40S рибосомальный белок S16

РПС16
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS16 , S16, рибосомальный белок S16
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603675; МГИ : 98118; гомологен : 794; Генные карты : RPS16; OMA :RPS16 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 19 (человек)
Конец	39,435,949 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	28,052,580 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верхний выражен в
	эпителий носоглотки; ; зародышевый эпителий; ; висцеральная плевра; ; париетальная плевра; ; поверхностная височная артерия; ; кожа бедра; ; сосок; ; кожа бедра; ; кардиа; ; перикард;
	Верхний выражен в
	желточный мешок; ; эпибласт; ; эмбрион; ; селезенка; ; тимус; ; морула; ; эмбрион; ; губа; ; поджелудочная железа; ; желудочковая зона;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	структурный компонент рибосомы; связывание белков; Связывание РНК;
Клеточный компонент	цитозоль; рибосома; мембрана; фокальная адгезия; малая рибосомная субъединица; внеклеточная экзосома; нуклеоплазма; внеклеточный матрикс; цитозольная малая рибосомальная субъединица;
Биологический процесс	созревание SSU-рРНК из трицистронного транскрипта рРНК (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК); вирусная транскрипция; SRP-зависимый котрансляционный белок, направляющий свое внимание на мембрану; трансляционная инициация; катаболический процесс ядерной транскрибированной мРНК, бессмысленно-опосредованный распад; биогенез малой субъединицы рибосомы; биосинтез белка; процессинг рРНК; клеточный ответ на фактор, ингибирующий лейкемию; регенерация печени;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6217
	20055
	ENSG00000105193
	ENSMUSG00000037563
	Р62249
	Р14131
	НМ_001020 ; НМ_001321111 ; НМ_001363860
	NM_013647
	NP_001011 ; NP_001308040 ; NP_001350789
	NP_038675
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

40S рибосомальный белок S16' - это белок , который у людей кодируется геном RPS16 . ^[5]^[6]^[7]

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и приблизительно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок , который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S9P. Он расположен в цитоплазме . Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует несколько процессированных псевдогенов этого гена, рассеянных по геному. ^[7]

Взаимодействия

Рибосомальный белок S16 — один из белков малой рибосомальной субъединицы. Он принадлежит к семейству рибосомальных белков, которое делится на три группы на основе сходства последовательностей:

* Эубактериальный S16.

* Хлоропласты водорослей и растений S16.

* Цианель S16.

* Митохондриальный S24 (cyt-21) Neurospora crassa.

Белки S16 содержат около 100 аминокислотных остатков. У Arabidopsis thaliana есть два паралога, RPS16-1 (хлоропласт) и RPS16-2 (направленный на хлоропласт и митохондрию)

[4].

Было показано, что RPS16 взаимодействует с CDC5L . ^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000105193 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000037563 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Batra SK, Metzgar RS, Hollingsworth MA (май 1991). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческого рибосомального белка S16». J Biol Chem . 266 (11): 6830– 3. doi : 10.1016/S0021-9258(20)89575-1 . PMID 2016298.
^ Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека». Genome Res . 8 (5): 509–23 . doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194.
^ ab "Ген Энтреза: рибосомальный белок S16 RPS16".
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса человеческого CDC5L и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии». EMBO J . 19 (23). АНГЛИЯ: 6569– 81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846 . PMID 11101529.

Дальнейшее чтение

Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Biochem. Cell Biol . 73 ( 11– 12): 933– 47. doi :10.1139/o95-101. PMID 8722009.
Като С, Секин С, О С, и др. (1995). «Создание банка человеческой полноразмерной ДНК». Gene . 150 (2): 243– 50. doi :10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID 7821789.
Владимиров СН, Иванов АВ, Карпова ГГ и др. (1996). "Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования и масс-спектрометрии". Eur. J. Biochem . 239 (1): 144– 9. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID 8706699.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
Lei XH, Shen X, Xu XQ, Bernstein HS (2001). «Человеческий Cdc5, регулятор митотического входа, может действовать как сайт-специфический белок связывания ДНК». J. Cell Sci . 113 Pt 24 (24): 4523– 31. doi :10.1242/jcs.113.24.4523. PMID 11082045.
Ajuh P, Kuster B, Panov K, et al. (2001). «Функциональный анализ комплекса человеческого CDC5L и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии». EMBO J . 19 (23): 6569– 81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. PMC 305846 . PMID 11101529.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. Bibcode : 2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033.
Yoshihama M, Uechi T, Asakawa S и др. (2002). «Гены рибосомальных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов». Genome Res . 12 (3): 379–90 . doi :10.1101/gr.214202. PMC 155282. PMID 11875025 .
Karan D, Kelly DL, Rizzino A и др. (2002). «Профиль экспрессии дифференциально регулируемых генов во время прогрессирования андроген-независимого роста в клетках рака простаты человека». Carcinogenesis . 23 (6): 967– 75. doi : 10.1093/carcin/23.6.967 . PMID 12082018.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала человеческого TNF-альфа/NF-каппа B». Nat. Cell Biol . 6 (2): 97– 105. doi :10.1038/ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Yu Y, Ji H, Doudna JA, Leary JA (2005). "Масс-спектрометрический анализ человеческой 40S рибосомальной субъединицы: нативные и связанные с HCV IRES комплексы". Protein Sci . 14 (6): 1438– 46. doi :10.1110/ps.041293005. PMC 2253395. PMID 15883184 .
Tu LC, Yan X, Hood L, Lin B (2007). «Протеомный анализ интерактома нижестоящего регулируемого гена 1 N-myc и его взаимодействия с программой ответа на андрогены в клетках рака простаты». Mol. Cell. Proteomics . 6 (4): 575–88 . doi : 10.1074/mcp.M600249-MCP200 . PMID 17220478.
Ewing RM, Chu P, Elisma F и др. (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948 . PMID 17353931.

Эта статья о белках — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000105193 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000037563 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2016298-5] Batra SK, Metzgar RS, Hollingsworth MA (май 1991). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческого рибосомального белка S16». J Biol Chem . 266 (11): 6830– 3. doi : 10.1016/S0021-9258(20)89575-1 . PMID 2016298.

[pmid9582194-6] Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека». Genome Res . 8 (5): 509–23 . doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194.

[entrez-7] "Ген Энтреза: рибосомальный белок S16 RPS16".

[pmid11101529-8] Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса человеческого CDC5L и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии». EMBO J . 19 (23). АНГЛИЯ: 6569– 81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846 . PMID 11101529.