НПМ1
Ген, кодирующий белок у человека
НПМ1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNPM1 , B23, NPM, нуклеофосмин (ядрышковый фосфопротеин B23, нуматрин), нуклеофосмин, нуклеофосмин 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 164040; МГИ : 106184; гомологен : 81697; GeneCards : NPM1; OMA :NPM1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

4869

18148

Ансамбль

ENSG00000181163

ENSMUSG00000057113

UniProt

Р06748

Q61937

РефСек (мРНК)

НМ_001252260
НМ_001252261
НМ_008722

RefSeq (белок)

НП_001239189
НП_001239190
НП_032748

Местоположение (UCSC)Хр 5: 171.39 – 171.41 МбХр 11: 33,1 – 33,11 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Нуклеофосмин (NPM), также известный как ядрышковый фосфопротеин B23 или нуматрин , представляет собой белок , который у людей кодируется геном NPM1 . [ 5] [6]

Ген

У людей ген NPM1 расположен на длинном плече хромосомы 5 (5q35). Ген охватывает 23 кб и содержит 12 экзонов. Было описано три варианта транскрипта. Самая длинная изоформа (длиной 294 аминокислоты), кодируемая вариантом транскрипта 1, является основной и наиболее хорошо изученной изоформой нуклеофосмина. Вариант транскрипта 2 образуется путем пропуска экзона в рамке считывания (экзон 8) для получения изоформы длиной 265 аминокислот. Однако эта изоформа недостаточно хорошо охарактеризована, а ее функции и характер экспрессии недостаточно изучены. Вариант транскрипта 3 образуется путем использования альтернативного экзона (экзон 10), что приводит к изоформе длиной 259 аминокислот с другой С-концевой последовательностью. Изоформы 1 и 3 человеческого NPM1 у крысы — это B23.1 и B23.2 соответственно. [7] Изоформа 1 локализуется в ядрышке [8] , как это описано для крысы B23.1 [9] [10], тогда как изоформа 3 (B23.2) локализуется в нуклеоплазме или цитоплазме и экспрессируется на относительно более низких уровнях по сравнению с изоформой 1 в нормальных тканях крысы [11] и в клетках HeLa. [8] Было показано, что обе изоформы 1 и 3 стимулируют репликацию аденовирусной ДНК, связанной с основными вирусными белками. [8]

Функция

NPM1 связан с ядрышковыми рибонуклеопротеиновыми структурами и связывает одноцепочечные и двухцепочечные нуклеиновые кислоты, но он связывает преимущественно G-квадруплексы, образующие нуклеиновые кислоты. Он участвует в биогенезе рибосом и может помогать небольшим основным белкам в их транспорте в ядрышко . Его регуляция посредством SUMOylation ( SENP3 и SENP5) является еще одним аспектом регуляции белка и клеточных функций.

Он расположен в ядрышке , но может быть перемещен в нуклеоплазму в случае сывороточного голодания или лечения противораковыми препаратами. Белок был идентифицирован как фосфопротеин. Однако позднее были идентифицированы другие посттрансляционные модификации NPM1, включая ацетилирование и SUMOylation.

Нуклеофосмин имеет несколько функций: [12]

  1. Гистоновые шапероны
  2. Биогенез и транспорт рибосом
  3. Геномная стабильность и восстановление ДНК
  4. Эндорибонуклеазная активность
  5. Дублирование центросомы во время клеточного цикла
  6. Регуляция пути подавления опухолей ARF-p53
  7. Дестабилизирующая активность спирали РНК
  8. Ингибирование ДНКазы, активируемой каспазой
  9. Предотвращает апоптоз, если находится в ядрышке

Молекулярный и гистоновый шаперон

NPM1 функционирует как молекулярный шаперон для нескольких белков. Как N-концевой гидрофобный домен ядра, так и кислые участки важны для этой активности. Кроме того, было показано, что олигомеризация NPM1 необходима для максимальной активности шаперона. [13] Было предсказано, что NPM1 играет роль в предотвращении агрегации белков в плотно упакованном ядрышке, особенно во время биогенеза рибосом. NPM1 демонстрирует характерные свойства молекулярных шаперонов, такие как a) предотвращение температурно-зависимой и независимой агрегации белков, b) сохранение активности ферментов во время тепловой денатурации нескольких различных белков, c) содействие ренатурации ранее денатурированных белков, d) преимущественное связывание с денатурированными белками и экспонирование гидрофобных областей во время взаимодействия с другими белками. NPM1 может связываться с АТФ, [14] однако его функция шаперона не требует гидролиза АТФ или присутствия АТФ. [15]

