Смита Кришнасвами
американский ученый
Смита Кришнасвами
Альма-матер
Научная карьера
ПоляКомпьютерные науки , Генетика , Машинное обучение , Автоматизация проектирования электронных устройств
УчрежденияIBM , Йельский университет
ТезисПроектирование, анализ и тестирование логических схем в условиях неопределенности  (2008)
научный руководительИгорь Л. Марков , Джон П. Хейс

Смита Кришнасвами — американский ученый и доцент кафедры генетики и компьютерных наук [1] ​​в Йельском университете . Она специализируется на разработке методов машинного обучения для анализа многомерных высокопроизводительных биомедицинских данных с применением в иммунологии , иммунотерапии , онкологии , нейробиологии , биологии развития и результатах в области здравоохранения. Она организовала проект Open Problems in Single-Cell Biology совместно с Chan Zuckerberg Initiative и остается научным консультантом проекта. [2]

Образование и начало карьеры

Кришнасвами получила докторскую степень в области компьютерных наук и инженерии в Мичиганском университете в 2008 году. [3] Затем она присоединилась к исследовательскому центру IBM TJ Watson в качестве ученого в системном подразделении, где она исследовала формальные методы автоматизированного обнаружения ошибок. Ее алгоритм Deltasyn использовался в высокопроизводительных серверных чипах IBM System p и IBM System z . [4]

Кришнасвами переключила свои исследовательские усилия на биологию и завершила постдокторскую подготовку в 2015 году в Колумбийском университете на кафедре системной биологии , где она сосредоточилась на изучении вычислительных моделей клеточной сигнализации на основе данных массовой цитометрии отдельных клеток . [5]

Награды и почести

В 2022 году исследовательская, преподавательская и общественная деятельность Кришнасвами были отмечены премией FASEB за выдающиеся достижения в науке (премия исследователю раннего периода) от Федерации американских обществ экспериментальной биологии, финансируемой Eli Lilly and Company. [6]

В 2009 году Кришнасвами был удостоен премии Европейской ассоциации автоматизации проектирования за выдающуюся диссертацию в категории «новые направления в тестировании схем и систем». [7]

В 2005 году Кришнасвами получила награду за лучшую статью на конференции Design Automation and Test in Europe за статью, ведущим автором которой она была. [8]

Публикации

Кришнасвами был соавтором книги, опубликованной Springer Verlag [9] и более 50 рецензируемых публикаций, включая журнальные статьи в Nature Biotechnology , [10] Nature Protocols , [11] Nature Methods [12] Science , [13] Cell [14] и доклады на конференции International Conference on Machine Learning . [15]

