RANBP1
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
RANBP1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRANBP1 , HTF9A, RAN-связывающий белок 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 601180; МГИ : 96269; Гомологен : 21600; GeneCards : RANBP1; OMA :RANBP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

5902

19385

Ансамбль

ENSG00000099901

ENSMUSG00000005732

UniProt

Р43487

Р34022

РефСек (мРНК)

NM_001278639
NM_001278640
NM_001278641
NM_002882

NM_011239

RefSeq (белок)

NP_001265568
NP_001265569
NP_001265570
NP_002873

NP_035369

Местоположение (UCSC)Хр 22: 20.12 – 20.13 МбХр 16: 18.06 – 18.07 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Ran-специфический связывающий белок 1 — это фермент , который у людей кодируется геном RANBP1 . [ 5] [6] [7]

Ran /TC4-связывающий белок, RanBP1, специфически взаимодействует с GTP -заряженным RAN. RANBP1 кодирует 23-кДа белок, который связывается с RAN в комплексе с GTP, но не с GDP . RANBP1 не активирует GTPase активность RAN, но заметно увеличивает гидролиз GTP активирующим RanGTPase белком ( RANGAP1 ). КДНК RANBP1 кодирует 201-аминокислотный белок, который на 92% похож на его мышиный гомолог. Как в клетках млекопитающих, так и в дрожжах, RANBP1 действует как отрицательный регулятор RCC1 , ингибируя стимулированное RCC1 высвобождение гуанинового нуклеотида из RAN. [7]

Взаимодействия

Было показано, что RANBP1 взаимодействует с XPO1 , [8] [9] KPNB1 [9] [10] и Ran . [9] [11] [12]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000099901 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000005732 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Hayashi N, Yokoyama N, Seki T, Azuma Y, Ohba T, Nishimoto T (август 1995 г.). «RanBP1, ядерный белок G типа Ras, связывающийся с Ran/TC4, ингибирует RCC1 через Ran/TC4». Mol Gen Genet . 247 (6): 661– 9. doi :10.1007/BF00290397. PMID  7616957. S2CID  24266692.
  6. ^ Kehlenbach RH, Dickmanns A, Kehlenbach A, Guan T, Gerace L (июль 1999 г.). «Роль RanBP1 в высвобождении CRM1 из комплекса ядерной поры на конечном этапе ядерного экспорта». J Cell Biol . 145 (4): 645–57 . doi :10.1083/jcb.145.4.645. PMC 2133185. PMID  10330396 . 
  7. ^ ab "Ген Entrez: RANBP1 RAN-связывающий белок 1".
  8. ^ Singh, BB; Patel HH; Roepman R; Schick D; Ferreira PA (декабрь 1999 г.). «Кластерный домен цинкового пальца RanBP2 является специфическим местом стыковки для ядерного экспортного фактора, экспортина-1». J. Biol. Chem . 274 (52): 37370– 8. doi : 10.1074/jbc.274.52.37370 . hdl : 2066/120791 . ISSN  0021-9258. PMID  10601307.
  9. ^ abc Plafker, K; Macara IG (май 2000). "Facilitated Nucleocytoplasmic Shuttling of the Ran Binding Protein RanBP1". Mol. Cell. Biol . 20 (10): 3510– 21. doi :10.1128/MCB.20.10.3510-3521.2000. ISSN  0270-7306. PMC 85643. PMID 10779340  . 
  10. ^ Ясин, НР; Блобель Г (сентябрь 1999 г.). «Гидролиз ГТФ связывает инициацию и завершение ядерного импорта на нуклеопорине nup358». J. Biol. Chem . 274 (37): 26493– 502. doi : 10.1074/jbc.274.37.26493 . ISSN  0021-9258. PMID  10473610.
  11. ^ Ren, M; Villamarin A; Shih A; Coutavas E; Moore MS; LoCurcio M; Clarke V; Oppenheim JD; D'Eustachio P; Rush MG (апрель 1995 г.). «Отдельные домены Ran GTPase взаимодействуют с различными факторами для регулирования импорта ядерного белка и процессинга РНК». Mol. Cell. Biol . 15 (4): 2117– 24. doi :10.1128/MCB.15.4.2117. ISSN  0270-7306. PMC 230439. PMID 7891706  . 
  12. ^ Стеггерда, SM; Паскаль BM (июль 2000 г.). «Белок Mog1 млекопитающих является фактором высвобождения гуанинового нуклеотида для Ran». J. Biol. Chem . 275 (30): 23175– 80. doi : 10.1074/jbc.C000252200 . ISSN  0021-9258. PMID  10811801.

