60S рибосомальный белок L13 — это белок , который у людей кодируется геном RPL13 . [5] [6]
Функция
Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и приблизительно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок , который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков L13E. Он расположен в цитоплазме . Этот ген экспрессируется на значительно более высоких уровнях в доброкачественных образованиях молочной железы, чем в карциномах молочной железы . Существуют варианты транскрипта, полученные в результате альтернативного сплайсинга и/или альтернативного полиаденилирования ; эти варианты кодируют один и тот же белок. Как это типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует несколько процессированных псевдогенов этого гена, рассеянных по геному. [6]
Bbc1 (Mti1p) — это белок, экспрессируемый в дрожжах, который, как полагают, ассоциируется с актиновыми сетями. Bbc1 — это сокращение от Bni1 synthetic lethal и Bee1 ( las17 ) complex member. [8] Альтернативное название, Mti1p, — это сокращение от Myosin tail region-interacting protein. [9] Bbc1 участвует в регуляции цитоскелета во время эндоцитоза . Почкующиеся дрожжи Bbc1 ингибируют активатор комплекса Arp2/3 Las17 ( гомолог WASp ). [10] Белок также взаимодействует с хвостом белков Myosin 1. [9]
В делящихся дрожжах Bbc1 считается цитоскелетным белком семейства WIP. Bbc1 локализуется в актиновых кортикальных участках, местах деления клеток, кончике клетки и цитозоле. Клетки с делецией гена bbc1 жизнеспособны. [11] Bbc1 сродно захватывается белком Cyk3, закрепляющим актиновые филаменты семейства Nebulin [12] , и АТФ -зависимой ДНК-хеликазой Fft3 семейства SMARCAD1 . [11] [13] Bbc1 конкурирует с гомологом WIP Vrp1 за связывание хвоста миозина 1 для регуляции сборки актина в эндоцитозных участках. [14]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000167526 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000059776 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека». Genome Res . 8 (5): 509–23 . doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194.
^ ab "Ген Энтреза: рибосомальный белок L13 RPL13".
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса человеческого CDC5L и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии». EMBO J . 19 (23): 6569– 81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. PMC 305846 . PMID 11101529.
^ ab Mochida J, Yamamoto T, Fujimura-Kamada K, Tanaka K (март 2002 г.). «Новый адаптерный белок Mti1p и Vrp1p, гомолог белка, взаимодействующего с белком синдрома Вискотта-Олдрича (WIP), может антагонистически регулировать миозины типа I в Saccharomyces cerevisiae». Genetics . 160 (3): 923– 34. doi :10.1093/genetics/160.3.923. OCLC 678661938. PMC 1462009 . PMID 11901111.
^ Rodal AA, Manning AL, Goode BL, Drubin DG (июнь 2003 г.). «Отрицательная регуляция дрожжевого WASp двумя белками, содержащими домен SH3». Current Biology . 13 (12): 1000– 8. Bibcode :2003CBio...13.1000R. doi : 10.1016/s0960-9822(03)00383-x . PMID 12814545. S2CID 11363803.
^ ab "Pombase". www.pombase.org . Получено 2020-01-09 .
^ Roberts-Galbraith RH, Ohi MD, Ballif BA, Chen JS, McLeod I, McDonald WH и др. (июль 2010 г.). «Дефосфорилирование белка F-BAR Cdc15 модулирует его конформацию и стимулирует его каркасную активность в месте деления клетки». Molecular Cell . 39 (1): 86– 99. doi :10.1016/j.molcel.2010.06.012. PMC 2916701 . PMID 20603077.
^ Lee J, Choi ES, Seo HD, Kang K, Gilmore JM, Florens L и др. (февраль 2017 г.). "Fft3 индуцирует разборку нуклеосом для облегчения удлинения РНК-полимеразы II". Nature Communications . 8 : 14527. Bibcode :2017NatCo...814527L. doi :10.1038/ncomms14527. PMC 5321744 . PMID 28218250.
^ MacQuarrie CD, Mangione MC, Carroll R, James M, Gould KL, Sirotkin V (сентябрь 2019 г.). «Адаптерный белок S. pombe Bbc1 регулирует локализацию Wsp1 и Vrp1 во время сборки эндоцитарного актинового участка». Journal of Cell Science . 132 (17): jcs233502. doi :10.1242/jcs.233502. PMC 6771142 . PMID 31391237.
Дальнейшее чтение
Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Biochem. Cell Biol . 73 ( 11– 12): 933– 47. doi :10.1139/o95-101. PMID 8722009.
Adams SM, Helps NR, Sharp MG, Brammar WJ, Walker RA, Varley JM (1993). «Выделение и характеристика нового гена с дифференциальной экспрессией в доброкачественных и злокачественных опухолях молочной железы человека». Hum. Mol. Genet . 1 (2): 91– 6. doi :10.1093/hmg/1.2.91. PMID 1301162.
Като С, Секин С, О С, Ким Н. С., Умэдзава И., Абэ Н., Ёкояма-Кобаяши М., Аоки Т. (1995). «Создание банка полноразмерной ДНК человека». Gene . 150 (2): 243– 50. doi :10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID 7821789.
Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина бета3». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (9): 4451– 6. Bibcode : 1997PNAS...94.4451Y. doi : 10.1073 /pnas.94.9.4451 . PMC 20743. PMID 9114010.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. Bibcode : 2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033.
Bi W, Yan J, Stankiewicz P, Park SS, Walz K, Boerkoel CF, Potocki L, Shaffer LG, Devriendt K, Nowaczyk MJ, Inoue K, Lupski JR (2002). «Гены в уточненном интервале критической делеции синдрома Смита-Магениса на хромосоме 17p11.2 и синтенной области мыши». Genome Res . 12 (5): 713– 28. doi :10.1101/gr.73702. PMC 186594. PMID 11997338.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Kobayashi T, Sasaki Y, Oshima Y, Yamamoto H, Mita H, Suzuki H, Toyota M, Tokino T, Itoh F, Imai K, Shinomura Y (2006). «Активация гена рибосомального белка L13 при раке желудочно-кишечного тракта человека». Int. J. Mol. Med . 18 (1): 161– 70. doi : 10.3892/ijmm.18.1.161 . PMID 16786168.
Внешние ссылки
PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого рибосомального белка L13 60S.
