Комплекс Ragulator-Rag является регулятором лизосомальной сигнализации и трафика в эукариотических клетках, который играет важную роль в регуляции метаболизма и роста клеток в ответ на доступность питательных веществ в клетке. [1] Комплекс Ragulator-Rag состоит из пяти субъединиц LAMTOR, которые работают для регулирования MAPK и комплекса mTOR 1. [ 2] Субъединицы LAMTOR образуют комплекс с Rag GTPase и v-ATPase, который находится на лизосомах клетки и определяет доступность аминокислот. [1] Если комплекс Ragulator получает сигналы о низком количестве аминокислот, он начинает процесс катаболизма клетки. Если клетке доступно избыток аминокислот, комплекс Ragulator подает сигнал, что клетка может продолжать расти. [1] Белки Ragulator бывают двух разных форм: Rag A/Rag B и Rag C/Rag D. Они взаимодействуют, образуя гетеродимеры друг с другом.
Ламтор1 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Символ | 26068 | ||||||
Альтернативные символы | стр.18 | ||||||
Альтернативные имена | стр.18 | ||||||
ген NCBI | 55004 | ||||||
ОМИМ | 613510 | ||||||
РефСек | NM_017907.2 | ||||||
UniProt | Q6IAA8 | ||||||
Другие данные | |||||||
Локус | Хр. 11 q13.4 | ||||||
|
Ламтор2 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Символ | 29796 | ||||||
Альтернативные символы | стр.14 | ||||||
ген NCBI | 28956 | ||||||
ОМИМ | 610389 | ||||||
РефСек | NM_014017.3 | ||||||
UniProt | Q9Y2Q5 | ||||||
Другие данные | |||||||
Локус | Хр. 1 q22 | ||||||
|
Ламтор3 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Символ | 15606 | ||||||
Альтернативные символы | МП1 | ||||||
ген NCBI | 8649 | ||||||
ОМИМ | 603296 | ||||||
РефСек | NM_021970.3 | ||||||
UniProt | Q9UHA4 | ||||||
Другие данные | |||||||
Локус | Хр. 4 q23 | ||||||
|
Ламтор4 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Символ | 33772 | ||||||
Альтернативные символы | c7orf59 | ||||||
ген NCBI | 389541 | ||||||
РефСек | NM_001008395.3 | ||||||
UniProt | Q0VGL1 | ||||||
Другие данные | |||||||
Локус | Хр. 7 q22.1 | ||||||
|
Ламтор5 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Символ | 17955 | ||||||
Альтернативные символы | HBXIP | ||||||
ген NCBI | 10542 | ||||||
ОМИМ | 608521 | ||||||
РефСек | NM_006402.2 | ||||||
UniProt | О43504 | ||||||
Другие данные | |||||||
Локус | Хр. 1 стр. 13.3 | ||||||
|
mTORC1 — это комплекс в мембране лизосомы , который инициирует рост при стимулировании стимулом, таким как факторы роста. ГТФаза является ключевым компонентом в клеточной сигнализации, и в 2010 году было обнаружено четыре комплекса RAG в лизосомах клеток. В 2008 году считалось, что эти комплексы RAG замедляют аутофагию и активируют рост клеток, взаимодействуя с mTORC1. [3] Однако в 2010 году был открыт Ragulator. Исследователи определили, что функция этого Ragulator заключается во взаимодействии с комплексами RAG A, B, C и D для стимулирования роста клеток. Это открытие также привело к первому использованию термина «комплекс Rag-Ragulator» из-за взаимодействия между ними. [4]
Уровень аминокислот, рост клеток и другие важные факторы зависят от пути mTOR Complex 1. На лизосомальной поверхности аминокислоты сигнализируют об активации четырех белков Rag (RagA, RagB, RagC и RagD) для перемещения mTORC1 к месту активации. [5]
Исследование 2014 года отметило, что AMPK (AMP-активируемая протеинкиназа) и mTOR играют важную роль в управлении различными метаболическими программами. Также было обнаружено, что белковый комплекс v-ATPase-Ragulator необходим для активации mTOR и AMPK. Комплекс v-ATPase-Ragulator также используется в качестве инициирующего датчика энергетического стресса и служит местом эндосомальной стыковки для активации AMPK, опосредованной LKB1, путем формирования комплекса v-ATPase-Ragulator-AXIN/LKB1-AMPK. Это позволяет переключаться между катаболизмом и анаболизмом . [6]
В 2016 году было установлено, что RagA и Lamtor4 являются ключевыми для функционирования микроглии и регуляции биогенеза в лизосоме. Дальнейшие исследования также показывают, что комплекс Ragulator-Rag взаимодействует с белками, отличными от mTORC1, включая взаимодействие с v-АТФазой, что облегчает функции в микроглии лизосомы. [7]