Известно, что NPM1 ассоциируется с прерибосомальными частицами и другими ядрышковыми белками. Поскольку рибосомальные белки, как правило, нерастворимы в физиологических условиях, NPM1 предположительно связывается с рибосомальными белками в ядрышке, предотвращает их агрегацию и способствует их сборке в рибосомальные субъединицы. Аналогично, некоторые вирусные белки, такие как HIV-1 Rev, которые нерастворимы в физиологических условиях, связываются с NPM1, что предотвращает их агрегацию и позволяет им накапливаться в ядре/ядрышке, тем самым способствуя сборке вирусных частиц. Кроме того, поскольку NPM1 может перемещаться между ядром и цитоплазмой [16] благодаря своим NES и NLS , он может помочь в котрансляционном сворачивании клиентских белков в цитоплазме и способствовать их проникновению в ядро/ядрышко. [15]

NPM1 является высококислотным белком и может связываться с гистонами напрямую из-за их основной природы. Связывание NPM1 с гистонами сохраняется даже при концентрации соли 0,5 М KCl, что предполагает прочное связывание с помощью электростатических взаимодействий. [17] Однако одни только электростатические взаимодействия не отвечают за связывание с гистонами, как предполагает кристаллическая структура ядра NPM1. NPM1 напрямую связывается с гистонами ядра H2B, H3 и H4 и может связываться с H2A только в присутствии димера H2A-H2B или октамера ядра гистона. Он может собирать нуклеосомы in vitro и может деконденсировать хроматин сперматозоидов подобно нуклеоплазмину . [18] [19] [17] Предполагается, что активность шаперона гистонов NPM1 участвует в разборке нуклеосом во время транскрипции, что приводит к активации транскрипции. [17] Также предполагается, что он функционирует как шаперон гистонов в ядрышке. [20] Истощение NPM1 или сверхэкспрессия мутантного NPM1, лишенного активности шаперона гистонов, приводит к снижению транскрипции рДНК. [21] Он также может связываться с линкерным гистоном H1 и способствовать его сборке или разборке из хроматина. [22]

Биогенез рибосом

NPM1 — это молекулярный шаперон. [15] Также было замечено, что он ассоциируется с прерибосомами, поэтому изначально считалось, что NPM1 — это фактор сборки рибосом или шаперон рибосом. [23] Другими характерными свойствами, которые предполагают роль NPM1 в биогенезе рибосом, являются ядрышковая локализация, способность перемещаться между ядром и цитоплазмой, способность связываться с нуклеиновой кислотой и транспортировать прерибосомные частицы. [16] [24] [25] [26] [27] NPM1 также обладает внутренней рибонуклеазной активностью, которая расщепляет определенный участок в ITS2 (внутренний транскрибируемый спейсер 2) пре-5.8S рРНК. [28] [29] Снижение активности NPM1 приводит к изменениям в профилях рибосом. (Grisendi et al., 2005) Деградация NPM1, вызванная ARF, приводит к дефектам в обработке прерибосомальной РНК из предшественника рРНК 32S в виды рРНК 28S (Itahana et al., 2003). Более того, блокирование ядерно-цитоплазматического челнока NPM1 ингибирует экспорт субъединиц рибосомы, что приводит к снижению скорости роста клеток, показывая, что NPM1 экспортирует прерибосомы (Maggi et al., 2008). Кроме того, NPM1 взаимодействует с рядом рибосомальных белков, включая RPL5 (Yu et al., 2006), RPS9 (Lindström and Zhang, 2008) и RPL23 (Wanzel et al., 2008). Было показано, что NPM3 связывается с NPM1 и негативно регулирует биогенез рибосом, тогда как связывающий дефектный NPM1 мутант NPM3 не оказывал никакого влияния на биогенез рибосом (Huang et al., 2001). Интересно, что изоформа 3 NPM1, не имеющая домена связывания нуклеиновой кислоты, также ингибирует биогенез рибосом. Все эти результаты указывают на важную роль NPM1 в биогенезе рибосом.

Большинство раковых клеток имеют увеличенные ядрышки, а аберрантная сверхэкспрессия NPM1 хорошо коррелирует с повышенным биогенезом рибосом в высоко пролиферирующих клетках. Таким образом, NPM1, контролируя биогенез рибосом, может контролировать скорость пролиферации клеток. Эмбрионы мышей с нокаутом NPM1 выживают до середины беременности (9,5dpc-12,5dpc) (Colombo et al., 2005; Grisendi et al., 2005), тогда как нокаут pescadillo, белка, участвующего в биогенезе рибосом, приводит к гибели эмбрионов на стадии морулы (2,5 dpc) (Lerch-Gaggl et al., 2002). Это говорит о том, что либо NPM1 не является необходимым для биогенеза рибосом, поскольку другие белки могут иметь функции, перекрывающиеся с NPM1, либо могут существовать другие факторы, такие как хранение рибосом в ооцитах, которые могли бы компенсировать потерю NPM1 у эмбрионов с нулевым уровнем NPM1 (Grisendi et al., 2006).

