Минимальная информация об эксперименте с микрочипами
Минимальная информация об эксперименте с микрочипами ( MIAME ) — это стандарт, созданный обществом FGED для представления данных об экспериментах с микрочипами . [1]
MIAME предназначен для указания всей информации, необходимой для однозначной интерпретации результатов эксперимента и потенциального воспроизведения эксперимента. Хотя стандарт определяет содержание, необходимое для соответствующих отчетов, он не определяет формат, в котором должны быть представлены эти данные. MIAME описывает минимальную информацию, необходимую для обеспечения того, чтобы данные микрочипов можно было легко интерпретировать, а результаты, полученные в результате их анализа, можно было бы независимо проверить. [2] Существует ряд форматов файлов , используемых для представления этих данных, а также как публичные, так и подписные репозитории для таких экспериментов. [2] Кроме того, существует программное обеспечение, помогающее в подготовке отчетов, соответствующих MIAME.
MIAME вращается вокруг шести ключевых компонентов: необработанные данные , нормализованные данные , аннотации образцов, экспериментальный дизайн , аннотации массивов и протоколы данных.
Ссылки
- ^ "Домашняя страница MIAME". Веб-сайт FGED Society . Получено 13 сентября 2012 г.
- ^ ab Brazma, Alvis; Hingamp, Pascal; Quackenbush, John; Sherlock, Gavin; Spellman, Paul; Stoeckert, Chris; Aach, John; Ansorge, Wilhelm; Ball, Catherine A.; Causton, Helen C.; Gaasterland, Terry; Glenisson, Patrick; Holstege, Frank CP; Kim, Irene F.; Markowitz, Victor; Matese, John C.; Parkinson, Helen; Robinson, Alan; Sarkans, Ugis; Schulze-Kremer, Steffen; Stewart, Jason; Taylor, Ronald; Vilo, Jaak; Vingron, Martin (декабрь 2001 г.). "Минимальная информация об эксперименте с микрочипами (MIAME) — к стандартам для данных с микрочипами". Nature Genetics . 29 (4): 365– 371. doi : 10.1038/ng1201-365 . ISSN 1061-4036. PMID 11726920. S2CID 6994467.
