаперонина, содержащего TCP-1». Curr. Biol . 4 (2): 89– 99. doi :10.1016/S0960-9822(94)00024-2. PMID 7953530. S2CID 31300131.
Frydman J, Hartl FU (1996). «Принципы сворачивания белков с помощью шаперона: различия между механизмами in vitro и in vivo». Science . 272 (5267): 1497– 502. Bibcode :1996Sci...272.1497F. doi :10.1126/science.272.5267.1497. PMID 8633246. S2CID 22363826.
Moudjou M, Bordes N, Paintrand M, Bornens M (1996). "гамма-тубулин в клетках млекопитающих: центросомальная и цитозольная формы". J. Cell Sci . 109 (4): 875–87 . doi :10.1242/jcs.109.4.875. PMID 8718679.
Morrison K, Papapetrou C, Attwood J, Hol F, Lynch SA, Sampath A, Hamel B, Burn J, Sowden J, Stott D, Mariman E, Edwards YH (1997). "Генетическое картирование человеческого гомолога (T) мышиного T (Brachyury) и поиск аллельной ассоциации между человеческим T и spina bifida". Hum. Mol. Genet . 5 (5): 669– 74. doi : 10.1093/hmg/5.5.669 . hdl : 2066/23945 . PMID 8733136.
Masuno M, Fukao T, Song XQ, Yamaguchi S, Orii T, Kondo N, Imaizumi K, Kuroki Y (1997). "Присвоение гена цитозольной ацетоацетил-коэнзим А тиолазы человека (ACAT2) хромосоме 6q25.3-q26". Genomics . 36 (1): 217– 8. doi :10.1006/geno.1996.0452. PMID 8812443.

Эта статья о гене на хромосоме 6 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[5] Термин « TCP-1 » по-разному расшифровывается как «T-комплексный белок 1» и «полипептид 1 без хвоста». «T-комплекс» — это то же самое, что и комплекс без хвоста , локус CCT, связанный с длиной хвоста у мышей.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000120438 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000068039 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid3476253-6] Фонатч К, Градл Г, Рагуссис Дж, Циглер А (октябрь 1987 г.). «Присвоение локуса TCP1 длинному плечу человеческой хромосомы 6 методом гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet . 45 (2): 109– 12. doi :10.1159/000132439. PMID 3476253.

[pmid3653076-7] Willison K, Kelly A, Dudley K, Goodfellow P, Spurr N, Groves V, Gorman P, Sheer D, Trowsdale J (ноябрь 1987 г.). «Человеческий гомолог гена t-комплекса мыши, TCP1, расположен на хромосоме 6, но не рядом с регионом HLA». EMBO J . 6 (7): 1967–74 . doi :10.1002/j.1460-2075.1987.tb02459.x. PMC 553584 . PMID 3653076.

[entrez-8] "Ген Энтреза: TCP1 t-комплекс 1".

[pmid18715871-9] Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (октябрь 2008 г.). "PP4R4/KIAA1622 образует новый стабильный цитозольный комплекс с фосфопротеинфосфатазой 4". J. Biol. Chem . 283 (43): 29273– 84. doi : 10.1074/jbc.M803443200 . PMC 2662017. PMID 18715871 .

[pmid16085932-10] Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (ноябрь 2005 г.). «Новый, эволюционно консервативный комплекс протеинфосфатазы, участвующий в чувствительности к цисплатину». Mol. Cell. Proteomics . 4 (11): 1725– 40. doi : 10.1074/mcp.M500231-MCP200 . PMID 16085932.

[pmid12502735-11] Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (декабрь 2002 г.). «Сборка комплекса репрессии SMRT–гистондеацетилаза 3 требует кольцевого комплекса TCP-1». Genes Dev . 16 (24): 3130– 5. doi :10.1101/gad.1037502. PMC 187500. PMID 12502735 .

[pmid24846140-12] Bakthavatsalam D, Soung RH, Tweardy DJ, Chiu W, Dixon RA, Woodside DG (июнь 2014 г.). «Комплекс TCP-1, содержащий шаперонин, напрямую связывается с цитоплазматическим доменом рецептора LOX-1». FEBS Lett . 588 (13): 2133– 40. doi :10.1016/j.febslet.2014.04.049. PMC 4100626. PMID 24846140 .