Дальнейшее чтение

  • Bischoff FR, Krebber H, Smirnova E, et al. (1995). "Коактивация RanGTPase и ингибирование диссоциации GTP связывающим белком Ran-GTP RanBP1". EMBO J . 14 (4): 705– 15. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb07049.x. PMC  398135 . PMID  7882974.
  • Ren M, Villamarin A, Shih A и др. (1995). «Отдельные домены Ran GTPase взаимодействуют с различными факторами для регулирования импорта ядерного белка и процессинга РНК». Mol. Cell. Biol . 15 (4): 2117– 24. doi :10.1128/MCB.15.4.2117. PMC  230439. PMID  7891706 .
  • Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Coutavas E, Ren M, Oppenheim JD и др. (1994). «Характеристика белков, взаимодействующих с регуляторным белком клеточного цикла Ran/TC4». Nature . 366 (6455): 585– 7. Bibcode :1993Natur.366..585C. doi :10.1038/366585a0. PMID  8255297. S2CID  4302198.
  • Золотухин АС, Фельбер БК (1997). "Мутации в сигнале ядерного экспорта человеческого ran-связывающего белка RanBP1 блокируют Rev-опосредованную посттранскрипционную регуляцию вируса иммунодефицита человека типа 1". J. Biol. Chem . 272 ​​(17): 11356– 60. doi : 10.1074/jbc.272.17.11356 . PMID  9111043.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Plafker K, Macara IG (2000). "Облегченный нуклеоцитоплазматический челнок связывающего белка Ran RanBP1". Mol. Cell. Biol . 20 (10): 3510– 21. doi :10.1128/MCB.20.10.3510-3521.2000. PMC  85643. PMID  10779340 .
  • Steggerda SM, Paschal BM (2000). «Белок Mog1 млекопитающих является фактором высвобождения гуанинового нуклеотида для Ran». J. Biol. Chem . 275 (30): 23175– 80. doi : 10.1074/jbc.C000252200 . PMID  10811801.
  • Maynard TM, Haskell GT, Bhasin N и др. (2002). "RanBP1, ген-кандидат велокардиофациального/синдрома ДиДжорджи, экспрессируется в местах мезенхимальной/эпителиальной индукции". Mech. Dev . 111 ( 1– 2): 177– 80. doi : 10.1016/S0925-4773(01)00616-5 . PMID  11804793.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ди Фиоре Б., Чичарелло М., Мангиакасале Р. и др. (2004). «RanBP1 млекопитающих регулирует слипание центросом во время митоза». Дж. Клеточная наука . 116 (Pt 16): 3399–411 . doi : 10.1242/jcs.00624 . ПМИД  12840069.
  • Seewald MJ, Kraemer A, Farkasovsky M и др. (2003). «Биохимическая характеристика системы Ran-RanBP1-RanGAP: требуются ли белки RanBP и кислый хвост RanGAP для реакции Ran-RanGAP GTPase?». Mol. Cell. Biol . 23 (22): 8124– 36. doi :10.1128/MCB.23.22.8124-8136.2003. PMC  262373. PMID  14585972 .
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Bohlson SS, Zhang M, Ortiz CE, Tenner AJ (2005). «CD93 взаимодействует с адаптерным белком GIPC, содержащим домен PDZ: влияние на модуляцию фагоцитоза». J. Leukoc. Biol . 77 (1): 80– 9. doi :10.1189/jlb.0504305. PMID  15459234. S2CID  3219168.
  • Collins JE, Wright CL, Edwards CA и др. (2005). «Подход к клонированию человеческого ORF на основе аннотации генома». Genome Biol . 5 (10): R84. doi : 10.1186 /gb-2004-5-10-r84 . PMC  545604. PMID  15461802.
  • Bruneel A, Labas V, Mailloux A и др. (2006). «Протеомика эндотелиальных клеток пупочной вены человека применительно к апоптозу, вызванному этопозидом». Proteomics . 5 (15): 3876– 84. doi :10.1002/pmic.200401239. PMID  16130169. S2CID  26007149.
  • Takeda E, Hieda M, Katahira J, Yoneda Y (2006). «Фосфорилирование RanGAP1 стабилизирует его взаимодействие с Ran и RanBP1». Cell Struct. Funct . 30 (2): 69– 80. doi : 10.1247/csf.30.69 . PMID  16428860.
  • Ewing RM, Chu P, Elisma F и др. (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии». Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC  1847948 . PMID  17353931.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RANBP1&oldid=1193733480"