SLX4IP
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

SLX4IP
Идентификаторы
ПсевдонимыSLX4IP , C20orf94, bA204H22.1, bA254M13.1, dJ1099D15.3, белок, взаимодействующий с SLX4
Внешние идентификаторыОМИМ : 615958; МГИ : 1921493; гомологен : 49913; GeneCards : SLX4IP; OMA :SLX4IP — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

128710

74243

Ансамбль

ENSG00000149346

ENSMUSG00000027281

UniProt

Q5VYV7

Q9D7Y9

РефСек (мРНК)

NM_001009608

RefSeq (белок)

NP_001009608

Местоположение (UCSC)Хр 20: 10.44 – 10.64 МбХр 2: 136,73 – 136,91 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Взаимодействующий белок SLX4 — это белок , который у людей кодируется геном SLX4IP . [ 5]

Функция

Взаимодействующий белок SLX4 (SLX4IP) существует в мономерной форме и взаимодействует с мультипротеиновым комплексом SLX4 - XPF - ERCC1 , который отвечает за сборку резольвазы соединения Холлидея в роли восстановления и поддержания ДНК. [6]

Было показано, что SLX4IP напрямую взаимодействует с N- концом белка SLX4 , который играет роль в координации множества различных эндонуклеаз, специфичных для структуры ДНК. [7]

Также было показано, что SLX4IP участвует в контроле альтернативного удлинения теломер посредством его накопления и взаимодействия с белками SLX4 , BLM и XPF . [8]

Расположение и выражение

Ген SLX4IP расположен на коротком плече (p) хромосомы 20 в позиции 12.2 (20p12.2). [9] Ген SLX4IP человека содержит 14 экзонов , при этом кДНК состоит из 204 000 пар оснований, ориентированных на плюс-цепи. [9] Он кодирует белок из 408 аминокислот с молекулярной массой 45 552 дальтон . [10]

Было обнаружено, что гомологи гена SLX4IP сохраняются у нескольких видов животных, не относящихся к человеку, включая мышей, крыс, лягушек, кур, собак, макак-резусов и шимпанзе. [11] Ортологи гена SLX4IP человека также были идентифицированы у 283 других организмов. [11]

Наибольшая экспрессия белка SLX4IP наблюдается в коже и яичках, а также в 26 других тканях. [12]

Клиническое значение

Рак

Острый лимфобластный лейкоз

Было показано, что соматические и моноаллельные делеции 5'-области SLX4IP встречаются у 30% пациентов с острым лимфобластным лейкозом (ОЛЛ) у детей, а в случаях острого лимфобластного лейкоза с перестройкой ETV6 / RUNX1 делеции были обнаружены более чем в 60% случаев. [13] Анализируя точки разрыва SLX4IP, была выявлена ​​характерная нелегитимная рекомбинация, опосредованная V(D)J . [13] Было обнаружено, что эти делеции в значительной степени смещены в сторону мужского пола. [13]

Альтернативное удлинение теломер

Для того чтобы раковые клетки сохраняли способность размножаться без ограничений, они могут регулировать теломеры своих хромосом путем рекомбинации с помощью процесса, известного как альтернативное удлинение теломер (ALT). [14] Было показано, что эта рекомбинация требует накопления SLX4IP на теломерах ALT из-за его антагонизма беспорядочной активности BLM . [8] BLM отвечает за удлинение теломер, поскольку это RecQ- хеликаза, жизненно важная для гомологичной рекомбинации и репликации ДНК. [15]

В ДНК межцепочечные сшивки (ICL) необходимо восстанавливать из-за их высокой токсичности, что часто приводит к таким заболеваниям, как анемия Фанкони . [16] SLX4IP играет роль в функциональности восстановления ICL комплекса SLX4-XPF-ERCC1 из-за его одновременного связывания как SLX4, так и XPF-ERCC1, что поддерживает стабильность комплекса и способствует взаимодействию между областями SLX4 и XPF-ERCC1. [6] [17] Когда SLX4IP был истощен из обработанных клеток, было обнаружено, что он накапливается в фазе G2/M клеточного цикла, где регулярно происходит разрешение праздничных соединений во время восстановления ICL. [17] [18]