Роль в регуляции транскрипции

Было показано, что NPM1 является важным коактиватором транскрипции, управляемой РНК-полимеразой II. Ацетилирование NPM1 усиливает эту активность за счет увеличения связывания гистонов и активности шаперона. [17] Интересно, что ацетилированный NPM1 (AcNPM1) представляет собой отдельный пул, локализованный в нуклеоплазме, в отличие от ядрышковой локализации немодифицированного и фосфорилированного NPM1. [30] Геномное профилирование занятости AcNPM1 с помощью ChIP-секвенирования показывает, что он локализуется в месте начала транскрипции многих промоторов генов и совместно занят с РНК-полимеразой II. [31]

Клиническое значение

Ген NPM1 активируется, мутирует и хромосомно транслоцируется во многих типах опухолей. Хромосомные аберрации , связанные с NPM1, были обнаружены у пациентов с неходжкинской лимфомой , острым промиелоцитарным лейкозом , миелодиспластическим синдромом и острым миелогенным лейкозом . [32] Гетерозиготные мыши по NPM1 уязвимы к развитию опухолей. В солидных опухолях NPM1 часто обнаруживается сверхэкспрессированным, и считается, что NPM1 может способствовать росту опухоли путем инактивации пути супрессора опухоли p53/ARF; напротив, при экспрессии на низких уровнях NPM1 может подавлять рост опухоли путем ингибирования дупликации центросомы.

Большое значение имеет участие NPM в остром миелоидном лейкозе , [33] где мутировавший белок, лишенный свернутого С-концевого домена (NPM1c+), был обнаружен в цитоплазме у пациентов. Эта аберрантная локализация была связана с развитием заболевания и связана с улучшением клинических результатов. Стратегии против этого подтипа острого миелоидного лейкоза включают рефолдинг С-концевого домена с использованием фармакологических шаперонов и перемещение белка из ядрышка в нуклеоплазму, что было связано с апоптотическими механизмами. Также было показано, что в контексте клонального гемопоэза неопределенного значения, несущего мутацию DNMT3A , последующие мутации NPM1 приводят к прогрессированию в явную миелопролиферативную неоплазму. [34]

Кроме того, NPM1 сверхэкспрессируется во многих солидных опухолях, включая рак желудка, толстой кишки, молочной железы, яичников, мочевого пузыря, полости рта, щитовидной железы, мозга, печени, простаты и множественную миелому. Сверхэкспрессия NPM1 хорошо коррелирует с клиническими признаками гепатоцеллюлярной карциномы, что позволяет предположить, что сверхэкспрессия NPM1 может служить диагностическим маркером гепатоцеллюлярной карциномы. Сверхэкспрессия и гиперацетилирование NPM1 прогрессируют в соответствии с увеличением степени злокачественности опухоли при OSCC. [30] Сверхэкспрессия NPM1 также хорошо коррелирует с рецидивом и прогрессированием рака мочевого пузыря до поздних стадий. Сверхэкспрессия NPM1 связана с приобретенной независимостью от эстрогена в клетках рака молочной железы человека (Skaar et al., 1998). Более того, NPM1 является прямой транскрипционной мишенью онкогенного фактора транскрипции c-myc (Zeller et al., 2001). Способность NPM1 подавлять апоптоз и способствовать восстановлению ДНК может быть ответственна за выживание опухолевых клеток, где NPM1 сверхэкспрессирован. Все эти исследования предполагают, что сверхэкспрессия NPM1 способствует развитию опухоли и, следовательно, может функционировать как протоонкоген.

Открытие

NPM1 был впервые обнаружен как ядрышковый фосфопротеин в клетках печени крысы и асцитных клетках гепатомы Новикова. [35] [36] Он был назван B23, поскольку это было 23-е пятно в секции B 2-D геля, где пятна были пронумерованы в порядке убывания подвижности. Он был назван нуматрином независимо другой группой, поскольку было обнаружено, что он тесно связан с ядерным матриксом, и его экспрессия была вызвана митогенными сигналами в человеческих B-лимфоцитах. [37] [38] Примерно в то же время был обнаружен Xenopus NO38, который оказался гомологичным Xenopus Nucleoplasmin и крысиному B23. [39]

Структура

Белок NPM1 можно разделить на несколько доменов с мотивами последовательностей, которые сохраняются в семействе нуклеоплазминов и имеют важные и различные функции. N-концевой основной домен, кислые участки, основной домен и домен ароматической нуклеиновой кислоты составляют белок NPM1. Кроме того, мотивы последовательностей, такие как сигналы ядерного экспорта (NES), сигналы ядерной локализации (NLS) и сигналы ядрышковой локализации (NoLS), имеют решающее значение для локализации NPM1 в ядрышке, а также для его ядерно-цитоплазматического перемещения, необходимого для его разнообразного набора функций.

