RFC1
Белок
RFC1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRFC1 , RFC, субъединица 1 фактора репликации C, A1, PO-GA, RECC1, MHCBFB, RFC140, CANVAS
Внешние идентификаторыОМИМ : 102579; МГИ : 97891; Гомологен : 2187; GeneCards : RFC1; OMA :RFC1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

5981

19687

Ансамбль

ENSG00000035928

ENSMUSG00000029191

UniProt

Р35251

Р35601

RefSeq (мРНК)

NM_001204747
NM_002913
NM_001363495
NM_001363496

НМ_011258
НМ_001347357
НМ_001347358

RefSeq (белок)

НП_001191676
НП_002904
НП_001350424
НП_001350425

НП_001334286
НП_001334287
НП_035388

Местоположение (UCSC)Хр 4: 39.29 – 39.37 МбХр 5: 65.42 – 65.49 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Субъединица 1 фактора репликации C — это белок , который у людей кодируется геном RFC1 . [ 5] [6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является большой субъединицей фактора репликации C , который является пятисубъединичным вспомогательным белком ДНК-полимеразы . Фактор репликации C является ДНК-зависимой АТФазой, которая необходима для репликации и репарации ДНК эукариот. Белок действует как активатор ДНК-полимераз, связывается с 3'-концом праймеров и способствует скоординированному синтезу обеих цепей. Он также может играть роль в стабильности теломер. [ 6]

Взаимодействия

Было показано, что RFC1 взаимодействует с:

Клиническая значимость

Биаллельные интронные повторные расширения (серия повторяющихся нуклеотидных последовательностей) в гене субъединицы 1 фактора репликации C (RFC1) вызывают мозжечковую атаксию, нейропатию и синдром вестибулярной арефлексии (CANVAS) . [17] В поли(A)-хвосте элемента AluSx3 в RFC1 имеется одиннадцать повторов пентануклеотида «AAAAG». Повторное расширение и полиморфная конфигурация наблюдаются у части популяции, с увеличенным числом повторов, связанных с альтернативными пентануклеотидами «AAAGG», «AAGGG» и «ACAGG». [18] В частности, биаллельное повторное расширение «AAGGG» и «ACAGG» непропорционально наблюдалось у пациентов с CANVAS. Расширение двуаллельных повторов «AAGGG» также сообщается в большом количестве спорадических случаев поздней атаксии [17] , изолированной сенсорной нейропатии [19] [20] и, реже, изолированной мозжечковой атаксии. [21] Из-за диагностического совпадения с CANVAS исследователи также исследовали наличие расширений RFC1 при патологически подтвержденной множественной системной атрофии (MSA), но обнаружили аналогичную частоту изменений (0,7%) со здоровой популяцией, что позволяет предположить, что RFC1 не играет роли в этом заболевании. [22]

Расширения мутантных биаллельных интронных повторов не влияют на экспрессию RFC1 в периферической и мозговой ткани пациента, что свидетельствует об отсутствии явной потери функции этого гена. [17]

