СЕНП3

СЕНП3
Идентификаторы
Псевдонимы	SENP3 , SMT3IP1, SSP3, Ulp1, специфическая пептидаза 3 SUMO1/sentrin/SMT3, специфическая пептидаза 3 SUMO
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 612844; МГИ : 2158736; гомологен : 9236; Генные карты : SENP3; OMA :SENP3 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 17 (человек)
Конец	7,571,969 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	69,572,910 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	правое полушарие мозжечка; ; правая лобная доля; ; слизистая оболочка поперечно-ободочной кишки; ; передняя поясная кора; ; ганглионарное возвышение; ; передняя доля гипофиза; ; желудочковая зона; ; мышечный слой сигмовидной кишки; ; правое легкое; ; правое яичко;
	Верх выражен в
	нервный слой сетчатки; ; эпибласт; ; сперматоцит; ; цилиарное тело; ; кучевые ячейки; ; верхнечелюстной выступ; ; выступ нижней челюсти; ; желудочковая зона; ; верхняя лобная извилина; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность пептидазы; активность пептидазы цистеинового типа; активность эндопептидазы; связывание белков; гидролазная активность;
Клеточный компонент	цитоплазма; ядрышко; ядро; нуклеоплазма; Комплекс MLL1;
Биологический процесс	протеолиз; процессинг рРНК; десумоилирование белка;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	26168
	80886
	ENSG00000161956
	ENSMUSG00000005204
	Q9H4L4
	Q9EP97
	NM_015670
	NM_001163571 ; NM_030702
	NP_056485
	NP_001157043 ; NP_109627
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у человека

Специфическая пептидаза 3 SUMO1/sentrin/SMT3 , также известная как SENP3 , представляет собой белок , который у людей кодируется геном SENP3 . ^[5]^[6]

SENP3 вместе с SENP5 принадлежит к ветви Ulp1 в дрожжах и локализуется в ядрышке через B23/NPM1. SENP3 связан и регулируется B23/нуклеофосмином/ NPM1 и участвует в регуляции биогенеза рибосом . SENP3 может регулироваться путем Arf-Mdm2-p53 . ^[7]

Дальнейшее чтение

Yeh ET, Gong L, Kamitani T (2000). «Убиквитин-подобные белки: новые вина в новых бутылках». Gene . 248 ( 1– 2): 1– 14. doi :10.1016/S0378-1119(00)00139-6. PMID 10806345.
Nishida T, Tanaka H, Yasuda H (2000). "Новая изопептидаза 1 млекопитающих, специфичная для Smt3 (SMT3IP1), локализованная в ядрышке в интерфазе". Eur. J. Biochem . 267 (21): 6423– 7. doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01729.x . PMID 11029585.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кодирующих белок человеческих кДНК». Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep . 1 (3): 287–92 . doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Colland F, Jacq X, Trouplin V и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res . 14 (7): 1324– 32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res . 14 (10B): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
Bouras T, Fu M, Sauve AA и др. (2005). «Деацетилирование SIRT1 и репрессия p300 включают остатки лизина 1020/1024 в регуляторном домене клеточного цикла 1». J. Biol. Chem . 280 (11): 10264–76 . doi : 10.1074/jbc.M408748200 . PMID 15632193.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Грегуар С., Янг XJ (2005). «Связь с деацетилазами гистонов класса IIa повышает сумоилирование факторов транскрипции MEF2». Mol. Cell. Biol . 25 (6): 2273– 87. doi :10.1128/MCB.25.6.2273-2287.2005. PMC 1061617. PMID 15743823 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Nucleic Acids Res . 34 (выпуск базы данных): D415–8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901 .
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, et al. (2006). "Анализ фосфопротеома митотического веретена человека". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (14): 5391– 6. Bibcode : 2006PNAS..103.5391N. doi : 10.1073 /pnas.0507066103 . PMC 1459365. PMID 16565220.
Gong L, Yeh ET (2006). «Характеристика семейства ядрышковых SUMO-специфичных протеаз с предпочтением SUMO-2 или SUMO-3». J. Biol. Chem . 281 (23): 15869– 77. doi : 10.1074/jbc.M511658200 . PMID 16608850.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
Yun C, Wang Y, Mukhopadhyay D и др. (2008). «Ядрышковый белок B23/нуклеофосмин регулирует путь SUMO позвоночных через протеазы SENP3 и SENP5». J. Cell Biol . 183 (4): 589–95 . doi :10.1083/jcb.200807185. PMC 2582899. PMID 19015314 .
Haindl M, Harasim T, Eick D, Muller S (март 2008 г.). «Протеаза SENP3, специфичная для ядрышка SUMO, отменяет модификацию SUMO нуклеофосмина и необходима для процессинга рРНК». EMBO Rep . 9 (3): 273– 9. doi :10.1038/embor.2008.3. PMC 2267381. PMID 18259216 .
Kuo ML, den Besten W, Thomas MC и др. (2008). "Arf-индуцированный оборот ядрышковой нуклеофосмин-ассоциированной протеазы SUMO-2/3 Senp3". Cell Cycle . 7 (21): 3378– 87. doi : 10.4161/cc.7.21.6930 . PMID 18948745.

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000161956 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000005204 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Yeh ET, Gong L, Kamitani T (май 2000). «Убиквитин-подобные белки: новые вина в новых бутылках». Gene . 248 ( 1– 2): 1– 14. doi :10.1016/S0378-1119(00)00139-6. PMID 10806345.
^ Виман С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсахс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер. Б, Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геном Рез . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК 311072 . PMID 11230166.
^ "Ген Энтреза: SENP3 SUMO1/сентрин/SMT3 специфическая пептидаза 3".

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 17 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000161956 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000005204 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10806345-5] Yeh ET, Gong L, Kamitani T (май 2000). «Убиквитин-подобные белки: новые вина в новых бутылках». Gene . 248 ( 1– 2): 1– 14. doi :10.1016/S0378-1119(00)00139-6. PMID 10806345.

[pmid11230166-6] Виман С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсахс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер. Б, Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геном Рез . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК 311072 . PMID 11230166.

[entrez-7] "Ген Энтреза: SENP3 SUMO1/сентрин/SMT3 специфическая пептидаза 3".