RBMX
Ген, кодирующий белок у человека
RBMX
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRBMX , HNRNPG, HNRPG, RBMXP1, RBMXRT, RNMX, hnRNP-G, MRXS11, белок мотива связывания РНК, сцепленный с Х-хромосомой, белок мотива связывания РНК, сцепленный с Х-хромосомой
Внешние идентификаторыОМИМ : 300199; МГИ : 1343044; гомологен : 20494; GeneCards : RBMX; OMA :RBMX — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

27316

19655

Ансамбль

ENSG00000147274

ENSMUSG00000031134

UniProt

Р38159

Q9WV02

РефСек (мРНК)

NM_001164803
NM_002139

NM_001166623
NM_011252

RefSeq (белок)

NP_001158275
NP_002130

NP_001160095
NP_035382

Местоположение (UCSC)Хр X: 136.85 – 136.88 МбХр X: 56.43 – 56.44 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин G — это белок , который у людей кодируется геном RBMX . [ 5] [6] [7]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству генов RBMY, которое включает в себя кандидаты на гены сперматогенеза Y-хромосомы. Этот ген, активный гомолог X-хромосомы гена RBMY Y-хромосомы, широко экспрессируется, тогда как ген RBMY развил специфичную для самцов функцию в сперматогенезе. Псевдогены этого гена, обнаруженные на хромосомах 1, 4, 9, 11 и 6, вероятно, были получены путем ретротранспозиции из исходного гена. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы, но их биологическая природа не была определена. [7]

Взаимодействия

Было показано, что RBMX взаимодействует с SFRS10 [8] и CDC5L . [9]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000147274 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031134 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Delbridge ML, Lingenfelter PA, Disteche CM, Graves JA (июль 1999). «Кандидатный ген сперматогенеза RBMY имеет гомолога на человеческой X-хромосоме». Nature Genetics . 22 (3): 223– 4. doi :10.1038/10279. PMID  10391206. S2CID  43301464.
  6. ^ Mazeyrat S, Saut N, Mattei MG, Mitchell MJ (июль 1999). «RBMY развился на Y-хромосоме из повсеместно транскрибируемого гена, идентичного XY». Nature Genetics . 22 (3): 224– 6. doi :10.1038/10282. PMID  10391207. S2CID  13071214.
  7. ^ ab "Ген Entrez: белок мотива связывания РНК RBMX, X-сцепленный".
  8. ^ Хофманн Y, Вирт B (август 2002 г.). "hnRNP-G способствует включению экзона 7 в двигательный нейрон выживания (SMN) посредством прямого взаимодействия с Htra2-beta1". Молекулярная генетика человека . 11 (17): 2037– 49. doi : 10.1093/hmg/11.17.2037 . PMID  12165565.
  9. ^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса человеческого CDC5L и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии». The EMBO Journal . 19 (23): 6569– 81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. PMC 305846. PMID  11101529 . 

