Белок 1, ассоциированный с киназой S-фазы
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

СКП1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSKP1 , EMC19, OCP-II, OCP2, SKP1A, TCEB1L, p19A, Белок 1, ассоциированный с киназой S-фазы, ассоциированный с киназой S-фазы
Внешние идентификаторыОМИМ : 601434; МГИ : 103575; гомологен : 38775; Генные карты : SKP1; ОМА :SKP1 - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

6500

21402

Ансамбль

ENSG00000113558

ENSMUSG00000036309

UniProt

Р63208

Q9WTX5

РефСек (мРНК)

NM_170679
NM_006930

NM_011543

RefSeq (белок)

NP_008861
NP_733779

NP_035673

Местоположение (UCSC)Хр 5: 134.15 – 134.18 МбХр 11: 52.12 – 52.14 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 1, ассоциированный с киназой S-фазы, представляет собой фермент , который у человека кодируется геном SKP1 . [ 5] [6] [7]

Этот ген кодирует белок , который является членом комплекса белков SCF убиквитинлигазы . Он связывается с белками F-box (белками, содержащими мотив F-box), такими как циклин F, белок 2, ассоциированный с киназой S-фазы , и другими регуляторными белками, участвующими в убиквитин- зависимом протеолизе. [8] Кодируемый белок также сотрудничает с сетью белков для контроля уровней бета-катенина и влияет на уровень активности бета-катенин-зависимых факторов транскрипции TCF. Исследования также охарактеризовали белок как фактор удлинения РНК-полимеразы II. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта. Связанный псевдоген был идентифицирован на хромосоме 7.