N-концевой домен, также известный как основной домен (остатки 1-119 человеческого NPM1), является наиболее консервативным доменом среди белков семейства NPM. Этот домен сворачивается в отчетливую структуру, которая устойчива к протеазе и отвечает за олигомеризацию и шаперонную активность этих белков. Он содержит несколько гидрофобных остатков, которые являются высококонсервативными (~80%) среди белков NPM. Кристаллическая структура основного домена NPM1 (остатки 9-122) показывает, что этот домен сворачивается в восьмицепочечный β-бочонок с топологией желеобразного рулета, образуя клиновидное гидрофобное ядро, которое плотно прилегает, образуя пентамер посредством гидрофобных взаимодействий между мономерными субъединицами. Два пентамерных комплекса выстраиваются в линию голова к голове, образуя декамерную структуру. Сравнение кристаллической структуры человеческого NPM1 и основных доменов Xenopus NO38, Xenopus Nucleoplasmin и Drosophila Nucleoplasmin like protein (dNLP) показывает, что как мономерная, так и пентамерная структуры очень похожи среди всех белков семейства NPM. Основной домен человеческого NPM1 (остатки 15-118) имеет идентичность последовательности 80%, 51% и 29% с ядрами Xenopus NO38, Nucleoplasmin и Drosophila NLP соответственно. Все они образуют одну и ту же структуру β-бочки с топологией рулета-желе.

Предполагалось, что NPM1 является гексамером в нативных условиях, поскольку было обнаружено, что его молекулярная масса составляет 230–255 кДа, рассчитанная с помощью гель-фильтрационной хроматографии и седиментационного анализа. Однако кристаллическая структура ядра NPM1 ясно показывает, что это пентамер. Интерфейс пентамер-пентамер состоит из нескольких молекул воды, участвующих в образовании водородных связей между двумя пентамерами. Более того, взаимодействия на основе десяти зарядов между Asp высококонсервативной петли AKDE и Lys82 придают дополнительную стабильность. Сравнение структур dNLP и нуклеоплазмина показало, что образование декамера может быть облегчено связыванием гистонов. Димер H2A-H2B может связываться с боковой поверхностью декамера NPM1. Кроме того, сравнение кристаллических структур человеческого NPM1 и Xenopus NO38 выявляет структурную пластичность в интерфейсе пентамер-пентамер. При наложении одного из пентамеров человеческого NPM1 и Xenopus NO38 возникает большое вращательное смещение (~20°) между другими пентамерами. Кроме того, направление вращательных смещений противоположно для человеческого NPM1 и Xenopus NO38 по сравнению со структурой ядра нуклеоплазмина Xenopus. Значение этой структурной пластичности не совсем понятно, однако, оно может иметь значение в шаперонной функции NPM1.

Взаимодействия

Было показано, что NPM1 взаимодействует с

Нуклеофосмин имеет несколько партнеров по связыванию: [12]

  1. рРНК
  2. ВИЧ Rev и Rex пептид
  3. супрессор опухолей p53
  4. супрессор опухолей АРФ
  5. MDM2 (мышиная двойная минута 2, убиквитинлигаза)
  6. Рибосомный белок S9
  7. Фосфатидилинозитол 3,4,5-трифосфат (PIP3)
  8. Экспортин-1 (CRM1, поддержание хромосомного региона)
  9. Нуклеолин/С23
  10. Транскрипционная мишень онкогена myc