В 2017 году считалось, что Ragulator регулирует положение лизосомы и взаимодействует с BORC, многосубъединичным комплексом, расположенным на поверхности лизосомальной мембраны. [8] Как BORC, так и mTORC1 работают вместе, активируя ГТФазы для изменения положения лизосомы. Был сделан вывод, что BORC и ГТФазы конкурируют за сайт связывания в белке LAMTOR 2 для изменения положения лизосомы. [9]
Хотя сложные функции комплекса Ragulator-Rag до конца не изучены, известно, что комплекс Ragulator-Rag ассоциируется с лизосомой и играет ключевую роль в регуляции сигнализации mTOR (мишень рапамицина у млекопитающих). [10] Сигнализация mTOR чувствительна к концентрации аминокислот в цитоплазме клетки, а комплекс Ragulator работает для определения концентрации аминокислот и передачи сигналов, которые активируют или ингибируют mTORC1 . [11]
Ragulator, наряду с Rag GTPases и v-ATPases , являются частью пути идентификации аминокислот и необходимы для локализации mTORC1 на поверхности лизосомы. Ragulator и v-ATPases находятся на поверхности лизосомы. Rag GTPases не могут быть напрямую связаны с лизосомой, поскольку у них отсутствуют белки, необходимые для связывания с ее липидным бислоем, поэтому Rag GTPases должны быть прикреплены к Ragulator. [12] Ragulator связан с поверхностью через V-ATPase. [13] Ragulator представляет собой кристаллизованную структуру, состоящую из пяти различных субъединиц: LAMTOR 1, LAMTOR 2, LAMTOR 3, LAMTOR 4, LAMTOR 5. В комплексе есть два набора обязательных гетеродимеров, LAMTOR 2/3, который находится прямо над LAMTOR 4/5. [12] Димер LAMTOR 1 не имеет той же структуры, что и другие субъединицы. LAMTOR 1 окружает большинство двух гетеродимеров , обеспечивая структурную поддержку и удерживая гетеродимеры на месте. Когда присутствуют аминокислоты, субъединицы сворачиваются и располагаются таким образом, что позволяют Rag-GTPases закрепиться на его первичном месте стыковки LAMTOR 2/3 на Ragulator. [12] Rag-GTPases состоят из двух наборов гетеродимеров; RAG A/B и RAG C/D. Прежде чем Rag-GTPases смогут связаться с Ragulator, Rag A/B должен быть загружен GTP через факторы обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF), а RAG C/D должен быть загружен GDP. [14] После того, как Rag-GTPases связаны с регуляторным комплексом, mTORC1 может быть перемещен на поверхность лизосомы. На лизосомальной поверхности mTORC1 затем связывается с Rheb , но только если Rheb был предварительно загружен в GTP через GEF. [13] Если количество питательных веществ и концентрация аминокислот достаточны, mTORC1 активируется.
Лизосомальная мембрана является основной областью, в которой активируется mTORC1. Однако некоторая активация может происходить в аппарате Гольджи и пероксисоме. [15] В клетках млекопитающих ГТФаза RagA и RagB являются гетеродимерами с RagC и RagD соответственно. Когда присутствует достаточное количество аминокислот, ГТФаза RagA/B активируется, что приводит к транслокации mTORC1 из цитоплазмы на поверхность лизосомы через Raptor. Этот процесс приводит mTORC1 в достаточно близкую близость к Rheb для того, чтобы Rheb либо (1) вызвал конформационное изменение mTORC1, что приводит к увеличению оборота субстрата, либо (2) индуцировал киназную активность mTORC1. Rags не содержат последовательностей, нацеленных на мембрану, и, как следствие, зависят от всего комплекса Ragulator-Rag для связывания с лизосомой, активирующего mTORC1. [16]
В то время как большинство аминокислот косвенно активируют mTORC1 у млекопитающих, лейцин обладает способностью напрямую активировать mTORC1 в клетках, в которых наблюдается дефицит аминокислот. Дрожжи содержат LRS (лейцилтРНК-синтетазу), которая является молекулой, способной взаимодействовать с Rags, напрямую активируя молекулу. [16]
Комплекс состоит из пяти субъединиц, [2] называемых LAMTOR 1-5 ( поздний эндосомальный/лизосомальный адаптер, mapk и активатор mtor 1 ), однако некоторые из них имеют альтернативные названия.