Rc-o319

Rc-o319
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирус
Королевство:	Орторнавирусы
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Пизонивирицеты
Заказ:	Нидовирусы
Семья:	Коронавирусы
Род:	бетакоронавирус
Подрод:	Сарбековирус
Разновидность:	Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом
Напряжение:	Rc-o319

Rc-o319 — это штамм коронавируса, вызывающего тяжелый острый респираторный синдром, полученный от летучих мышей , собранный у маленьких японских подковоносов ( Rhinolophus cornutus ) в префектуре Иватэ , Япония. ^[1]^[2] Он имеет 81% сходства с SARS-CoV-2 и является самой ранней ветвью штаммов коронавируса, родственного SARS-CoV-2.

Филогенетическое дерево, основанное на последовательностях всего генома SARS-CoV-2 и родственных коронавирусов, выглядит следующим образом: ^[3]^[4]

Коронавирус, связанный с SARS‑CoV‑2

( Летучая мышь ) Rc-o319, 81% к SARS-CoV-2, Rhinolophus cornutus , Ивате , Япония ^[1]

	Летучая мышь SL-ZXC21 , 88% к SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Чжоушань , Чжэцзян ^[5]

	Летучая мышь SL-ZC45 , 88% к SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Чжоушань, Чжэцзян ^[5]

Панголин SARSr-CoV-GX, 85,3% к SARS-CoV-2, Manis javanica , контрабандой доставлен из Юго-Восточной Азии ^[6]

Панголин SARSr-CoV-GD, 90,1% SARS-CoV-2, Manis javanica , контрабандой доставлен из Юго-Восточной Азии ^[7]

	Летучая мышь RshSTT182, 92,6% к SARS-CoV-2, Rhinolophusshameli , Стеунг Тренг , Камбоджа ^[8]

	Летучая мышь RshSTT200, 92,6% к SARS-CoV-2, Rhinolophusshameli , Стеунг Тренг, Камбоджа ^[8]

	(Летучая мышь) RacCS203 , 91,5% к SARS-CoV-2, Rhinolophus acuminatus , Чаченгсао , Таиланд ^[4]

	(Летучая мышь) RmYN02 , 93,3% к SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Менгла , Юньнань ^[9]

(Летучая мышь) RpYN06 , 94,4% к SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Сишуанбаньна , Юньнань ^[3]

	(Летучие мыши) RaTG13 , 96,1% к SARS-CoV-2, Rhinolophus affinis , Модзян , Юньнань ^[10]

	(Летучая мышь) BANAL-52, 96,8% к SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Вьентьян , Лаос ^[11]

	SARS-CoV-2

SARS-CoV-1 , 79% до SARS-CoV-2

Ссылки

^ ab Murakami S, Kitamura T, Suzuki J, Sato R, Aoi T, Fujii M и др. (декабрь 2020 г.). «Обнаружение и характеристика сарбековируса летучих мышей, филогенетически связанного с SARS-CoV-2, Япония». Emerging Infectious Diseases . 26 (12): 3025– 3029. doi :10.3201/eid2612.203386. PMC 7706965 . PMID 33219796.
^ Маллапати, Смрити (2020-11-23). «Коронавирусы, тесно связанные с пандемическим вирусом, обнаруженным в Японии и Камбодже». Nature . 588 (7836): 15– 16. Bibcode :2020Natur.588...15M. doi :10.1038/d41586-020-03217-0. PMID 33230273. S2CID 227157702.
^ ab Zhou H, Ji J, Chen X, Bi Y, Li J, Wang Q и др. (август 2021 г.). «Идентификация новых коронавирусов летучих мышей проливает свет на эволюционное происхождение SARS-CoV-2 и родственных вирусов». Cell . 184 (17): 4380–4391.e14. doi :10.1016/j.cell.2021.06.008. PMC 8188299 . PMID 34147139.
^ ab Wacharapluesadee S, Tan CW, Maneeorn P, Duengkae P, Zhu F, Joyjinda Y и др. (февраль 2021 г.). «Доказательства наличия коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, циркулирующих у летучих мышей и ящеров в Юго-Восточной Азии». Природные коммуникации . 12 (1): 972. Бибкод : 2021NatCo..12..972W. дои : 10.1038/s41467-021-21240-1 . ПМЦ 7873279 . ПМИД 33563978.
^ ab Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучей мыши, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в месте расщепления S1/S2 белка шипа». Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627 . PMID 32416074.
^ Лам Т.Т., Цзя Н., Чжан Ю.В., Шум М.Х., Цзян Дж.Ф., Чжу Х.К. и др. (июль 2020 г.). «Идентификация коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, у малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 282–285 . Бибкод : 2020Natur.583..282L. дои : 10.1038/s41586-020-2169-0. PMID 32218527. S2CID 214683303.
^ Сяо К., Чжай Дж., Фэн Ю., Чжоу Н., Чжан Х., Цзоу Дж.Дж. и др. (июль 2020 г.). «Выделение коронавируса, связанного с SARS-CoV-2, от малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 286–289 . Бибкод : 2020Natur.583..286X. дои : 10.1038/s41586-020-2313-x. PMID 32380510. S2CID 256822274.
^ ab Делон Д., Хул В., Карлссон Е.А., Хассанин А., Оу Т.П., Байдалюк А. и др. (ноябрь 2021 г.). «Новый коронавирус, связанный с SARS-CoV-2, у летучих мышей из Камбоджи». Природные коммуникации . 12 (1): 6563. Бибкод : 2021NatCo..12.6563D. дои : 10.1038/s41467-021-26809-4. ПМЦ 8578604 . ПМИД 34753934.
^ Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучей мыши, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в месте расщепления S1/S2 белка шипа». Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627 . PMID 32416074.
^ Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W и др. (март 2020 г.). «Вспышка пневмонии, связанная с новым коронавирусом вероятного происхождения от летучих мышей». Nature . 579 (7798): 270– 273. Bibcode :2020Natur.579..270Z. doi :10.1038/s41586-020-2012-7. PMC 7095418 . PMID 32015507.
^ Теммам С., Вонгфайлот К., Бакеро Э., Мунье С., Бономи М., Рено Б. и др. (апрель 2022 г.). «Коронавирусы летучих мышей, родственные SARS-CoV-2 и заразные для клеток человека». Природа . 604 (7905): 330–336 . Бибкод : 2022Natur.604..330T. дои : 10.1038/s41586-022-04532-4. PMID 35172323. S2CID 246902858.

