РАНГАП1
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
РАНГАП1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRANGAP1 , Fug1, RANGAP, SD, Ran GTPase активирующий белок 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 602362; МГИ : 103071; гомологен : 55700; GeneCards : RANGAP1; OMA :RANGAP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

5905

19387

Ансамбль

ENSG00000100401

ENSMUSG00000022391

UniProt

Р46060

Р46061

РефСек (мРНК)

НМ_001278651
НМ_002883
НМ_001317930

НМ_001146174
НМ_011241
НМ_001358622

RefSeq (белок)

НП_001265580
НП_001304859
НП_002874

НП_001139646
НП_035371
НП_001345551

Местоположение (UCSC)Хр 22: 41.24 – 41.29 МбХр 15: 81,59 – 81,63 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Активирующий белок Ran GTPase 1 — это фермент , который у людей кодируется геном RANGAP1 . [5] [6]

Функция

RanGAP1 — гомодимерный 65-кДа полипептид, который специфически индуцирует активность ГТФазы RAN , но не RAS более чем в 1000 раз. RanGAP1 — непосредственный антагонист RCC1 , регуляторной молекулы, которая удерживает RAN в активном, связанном с ГТФ состоянии. Ген RANGAP1 кодирует полипептид из 587 аминокислот. Последовательность не связана с последовательностью активаторов ГТФазы для других белков, связанных с RAS , но на 88% идентична Rangap1 (Fug1), мышиному гомологу дрожжевого Rna1p. RanGAP1 и RCC1 контролируют RAN-зависимый транспорт между ядром и цитоплазмой. RanGAP1 — ключевой регулятор цикла ГТФ/ГДФ RAN . [6]

Взаимодействия

RanGAP1 — это транспортный белок, который помогает транспортировать другие белки из цитоплазмы в ядро. Небольшой модификатор, связанный с убиквитином, должен быть связан с ним, прежде чем он сможет быть локализован в ядерной поре. [7]

Было показано, что RANGAP1 взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000100401 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022391 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Bischoff FR, Krebber H, Kempf T, Hermes I, Ponstingl H (апрель 1995 г.). «Человеческий белок, активирующий RanGTPase RanGAP1, является гомологом дрожжевого Rna1p, участвующего в обработке и транспорте мРНК». Proc Natl Acad Sci USA . 92 (5): 1749–53. Bibcode :1995PNAS...92.1749B. doi : 10.1073/pnas.92.5.1749 . PMC 42597 . PMID  7878053. 
  6. ^ ab "Ген Энтреза: RANGAP1 Ran GTPase активирующий белок 1".
  7. ^ Хохштрассер М (2000). «Биохимия. Все в семействе убиквитина». Science . 289 (5479): 563–4. doi :10.1126/science.289.5479.563. PMID  10939967. S2CID  32469429.
  8. ^ Hillig RC, Renault L, Vetter IR, Drell T, Wittinghofer A, Becker J (июнь 1999 г.). «Кристаллическая структура rna1p: новая складка для белка, активирующего ГТФазу». Mol. Cell . 3 (6): 781–91. doi : 10.1016/S1097-2765(01)80010-1 . PMID  10394366.
  9. ^ Becker J, Melchior F, Gerke V, Bischoff FR, Ponstingl H, Wittinghofer A (май 1995 г.). «РНК1 кодирует активирующий ГТФазу белок, специфичный для Gsp1p, гомолога Ran/TC4 Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem . 270 (20): 11860–5. doi : 10.1074/jbc.270.20.11860 . PMID  7744835.
  10. ^ Bischoff FR, Klebe C, Kretschmer J, Wittinghofer A, Ponstingl H (март 1994). "RanGAP1 индуцирует активность ГТФазы ядерного Ras-связанного Ran". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (7): 2587–91. Bibcode :1994PNAS...91.2587B. doi : 10.1073/pnas.91.7.2587 . PMC 43414 . PMID  8146159. 
  11. ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 : 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID  17353931 . 
  12. ^ Tatham MH, Kim S, Yu B, Jaffray E, Song J, Zheng J, Rodriguez MS, Hay RT, Chen Y (август 2003 г.). «Роль N-концевого участка Ubc9 в связывании и конъюгации SUMO-1, -2 и -3». Биохимия . 42 (33): 9959–69. doi :10.1021/bi0345283. PMID  12924945.
  13. ^ Книпшер П., Флото А., Клюг Х., Олсен Дж.В., ван Дейк В.Дж., Фиш А., Джонсон Э.С., Манн М., Сиксма Т.К., Пихлер А. (август 2008 г.). «Сумойлирование Ubc9 регулирует дискриминацию целей СУМО». Мол. Клетка . 31 (3): 371–82. doi : 10.1016/j.molcel.2008.05.022 . ПМИД  18691969.