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000181163 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000057113 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Liu QR, Chan PK (март 1993). «Характеристика семи обработанных псевдогенов нуклеофосмина/B23 в геноме человека». DNA and Cell Biology . 12 (2): 149–156. doi :10.1089/dna.1993.12.149. PMID  8471164.
  6. ^ Morris SW, Kirstein MN, Valentine MB, Dittmer KG, Shapiro DN, Saltman DL, Look AT (март 1994). «Слияние гена киназы ALK с геном ядрышкового белка NPM при неходжкинской лимфоме». Science . 263 (5151): 1281–1284. Bibcode :1994Sci...263.1281M. doi :10.1126/science.8122112. PMID  8122112.
  7. ^ Chang JH, Olson MO (июль 1989). «Один ген кодирует две формы мРНК ядрышкового белка B23 крысы». Журнал биологической химии . 264 (20): 11732–11737. doi : 10.1016/S0021-9258(18)80126-0 . PMID  2745414.
  8. ^ abc Okuwaki M, Iwamatsu A, Tsujimoto M, Nagata K (август 2001 г.). «Идентификация нуклеофосмина/B23, кислого ядрышкового белка, как стимулирующего фактора для in vitro репликации аденовирусной ДНК в комплексе с вирусными основными белками ядра». Журнал молекулярной биологии . 311 (1): 41–55. doi :10.1006/jmbi.2001.4812. PMID  11469856.
  9. ^ Michalik J, Yeoman LC, Busch H (март 1981). «Ядрышковая локализация белка B23 (37/5.1) с помощью иммуноцитохимических методов». Life Sciences . 28 (12): 1371–1379. doi :10.1016/0024-3205(81)90411-2. PMID  7017325.
  10. ^ Spector DL, Ochs RL, Busch H (1984). «Окрашивание серебром, иммунофлуоресценция и иммуноэлектронная микроскопическая локализация ядрышковых фосфопротеинов B23 и C23». Chromosoma . 90 (2): 139–148. doi :10.1007/BF00292451. PMID  6206987. S2CID  38080472.
  11. ^ Ван Д., Умекава Х., Олсон МО. (1993). «Экспрессия и субклеточные расположения двух форм ядрышкового белка B23 в тканях и клетках крыс». Cellular & Molecular Biology Research . 39 (1): 33–42. PMID  8287070.
  12. ^ ab Lindström MS (2011). "NPM1/B23: многофункциональный шаперон в биогенезе рибосом и ремоделировании хроматина". Biochemistry Research International . 2011 : 195209. doi : 10.1155/2011/195209 . PMC 2989734. PMID  21152184 . 
  13. ^ Hingorani K, Szebeni A, Olson MO (август 2000). «Картирование функциональных доменов ядрышкового белка B23». Журнал биологической химии . 275 (32): 24451–24457. doi : 10.1074/jbc.M003278200 . PMID  10829026.
  14. ^ Chang JH, Lin JY, Wu MH, Yung BY (февраль 1998). «Доказательства способности нуклеофозмина/B23 связывать АТФ». The Biochemical Journal . 329 (Pt 3) (Pt 3): 539–544. doi :10.1042/bj3290539. PMC 1219074 . PMID  9445380. 
  15. ^ abc Szebeni A, Olson MO (апрель 1999). «Ядрышковый белок B23 обладает молекулярной шаперонной активностью». Protein Science . 8 (4): 905–912. doi :10.1110/ps.8.4.905. PMC 2144306 . PMID  10211837. 
  16. ^ ab Borer RA, Lehner CF, Eppenberger HM, Nigg EA (февраль 1989). «Основные ядрышковые белки перемещаются между ядром и цитоплазмой». Cell . 56 (3): 379–390. doi :10.1016/0092-8674(89)90241-9. PMID  2914325. S2CID  32557569.
  17. ^ abcd Swaminathan V, Kishore AH, Febitha KK, Kundu TK (сентябрь 2005 г.). «Человеческий гистоновый шаперон нуклеофосмин усиливает транскрипцию хроматина, зависящую от ацетилирования». Молекулярная и клеточная биология . 25 (17): 7534–7545. doi :10.1128/MCB.25.17.7534-7545.2005. PMC 1190275. PMID  16107701 . 
  18. ^ Окуваки, М.; Ивамацу, А.; Цудзимото, М.; Нагата, К. (2001-08-03). «Идентификация нуклеофосмина/B23, кислого ядрышкового белка, как стимулирующего фактора для репликации in vitro аденовирусной ДНК в комплексе с вирусными основными белками ядра». Журнал молекулярной биологии . 311 (1): 41–55. doi :10.1006/jmbi.2001.4812. ISSN  0022-2836. PMID  11469856.