Эта статья о вирусах — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[Rc-o319-1] Murakami S, Kitamura T, Suzuki J, Sato R, Aoi T, Fujii M и др. (декабрь 2020 г.). «Обнаружение и характеристика сарбековируса летучих мышей, филогенетически связанного с SARS-CoV-2, Япония». Emerging Infectious Diseases . 26 (12): 3025– 3029. doi :10.3201/eid2612.203386. PMC 7706965 . PMID 33219796.

[2] Маллапати, Смрити (2020-11-23). «Коронавирусы, тесно связанные с пандемическим вирусом, обнаруженным в Японии и Камбодже». Nature . 588 (7836): 15– 16. Bibcode :2020Natur.588...15M. doi :10.1038/d41586-020-03217-0. PMID 33230273. S2CID 227157702.

[RpYN06-3] Zhou H, Ji J, Chen X, Bi Y, Li J, Wang Q и др. (август 2021 г.). «Идентификация новых коронавирусов летучих мышей проливает свет на эволюционное происхождение SARS-CoV-2 и родственных вирусов». Cell . 184 (17): 4380–4391.e14. doi :10.1016/j.cell.2021.06.008. PMC 8188299 . PMID 34147139.

[RacCS203-4] Wacharapluesadee S, Tan CW, Maneeorn P, Duengkae P, Zhu F, Joyjinda Y и др. (февраль 2021 г.). «Доказательства наличия коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, циркулирующих у летучих мышей и ящеров в Юго-Восточной Азии». Природные коммуникации . 12 (1): 972. Бибкод : 2021NatCo..12..972W. дои : 10.1038/s41467-021-21240-1 . ПМЦ 7873279 . ПМИД 33563978.

[ZXC21-5] Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучей мыши, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в месте расщепления S1/S2 белка шипа». Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627 . PMID 32416074.

[Pangolin_CoV_GX-6] Лам Т.Т., Цзя Н., Чжан Ю.В., Шум М.Х., Цзян Дж.Ф., Чжу Х.К. и др. (июль 2020 г.). «Идентификация коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, у малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 282–285 . Бибкод : 2020Natur.583..282L. дои : 10.1038/s41586-020-2169-0. PMID 32218527. S2CID 214683303.

[Pangolin_CoV_GD-7] Сяо К., Чжай Дж., Фэн Ю., Чжоу Н., Чжан Х., Цзоу Дж.Дж. и др. (июль 2020 г.). «Выделение коронавируса, связанного с SARS-CoV-2, от малайских панголинов». Природа . 583 (7815): 286–289 . Бибкод : 2020Natur.583..286X. дои : 10.1038/s41586-020-2313-x. PMID 32380510. S2CID 256822274.

[RshSTT-8] Делон Д., Хул В., Карлссон Е.А., Хассанин А., Оу Т.П., Байдалюк А. и др. (ноябрь 2021 г.). «Новый коронавирус, связанный с SARS-CoV-2, у летучих мышей из Камбоджи». Природные коммуникации . 12 (1): 6563. Бибкод : 2021NatCo..12.6563D. дои : 10.1038/s41467-021-26809-4. ПМЦ 8578604 . ПМИД 34753934.

[RmYN02-9] Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y и др. (июнь 2020 г.). «Новый коронавирус летучей мыши, тесно связанный с SARS-CoV-2, содержит естественные вставки в месте расщепления S1/S2 белка шипа». Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627 . PMID 32416074.

[RaTG13-10] Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W и др. (март 2020 г.). «Вспышка пневмонии, связанная с новым коронавирусом вероятного происхождения от летучих мышей». Nature . 579 (7798): 270– 273. Bibcode :2020Natur.579..270Z. doi :10.1038/s41586-020-2012-7. PMC 7095418 . PMID 32015507.

[BANAL-52-11] Теммам С., Вонгфайлот К., Бакеро Э., Мунье С., Бономи М., Рено Б. и др. (апрель 2022 г.). «Коронавирусы летучих мышей, родственные SARS-CoV-2 и заразные для клеток человека». Природа . 604 (7905): 330–336 . Бибкод : 2022Natur.604..330T. дои : 10.1038/s41586-022-04532-4. PMID 35172323. S2CID 246902858.