У пациентов с патогенной экспансией RFC1 сенсорная нейропатия, по-видимому, является преобладающей особенностью, и у пациентов также могут наблюдаться такие симптомы, как дисфункция мозжечка, вестибулярное поражение и сухой спазматический кашель, поэтому у пациентов с этими симптомами рекомендуется генетическое тестирование. [23]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000035928 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000029191 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Luckow B, Bunz F, Stillman B, Lichter P, Schütz G (март 1994). «Клонирование, экспрессия и хромосомная локализация 140-килодальтонной субъединицы фактора репликации C у мышей и людей». Молекулярная и клеточная биология . 14 (3): 1626– 34. doi :10.1128/mcb.14.3.1626. PMC 358521. PMID  8114700 . 
  6. ^ ab "Ген Entrez: фактор репликации C RFC1 (активатор 1) 1, 145 кДа".
  7. ^ ab Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T и др. (сентябрь 2002 г.). «Бромодоменный белок млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология . 22 (18): 6509– 20. doi :10.1128/mcb.22.18.6509-6520.2002. PMC 135621. PMID  12192049 . 
  8. ^ Anderson LA, Perkins ND (август 2002). «Большая субъединица фактора репликации C взаимодействует с гистондеацетилазой, HDAC1». Журнал биологической химии . 277 (33): 29550– 4. doi : 10.1074/jbc.M200513200 . PMID  12045192.
  9. ^ Fotedar R, Mossi R, Fitzgerald P, Rousselle T, Maga G, Brickner H, et al. (Август 1996). "Консервативный домен большой субъединицы фактора репликации C связывает PCNA и действует как доминантный отрицательный ингибитор репликации ДНК в клетках млекопитающих". The EMBO Journal . 15 (16): 4423– 33. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00815.x. PMC 452166 . PMID  8861969. 
  10. ^ Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (январь 1997). «Фактор репликации C взаимодействует с C-терминальной стороной ядерного антигена пролиферирующей клетки». Журнал биологической химии . 272 ​​(3): 1769–76 . doi : 10.1074/jbc.272.3.1769 . PMID  8999859.
  11. ^ van der Kuip H, Carius B, Haque SJ, Williams BR, Huber C, Fischer T (апрель 1999). «ДНК-связывающая субъединица p140 фактора репликации C активируется в циклических клетках и ассоциируется с регуляторными белками клеточного цикла фазы G1». Журнал молекулярной медицины . 77 (4): 386–92 . doi :10.1007/s001090050365. PMID  10353443. S2CID  22183443.
  12. ^ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (октябрь 2002 г.). «Протеомный подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация комплекса CHL12/RFCs2-5 человека как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии . 277 (43): 40362– 7. doi : 10.1074/jbc.M206194200 . PMID  12171929.
  13. ^ Андерсон LA, Перкинс ND (январь 2003). «Регулирование функции RelA (p65) большой субъединицей фактора репликации C». Молекулярная и клеточная биология . 23 (2): 721– 32. doi :10.1128/mcb.23.2.721-732.2003. PMC 151544. PMID  12509469 . 
  14. ^ Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация подкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой АТФазной активностью». Журнал биологической химии . 273 (10): 5979– 87. doi : 10.1074/jbc.273.10.5979 . PMID  9488738.
