Филип Борн
Физический химик и вычислительный биолог
Фил Борн
Филип Эрик Борн
Рожденный
Филип Эрик Борн

1953 (71–72 года) [6]
Альма-матерУниверситет Флиндерса (доктор философии)
Известный
Супруг
Рома Чалупа
​
( м.  1983 )
Дети
  • Скотт Борн (р. 1985)
  • Мелани Борн (р. 1997)
Награды
Научная карьера
ПоляНаука о данных
Вычислительная биология
Научная коммуникация [5]
Биоинформатика
Учреждения
ТезисАнализ кристаллической структуры: комплексы металлов, представляющие биологический интерес, и стереохимия замещенных фонилбициклооктанов  (1979)
Известные студентыВернер Г. Кребс
Веб-сайтdatascience.virginia.edu/people/phil-bourne

Филип Эрик Борн (родился в 1953 году) — австралийский биоинформатик , [10] писатель-документалист, [7] и бизнесмен. [9] В настоящее время он является заведующим кафедрой науки о данных Стивенсона, директором Школы науки о данных и профессором биомедицинской инженерии [11] и был первым заместителем директора по науке о данных в Национальном институте здравоохранения , где его проекты включают управление инициативой « Большие данные в знания» , а ранее — заместителем вице-канцлера Калифорнийского университета в Сан-Диего . [12] Он внес вклад в учебники и является ярым сторонником литературы и программного обеспечения с открытым доступом. Его разнообразные интересы охватывают структурную биологию , медицинскую информатику , информационные технологии , структурную биоинформатику , научную коммуникацию и фармацевтические науки . [10] Его статьи высоко цитируются, и его индекс Хирша превышает 80. [13] [14] [5]

Образование

Борн получил образование в области физической химии в середине-конце 1970-х годов и получил докторскую степень в 1979 году [6] в Университете Флиндерса .

Карьера и исследования

После получения степени доктора философии Борн перешёл в Шеффилдский университет, где занимался постдокторскими исследованиями в 1979–1981 годах [15] , а затем в Колумбийский университет в Нью-Йорке в 1981 году. В 1995 году он перешёл в Калифорнийский университет в Сан-Диего , где был профессором кафедры фармакологии. В 2014 году он перешёл в NIH, чтобы стать заместителем директора по науке о данных. В январе 2017 года было объявлено, что он принял должность директора Института науки о данных при Университете Вирджинии . [16]

Он известен тем, что написал книгу Unix for VMS Users (1990) [7] и был соавтором алгоритма комбинаторного расширения для трехмерного выравнивания структур белков [ 17] вместе с И. Шиндяловым (1998). В 1999 году он стал содиректором Protein Data Bank . [18] Он был президентом ISCB ( 2002–2003). [19] Он является членом Американской ассоциации медицинской информатики с 2002 года. [20] Он является основателем и главным редактором журнала PLoS Computational Biology (2005-). В 2007 году он стал соучредителем SciVee . [9] Борн является редактором популярной серии статей Ten Simple Rules , опубликованных в журнале PLoS Computational Biology . [21] Он занимал должность заместителя проректора по инновациям и промышленным альянсам [12] и профессора фармакологии в Школе фармацевтики и фармацевтических наук Скаггса в Калифорнийском университете в Сан-Диего (UCSD). [22] [23] Он является консультантом проекта Hypothes.is [24] и заместителем директора по науке о данных в Национальном институте здравоохранения , где его проекты включают управление инициативой «Большие данные в знания» . [25] [26]

Публикации

Борн является автором многочисленных научных статей и глав книг, а также редактором учебника «Структурная биоинформатика» [27] [28] и «Фармацевтическая информатика» [29] . Другие публикации [5] включают:

  • Структурная биоинформатика 1-е издание [27]
  • Структурная биоинформатика 2-е издание [28]
  • Аптечная информатика [29]
  • Пользователи Unix для VMS [7]
  • Борн, Филип Э. (1997-01-01). Поваренная книга по обслуживанию Интернета для UNIX . Prentice Hall. ISBN 9780135199923.
  • Харт, Дэвид Л.; Борн, Филип Э. (1998-08-12). Mac OS 8 Web Server Cookbook (1-е изд.). Prentice Hall PTR. ISBN 9780135200162.
  • Борн, Филип Э. (2000-01-01). Underground Guide Unix . Prentice Hall. ISBN 9780131844582.
  • Berman, HM; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, TN; Weissig, H.; Shindyalov, IN; Bourne, PE (2000-01-01). "Банк данных белков". Nucleic Acids Research . 28 (1): 235– 242. doi :10.1093/nar/28.1.235. ISSN  0305-1048. PMC 102472.  PMID 10592235  .

Награды и почести

Борн был избран членом AAAS по фармацевтическим наукам в 2011 году [1] и членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB) в 2011 году. [2] В 2010 году он выиграл премию Джима Грея в области электронной науки от Microsoft [3] , а в 2009 году выиграл премию Бенджамина Франклина (2009). [4] [30]

Личная жизнь

С 1983 года Борн женат на Роме Чалупе, у них двое детей: Скотт Борн (1985-) и Мелани Борн (1997-). [ необходима ссылка ] Его интересы включают мотоциклы, [31] полеты и походы.