Взаимодействия

Было показано, что SKP1A взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000113558 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036309 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Чжан Х., Кобаяши Р., Галактионов К., Бич Д. (октябрь 1995 г.). "p19Skp1 и p45Skp2 являются необходимыми элементами киназы S фазы циклина A-CDK2". Cell . 82 (6): 915– 25. doi : 10.1016/0092-8674(95)90271-6 . PMID  7553852. S2CID  16325791.
  6. ^ Demetrick DJ, Zhang H, Beach DH (июль 1996 г.). «Хромосомное картирование генов человеческих CDK2/циклин А-ассоциированных белков p19 (SKP1A и SKP1B) и p45 (SKP2)». Cytogenet Cell Genet . 73 ( 1– 2): 104– 7. doi :10.1159/000134318. PMID  8646875.
  7. ^ «Ген Entrez: белок 1A, ассоциированный с киназой S-фазы SKP1A (p19A)».
  8. ^ Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ (1996). «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом протеолиза убиквитина через новый мотив, F-box». Cell . 86 (2): 263– 74. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80098-7 . PMID  8706131. ​​S2CID  18387009.
  9. ^ abcdefg Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). "Идентификация семейства белков F-box человека". Curr. Biol . 9 (20): 1177– 9. Bibcode :1999CBio....9.1177C. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . PMID  10531035. S2CID  7467493.
  10. ^ abc Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (май 2003 г.). «TIP120A ассоциируется с куллинами и модулирует активность убиквитинлигазы». J. Biol. Chem . 278 (18): 15905– 10. doi : 10.1074/jbc.M213070200 . PMID  12609982.
  11. ^ ab Strack P, Caligiuri M, Pelletier M, Boisclair M, Theodoras A, Beer-Romero P, Glass S, Parsons T, Copeland RA, Auger KR, Benfield P, Brizuela L, Rolfe M (июль 2000 г.). "SCF(beta-TRCP) и зависимое от фосфорилирования убиквитинирование I kappa B alpha, катализируемое Ubc3 и Ubc4". Oncogene . 19 (31): 3529– 36. doi :10.1038/sj.onc.1203647. PMID  10918611. S2CID  24267499.
  12. ^ Suzuki H, Chiba T, Suzuki T, Fujita T, Ikenoue T, Omata M, Furuichi K, Shikama H, Tanaka K (январь 2000 г.). «Гомодимер двух белков F-box betaTrCP1 или betaTrCP2 связывается с IkappaBalpha для зависимого от сигнала убиквитинирования». J. Biol. Chem . 275 (4): 2877– 84. doi : 10.1074/jbc.275.4.2877 . PMID  10644755.
  13. ^ Margottin F, Bour SP, Durand H, Selig L, Benichou S, Richard V, Thomas D, Strebel K, Benarous R (март 1998). "Новый человеческий белок WD, h-beta TrCp, который взаимодействует с ВИЧ-1 Vpu, соединяет CD4 с путем деградации ER через мотив F-box". Mol. Cell . 1 (4): 565– 74. doi : 10.1016/s1097-2765(00)80056-8 . PMID  9660940.
  14. ^ Matsuzawa SI, Reed JC (май 2001). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанном с ответами p53». Mol. Cell . 7 (5): 915– 26. doi : 10.1016/s1097-2765(01)00242-8 . PMID  11389839.
  15. ^ Аяд Н.Г., Рэнкин С., Мураками М., Джебанатираджа Дж., Гиги С., Киршнер М.В. (апрель 2003 г.). «Том-1, триггер вступления в митоз, разрушается во время G1 через APC». Клетка . 113 (1): 101–13 . CiteSeerX 10.1.1.522.1877 . дои : 10.1016/s0092-8674(03)00232-0 . PMID  12679038. S2CID  14962502. 
