Белок ArgBP2 , также называемый сорбином и белком 2, содержащим домен SH3, — это белок , который у людей кодируется геном SORBS2 . [5] [6] ArgBP2 принадлежит к небольшому семейству адаптерных белков, имеющих домены гомологии с сорбином (SOHO). ArgBP2 широко распространен в клетках сердечной мышцы в саркомерных структурах Z-диска и экспрессируется в других клетках в актиновых стрессовых волокнах и ядре .
Структура
ArgBP2 может существовать в 9 уникальных изоформах в диапазоне от 52 кДа до 117 кДа (от 492 до 1100 аминокислот). [6] ArgBP2 принадлежит к небольшому семейству адаптерных белков, имеющих домены гомологии сорбина (SOHO) и три домена SH3 , которые регулируют клеточную адгезию, организацию цитоскелета и сигнализацию факторов роста; другие члены включают CAP/понсин и винексин . [7] Три домена SH3 являются C-концевыми , домен, богатый серином-треонином [8], находится в середине, а домен гомологии сорбина (SoHo) является N-концевым . Домены SH3 взаимодействуют с Arg/Abl, винкулином. [7] Домен SOHO взаимодействует с флотилином, обнаруженным в липидных плотах. [9]
Функция
Субклеточная локализация этого белка в эпителиальных и сердечных мышечных клетках предполагает, что ArgBP2 функционирует как адаптерный белок для сборки сигнальных комплексов в стрессовых волокнах и что он является потенциальной связью между киназами семейства Abl и актиновым цитоскелетом. ArgBP2 содержит несколько потенциальных участков фосфорилирования Abl; [8] Arg и c-Abl представляют собой млекопитающих членов семейства Абельсона нерецепторных протеин-тирозиновых киназ. В немышечных клетках ArgBP2 связывается с Cbl , что усиливает деградацию c-Abl ; [10] а также с Pyk2, который способствует ремоделированию цитоскелета. [11] Связывание ArgBP2 с флотилином на липидных плотах может указывать на роль ArgBP2 в транспортировке везикул и передаче сигнала. Флотиллин в клетках скелетных мышц имеет полосатый рисунок [12], что предполагает локализацию в Т-трубочках или саркоплазматических ретикулярных цистернах, хотя точная роль в сердечных клетках не определена . В клетках сердечной мышцы эксперименты по вытягиванию обнаружили ArgBP2 в комплексе с альфа-актинином-2 , винкулином , спектрином , паксиллином , Pyk2 и флотиллином , что предполагает, что ArgBP2 может участвовать в сборке миофибрилл и передаче сигналов Z-полосы в кардиомиоцитах, [13] хотя для выяснения конкретных механизмов необходимы функциональные исследования. ArgBP2 был связан с гипертрофической сигнализацией, поскольку мощная паракринно-действующая молекула РНК, которая, как было показано, вызывает сердечную гипертрофию у мышей, miR-21 действует как на ArgBP2, так и на PDLIM5 , запуская гипертрофическую реакцию. [14]
Клиническое значение
Повышенные уровни сывороточного ArgBP2 и координированное снижение ArgBP2 в ткани миокарда были обнаружены на самой ранней стадии у пациентов, перенесших инфаркт миокарда и умерших в течение 7 часов после инсульта. [15] Перицентрическая инверсия хромосомы 4 наблюдалась у 10 пациентов с сопутствующими сердечными дефектами, связанными с терминальными делециями 4q35.1, которые могут влиять на SORBS2 . [16]
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000154556 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031626 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ abc Wang B, Golemis EA, Kruh GD (июль 1997 г.). "ArgBP2, содержащий множественный домен Src homology 3, взаимодействующий с Arg/Abl белок, фосфорилируется в трансформированных v-Abl клетках и локализуется в стрессовых волокнах и Z-дисках кардиоцитов". Журнал биологической химии . 272 (28): 17542– 50. doi : 10.1074/jbc.272.28.17542 . hdl : 20.500.12613/9174 . PMID 9211900.
^ ab "Ген Entrez: сорбин SORBS2 и домен SH3, содержащий 2".
^ ab Kioka N, Ueda K, Amachi T (февраль 2002 г.). «Vinexin, CAP/ponsin, ArgBP2: новое семейство адаптерных белков, регулирующее организацию цитоскелета и передачу сигнала». Cell Structure and Function . 27 (1): 1– 7. doi : 10.1247/csf.27.1 . PMID 11937713.