ВИЧ-1

Вспомогательный белок ВИЧ -1 Vpr эффективно останавливает прогрессирование клеток хозяина через его естественный цикл на стадии перехода G2/M . [19] Было обнаружено, что эта остановка вызвана преждевременной активацией комплекса эндонуклеазы , специфичного для структуры SLX4 , с которым SLX4IP напрямую взаимодействует. [20] В ходе этого исследования было также обнаружено, что комплекс SLX4 участвует в регуляции врожденного иммунитета из-за его отрицательной регуляции продукции интерферона типа 1 , как при спонтанной индукции, так и при опосредованной ВИЧ-1. [20]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000149346 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027281 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Энтреза: белок, взаимодействующий с SLX4».
  6. ^ ab Svendsen JM, Smogorzewska A, Sowa ME, O'Connell BC, Gygi SP, Elledge SJ, Harper JW (июль 2009 г.). "Млекопитающий BTBD12/SLX4 собирает резольвазу соединения Холлидея и требуется для восстановления ДНК". Cell . 138 (1): 63– 77. doi :10.1016/j.cell.2009.06.030. PMC 2720686 . PMID  19596235. 
  7. ^ Fekairi S, Scaglione S, Chahwan C, Taylor ER, Tissier A, Coulon S и др. (Июль 2009 г.). «Человеческий SLX4 — это субъединица резольвазы соединения Холлидея, которая связывает несколько эндонуклеаз репарации/рекомбинации ДНК». Cell . 138 (1): 78– 89. doi :10.1016/j.cell.2009.06.029. PMC 2861413 . PMID  19596236. 
  8. ^ ab Panier S, Maric M, Hewitt G, Mason-Osann E, Gali H, Dai A и др. (октябрь 2019 г.). «SLX4IP противодействует беспорядочной активности BLM во время поддержания ALT». Molecular Cell . 76 (1): 27–43.e11. doi :10.1016/j.molcel.2019.07.010. PMC 6863466 . PMID  31447390. 
  9. ^ ab "SLX4IP SLX4 взаимодействующий белок [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2019-10-31 .
  10. ^ "SLX4IP - Белок SLX4IP - Homo sapiens (Человек) - Ген и белок SLX4IP". www.uniprot.org . Получено 31 октября 2019 г.
  11. ^ ab "Ген: SLX4IP (ENSG00000149346) - Краткое содержание - Homo sapiens - Ensembl genome browser 98". asia.ensembl.org . Получено 2019-10-31 .
  12. ^ Fagerberg L, Hallström BM, Oksvold P, Kampf C, Djureinovic D, Odeberg J, et al. (Февраль 2014). «Анализ специфической для тканей человека экспрессии с помощью полногеномной интеграции транскриптомики и протеомики на основе антител». Молекулярная и клеточная протеомика . 13 (2): 397– 406. doi : 10.1074/mcp.M113.035600 . PMC 3916642. PMID  24309898 . 
  13. ^ abc Meissner B, Bartram T, Eckert C, Trka J, Panzer-Grümayer R, Hermanova I и др. (февраль 2014 г.). «Частое и обусловленное полом удаление SLX4IP в результате нелегитимной рекомбинации, опосредованной V(D)J, при остром лимфобластном лейкозе у детей». Human Molecular Genetics . 23 (3): 590– 601. doi : 10.1093/hmg/ddt447 . PMID  24045615.
  14. ^ Bryan TM, Englezou A, Dalla-Pozza L, Dunham MA, Reddel RR (ноябрь 1997 г.). «Доказательства альтернативного механизма поддержания длины теломер в опухолях человека и клеточных линиях, полученных из опухолей». Nature Medicine . 3 (11): 1271– 4. doi :10.1038/nm1197-1271. PMID  9359704. S2CID  10220776.
  15. ^ Bhattacharyya S, Keirsey J, Russell B, Kavecansky J, Lillard-Wetherell K, Tahmaseb K и др. (май 2009 г.). «Теломеразо-ассоциированный белок 1, HSP90 и топоизомераза IIальфа напрямую связываются с геликазой BLM в иммортализованных клетках с использованием ALT и модулируют ее геликазную активность с использованием теломерных ДНК-субстратов». Журнал биологической химии . 284 (22): 14966– 77. doi : 10.1074/jbc.m900195200 . PMC 2685679. PMID  19329795 . 
  16. ^ Хашимото С., Анаи Х., Ханада К. (2016-05-01). "Механизмы восстановления межцепочечных сшивок ДНК и человеческие расстройства". Гены и окружающая среда . 38 (1): 9. Bibcode : 2016GeneE..38....9H. doi : 10.1186/s41021-016-0037-9 . PMC 4918140. PMID  27350828. 
  17. ^ ab Zhang H, Chen Z, Ye Y, Ye Z, Cao D, Xiong Y и др. (ноябрь 2019 г.). «SLX4IP действует вместе с SLX4 и XPF-ERCC1, способствуя восстановлению межцепочечных сшивок». Nucleic Acids Research . 47 (19): 10181– 10201. doi :10.1093/nar/gkz769. PMC 6821277 . PMID  31495888. 
  18. ^ McHugh PJ, Sarkar S (май 2006). «Репарация межцепочечных поперечных связей ДНК в клеточном цикле: критическая роль полимеразы дзета в фазе G1». Cell Cycle . 5 (10): 1044– 7. doi : 10.4161/cc.5.10.2763 . PMID  16687932.
  19. ^ Connor RI, Chen BK, Choe S, Landau NR (февраль 1995). «Vpr необходим для эффективной репликации вируса иммунодефицита человека типа 1 в мононуклеарных фагоцитах». Вирусология . 206 (2): 935–44 . doi : 10.1006/viro.1995.1016 . PMID  7531918.
  20. ^ ab Laguette N, Brégnard C, Hue P, Basbous J, Yatim A, Larroque M и др. (январь 2014 г.). «Преждевременная активация комплекса SLX4 с помощью Vpr способствует остановке G2/M и выходу из-под контроля врожденного иммунитета». Cell . 156 ( 1– 2): 134– 45. doi : 10.1016/j.cell.2013.12.011 . PMID  24412650.

