RUNX1T1

Ген, кодирующий белок у человека
RUNX1T1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRUNX1T1 , AML1T1, CBFA2T1, CDR, ETO, MTG8, ZMYND2, AML1-MTG8, t(8;21)(q22;q22), партнер по транслокации RUNX1 1, партнер по транскрипционному корепрессору RUNX1 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 133435; МГИ : 104793; Гомологен : 3801; Генные карты : RUNX1T1; OMA :RUNX1T1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

НМ_001111026
НМ_001111027
НМ_009822

RefSeq (белок)

НП_001104496
НП_001104497
НП_033952

Местоположение (UCSC)Хр 8: 91.95 – 92.1 МбХр 4: 13.74 – 13.89 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок CBFA2T1 — это белок , который у людей кодируется геном RUNX1T1 . [ 5] [6] [7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является предполагаемым фактором транскрипции цинкового пальца и онкопротеином. При остром миелоидном лейкозе , особенно в подтипе M2, транслокация t(8;21)(q22;q22) является одной из наиболее частых кариотипических аномалий. Транслокация производит химерный ген, состоящий из 5'-области гена RUNX1 , слитой с 3'-областью этого гена. Считается, что химерный белок ассоциируется с комплексом ядерного корепрессора/гистондеацетилазы, блокируя гемопоэтическую дифференциацию. Для этого гена было обнаружено несколько вариантов транскриптов, кодирующих множественные изоформы. [7]

Взаимодействия

Было показано, что RUNX1T1 взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000079102 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000006586 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Erickson P, Gao J, Chang KS, Look T, Whisenant E, Raimondi S, Lasher R, Trujillo J, Rowley J, Drabkin H (октябрь 1992 г.). «Идентификация точек разрыва при остром миелоидном лейкозе t(8;21) и изоляция транскрипта слияния AML1/ETO со сходством с геном сегментации Drosophila runt». Blood . 80 (7): 1825– 31. doi : 10.1182/blood.V80.7.1825.1825 . PMID  1391946.
  6. ^ Калаби Ф., Силли В. (декабрь 1998 г.). «CBFA2T1, ген, перестроенный при лейкемии человека, является членом семейства мультигенов». Геномика . 52 (3): 332–341 . doi :10.1006/geno.1998.5429. PMID  9790752.
  7. ^ ab "Ген Entrez: фактор транскрипции 1, связанный с RUNX1T1 runt; транслоцирован в 1 (связанный с циклином D)".
  8. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал. М (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  9. ^ ab Lindberg SR, Olsson A, Persson AM, Olsson I (декабрь 2003 г.). "Взаимодействия между гомологами ETO, связанными с лейкемией, ядерных репрессорных белков". Eur. J. Haematol . 71 (6): 439– 47. doi :10.1046/j.0902-4441.2003.00166.x. PMID  14703694. S2CID  23106882.
  10. ^ ab Hoogeveen AT, Россетти С, Стоянова В, Шонкерен Дж, Фенароли А, Скьяффонати Л, ван Унен Л, Сакки Н (сентябрь 2002 г.). «Транскрипционный корепрессор MTG16a содержит новую последовательность ядрышкового нацеливания, нарушенную при t (16; 21)-позитивных миелоидных злокачественных новообразованиях». Онкоген . 21 (43): 6703– 12. doi : 10.1038/sj.onc.1205882 . ПМИД  12242670.