  19. ^ Окуваки, М.; Мацумото, К.; Цудзимото, М.; Нагата, К. (12 октября 2001 г.). «Функция нуклеофосмина / B23, ядрышкового кислого белка, как шаперона гистонов». Письма ФЭБС . 506 (3): 272–276. дои : 10.1016/s0014-5793(01)02939-8. ISSN  0014-5793. PMID  11602260. S2CID  27961615.
  20. ^ Намбудири, В. М. Харидасан; Акей, Ильдико В.; Шмидт-Захманн, Мэрион С.; Хэд, Джеймс Ф.; Акей, Кристофер В. (декабрь 2004 г.). «Структура и функция ядра Xenopus NO38, гистонового шаперона в ядрышке». Структура . 12 (12): 2149–2160. doi : 10.1016/j.str.2004.09.017 . ISSN  0969-2126. PMID  15576029.
  21. ^ Мурано, Кенсаку; Окуваки, Мицуру; Хисаока, Михару; Нагата, Кёске (май 2008 г.). «Регуляция транскрипции гена рРНК с помощью многофункционального ядрышкового белка B23 / нуклеофосмина посредством его активности гистонов-шаперонов». Молекулярная и клеточная биология . 28 (10): 3114–3126. дои : 10.1128/MCB.02078-07. ISSN  1098-5549. ПМК 2423177 . ПМИД  18332108. 
  22. ^ аб Гадад, Шрикант С.; Сенапати, Париджат; Сайед, Саджад Хусейн; Раджан, Рошан Элизабет; Шандилья, Джаяша; Сваминатан, Венкатеш; Чаттерджи, Снехаджьоти; Коломбо, Эмануэла; Димитров, Стефан; Пеличчи, Пьер Джузеппе; Ранга, Удайкумар; Кунду, Тапас К. (12 апреля 2011 г.). «Многофункциональный белок нуклеофосмин (NPM1) представляет собой шаперон человеческого линкерного гистона H1». Биохимия . 50 (14): 2780–2789. дои : 10.1021/bi101835j. ISSN  1520-4995. ПМИД  21425800.
  23. ^ Yu Y, Maggi LB, Brady SN, Apicelli AJ, Dai MS, Lu H, Weber JD (май 2006 г.). «Нуклеофосмин необходим для ядерного экспорта рибосомального белка L5». Молекулярная и клеточная биология . 26 (10): 3798–3809. doi :10.1128/MCB.26.10.3798-3809.2006. PMC 1488996. PMID  16648475. 
  24. ^ Dumbar TS, Gentry GA, Olson MO (ноябрь 1989). «Взаимодействие ядрышкового фосфопротеина B23 с нуклеиновыми кислотами». Биохимия . 28 (24): 9495–9501. doi :10.1021/bi00450a037. PMID  2482073.
  25. ^ Olson, MO; Wallace, MO; Herrera, AH; Marshall-Carlson, L.; Hunt, RC (1986-01-28). «Прерибосомальные рибонуклеопротеиновые частицы являются основным компонентом фракции ядрышкового матрикса». Biochemistry . 25 (2): 484–491. doi :10.1021/bi00350a031. ISSN  0006-2960. PMID  3955008.
  26. ^ Ван, Д.; Бауманн, А.; Себени, А.; Олсон, МО (1994-12-09). «Активность связывания нуклеиновой кислоты ядрышкового белка B23.1 находится в его карбоксильном конце». Журнал биологической химии . 269 (49): 30994–30998. doi : 10.1016/S0021-9258(18)47380-2 . ISSN  0021-9258. PMID  7527039.
  27. ^ Yun, Jing-Ping; Chew, Eng Ching; Liew, Choong-Tsek; Chan, John YH; Jin, Mei-Lin; Ding, Ming-Xiao; Fai, Yam Hin; Li, HK Richard; Liang, Xiao-Man; Wu, Qiu-Liang (2003-12-15). "Nucleophosmin/B23 is a proliferate transport protein associated with nuclear matrix". Journal of Cellular Biochemistry . 90 (6): 1140–1148. doi :10.1002/jcb.10706. ISSN  0730-2312. PMID  14635188.
  28. ^ Herrera, JE; Savkur, R.; Olson, MO (1995-10-11). "Активность рибонуклеазы ядрышкового белка B23". Nucleic Acids Research . 23 (19): 3974–3979. doi :10.1093/nar/23.19.3974. ISSN  0305-1048. PMC 307319. PMID 7479045  . 
  29. ^ Savkur, RS; Olson, MO (1 октября 1998 г.). «Преимущественное расщепление прерибосомальной РНК эндорибонуклеазой B23». Nucleic Acids Research . 26 (19): 4508–4515. doi :10.1093/nar/26.19.4508. ISSN  0305-1048. PMC 147876. PMID  9742256 . 
  30. ^ ab Shandilya J, Swaminathan V, Gadad SS, Choudhari R, Kodaganur GS, Kundu TK (сентябрь 2009 г.). «Ацетилированный NPM1 локализуется в нуклеоплазме и регулирует транскрипционную активацию генов, вовлеченных в проявление рака полости рта». Молекулярная и клеточная биология . 29 (18): 5115–5127. doi :10.1128/MCB.01969-08. PMC 2738287. PMID  19581289 . 