  15. ^ Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (июнь 1996 г.). "In vitro восстановление человеческого фактора репликации C из его пяти субъединиц". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (13): 6521– 6. Bibcode : 1996PNAS...93.6521U. doi : 10.1073/pnas.93.13.6521 . PMC 39056. PMID  8692848 . 
  16. ^ Томида Дж., Масуда Й., Хироаки Х., Ишикава Т., Сонг И., Цуримото Т. и др. (апрель 2008 г.). «Убиквитилирование субъединицы RFC2 комплекса фактора репликации C, вызванное повреждением ДНК». Журнал биологической химии . 283 (14): 9071– 9. doi : 10.1074/jbc.M709835200 . PMC 2431014. PMID  18245774 . 
  17. ^ abc Cortese A, Simone R, Sullivan R, Vandrovcova J, Tariq H, Yau WY и др. (май 2019 г.). "Исправление автора: двуаллельное расширение интронного повтора в RFC1 является распространенной причиной поздней атаксии". Nature Genetics . 51 (5): 920. doi :10.1038/s41588-019-0422-y. PMC 6730635 . PMID  31028356. 
  18. ^ Scriba CK, Beecroft SJ, Clayton JS, Cortese A, Sullivan R, Yau WY, Dominik N, Rodrigues M, Walker E, Dyer Z, Wu TY, Davis MR, Chandler DC, Weisburd B, Houlden H, Reilly MM, Laing NG, Lamont PJ, Roxburgh RH, Ravenscroft G (октябрь 2020 г.). «Новый мотив повтора RFC1 (ACAGG) в двух азиатско-тихоокеанских семействах CANVAS». Brain . 143 (10): 2904– 10. doi :10.1093/brain/awaa263. PMC 7780484 . PMID  33103729. 
  19. ^ Тальяпьетра М, Карделлини Д, Феррарини М, Тести С, Феррари С, Монако С, Кавалларо Т, Фабрици ГМ (апрель 2021 г.). «Расширение повторов RFC1 AAGGG, маскирующееся под хроническую идиопатическую аксональную полинейропатию». Журнал неврологии . 268 (11): 4280–4290 . doi : 10.1007/s00415-021-10552-3 . ПМЦ 8505379 . ПМИД  33884451. 
  20. ^ Курро Р, Сальваладжо А, Тоцца С, Джемелли С, Доминик Н, Галасси Дефори В, Магринелли Ф, Кастеллани Ф, Вегецци Е, Бузинаро П, Каллегари I, Пикеккьо А, Козентино Г, Альфонси Е, Маркиони Е, Колнаги С, Гана С, Валенте ЭМ, Тассорелли С, Эфтимиу С, Факкини С., Карр А., Лаура М., Россор А.М., Манджи Х., Ланн М.П., ​​Пегораро Э., Санторо Л., Грандис М., Беллоне Е., Бошан Н.Дж., Хадживассилиу М., Каски Д., Бронштейн А.М., Хоулден Х., Рейли М.М., Мандич П. , Шеноне А, Манганелли Ф, Бриани С (июнь 2021 г.). «Расширения RFC1 являются частой причиной идиопатической сенсорной нейропатии». Мозг . 144 (5): 2904– 10. doi : 10.1093/brain/awab072 . ISSN  0006-8950. PMC 8262986 . PMID  33969391. 
  21. ^ Traschütz A, Cortese A, Reich S, Dominik N, Faber J, Jacobi H и др. (Исследование группы R) (март 2021 г.). «Естественное течение, фенотипический спектр и отличительные признаки мультисистемного заболевания RFC1». Neurology . 96 (9): e1369 – e1382 . doi : 10.1212/WNL.0000000000011528 . PMC 8055326 . PMID  33495376.  
  22. ^ Салливан Р., Яу В.И., Челбан В., Росси С., О'Коннор Э., Вуд Н.В. и др. (апрель 2020 г.). « Расширения интронных повторов RFC1 отсутствуют при патологически подтвержденной мультисистемной атрофии». Расстройства движения . 35 (7): 1277– 1279. doi : 10.1002/mds.28074. PMID  32333430. S2CID  216129457.
  23. ^ Cortese A, Tozza S, Yau WY, Rossi S, Beecroft SJ, Jaunmuktane Z и др. (февраль 2020 г.). «Мозжечковая атаксия, нейропатия, синдром вестибулярной арефлексии из-за расширения повторов RFC1». Brain . 143 (2): 480– 490. doi :10.1093/brain/awz418. PMC 7009469 . PMID  32040566. 

