Подавление субтрактивной гибридизации

Субтрактивная гибридизация — это технология, которая позволяет проводить ПЦР- амплификацию только фрагментов кДНК , которые различаются между контрольным (драйверным) и экспериментальным транскриптомом . кДНК производится из мРНК . Выделены различия в относительном количестве транскриптов, а также генетические различия между видами. Метод основан на удалении дцДНК, образованной гибридизацией между контрольным и тестовым образцом, тем самым устраняя кДНК или гДНК с аналогичным количеством и сохраняя дифференциально выраженные или изменяющиеся по последовательности транскрипты или геномные последовательности.

Супрессионная субтрактивная гибридизация также успешно применялась для идентификации штаммо- или видоспецифичных последовательностей ДНК у различных бактерий, включая виды Vibrio ( метагеномика ).

Смотрите также

  • Обзор на evrogen.com
  • Мунир, С.; Сингх, С.; Каур, К.; Капур, В. (2004). «Подавляющая субтрактивная гибридизация в сочетании с анализом микрочипов для изучения дифференциальной экспрессии генов в клетках, инфицированных вирусом». Biological Procedures Online . 6 : 94–104. doi :10.1251/bpo77. PMC 420231.  PMID 15181476  .
  • Дятченко, Л. (1996). «Подавляющая субтрактивная гибридизация: метод создания дифференциально регулируемых или тканеспецифичных зондов и библиотек кДНК». Труды Национальной академии наук . 93 (12): 6025–6030. Bibcode : 1996PNAS ...93.6025D. doi : 10.1073/pnas.93.12.6025 . PMC  39182. PMID  8650213.
  • Galbraith, EA; Antonopoulos, DA; White, BA (2004). «Подавляющая субтрактивная гибридизация как инструмент для определения генетического разнообразия в экологическом метагеноме: рубец как модель». Environmental Microbiology . 6 (9): 928–937. doi :10.1111/j.1462-2920.2004.00575.x. PMID  15305918.


Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Suppression_subtractive_hybridization&oldid=1045512151"