  31. ^ Senapati P, Bhattacharya A, Das S, Dey S, Sudarshan D, GS и др. (Февраль 2022 г.). «Гистоновый шаперон нуклеофосмин регулирует транскрипцию ключевых генов, вовлеченных в оральный опухолегенез». Молекулярная и клеточная биология . 42 (2): e0066920. doi :10.1128/mcb.00669-20. PMC 8852714. PMID 34898280  . 
  32. ^ Falini B, Nicoletti I, Bolli N, Martelli MP, Liso A, Gorello P и др. (апрель 2007 г.). «Транслокации и мутации, связанные с геном нуклеофосмина (NPM1) при лимфомах и лейкемиях». Haematologica . 92 (4): 519–532. doi :10.3324/haematol.11007. hdl : 2434/424144 . PMID  17488663.
  33. ^ Meani N, Alcalay M (сентябрь 2009 г.). «Роль нуклеофосмина при остром миелоидном лейкозе». Expert Review of Anticancer Therapy . 9 (9): 1283–1294. doi :10.1586/era.09.84. PMID  19761432. S2CID  7390794.
  34. ^ Loberg MA, Bell RK, Goodwin LO, Eudy E, Miles LA, SanMiguel JM и др. (июль 2019 г.). «Последовательно индуцируемые мышиные модели показывают, что мутация Npm1 вызывает злокачественную трансформацию клонального гемопоэза, вызванного мутантом Dnmt3a». Leukemia . 33 (7): 1635–1649. doi :10.1038/s41375-018-0368-6. PMC 6609470 . PMID  30692594. 
  35. ^ Olson MO, Orrick LR, Jones C, Busch H (май 1974). «Фосфорилирование кислоторастворимых ядрышковых белков асцитных клеток гепатомы Новикова in vivo». Журнал биологической химии . 249 (9): 2823–2827. doi : 10.1016/S0021-9258(19)42704-X . PMID  4364031.
  36. ^ Orrick LR, Olson MO, Busch H (май 1973). "Сравнение ядрышковых белков нормальной печени крысы и асцитных клеток гепатомы Новикова методом двумерного электрофореза в полиакриламидном геле". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 70 (5): 1316–1320. Bibcode : 1973PNAS...70.1316O. doi : 10.1073/pnas.70.5.1316 . PMC 433487. PMID  4351171 . 
  37. ^ Feuerstein N, Chan PK, Mond JJ (август 1988 г.). «Идентификация нуматрина, ядерного матричного белка, связанного с индукцией митогенеза, как ядрышкового белка B23. Значение для роли ядрышка в ранней передаче митогенных сигналов». Журнал биологической химии . 263 (22): 10608–10612. doi : 10.1016/S0021-9258(18)38014-1 . PMID  3392030.
  38. ^ Feuerstein N, Mond JJ (август 1987 г.). ««Нуматрин», ядерный матричный белок, связанный с индукцией пролиферации в В-лимфоцитах». Журнал биологической химии . 262 (23): 11389–11397. doi : 10.1016/S0021-9258(18)60972-X . PMID  3301855.
  39. ^ Schmidt-Zachmann MS, Hügle-Dörr B, Franke WW (июль 1987 г.). «Конститутивный ядрышковый белок, идентифицированный как член семейства нуклеоплазминов». The EMBO Journal . 6 (7): 1881–1890. doi :10.1002/j.1460-2075.1987.tb02447.x. PMC 553572 . PMID  3308448. 
  40. ^ Lee SB, Xuan Nguyen TL, Choi JW, Lee KH, Cho SW, Liu Z и др. (октябрь 2008 г.). «Ядерный Akt взаимодействует с B23/NPM и защищает его от протеолитического расщепления, повышая выживаемость клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (43): 16584–16589. Bibcode : 2008PNAS..10516584L. doi : 10.1073/pnas.0807668105 . PMC 2569968. PMID  18931307 . 
  41. ^ ab Sato K, Hayami R, Wu W, Nishikawa T, Nishikawa H, Okuda Y, et al. (Июль 2004 г.). «Нуклеофосмин/B23 является кандидатом на субстрат для убиквитинлигазы BRCA1-BARD1». Журнал биологической химии . 279 (30): 30919–30922. doi : 10.1074/jbc.C400169200 . PMID  15184379. S2CID  23001611.
  42. ^ Li YP, Busch RK, Valdez BC, Busch H (апрель 1996 г.). «C23 взаимодействует с B23, предполагаемым белком, связывающим сигнал ядрышковой локализации». European Journal of Biochemistry . 237 (1): 153–158. doi :10.1111/j.1432-1033.1996.0153n.x. PMID  8620867.