  16. ^ Kiernan RE, Emiliani S, Nakayama K, Castro A, Labbé JC, Lorca T, Nakayama Ki K, Benkirane M (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие между циклином T1 и SCF(SKP2) нацеливает CDK9 на убиквитинирование и деградацию протеасомой». Mol. Cell. Biol . 21 (23): 7956– 70. doi :10.1128/MCB.21.23.7956-7970.2001. PMC 99964. PMID  11689688 . 
  17. ^ ab Staropoli JF, McDermott C, Martinat C, Schulman B, Demireva E, Abeliovich A (март 2003 г.). «Паркин является компонентом SCF-подобного комплекса убиквитинлигазы и защищает постмитотические нейроны от эксайтотоксичности каината». Neuron . 37 (5): 735– 49. doi : 10.1016/s0896-6273(03)00084-9 . PMID  12628165. S2CID  17024826.
  18. ^ Lisztwan J, Marti A, Sutterlüty H, Gstaiger M, Wirbelauer C, Krek W (январь 1998 г.). «Связь человеческого CUL-1 и убиквитин-конъюгирующего фермента CDC34 с белком F-box p45(SKP2): доказательства эволюционной консервации в составе субъединиц пути CDC34-SCF». EMBO J . 17 (2): 368– 83. doi :10.1093/emboj/17.2.368. PMC 1170388 . PMID  9430629. 
  19. ^ Zheng N, Schulman BA, Song L, Miller JJ, Jeffrey PD, Wang P, Chu C, Koepp DM, Elledge SJ, Pagano M, Conaway RC, Conaway JW, Harper JW, Pavletich NP (апрель 2002 г.). «Структура комплекса убиквитинлигазы Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF». Nature . 416 (6882): 703– 9. Bibcode :2002Natur.416..703Z. doi :10.1038/416703a. PMID  11961546. S2CID  4423882.
  20. ^ Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (апрель 1999 г.). «ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров куллина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы». Mol. Cell . 3 (4): 535– 41. doi : 10.1016/s1097-2765(00)80482-7 . PMID  10230407. S2CID  19371828.
  21. ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 : 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID  17353931 . 
  22. ^ Wu G, Lyapina S, Das I, Li J, Gurney M, Pauley A, Chui I, Deshaies RJ, Kitajewski J (ноябрь 2001 г.). "SEL-10 является ингибитором сигнализации notch, который нацеливает notch на деградацию белка, опосредованную убиквитином". Mol . Cell. Biol . 21 (21): 7403– 15. doi :10.1128/MCB.21.21.7403-7415.2001. PMC 99913. PMID  11585921. 
  23. ^ Ng RW, Arooz T, Yam CH, Chan IW, Lau AW, Poon RY (ноябрь 1998 г.). «Характеристика белка-партнера cullin и F-box Skp1». FEBS Lett . 438 (3): 183– 9. doi : 10.1016/s0014-5793(98)01299-x . PMID  9827542. S2CID  40950881.
  24. ^ Шульман Б.А., Каррано AC, Джеффри П.Д., Боуэн З., Киннукан Э.Р., Финнин М.С., Элледж С.Дж., Харпер Дж.В., Пагано М., Павлетич Н.П. (ноябрь 2000 г.). «Изучение убиквитинлигаз SCF на основе структуры комплекса Skp1-Skp2». Природа . 408 (6810): 381–6 . Бибкод : 2000Natur.408..381S. дои : 10.1038/35042620. PMID  11099048. S2CID  4300503.
  25. ^ Marti A, Wirbelauer C, Scheffner M, Krek W (май 1999). «Взаимодействие между убиквитин-протеинлигазой SCFSKP2 и E2F-1 лежит в основе регуляции деградации E2F-1». Nat. Cell Biol . 1 (1): 14– 9. doi :10.1038/8984. PMID  10559858. S2CID  8884226.