Дальнейшее чтение

  • Lu Y, Riegel AT (август 1994). "Человеческий ДНК-связывающий белок, PO-GA, гомологичен большой субъединице мышиного фактора репликации C: регуляция путем альтернативной 3'-обработки мРНК". Gene . 145 (2): 261– 5. doi :10.1016/0378-1119(94)90017-5. PMID  7914507.
  • Bunz F, Kobayashi R, Stillman B (декабрь 1993 г.). "cDNAs, кодирующие большую субъединицу человеческого фактора репликации C". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (23): 11014– 8. Bibcode :1993PNAS...9011014B. doi : 10.1073/pnas.90.23.11014 . PMC  47912 . PMID  8248204.
  • Lu Y, Zeft AS, Riegel AT (июнь 1993 г.). «Клонирование и экспрессия нового белка, связывающего ДНК человека, PO-GA». Biochemical and Biophysical Research Communications . 193 (2): 779– 86. doi : 10.1006/bbrc.1993.1693 . PMID  8512577.
  • Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (июнь 1996 г.). "In vitro восстановление человеческого фактора репликации C из его пяти субъединиц". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (13): 6521– 6. Bibcode : 1996PNAS...93.6521U. doi : 10.1073/pnas.93.13.6521 . PMC  39056. PMID  8692848 .
  • Fotedar R, Mossi R, Fitzgerald P, Rousselle T, Maga G, Brickner H и др. (август 1996 г.). «Консервативный домен большой субъединицы фактора репликации C связывает PCNA и действует как доминантный отрицательный ингибитор репликации ДНК в клетках млекопитающих». The EMBO Journal . 15 (16): 4423– 33. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00815.x. PMC  452166 . PMID  8861969.
  • Uchiumi F, Ohta T, Tanuma S (декабрь 1996 г.). «Фактор репликации C распознает 5'-фосфатные концы теломер». Biochemical and Biophysical Research Communications . 229 (1): 310– 5. doi :10.1006/bbrc.1996.1798. PMID  8954124.
  • Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (январь 1997 г.). «Фактор репликации C взаимодействует с C-концевой стороной ядерного антигена пролиферирующей клетки». Журнал биологической химии . 272 ​​(3): 1769–76 . doi : 10.1074/jbc.272.3.1769 . PMID  8999859.
  • Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (апрель 1997 г.). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с голоферментом РНК-полимеразы II». Молекулярная и клеточная биология . 17 (4): 1817– 23. doi :10.1128/mcb.17.4.1817. PMC  232028. PMID  9121429 .
  • Ubeda M, Habener JF (август 1997 г.). «Большая субъединица комплекса репликации ДНК C (DSEB/RF-C140) расщепляется и инактивируется каспазой-3 (CPP32/YAMA) во время апоптоза, вызванного Fas». Журнал биологической химии . 272 ​​(31): 19562– 8. doi : 10.1074/jbc.272.31.19562 . PMID  9235961.
  • Rhéaume E, Cohen LY, Uhlmann F, Lazure C, Alam A, Hurwitz J, et al. (Ноябрь 1997 г.). «Большая субъединица фактора репликации C является субстратом для каспазы-3 in vitro и расщепляется протеазой, подобной каспазе-3, во время апоптоза, опосредованного Fas». The EMBO Journal . 16 (21): 6346– 54. doi : 10.1093 /emboj/16.21.6346. PMC  1170241. PMID  9351817.
  • Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой АТФазной активностью». Журнал биологической химии . 273 (10): 5979– 87. doi : 10.1074/jbc.273.10.5979 . PMID  9488738.
  • Coll JM, Hickey RJ, Cronkey EA, Jiang HY, Schnaper L, Lee MY и др. (1998). «Картирование специфических белок-белковых взаимодействий в основном компоненте синтезосомы ДНК молочной железы». Oncology Research . 9 ( 11–12 ): 629–39 . PMID  9563011.
  • Allen BL, Uhlmann F, Gaur LK, Mulder BA, Posey KL, Jones LB, Hardin SH (сентябрь 1998 г.). «Свойства распознавания ДНК N-концевого домена связывания ДНК в большой субъединице фактора репликации C». Nucleic Acids Research . 26 (17): 3877– 82. doi : 10.1093 /nar/26.17.3877. PMC  147807. PMID  9705493.
  • van der Kuip H, Carius B, Haque SJ, Williams BR, Huber C, Fischer T (апрель 1999). «ДНК-связывающая субъединица p140 фактора репликации C активируется в циклических клетках и ассоциируется с регуляторными белками клеточного цикла фазы G1». Журнал молекулярной медицины . 77 (4): 386–92 . doi :10.1007/s001090050365. PMID  10353443. S2CID  22183443.
  • Wang Y, Cortez D, Yazdi P, Neff N, Elledge SJ, Qin J (апрель 2000 г.). «BASC, суперкомплекс белков, ассоциированных с BRCA1, участвующих в распознавании и восстановлении аберрантных структур ДНК». Genes & Development . 14 (8): 927– 39. doi :10.1101/gad.14.8.927. PMC  316544 . PMID  10783165.
  • Yazdi PT, Wang Y, Zhao S, Patel N, Lee EY , Qin J (март 2002 г.). «SMC1 является нижестоящим эффектором в ветви ATM/NBS1 контрольной точки S-фазы человека». Genes & Development . 16 (5): 571– 82. doi :10.1101/gad.970702. PMC  155356 . PMID  11877377.
  • Anderson LA, Perkins ND (август 2002). «Большая субъединица фактора репликации C взаимодействует с гистондеацетилазой, HDAC1». Журнал биологической химии . 277 (33): 29550– 4. doi : 10.1074/jbc.M200513200 . PMID  12045192.
  • Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (октябрь 2002 г.). «Протеомный подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация комплекса CHL12/RFCs2-5 человека как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии . 277 (43): 40362– 7. doi : 10.1074/jbc.M206194200 . PMID  12171929.
  • Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T и др. (сентябрь 2002 г.). «Бромодоменный белок млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология . 22 (18): 6509– 20. doi :10.1128/MCB.22.18.6509-6520.2002. PMC  135621. PMID  12192049 .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RFC1&oldid=1174664940"