Дальнейшее чтение

  • Yun C, Wang Y, Mukhopadhyay D, Backlund P, Kolli N, Yergey A и др. (ноябрь 2008 г.). «Ядрышковый белок B23/нуклеофосмин регулирует путь SUMO позвоночных через протеазы SENP3 и SENP5». Журнал клеточной биологии . 183 (4): 589–595. doi :10.1083/jcb.200807185. PMC 2582899.  PMID 19015314  .
  • Haindl M, Harasim T, Eick D, Muller S (март 2008 г.). «Протеаза SENP3, специфичная для ядрышка SUMO, отменяет модификацию SUMO нуклеофосмина и необходима для процессинга рРНК». EMBO Reports . 9 (3): 273–279. doi :10.1038/embor.2008.3. PMC  2267381. PMID  18259216 .
  • Ли Л., Ли Х. С., Пауза К. Д., Букринский М., Чжао Р. Ю. (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействиях хозяин-патоген». Cell Research . 15 (11–12): 923–934. doi : 10.1038/sj.cr.7290370 . PMID  16354571. S2CID  24253878.
  • Gjerset RA (сентябрь 2006 г.). «Повреждение ДНК, p14ARF, нуклеофосмин (NPM/B23) и рак». Журнал молекулярной гистологии . 37 (5–7): 239–251. doi :10.1007/s10735-006-9040-y. PMID  16855788. S2CID  24017618.
  • Chen W, Rassidakis GZ, Medeiros LJ (ноябрь 2006 г.). «Мутации гена нуклеофосмина при остром миелоидном лейкозе». Архивы патологии и лабораторной медицины . 130 (11): 1687–1692. doi :10.5858/2006-130-1687-NGMIAM. PMID  17076533.
  • Falini B, Nicoletti I, Bolli N, Martelli MP, Liso A, Gorello P и др. (апрель 2007 г.). «Транслокации и мутации, связанные с геном нуклеофосмина (NPM1) при лимфомах и лейкемиях». Haematologica . 92 (4): 519–532. doi :10.3324/haematol.11007. hdl : 2434/424144 . PMID  17488663.
  • Fankhauser C, Izaurralde E, Adachi Y, Wingfield P, Laemmli UK (май 1991 г.). «Специфический комплекс белков вируса иммунодефицита человека типа 1 rev и ядрышковых белков B23: диссоциация элементом ответа Rev». Молекулярная и клеточная биология . 11 (5): 2567–2575. doi :10.1128/MCB.11.5.2567. PMC  360026. PMID  2017166 .
  • Venkatesh LK, Mohammed S, Chinnadurai G (май 1990). «Функциональные домены гена HIV-1 rev, необходимые для трансрегуляции и субклеточной локализации». Вирусология . 176 (1): 39–47. doi :10.1016/0042-6822(90)90228-J. PMID  2109912.
  • Cochrane AW, Perkins A, Rosen CA (февраль 1990 г.). «Идентификация последовательностей, важных для ядрышковой локализации вируса иммунодефицита человека Rev: значимость ядрышковой локализации для функции». Журнал вирусологии . 64 (2): 881–885. doi :10.1128/JVI.64.2.881-885.1990. PMC  249184 . PMID  2404140.
  • Chan PK, Chan WY, Yung BY, Cook RG, Aldrich MB, Ku D и др. (октябрь 1986 г.). «Аминокислотная последовательность специфического антигенного пептида белка B23». Журнал биологической химии . 261 (30): 14335–14341. doi : 10.1016/S0021-9258(18)67023-1 . PMID  2429957.
  • Zhang XX, Thomis DC, Samuel CE (октябрь 1989 г.). «Выделение и характеристика молекулярного клона кДНК человеческой мРНК из обработанных интерфероном клеток, кодирующих ядрышковый белок B23, нуматрин». Biochemical and Biophysical Research Communications . 164 (1): 176–184. doi :10.1016/0006-291X(89)91699-9. PMID  2478125.
  • Hale TK, Mansfield BC (декабрь 1989 г.). "Нуклеотидная последовательность клона кДНК, представляющего третий аллель человеческого белка B23". Nucleic Acids Research . 17 (23): 10112. PMC  335249. PMID  2602120 .
  • Chan WY, Liu QR, Borjigin J, Busch H, Rennert OM, Tease LA, Chan PK (февраль 1989). «Характеристика кДНК, кодирующей человеческий нуклеофосмин, и исследования ее роли в нормальном и аномальном росте». Биохимия . 28 (3): 1033–1039. doi :10.1021/bi00429a017. PMID  2713355.
  • Li XZ, McNeilage LJ, Whittingham S (август 1989). «Нуклеотидная последовательность человеческой кДНК, кодирующая высококонсервативный ядрышковый фосфопротеин B23». Biochemical and Biophysical Research Communications . 163 (1): 72–78. doi :10.1016/0006-291X(89)92100-1. PMID  2775293.
  • Chan PK, Aldrich M, Cook RG, Busch H (февраль 1986 г.). «Аминокислотная последовательность участка фосфорилирования белка B23». Журнал биологической химии . 261 (4): 1868–1872. doi : 10.1016/S0021-9258(18)67023-1 . PMID  3944116.
  • Bocker T, Bittinger A, Wieland W, Buettner R, Fauser G, Hofstaedter F, Rüschoff J (апрель 1995 г.). «Экспрессия ядрышковых белков B23 и p120 in vitro и ex vivo при доброкачественных и злокачественных эпителиальных поражениях простаты». Modern Pathology . 8 (3): 226–231. PMID  7542384.
  • Dundr M, Leno GH, Hammarskjöld ML, Rekosh D, Helga-Maria C, Olson MO (август 1995 г.). «Роль ядрышковой структуры и функции в субклеточном расположении белка HIV-1 Rev». Journal of Cell Science . 108 ( Pt 8) (8): 2811–2823. doi :10.1242/jcs.108.8.2811. PMID  7593322.
  • Miyazaki Y, Takamatsu T, Nosaka T, Fujita S, Martin TE, Hatanaka M (июль 1995 г.). «Цитотоксичность вируса иммунодефицита человека типа 1 Rev: последствия его взаимодействия с ядрышковым белком B23». Experimental Cell Research . 219 (1): 93–101. doi :10.1006/excr.1995.1209. PMID  7628555.
  • Szebeni A, Herrera JE, Olson MO (июнь 1995). «Взаимодействие ядрышкового белка B23 с пептидами, связанными с сигналами ядерной локализации». Биохимия . 34 (25): 8037–8042. doi :10.1021/bi00025a009. PMID  7794916.
  • Kato S, Sekine S, Oh SW, Kim NS, Umezawa Y, Abe N и др. (декабрь 1994 г.). «Создание банка человеческой полноразмерной ДНК». Gene . 150 (2): 243–250. doi :10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID  7821789.
  • Marasco WA, Szilvay AM, Kalland KH, Helland DG, Reyes HM, Walter RJ (1995). «Пространственная ассоциация белка tat ВИЧ-1 и ядрышкового транспортного белка B23 в стабильно трансфицированных Т-клетках Jurkat». Архивы вирусологии . 139 (1–2): 133–154. doi :10.1007/BF01309460. PMID  7826206. S2CID  24710329.
  • Valdez BC, Perlaky L, Henning D, Saijo Y, Chan PK, Busch H (сентябрь 1994 г.). «Идентификация сигналов ядерной и ядрышковой локализации белка p120. Взаимодействие с транслокационным белком B23». Журнал биологической химии . 269 (38): 23776–23783. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31583-1 . PMID  8089149.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=NPM1&oldid=1218029615"