СПТБН4

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
СПТБН4
Идентификаторы
ПсевдонимыSPTBN4 , QV, SPNB4, SPTBN3, спектрин бета, неэритроцитарный 4, CMND, NEDHND
Внешние идентификаторыОМИМ : 606214; МГИ : 1890574; гомологен : 11879; GeneCards : SPTBN4; OMA :SPTBN4 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_020971
NM_025213

NM_001199234
NM_001199235
NM_001199236
NM_032610

RefSeq (белок)

NP_066022
NP_079489

н/д

Местоположение (UCSC)Хр 19: 40.47 – 40.58 МбХр 7: 27.06 – 27.15 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Спектрин, бета, неэритроцитарный 4 , также известный как SPTBN4 , представляет собой белок , который у людей кодируется геном SPTBN4 . [ 5] [6]

Спектрин — это сшивающий актин и молекулярный белок-каркас, который связывает клеточную мембрану с актиновым цитоскелетом и функционирует в определении формы клетки, расположении трансмембранных белков и организации органелл . Он состоит из двух антипараллельных димеров альфа- и бета-субъединиц. Этот ген является одним из членов семейства генов бета-спектрина. Кодируемый белок локализуется в ядерном матриксе , ядерных тельцах PML и цитоплазматических везикулах . Очень похожий ген у мыши необходим для локализации специфических мембранных белков в поляризованных областях нейронов. Для этого гена были обнаружены множественные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [5]

Взаимодействия

Было показано, что SPTBN4 взаимодействует с PTPRN [6] и DISC1 . [7]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000160460 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000011751 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab "Ген Энтреза: спектрин SPTBN4, бета, неэритроцитарный 4".
  6. ^ ab Berghs S, Aggujaro D, Dirkx R, Maksimova E, Stabach P, Hermel JM, Zhang JP, Philbrick W, Slepnev V, Ort T, Solimena M (ноябрь 2000 г.). "betaIV spectrin, a new spectrin, located at a accon initial segments and nodes of ranvier in the central and periferical nerve system". J. Cell Biol . 151 (5): 985– 1002. doi :10.1083/jcb.151.5.985. PMC 2174349. PMID  11086001 . 
  7. ^ Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (июль 2003 г.). "DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) — это белок, ассоциированный с центросомой, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4/5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией". Hum. Mol. Genet . 12 (13): 1591– 608. doi : 10.1093/hmg/ddg162 . PMID  12812986.

Дальнейшее чтение

  • Nagase T, Kikuno R, Nakayama M, Hirosawa M, Ohara O (2001). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 7 (4): 273– 81. doi : 10.1093/dnares/7.4.271 . PMID  10997877.
  • Berghs S, Aggujaro D, Dirkx R, Maksimova E, Stabach P, Hermel JM, Zhang JP, Philbrick W, Slepnev V, Ort T, Solimena M (2001). "betaIV spectrin, новый spectrin, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе". J. Cell Biol . 151 (5): 985– 1002. doi :10.1083/jcb.151.5.985. PMC  2174349. PMID  11086001 .
  • Tse WT, Tang J, Jin O, Korsgren C, John KM, Kung AL, Gwynn B, Peters LL, Lux SE (2001). «Новый спектрин, бета IV, имеет основную укороченную изоформу, которая ассоциируется с ядерными тельцами белка промиелоцитарного лейкоза и ядерным матриксом». J. Biol. Chem . 276 (26): 23974– 85. doi : 10.1074/jbc.M009307200 . PMID  11294830.
  • Комада М., Сориано П. (2002). «[Бета]IV-спектрин регулирует кластеризацию натриевых каналов через анкирин-G в начальных сегментах аксонов и перехватах Ранвье». J. Cell Biol . 156 (2): 337–48 . doi :10.1083/jcb.200110003. PMC  2199236. PMID  11807096 .
  • Shoeman RL, Hartig R, Hauses C, Traub P (2003). «Организация очаговых адгезионных бляшек нарушается под действием протеазы ВИЧ-1». Cell Biol. Int . 26 (6): 529–39 . doi :10.1006/cbir.2002.0895. PMID  12119179. S2CID  39778155.
  • Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Взаимодействия белок-белок между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res . 12 (11): 1773– 84. doi :10.1101/gr.406902. PMC  187542. PMID  12421765 .
  • Ozeki Y, Tomoda T, Kleiderlein J, Kamiya A, Bord L, Fujii K, Okawa M, Yamada N, Hatten ME, Snyder SH, Ross CA, Sawa A (2003). "Disrupted-in-Schizophrenia-1 (DISC-1): усечение мутанта предотвращает связывание с NudE-like (NUDEL) и ингибирует рост нейритов". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (1): 289– 94. Bibcode :2003PNAS..100..289O. doi : 10.1073/pnas.0136913100 . PMC  140954 . PMID  12506198.
  • Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (2004). "DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) — это белок, ассоциированный с центросомой, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4/5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией". Hum. Mol. Genet . 12 (13): 1591– 608. doi : 10.1093/hmg/ddg162 . PMID  12812986.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SPTBN4&oldid=1115731392"