Дальнейшее чтение

  • Le Coniat M, Soulard M, Della Valle V, Larsen CJ, Berger R (март 1992). «Локализация человеческого гена, кодирующего гетерогенный ядерный РНК рибонуклеопротеин G (hnRNP-G), на хромосоме 6p12». Генетика человека . 88 (5): 593– 5. doi :10.1007/bf00219352. PMID  1551662. S2CID  23980780.
  • Soulard M, Della Valle V, Siomi MC, Piñol-Roma S, Codogno P, Bauvy C, Bellini M, Lacroix JC, Monod G, Dreyfuss G (сентябрь 1993 г.). "hnRNP G: последовательность и характеристика гликозилированного РНК-связывающего белка". Nucleic Acids Research . 21 (18): 4210– 7. doi :10.1093/nar/21.18.4210. PMC  310052. PMID  7692398 .
  • Хиллиер Л.Д., Леннон Дж., Беккер М., Бональдо М.Ф., Кьяпелли Б., Чиссо С., Дитрих Н., Дюбук Т., Фавелло А., Гиш В., Хокинс М., Хультман М., Кукаба Т., Лейси М., Ле М., Ле Н., Мардис Э. , Мур Б, Моррис М, Парсонс Дж, Прейндж С, Рифкин Л, Ролфинг Т, Шелленберг К, Бенто Соареш М, Тан Ф., Тьерри-Мэг Дж., Треваскис Э., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра М. (сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 меток экспрессируемых последовательностей человека». Геномные исследования . 6 (9): 807–28 . doi : 10.1101/gr.6.9.807 . ПМИД  8889549.
  • Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J, Cooke HJ, Artzt K, Eperon IC (июнь 1999 г.). "T-STAR/ETOILE: новый родственник SAM68, который взаимодействует с РНК-связывающим белком, участвующим в сперматогенезе". Human Molecular Genetics . 8 (6): 959– 69. doi : 10.1093/hmg/8.6.959 . PMID  10332027.
  • Venables JP, Elliott DJ, Makarova OV, Makarov EM, Cooke HJ, Eperon IC (март 2000 г.). «RBMY, вероятный фактор сперматогенеза человека, и другие белки hnRNP G взаимодействуют с Tra2beta и влияют на сплайсинг». Human Molecular Genetics . 9 (5): 685–94 . doi : 10.1093/hmg/9.5.685 . PMID  10749975.
  • Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса человеческого CDC5L и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии». The EMBO Journal . 19 (23): 6569– 81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. PMC  305846. PMID  11101529 .
  • Lingenfelter PA, Delbridge ML, Thomas S, Hoekstra HE, Mitchell MJ, Graves JA, Disteche CM (июль 2001 г.). «Экспрессия и сохранение обработанных копий гена RBMX». Mammalian Genome . 12 (7): 538– 45. CiteSeerX  10.1.1.721.2504 . doi :10.1007/s00335001-0003-z. PMID  11420617. S2CID  7201204.
  • Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа». РНК . 8 (4): 426– 39. doi :10.1017/S1355838202021088. PMC  1370266 . PMID  11991638.
  • Hofmann Y, Wirth B (август 2002 г.). "hnRNP-G способствует включению экзона 7 в двигательный нейрон выживания (SMN) посредством прямого взаимодействия с Htra2-beta1". Human Molecular Genetics . 11 (17): 2037– 49. doi : 10.1093/hmg/11.17.2037 . PMID  12165565.
  • Angenstein F, Evans AM, Settlage RE, Moran ST, Ling SC, Klintsova AY, Shabanowitz J, Hunt DF, Greenough WT (октябрь 2002 г.). «Рецептор активированной С-киназы является частью комплексов мессенджерных рибонуклеопротеинов, связанных с полиА-мРНК в нейронах». The Journal of Neuroscience . 22 (20): 8827– 37. doi : 10.1523/JNEUROSCI.22-20-08827.2002 . PMC  6757688 . PMID  12388589.
  • Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (ноябрь 2003 г.). «Регулирование альтернативного сплайсинга SRrp86 и его взаимодействующими белками». Молекулярная и клеточная биология . 23 (21): 7437– 47. doi :10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC  207616. PMID  14559993.
  • Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (май 2004 г.). "Надежное фосфопротеомное профилирование участков фосфорилирования тирозина из человеческих Т-клеток с использованием иммобилизованной металл-аффинной хроматографии и тандемной масс-спектрометрии" (PDF) . Аналитическая химия . 76 (10): 2763– 72. doi :10.1021/ac035352d. PMID  15144186.
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (август 2004 г.). «Масштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
  • Онг С.Е., Миттлер Г., Манн М. (ноябрь 2004 г.). «Идентификация и количественная оценка участков метилирования in vivo с помощью тяжелого метилового SILAC». Nature Methods . 1 (2): 119–26 . doi :10.1038/nmeth715. PMID  15782174. S2CID  6654604.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RBMX&oldid=1222978319"