  11. ^ Puccetti E, Obradovic D, Beissert T, Bianchini A, Washburn B, Chiaradonna F, Boehrer S, Hoelzer D, Ottmann OG, Pelicci PG, Nervi C, Ruthardt M (декабрь 2002 г.). «Продукты транслокации, ассоциированные с ОМЛ, блокируют дифференциацию, вызванную витамином D(3), путем секвестрации рецептора витамина D(3)». Cancer Res . 62 (23): 7050– 8. PMID  12460926.
  12. ^ McGhee L, Bryan J, Elliott L, Grimes HL, Kazanjian A, Davis JN, Meyers S (август 2003 г.). «Gfi-1 прикрепляется к ядерному матриксу, связывается с белками ETO (MTG8) и гистондеацетилазой и подавляет транскрипцию с помощью чувствительного к TSA механизма». J. Cell. Biochem . 89 (5): 1005– 18. doi :10.1002/jcb.10548. PMID  12874834. S2CID  25450754.
  13. ^ Amann JM, Nip J, Strom DK, Lutterbach B, Harada H, Lenny N, Downing JR, Meyers S, Hiebert SW (октябрь 2001 г.). "ETO, мишень t(8;21) при остром лейкозе, образует отдельные контакты с несколькими гистондеацетилазами и связывает mSin3A через свой домен олигомеризации". Mol. Cell. Biol . 21 (19): 6470– 83. doi : 10.1128 /mcb.21.19.6470-6483.2001. PMC 99794. PMID  11533236. 
  14. ^ ab Zhang J, Hug BA, Huang EY, Chen CW, Gelmetti V, Maccarana M, Minucci S, Pelicci PG, Lazar MA (январь 2001 г.). «Олигомеризация ETO обязательна для взаимодействия с корепрессором». Mol. Cell. Biol . 21 (1): 156– 63. doi : 10.1128 /MCB.21.1.156-163.2001. PMC 88789. PMID  11113190. 
  15. ^ Takahashi S, McConnell MJ, Harigae H, Kaku M, Sasaki T, Melnick AM, Licht JD (июнь 2004 г.). «Мутант внутренней тандемной дупликации Flt3 ингибирует функцию транскрипционных репрессоров, блокируя взаимодействия с SMRT». Blood . 103 (12): 4650– 8. doi : 10.1182/blood-2003-08-2759 . PMID  14982881.
  16. ^ Fukuyama T, Sueoka E, Sugio Y, Otsuka T, Niho Y, Akagi K, Kozu T (сентябрь 2001 г.). «Протоонкопротеин MTG8 взаимодействует с регуляторной субъединицей циклической АМФ-зависимой протеинкиназы II типа в лимфоцитах». Онкоген . 20 (43): 6225– 32. doi : 10.1038/sj.onc.1204794 . PMID  11593431.
  17. ^ Melnick AM, Westendorf JJ, Polinger A, Carlile GW, Arai S, Ball HJ, Lutterbach B, Hiebert SW, Licht JD (март 2000 г.). «Белок ETO, разрушенный при остром миелоидном лейкозе, связанном с t(8;21), является корепрессором для белка цинкового пальца промиелоцитарного лейкоза». Mol. Cell. Biol . 20 (6): 2075– 86. doi :10.1128/mcb.20.6.2075-2086.2000. PMC 110824. PMID  10688654 . 
  18. ^ Melnick A, Carlile GW, McConnell MJ, Polinger A, Hiebert SW, Licht JD (декабрь 2000 г.). «Белок слияния AML-1/ETO является доминантным отрицательным ингибитором транскрипционной репрессии белком цинкового пальца промиелоцитарного лейкоза». Blood . 96 (12): 3939– 47. doi :10.1182/blood.V96.12.3939. PMID  11090081.