Ссылки

  1. ^ "Смита Кришнасвами". Йельская школа инженерии и прикладных наук . Получено 28 августа 2023 г.
  2. ^ "Знакомьтесь с командой". Открытые проблемы . Получено 28 августа 2023 г.
  3. ^ "Смита Кришнасвами". Проект генеалогии математики . Получено 28 августа 2023 г.
  4. ^ Кришнасвами, Смита; Рен, Хаосин; Моди, Нилеш; Пури, Ручир (ноябрь 2009 г.). «DeltaSyn: эффективный логический оптимизатор разности для синтеза ECO». ICCAD : 789– 796. doi :10.1145/1687399.1687546. S2CID  5473395.
  5. ^ «Смита Кришнасвами, доктор философии». Фонд Саймонса. 2017.
  6. ^ "Past Recipients". Федерация американских обществ экспериментальной биологии . Получено 28 августа 2023 г.
    - «Кришнасвами получает премию за выдающиеся достижения в науке». Факультет компьютерных наук Йельского университета. 8 сентября 2022 г.
  7. ^ «Получатели премии EDAA за выдающуюся диссертацию» . ЭДАА. Архивировано из оригинала 17 ноября 2023 года . Проверено 28 августа 2023 г.
  8. ^ Кришнасвами, Смита; Виамонтес, Джордж Ф.; Марков, Игорь Л.; Хейс, Джон П. (2005). «Точная оценка надежности и повышение ее с помощью вероятностных матриц переноса». ДАТА : 282–287 .
    - "Best Paper Awards" (PDF) . Получено 12 августа 2023 г. .
  9. ^ Кришнасвами, Смита; Марков, Игорь Л.; Хейс, Джон П. (2012). Проектирование, анализ и тестирование логических схем в условиях неопределенности . Springer. ISBN 978-90-481-9643-2.
  10. ^ ED Amir; KL Davis; MD Tadmor; EF Simonds; JH Levine; SC Bendall (2013). «viSNE позволяет визуализировать многомерные данные по отдельным клеткам и выявляет фенотипическую гетерогенность лейкемии». Nature Biotechnology . 31 (6): 545– 552. doi :10.1038/nbt.2594. PMC 4076922 . PMID  23685480. 
    - KR Moon; D van Dijk; Z Wang; S Gigante; DB Burkhardt; WS Chen; K Yim (2019). «Визуализация структуры и переходов в многомерных биологических данных». Nature Biotechnology . 37 (12): 1482– 1492. doi :10.1038/s41587-019-0336-3. PMC 7073148 . PMID  31796933. 
  11. ^ ER Zunder; R Finck; GK Behbehani; ED Amir; S Krishnaswamy (2015). «Штрихкодирование ячеек с использованием палладиевой массовой метки со схемой дублетной фильтрации и алгоритмом деконволюции отдельных ячеек». Nature Protocols . 10 (2): 316– 333. doi :10.1038/nprot.2015.020. PMC 4347881 . PMID  25612231. 
  12. ^ M Amodio; D Van Dijk; K Srinivasan; WS Chen; H Mohsen; KR Moon (2019). «Изучение данных об отдельных ячейках с помощью глубоких многозадачных нейронных сетей». Nature Methods . 16 (11): 1139– 1145. doi :10.1038/s41592-019-0576-7. PMC 10164410. PMID  31591579. 
  13. ^ S Krishnaswamy; MH Spitzer; M Mingueneau; SC Bendall; O Litvin (2014). "Условный анализ на основе плотности сигналов Т-клеток в данных об отдельных клетках". Science . 346 (6213): 1250689. doi :10.1126/science.1250689. PMC 4334155 . PMID  25342659. 
  14. ^ D Van Dijk; R Sharma; J Nainys; K Yim; P Kathail; AJ Carr; C Burdziak (2018). «Восстановление взаимодействий генов из данных об отдельных клетках с использованием диффузии данных». Cell . 174 (3): 716– 729. doi :10.1016/j.cell.2018.05.061. PMC 6771278 . PMID  29961576. 
  15. ^ Мэтью Амодио; Смита Кришнасвами (2018). «MAGAN: Выравнивание биологического многообразия». ICML . 2018 : 215–223 . arXiv : 1803.00385 .
    - Александр Тонг; Джесси Хуан; Гай Вольф; Дэвид ван Дейк; Смита Кришнасвами (2020). «TrajectoryNet: динамическая оптимальная транспортная сеть для моделирования клеточной динамики». ICML . 2020 : 9526–9536 . arXiv : 2002.04461 .
    - Александр Тонг; Гийом Юге; Амин Натик; Кинкейд Макдональд; Маник Кучру; Рональд Р. Койфман; Гай Вольф; Смита Кришнасвами (2021). «Расстояние и распределение вложений диффузионного землеройного двигателя». ICML . 2021 : 10336– 10346. arXiv : 2102.12833 .
  • Открытые проблемы в биологии одноклеточных организмов
  • Публикации Смиты Кришнасвами, проиндексированные Google Scholar
  • Смита Кришнасвами на библиографическом сервере DBLP
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Смита_Кришнасвами&oldid=1268932093"