Дальнейшее чтение

  • Becker J, Melchior F, Gerke V, Bischoff FR, Ponstingl H, Wittinghofer A (1995). "РНК1 кодирует активирующий ГТФазу белок, специфичный для Gsp1p, гомолога Ran/TC4 Saccharomyces cerevisiae". J. Biol. Chem . 270 (20): 11860–5. doi : 10.1074/jbc.270.20.11860 . PMID  7744835.
  • Bischoff FR, Klebe C, Kretschmer J, Wittinghofer A, Ponstingl H (1994). "RanGAP1 индуцирует активность ГТФазы ядерного Ras-связанного Ran". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (7): 2587–91. Bibcode :1994PNAS...91.2587B. doi : 10.1073/pnas.91.7.2587 . PMC  43414 . PMID  8146159.
  • Krebber H, Ponstingl H (1997). "Повсеместная экспрессия и специфическое для яичек альтернативное полиаденилирование мРНК для человеческого активатора Ran GTPase RanGAP1". Gene . 180 (1–2): 7–11. doi :10.1016/S0378-1119(96)00389-7. PMID  8973340.
  • Matunis MJ, Coutavas E, Blobel G (1997). «Новая убиквитин-подобная модификация модулирует распределение активирующего Ran-GTPase белка RanGAP1 между цитозолем и комплексом ядерной поры». J. Cell Biol . 135 (6 Pt 1): 1457–70. doi :10.1083/jcb.135.6.1457. PMC  2133973. PMID  8978815 .
  • Mahajan R, Delphin C, Guan T, Gerace L, Melchior F (1997). «Небольшой полипептид, связанный с убиквитином, участвующий в нацеливании RanGAP1 на комплексный белок ядерной поры RanBP2». Cell . 88 (1): 97–107. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81862-0 . PMID  9019411.
  • Гёрлих Д., Дабровски М., Бишофф Ф.Р., Кутай У., Борк П., Хартманн Е., Прен С., Изаурральде Е. (1997). «Новый класс RanGTP-связывающих белков». Дж. Клеточная Биол . 138 (1): 65–80. дои : 10.1083/jcb.138.1.65. ПМК  2139951 . ПМИД  9214382.
  • Scheffzek K, Ahmadian MR, Kabsch W, Wiesmüller L, Lautwein A, Schmitz F, Wittinghofer A (1998). «Комплекс Ras-RasGAP: структурная основа активации GTPase и ее потери у онкогенных мутантов Ras». Science . 277 (5324): 333–8. doi :10.1126/science.277.5324.333. PMID  9219684.
  • Махаджан Р., Джерасе Л., Мельхиор Ф. (1998). «Молекулярная характеристика модификации SUMO-1 RanGAP1 и ее роль в ассоциации ядерной оболочки». J. Cell Biol . 140 (2): 259–70. doi :10.1083/jcb.140.2.259. PMC  2132567. PMID  9442102 .
  • Камитани Т, Кито К, Нгуен ХП, Фукуда-Камитани Т, Йе ЕТ (1998). «Характеристика второго члена семейства сентринов убиквитин-подобных белков». J. Biol. Chem . 273 (18): 11349–53. doi : 10.1074/jbc.273.18.11349 . PMID  9556629.
  • Окума Т., Хонда Р., Итикава Г., Цумагари Н., Ясуда Х. (1999). «Модификация SUMO-1 in vitro требует двух ферментативных стадий: E1 и E2». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 254 (3): 693–8. дои : 10.1006/bbrc.1998.9995. ПМИД  9920803.
  • Hillig RC, Renault L, Vetter IR, Drell T, Wittinghofer A, Becker J (1999). «Кристаллическая структура rna1p: новая складка для белка, активирующего ГТФазу». Mol. Cell . 3 (6): 781–91. doi : 10.1016/S1097-2765(01)80010-1 . PMID  10394366.
  • Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). "Последовательность ДНК человеческой хромосомы 22". Nature . 402 (6761): 489–95. Bibcode :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID  10591208.
  • Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (2001). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных человеческих генов. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 8 (2): 85–95. doi : 10.1093/dnares/8.2.85 . PMID  11347906.
  • Бернье-Вилламор В., Сэмпсон Д.А., Матунис М.Дж., Лима К.Д. (2002). «Структурная основа конъюгации SUMO, опосредованной E2, выявленная комплексом между убиквитин-конъюгирующим ферментом Ubc9 и RanGAP1». Cell . 108 (3): 345–56. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00630-X . PMID  11853669.
  • Joseph J, Tan SH, Karpova TS, McNally JG, Dasso M (2002). «SUMO-1 нацеливает RanGAP1 на кинетохоры и митотические веретена». J. Cell Biol . 156 (4): 595–602. doi :10.1083/jcb.200110109. PMC  2174074. PMID  11854305 .
  • Zhang H, Saitoh H, Matunis MJ (2002). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в филаментах комплекса ядерной поры». Mol. Cell. Biol . 22 (18): 6498–508. doi :10.1128/MCB.22.18.6498-6508.2002. PMC  135644. PMID  12192048 .
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). "Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
  • Macauley MS, Errington WJ, Okon M, Schärpf M, Mackereth CD, Schulman BA, McIntosh LP (2005). "Структурная и динамическая независимость изопептид-связанных RanGAP1 и SUMO-1". J. Biol. Chem . 279 (47): 49131–7. doi : 10.1074/jbc.M408705200 . PMID  15355965.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RANGAP1&oldid=1142792002"