^ ab Wang B, Golemis EA, Kruh GD (июль 1997 г.). "ArgBP2, содержащий множественный домен Src homology 3, взаимодействующий с Arg/Abl белок, фосфорилируется в трансформированных v-Abl клетках и локализуется в стрессовых волокнах и Z-дисках кардиоцитов". Журнал биологической химии . 272 (28): 17542– 50. doi : 10.1074/jbc.272.28.17542 . hdl : 20.500.12613/9174 . PMID 9211900.
^ Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные плоты». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (16): 9098– 103. Bibcode : 2001PNAS ...98.9098K. doi : 10.1073/pnas.151252898 . PMC 55379. PMID 11481476.
^ Soubeyran P, Barac A, Szymkiewicz I, Dikic I (февраль 2003 г.). «Комплекс Cbl-ArgBP2 опосредует убиквитинирование и деградацию c-Abl». The Biochemical Journal . 370 (Pt 1): 29– 34. doi :10.1042/BJ20021539. PMC 1223168 . PMID 12475393.
^ Haglund K, Ivankovic-Dikic I, Shimokawa N, Kruh GD, Dikic I (май 2004 г.). «Привлечение Pyk2 и Cbl к липидным плотам опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах». Journal of Cell Science . 117 (Pt 12): 2557– 68. doi : 10.1242/jcs.01148 . PMID 15128873.
^ Voldstedlund M, Vinten J, Tranum-Jensen J (ноябрь 2001 г.). "экспрессия cav-p60 в мышечных тканях крыс. Распределение кавеолярных белков". Cell and Tissue Research . 306 (2): 265–76 . doi :10.1007/s004410100439. PMID 11702238. S2CID 7420385.
^ abc Sanger JM, Wang J, Gleason LM, Chowrashi P, Dube DK, Mittal B, Zhukareva V, Sanger JW (декабрь 2010 г.). "Arg/Abl-связывающий белок, белок Z-тела и Z-полосы, связывает саркомерные, костамерные и сигнальные молекулы". Cytoskeleton . 67 (12): 808– 23. doi :10.1002/cm.20490. PMC 3019100 . PMID 20886612.
^ Bang C, Batkai S, Dangwal S, Gupta SK, Foinquinos A, Holzmann A, Just A, Remke J, Zimmer K, Zeug A, Ponimaskin E, Schmiedl A, Yin X, Mayr M, Halder R, Fischer A, Engelhardt S, Wei Y, Schober A, Fiedler J, Thum T (май 2014 г.). «Экзосомы, обогащенные пассажирской цепью микроРНК, полученной из сердечных фибробластов, опосредуют гипертрофию кардиомиоцитов». Журнал клинических исследований . 124 (5): 2136– 46. doi :10.1172/JCI70577. PMC 4001534. PMID 24743145 .
^ Kakimoto Y, Ito S, Abiru H, Kotani H, Ozeki M, Tamaki K, Tsuruyama T (2013). «Сорбин и белок 2, содержащий домен SH3, высвобождаются из инфарктного сердца на очень ранней стадии: протеомный анализ сердечных тканей пациентов». Журнал Американской кардиологической ассоциации . 2 (6): e000565. doi :10.1161/JAHA.113.000565. PMC 3886759. PMID 24342996 .
^ Maurin ML, Labrune P, Brisset S, Le Lorc'h M, Pineau D, Castel C, Romana S, Tachdjian G (февраль 2009 г.). «Молекулярно-цитогенетическая характеристика дупликации 4p15.1-pter и делеции 4q35.1-qter в рекомбинанте перицентрической инверсии хромосомы 4». American Journal of Medical Genetics Часть A. 149A ( 2): 226– 31. doi : 10.1002/ajmg.a.32603. PMID 19161154. S2CID 205310317.
^ ab Soubeyran P, Barac A, Szymkiewicz I, Dikic I (февраль 2003 г.). "Комплекс Cbl-ArgBP2 опосредует убиквитинирование и деградацию c-Abl". Biochem. J . 370 (Pt 1): 29– 34. doi :10.1042/BJ20021539. PMC 1223168 . PMID 12475393.
^ Sanger JM, Wang J, Gleason LM, Chowrashi P, Dube DK, Mittal B, Zhukareva V, Sanger JW (декабрь 2010 г.). "Arg/Abl-связывающий белок, белок Z-тела и Z-полосы, связывает саркомерные, костамерные и сигнальные молекулы". Cytoskeleton . 67 (12): 808– 23. doi :10.1002/cm.20490. PMC 3019100 . PMID 20886612.
^ ab Haglund K, Ivankovic-Dikic I, Shimokawa N, Kruh GD, Dikic I (май 2004 г.). «Привлечение Pyk2 и Cbl к липидным плотам опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах». J. Cell Sci . 117 (Pt 12): 2557– 68. doi : 10.1242/jcs.01148 . PMID 15128873.
^ Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные плоты». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (16): 9098– 103. Bibcode :2001PNAS...98.9098K. doi : 10.1073/pnas.151252898 . PMC 55379 . PMID 11481476.
^ Rönty M, Taivainen A, Moza M, Kruh GD, Ehler E, Carpen O (октябрь 2005 г.). «Участие палладина и альфа-актинина в нацеливании адаптера киназы Abl/Arg ArgBP2 на актиновый цитоскелет». Exp. Cell Res . 310 (1): 88– 98. doi :10.1016/j.yexcr.2005.06.026. PMID 16125169.
^ Kioka N, Ueda K, Amachi T (февраль 2002 г.). «Vinexin, CAP/ponsin, ArgBP2: новое семейство адаптерных белков, регулирующее организацию цитоскелета и передачу сигнала». Cell Struct. Funct . 27 (1): 1– 7. doi : 10.1247/csf.27.1 . PMID 11937713.
Дальнейшее чтение
Киока Н (ноябрь 2002 г.). «[Новое семейство адаптерных белков, регулирующее организацию цитоскелета и передачу сигнала — Винексин, CAP/понсин, ArgBP2]». Seikagaku. Журнал японского биохимического общества . 74 (11): 1356– 60. PMID 12510380.
Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Хиллер Л.Д., Леннон Дж., Беккер М., Бональдо М.Ф., Кьяпелли Б., Чиссо С., Дитрих Н., Дюбук Т., Фавелло А., Гиш В., Хокинс М., Хультман М., Кукаба Т., Лейси М., Ле М., Ле Н., Мардис Э. , Мур Б, Моррис М, Парсонс Дж, Прейндж С, Рифкин Л, Ролфинг Т, Шелленберг К, Бенто Соареш М, Тан Ф., Тьерри-Мэг Дж., Треваскис Э., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра М. (сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 меток экспрессируемых последовательностей человека». Геномные исследования . 6 (9): 807–28 . doi : 10.1101/gr.6.9.807 . ПМИД 8889549.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки ДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Kawabe H, Hata Y, Takeuchi M, Ide N, Mizoguchi A, Takai Y (октябрь 1999 г.). "nArgBP2, новый нейронный член семейства ponsin/ArgBP2/vinexin, который взаимодействует с белком 90, ассоциированным с синапсом/белком, ассоциированным с постсинаптической плотностью 95 (SAPAP)". Журнал биологической химии . 274 (43): 30914– 8. doi : 10.1074/jbc.274.43.30914 . PMID 10521485.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Research . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсакс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б. , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК 311072 . PMID 11230166.
Zucconi A, Dente L, Santonico E, Castagnoli L, Cesareni G (апрель 2001 г.). «Выбор лигандов путем панорамирования библиотек доменов, отображаемых на фаге лямбда, выявляет новых потенциальных партнеров синаптоянина 1». Журнал молекулярной биологии . 307 (5): 1329–39 . doi :10.1006/jmbi.2001.4572. PMID 11292345.
Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные плоты». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (16): 9098– 103. Bibcode : 2001PNAS...98.9098K. doi : 10.1073/pnas.151252898 . PMC 55379. PMID 11481476 .
Xu YC, Wu RF, Gu Y, Yang YS, Yang MC, Nwariaku FE, Terada LS (август 2002 г.). «Участие TRAF4 в окислительной активации N-терминальной киназы c-Jun». Журнал биологической химии . 277 (31): 28051– 7. doi : 10.1074/jbc.M202665200 . PMID 12023963.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (ноябрь 2002 г.). «Взаимодействия белок-белок между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Research . 12 (11): 1773– 84. doi :10.1101/gr.406902. PMC 187542 . PMID 12421765.
Soubeyran P, Barac A, Szymkiewicz I, Dikic I (февраль 2003 г.). "Комплекс Cbl-ArgBP2 опосредует убиквитинирование и деградацию c-Abl". The Biochemical Journal . 370 (Pt 1): 29– 34. doi :10.1042/BJ20021539. PMC 1223168 . PMID 12475393.
Haglund K, Ivankovic-Dikic I, Shimokawa N, Kruh GD, Dikic I (май 2004 г.). «Привлечение Pyk2 и Cbl к липидным плотам опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах». Journal of Cell Science . 117 (Pt 12): 2557– 68. doi : 10.1242/jcs.01148 . PMID 15128873.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (август 2004 г.). «Масштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования . 14 (10Б): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. ПМК 528930 . ПМИД 15489336.
