Белок, активирующий расщепление SREBP

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
СКАП
Идентификаторы
ПсевдонимыSCAP , entrez:22937, шаперон SREBF
Внешние идентификаторыОМИМ : 601510; МГИ : 2135958; Гомологен : 8160; GeneCards : SCAP; OMA :SCAP — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_012235
NM_001320044

NM_001001144
NM_001103162

RefSeq (белок)

NP_001306973
NP_036367

NP_001001144
NP_001096632

Местоположение (UCSC)Хр 3: 47.41 – 47.48 МбХр 9: 110.16 – 110.21 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок, связывающий регуляторный элемент стерола, активирующий расщепление , также известный как белок, активирующий расщепление SREBP или SCAP , представляет собой белок , который у людей кодируется геном SCAP . [ 5] [6] [7] [8]

SCAP содержит домен стерол-сенсора (SSD) и семь доменов WD . В клетках с дефицитом холестерина этот белок связывается с белками, связывающими регуляторные элементы стерола (SREBP), и опосредует их транспорт из ЭР в аппарат Гольджи . Затем SREBP протеолитически расщепляются и стимулируют биосинтез стерола . [5]

Функция

SCAP — это регуляторный белок, который необходим для протеолитического расщепления белка, связывающего регуляторный элемент стерола ( SREBP ). SCAP — это интегральный мембранный белок, расположенный в эндоплазматическом ретикулуме (ER). Одна из цитозольных областей SCAP содержит гексапептидную аминокислотную последовательность, MELADL, которая функционирует для обнаружения клеточного холестерина. Когда присутствует холестерин, SCAP претерпевает конформационное изменение, которое не позволяет ему активировать SREBP, и синтез холестерина не происходит. [9]

Структура

Scap имеет 8 трансмембранных доменов, и оба N-конца и C-конца обращены к цитоплазме . Кроме того, он связывает SREBP серией последовательных повторов WD на своем C-конце. [10]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000114650 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032485 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab "Entrez Gene: шаперон SREBF".
  6. ^ Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tanaka A, Nomura N (февраль 1996 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. V. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0161-KIAA0200), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». DNA Res . 3 (1): 17– 24. doi : 10.1093/dnares/3.1.17 . PMID  8724849.
  7. ^ Hua X, Nohturfft A, Goldstein JL, Brown MS (ноябрь 1996 г.). «Устойчивость к стеролам в клетках CHO, отслеженная до точечной мутации в белке, активирующем расщепление SREBP». Cell . 87 (3): 415–26 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)81362-8 . PMID  8898195. S2CID  1963192.
  8. ^ Nakajima T, Hamakubo T, Kodama T, Inazawa J, Emi M (1999). «Геномная структура и хромосомное картирование гена белка, связывающего регуляторный элемент стерола человека (SREBP), активирующего расщепление белка (SCAP)». J. Hum. Genet . 44 (6): 402–7 . doi : 10.1007/s100380050187 . PMID  10570913.
  9. ^ Sun LP, Seemann J, Goldstein JL, Brown MS (2007). «Регулируемый стеролами транспорт SREBP из эндоплазматического ретикулума в Гольджи: Insig делает сортировочный сигнал в Scap недоступным для белков COPII». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 104 (16): 6519– 26. doi : 10.1073/pnas.0700907104 . PMC 1851663 . PMID  17428919. 
  10. ^ Браун М.С., Голдштейн Дж.Л. (1999). «Протеолитический путь, контролирующий содержание холестерина в мембранах, клетках и крови». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (20): 11041– 8. Bibcode : 1999PNAS...9611041B. doi : 10.1073 /pnas.96.20.11041 . PMC 34238. PMID  10500120. 