Дальнейшее чтение

  • Феррара Ф., Дель Веккио Л. (2002). «Острый миелоидный лейкоз с t(8;21)/AML1/ETO: отдельная биологическая и клиническая сущность». Haematologica . 87 (3): 306–19 . PMID  11869944.
  • Nisson PE, Watkins PC, Sacchi N (1992). «Транскрипционно активный химерный ген, полученный в результате слияния гена AML1 и нового гена на хромосоме 8 в лейкозных клетках t(8;21)». Cancer Genet. Cytogenet . 63 (2): 81– 88. doi :10.1016/0165-4608(92)90384-K. PMID  1423235.
  • Era T, Asou N, Kunisada T, Yamasaki H, Asou H, Kamada N, Nishikawa S, Yamaguchi K, Takatsuki K (1995). «Идентификация двух транскриптов гена, слитого с AML1/ETO, в лейкемических клетках t(8;21) и экспрессия гена ETO дикого типа в гемопоэтических клетках». Гены Хромосомы Рак . 13 (1): 25– 33. doi :10.1002/gcc.2870130105. PMID  7541640. S2CID  41918020.
  • Tighe JE, Calabi F (1994). "Альтернативные, внерамочные транскрипты runt/MTG8 кодируются производной (8) хромосомой в t(8;21) острого миелоидного лейкоза M2". Blood . 84 (7): 2115– 21. doi : 10.1182/blood.V84.7.2115.2115 . PMID  7919324.
  • Эриксон ПФ, Робинсон М, Оуэнс Г, Драбкин ХА (1994). «Часть ETO транскрипта слияния острого миелоидного лейкоза t(8;21) кодирует высоко эволюционно консервативный, предполагаемый фактор транскрипции». Cancer Res . 54 (7): 1782– 6. PMID  8137293.
  • Miyoshi H, Kozu T, Shimizu K, Enomoto K, Maseki N, Kaneko Y, Kamada N, Ohki M (1993). «Транслокация t(8;21) при остром миелоидном лейкозе приводит к образованию транскрипта слияния AML1-MTG8». EMBO J . 12 (7): 2715– 21. doi :10.1002/j.1460-2075.1993.tb05933.x. PMC  413521 . PMID  8334990.
  • Kozu T, Miyoshi H, Shimizu K, Maseki N, Kaneko Y, Asou H, Kamada N, Ohki M (1993). "Соединения слияния AML1/MTG8(ETO) постоянны при остром миелоидном лейкозе t(8;21), обнаруженном с помощью полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией". Blood . 82 (4): 1270– 6. doi : 10.1182/blood.V82.4.1270.1270 . PMID  8353289.
  • Niwa-Kawakita M, Miyoshi H, Gotoh O, Matsushima Y, Nishimura M, Shisa H, Ohki M (1996). «Клонирование и картирование генов мышиного гомолога гена CBFA2T1, связанного с острым миелоидным лейкозом человека». Genomics . 29 (3): 755– 759. doi :10.1006/geno.1995.9941. PMID  8575770.
  • Erickson PF, Dessev G, Lasher RS, Philips G, Robinson M, Drabkin HA (1996). "ETO и фосфопротеины AML1 экспрессируются в гемопоэтических предшественниках CD34+: последствия для лейкемогенеза t(8;21) и мониторинг остаточного заболевания". Blood . 88 (5): 1813– 23. doi : 10.1182/blood.V88.5.1813.1813 . PMID  8781439.
  • Wolford JK, Bogardus C, Prochazka M (1998). «Полиморфизм в 3'-нетранслируемой области MTG8 связан с ожирением у мужчин индейцев пима». Biochem. Biophys. Res. Commun . 246 (3): 624– 626. doi :10.1006/bbrc.1998.8683. PMID  9618262.
  • Сакки Н., Таманини Ф., Виллемсен Р., Денис-Донини С., Кампильо С., Хогевен А.Т. (1998). «Субклеточная локализация онкопротеина MTG8 (CDR/ETO) в нервных клетках». Онкоген . 16 (20): 2609–2615 . doi : 10.1038/sj.onc.1201824 . ПМИД  9632137.
  • Wolford JK, Prochazka M (1998). «Структура и экспрессия гена MTG8/ETO человека». Gene . 212 (1): 103– 109. doi :10.1016/S0378-1119(98)00141-3. PMID  9661669.
  • Komori A, Sueoka E, Fujiki H, Ishii M, Kozu T (1999). "Ассоциация MTG8 (ETO/CDR), белка, связанного с лейкемией, с сериновыми/треониновыми протеинкиназами и белком теплового шока HSP90 в линиях гемопоэтических клеток человека". Jpn. J. Cancer Res . 90 (1): 60– 8. doi :10.1111/j.1349-7006.1999.tb00666.x. PMC  5925983. PMID  10076566 .
  • Морохоши Ф, Митани С, Мицухаси Н, Китабаяши И, Такахаши Э, Сузуки М, Мунаката Н, Оки М (2000). «Структура и характер экспрессии гена семейства MTG8/ETO человека, MTGR1». Джин . 241 (2): 287–295 . doi :10.1016/S0378-1119(99)00481-3. ПМИД  10675041.
  • Melnick AM, Westendorf JJ, Polinger A, Carlile GW, Arai S, Ball HJ, Lutterbach B, Hiebert SW, Licht JD (2000). «Белок ETO, разрушенный при остром миелоидном лейкозе, связанном с t(8;21), является корепрессором для белка цинкового пальца промиелоцитарного лейкоза». Mol. Cell. Biol . 20 (6): 2075– 2086. doi : 10.1128 /MCB.20.6.2075-2086.2000. PMC  110824. PMID  10688654.
  • Миямото Т., Вайсман ИЛ., Акаши К. (2000). «Нелейкозные стволовые клетки, экспрессирующие AML1/ETO, при остром миелоидном лейкозе с хромосомной транслокацией 8;21». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (13): 7521– 7526. Bibcode : 2000PNAS...97.7521M. doi : 10.1073/pnas.97.13.7521 . PMC  16578. PMID  10861016 .
  • Одака Y, Малли A, Эллиотт LT, Мейерс S (2000). «Ядерный импорт и субъядерная локализация протоонкопротеина ETO (MTG8)». Онкоген . 19 (32): 3584– 3597. doi : 10.1038/sj.onc.1203689 . PMID  10951564.
  • Wood JD, Nucifora FC, Duan K, Zhang C, Wang J, Kim Y, Schilling G, Sacchi N, Liu JM, Ross CA (2000). «Атрофин-1, продукт гена дентато-рубральной и паллидо-луисовой атрофии, взаимодействует с ETO/MTG8 в ядерном матриксе и подавляет транскрипцию». J. Cell Biol . 150 (5): 939– 948. doi :10.1083/jcb.150.5.939. PMC  2175251. PMID  10973986 .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RUNX1T1&oldid=1163314497"