Дальнейшее чтение

  • Svendsen JM, Smogorzewska A, Sowa ME, O'Connell BC, Gygi SP, Elledge SJ, Harper JW (июль 2009 г.). "Млекопитающий BTBD12/SLX4 собирает резольвазу соединения Холлидея и требуется для репарации ДНК". Cell . 138 (1): 63– 77. doi :10.1016/j.cell.2009.06.030. PMC  2720686 . PMID  19596235.
  • Ghosal G, Leung JW, Nair BC, Fong KW, Chen J (октябрь 2012 г.). "Пролиферирующий клеточный ядерный антиген (PCNA)-связывающий белок C1orf124 является регулятором синтеза транслезиона". Журнал биологической химии . 287 (41): 34225– 33. doi : 10.1074/jbc.M112.400135 . PMC  3464530. PMID  22902628 .
  • Warnatz HJ, Schmidt D, Manke T, Piccini I, Sultan M, Borodina T и др. (Июль 2011 г.). «Целевые гены BTB и CNC homology 1 (BACH1) участвуют в реакции на окислительный стресс и контроле клеточного цикла». Журнал биологической химии . 286 (26): 23521– 32. doi : 10.1074/jbc.M111.220178 . PMC  3123115. PMID  21555518 .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SLX4IP&oldid=1198032359"