Дальнейшее чтение

  • Chen H, Thalmann I, Adams JC, Avraham KB, Copeland NG, Jenkins NA, Beier DR, Corey DP, Thalmann R, Duyk GM (1995). «cDNA cloning, tissue distribution, andchromosomal localization of Ocp2, a gene codes a candidate, 27 ( 3): 389–98 . doi : 10.1006/geno.1995.1068. PMID 7558018  .
  • Sowden J, Morrison K, Schofield J, Putt W, Edwards Y (1996). "Новая кДНК с гомологией фактору элонгации РНК-полимеразы II картируется на человеческой хромосоме 5q31 (TCEB1L) и мышиной хромосоме 11 (Tceb1l)". Genomics . 29 (1): 145–51 . doi :10.1006/geno.1995.1225. PMID  8530064.
  • Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ (1996). «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом протеолиза убиквитина через новый мотив, F-box». Cell . 86 (2): 263– 74. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80098-7 . PMID  8706131. ​​S2CID  18387009.
  • Brown KA, Leek JP, Lench NJ, Moynihan LM, Markham AF, Mueller RF (1996). «Человеческие последовательности, гомологичные гену кохлеарного белка Ocp-II, не сопоставлены с известными в настоящее время несиндромными локусами потери слуха». Ann. Hum. Genet . 60 (Pt 5): 385– 9. doi :10.1111/j.1469-1809.1996.tb00436.x. PMID  8912791. S2CID  7687393.
  • Liang Y, Chen H, Asher JH, Chang CC, Friedman TB (1997). "КДНК OCP2 внутреннего уха человека отображается в 5q22-5q35.2 с соответствующими последовательностями на хромосомах 4p16.2-4p14, 5p13-5q22, 7pter-q22, 10 и 12p13-12qter". Gene . 184 (2): 163– 7. doi :10.1016/S0378-1119(96)00590-2. PMID  9031623.
  • Листван Дж., Марти А., Суттерлюти Х., Гстайгер М., Вирбелауэр К., Крек В. (1998). «Связь человеческого CUL-1 и убиквитин-конъюгирующего фермента CDC34 с белком F-box p45(SKP2): доказательства эволюционной консервации в составе субъединиц пути CDC34-SCF». EMBO J. 17 ( 2): 368– 83. doi :10.1093/emboj/17.2.368. PMC  1170388. PMID  9430629 .
  • Ng RW, Arooz T, Yam CH, Chan IW, Lau AW, Poon RY (1998). "Характеристика белка-партнера cullin и F-box Skp1". FEBS Lett . 438 (3): 183– 9. doi : 10.1016/S0014-5793(98)01299-X . PMID  9827542. S2CID  40950881.
  • Yam CH, Ng RW, Siu WY, Lau AW, Poon RY (1999). «Регуляция циклина A-Cdk2 компонентом SCF Skp1 и белком F-box Skp2». Mol. Cell. Biol . 19 (1): 635– 45. doi : 10.1128/mcb.19.1.635. PMC  83921. PMID  9858587.
  • Henzl MT, Thalmann I, Thalmann R (1999). «OCP2 существует в виде димера в органе Корти». Hear. Res . 126 ( 1– 2): 37– 46. doi :10.1016/S0378-5955(98)00148-8. PMID  9872132. S2CID  20953392.
  • Winston JT, Strack P, Beer-Romero P, Chu CY, Elledge SJ, Harper JW (1999). «Комплекс SCFbeta-TRCP-убиквитинлигаза специфически ассоциируется с фосфорилированными мотивами разрушения в IkappaBalpha и бета-катенине и стимулирует убиквитинирование IkappaBalpha in vitro». Genes Dev . 13 (3): 270– 83. doi :10.1101/gad.13.3.270. PMC 316433.  PMID 9990852  .
  • Ильин ГП, Риалланд М, Глейз Д, Гуген-Гийозо К (1999). «Идентификация нового белка млекопитающих, похожего на Skp2, содержащего F-box и богатые лейцином повторы». FEBS Lett . 459 (1): 75– 9. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01211-9 . PMID  10508920. S2CID  22945082.
  • Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (1999). «Идентификация семейства белков F-box человека». Curr. Biol . 9 (20): 1177– 9. Bibcode : 1999CBio....9.1177C. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . PMID  10531035. S2CID  7467493.
  • Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (1999). "Семейство белков F-box млекопитающих". Curr. Biol . 9 (20): 1180– 2. Bibcode :1999CBio....9.1180W. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80021-4 . PMID  10531037. S2CID  14341845.
  • Suzuki H, Chiba T, Suzuki T, Fujita T, Ikenoue T, Omata M, Furuichi K, Shikama H, Tanaka K (2000). «Гомодимер двух белков F-box betaTrCP1 или betaTrCP2 связывается с IkappaBalpha для зависимого от сигнала убиквитинирования». J. Biol. Chem . 275 (4): 2877– 84. doi : 10.1074/jbc.275.4.2877 . PMID  10644755.
  • Read MA, Brownell JE, Gladysheva TB, Hottelet M, Parent LA, Coggins MB, Pierce JW, Podust VN, Luo RS, Chau V, Palombella VJ (2000). "Модификация Nedd8 cul-1 активирует SCF(beta(TrCP))-зависимое убиквитинирование IkappaBalpha". Mol. Cell. Biol . 20 (7): 2326– 33. doi : 10.1128 /MCB.20.7.2326-2333.2000. PMC  85397. PMID  10713156.
  • Шульман Б.А., Каррано А.С., Джеффри П.Д., Боуэн З., Киннукан Э.Р., Финнин М.С., Элледж С.Дж., Харпер Дж.В., Пагано М., Павлетич Н.П. (2000). «Изучение убиквитинлигаз SCF на основе структуры комплекса Skp1-Skp2». Природа . 408 (6810): 381–6 . Бибкод : 2000Natur.408..381S. дои : 10.1038/35042620. PMID  11099048. S2CID  4300503.
  • Ляпина С., Коуп Г., Шевченко А., Серино Г., Цуге Т., Чжоу С., Вольф Д.А., Вэй Н., Шевченко А., Деше Р.Дж. (2001). «Стимулирование расщепления конъюгата NEDD-CUL1 сигналосомой COP9». Наука . 292 (5520): 1382–5 . Бибкод : 2001Sci...292.1382L. дои : 10.1126/science.1059780. PMID  11337588. S2CID  14224920.
  • Fukuchi M, Imamura T, Chiba T, Ebisawa T, Kawabata M, Tanaka K, Miyazono K (2001). «Лиганд-зависимая деградация Smad3 комплексом убиквитинлигазы ROC1 и связанных белков». Mol. Biol. Cell . 12 ( 5): 1431– 43. doi :10.1091/mbc.12.5.1431. PMC  34595. PMID  11359933.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P63208 (белок 1, ассоциированный с киназой S-фазы) на сайте PDBe-KB .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=S-фаза_киназа-ассоциированный_белок_1&oldid=1218476732"