Ссылки

  1. ^ ab "Доктор Фил Бурн избран членом AAAS по фармацевтическим наукам". Pharmacy.ucsd.edu . Получено 27.02.2011 .
  2. ^ ab "ISCB fellows". Архивировано из оригинала 2015-03-28 . Получено 2011-08-15 .
  3. ^ ab "Филипп Э. Борн выигрывает премию Джима Грея 2010 года в области электронной науки от Microsoft". Eurekalert.org. 2010-10-18 . Получено 2011-02-27 .
  4. ^ ab "Премия Бенджамина Франклина". Bioinformatics.org . Получено 27.02.2011 .
  5. ^ abc Публикации Филипа Борна, проиндексированные Google Scholar
  6. ^ ab Bourne, Philip Eric (1979). Анализ кристаллической структуры: комплексы металлов биологического интереса и стереохимия замещенных фонилбициклооктанов (диссертация на соискание степени доктора философии). Университет Флиндерса. OCLC  708090572.
  7. ^ abcd Bourne, Phil E (1990). Unix для пользователей VMS . Digital Press Newton, MA, США. ISBN 1-55558-034-3.
  8. ^ Берман, Х. М .; Уэстбрук, Дж.; Фэн, З.; Джиллиланд, Г.; Бхат, Т.; Вайсиг, Х.; Шиндьялов, И.; Борн, П. (2000). «Банк данных белков». Nucleic Acids Research . 28 (1): 235–242 . doi :10.1093/nar/28.1.235. PMC 102472. PMID  10592235 . 
  9. ^ abc Fink, JL; Bourne, PE (2007). «Переосмысление научной коммуникации для электронной эпохи». CTWatch Quarterly . 3 (3).
  10. ^ ab Публикации Филипа Борна, проиндексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
  11. ^ "Филипп Э. Борн". 6 июля 2017 г.
  12. ^ ab "Архивная копия" (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 2012-07-31 . Получено 2012-07-02 .{{cite web}}: CS1 maint: архивная копия как заголовок ( ссылка )
  13. ^ страница в Университете Вирджинии
  14. ^ старый сайт bournes
  15. ^ Клегг, GA; Стэнсфилд, RFD; Бурн, PE; Харрисон, PM (1980). «Упаковка спирали и конформация субъединицы в апоферритине селезенки лошади». Nature . 288 (5788): 298– 300. Bibcode :1980Natur.288..298C. doi :10.1038/288298a0. PMID  7432529. S2CID  4335735.
  16. ^ «UVA назначает исследователя NIH новым директором Института науки о данных». 11 января 2017 г.
  17. ^ Шиндялов, ИН; Борн, П.Е. (1998). «Выравнивание структуры белка путем инкрементального комбинаторного расширения (CE) оптимального пути». Protein Engineering Design and Selection . 11 (9): 739–747 . doi : 10.1093/protein/11.9.739 . PMID  9796821.
  18. ^ Берман, Х. М .; Уэстбрук, Дж.; Фэн, З.; Джиллиланд, Г.; Бхат, Т.; Вайсиг, Х.; Шиндьялов, И.; Борн, П. (2000). «Банк данных белков». Nucleic Acids Research . 28 (1): 235–242 . doi :10.1093/nar/28.1.235. PMC 102472. PMID  10592235 . 
  19. ^ "ISCB — Past Presidents". Архивировано из оригинала 28 августа 2015 г. Получено 3 сентября 2015 г.
  20. ^ Гринс, РА; Мэдсен, Э.; Миллер, РА (2003). "Американский колледж медицинской информатики, стипендиаты и международные партнеры, 2002". Журнал Американской ассоциации медицинской информатики . 10 (3): 281– 286. doi :10.1197/jamia.M1326. PMC 400512 . 
  21. ^ Десять простых правил
  22. ^ http://www.sdsc.edu/pb/ Веб-страница лаборатории Борна
  23. ^ http://www.sdsc.edu/~bourne/CV.pdf Резюме доктора философии Филипа Э. Борна
  24. ^ Официальный сайт Hypothes.is
  25. ^ NIH назначает доктора Филипа Э. Борна первым заместителем директора по науке о данных
  26. ^ Марголис, Р.; Дерр, Л.; Данн, М.; Уэрта, М.; Ларкин, Дж.; Шихан, Дж.; Гайер, М.; Грин, Э.Д. (2014). «Инициатива Национального института здравоохранения «Большие данные в знания» (BD2K): извлечение выгоды из больших биомедицинских данных». Журнал Американской ассоциации медицинской информатики . 21 (6): 957– 8. doi : 10.1136/amiajnl-2014-002974. ISSN  1067-5027. PMC 4215061. PMID  25008006 . 
  27. ^ ab Bourne, Philip E.; Weissig, Helga (2003). Структурная биоинформатика . John Wiley & Sons.
  28. ^ Аб Гу, Дженни; Борн, Филип Э. (март 2009 г.). Структурная биоинформатика (2-е изд.). Уайли-Блэквелл. ISBN 978-0-470-18105-8.
  29. ^ ab Андерсон, Филип О.; Борн, Филип Э. (декабрь 2009 г.). Фармацевтическая информатика . CRC Press. ISBN 978-1-4200-7175-7.
  30. ^ "Благодарность Борна: евангелист открытого доступа выигрывает премию Бенджамина Франклина 2009 года". Bio-itworld.com . Получено 27.02.2011 .
  31. ^ OFL | Филип Борн | Блог о путешествиях
ПредшествовалПрезидент Международного
общества вычислительной биологии
2002 – 2003 гг.		Преемник
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Philip_Bourne&oldid=1220554945"