Дальнейшее чтение

  • Le Hellard S, Theisen FM, Haberhausen M и др. (2009). «Связь между геном 2, индуцированным инсулином (INSIG2), и увеличением веса в немецкой выборке пациентов с шизофренией, лечившихся антипсихотиками: нарушение липогенеза, контролируемого SREBP, при метаболических побочных эффектах, связанных с приемом лекарств?». Mol. Psychiatry . 14 (3): 308– 17. doi :10.1038/sj.mp.4002133. PMID  18195716. S2CID  28333347.
  • McGeachie M, Ramoni RL, Mychaleckyj JC и др. (2009). «Интегративная прогностическая модель кальцификации коронарных артерий при атеросклерозе». Circulation . 120 (24): 2448– 54. doi :10.1161/CIRCULATIONAHA.109.865501. PMC  2810344 . PMID  19948975.
  • Friedlander Y, Schwartz SM, Durst R и др. (2008). «Изоформы SREBP-2 и SCAP и риск раннего инфаркта миокарда». Атеросклероз . 196 (2): 896–904 . doi :10.1016/j.atherosclerosis.2007.02.006. PMID  17383658.
  • Otsuki T, Ota T, Nishikawa T и др. (2005). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для выбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек кДНК с олиго-кэпом». DNA Res . 12 (2): 117–26 . doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID  16303743.
  • Javitt NB (2002). «Холестерин, гидроксихолестерины и желчные кислоты». Biochem. Biophys. Res. Commun . 292 (5): 1147– 53. doi :10.1006/bbrc.2001.2013. PMID  11969205.
  • Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Й и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560 .
  • Lee JN, Gong Y, Zhang X, Ye J (2006). «Протеасомная деградация убиквитинированных белков Insig определяется остатками серина, фланкирующими убиквитинированные лизины». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (13): 4958– 63. Bibcode :2006PNAS..103.4958L. doi : 10.1073/pnas.0600422103 . PMC  1405624 . PMID  16549805.
  • Lu Y, Dollé ME, Imholz S и др. (2008). «Множественные генетические варианты вдоль путей-кандидатов влияют на концентрацию холестерина липопротеинов высокой плотности в плазме». J. Lipid Res . 49 (12): 2582– 9. doi : 10.1194/jlr.M800232-JLR200 . PMID  18660489.
  • Suchanek M, Radzikowska A, Thiele C (2005). «Фотолейцин и фотометионин позволяют идентифицировать белок-белковые взаимодействия в живых клетках». Nat. Methods . 2 (4): 261– 7. doi : 10.1038/nmeth752 . PMID  15782218.
  • Irisawa M, Inoue J, Ozawa N и др. (2009). «Стерол-чувствительный мембранный белок эндоплазматического ретикулума (ER) TRC8 затрудняет транспорт стерол-регуляторного элемента-связывающего белка-2 (SREBP-2)/белка, активируемого расщеплением SREBP, из ER в аппарат Гольджи и снижает расщепление SREBP-2». J. Biol. Chem . 284 (42): 28995– 9004. doi : 10.1074/jbc.M109.041376 . PMC  2781446. PMID  19706601 .
  • Yang LH, Chen DF (2007). "[Влияние TNF альфа на экспрессию SCAP и содержание триглицеридов в культивируемых стеатозных гепатоцитах]". Zhonghua Gan Zang Bing Za Zhi . 15 (10): 767–70 . PMID  17963605.
  • Voora D, Shah SH, Reed CR и др. (2008). «Фармакогенетические предикторы снижения холестерина липопротеинов низкой плотности, опосредованного статинами, и дозозависимый ответ». Circ Cardiovasc Genet . 1 (2): 100– 6. doi :10.1161/CIRCGENETICS.108.795013. PMC  2995295. PMID  20031551 .
  • Fan YM, Karhunen PJ, Levula M и др. (2008). «Экспрессия фактора транскрипции, связывающего регуляторный элемент стерола (SREBF) 2 и белка, активирующего расщепление SREBF (SCAP), в атероме человека и связь их аллельных вариантов с внезапной сердечной смертью». Thromb J . 6 : 17. doi : 10.1186/1477-9560-6-17 . PMC  2645360 . PMID  19116028.
  • Vasseur F, Caeyseele T, Barat-Houari M и др. (2010). «Согласование двух множественных аналитических подходов демонстрирует, что взаимодействие между ИМТ и гаплотипами ADIPOQ является детерминантой холестерина ЛПНП в общей популяции Франции». J. Hum. Genet . 55 (4): 227– 31. doi : 10.1038/jhg.2010.10 . PMID  20186155.
  • Durst R, Jansen A, Erez G и др. (2006). «Дискретное и комбинированное действие изоформ SREBP-2 и SCAP в контроле липидов плазмы среди пациентов с семейной гиперхолестеринемией». Атеросклероз . 189 (2): 443–50 . doi :10.1016/j.atherosclerosis.2006.01.001. PMID  16466730.
  • Лю X, Ли Y, Лу X и др. (2010). «Взаимодействие генетических вариантов пути, связанного с активацией SREBP2, с риском ишемической болезни сердца у китайской популяции хань». Атеросклероз . 208 (2): 421– 6. doi :10.1016/j.atherosclerosis.2009.08.011. PMID  19740467.
  • Chen SN, Cilingiroglu M, Todd J, et al. (2009). "Кандидатный генетический анализ липопротеинов высокой плотности-холестерина плазмы и тяжесть коронарного атеросклероза". BMC Med. Genet . 10 : 111. doi : 10.1186/1471-2350-10-111 . PMC  2775733. PMID  19878569 .
  • Lee JN, Zhang X, Feramisco JD и др. (2008). «Ненасыщенные жирные кислоты ингибируют протеасомную деградацию Insig-1 на этапе постубиквитинирования». J. Biol. Chem . 283 (48): 33772– 83. doi : 10.1074/jbc.M806108200 . PMC  2586246. PMID  18835813 .
  • Nieminen T, Matinheikki J, Nenonen A и др. (2007). «Связь полиморфизмов гена белка, связывающего регуляторный элемент стерола, белка активации расщепления и аполипопротеина E с метаболическими изменениями во время снижения веса». Metab. Clin. Exp . 56 (7): 876– 80. doi :10.1016/j.metabol.2007.02.003. PMID  17570245.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .


Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SREBP_cleavage-activating_protein&oldid=1189312749"