PSIP1
Белок, обнаруженный в организме человека
PSIP1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыБелок взаимодействия PSIP1 , DFS70, LEDGF, PAIP, PSIP2, p52, p75, PC4 и SFRS1 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 603620; МГИ : 2142116; гомологен : 13242; GeneCards : PSIP1; OMA :PSIP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

11168

101739

Ансамбль

ENSG00000164985

ENSMUSG00000028484

UniProt

О75475

Q99JF8

РефСек (мРНК)

NM_001128217
NM_021144
NM_033222
NM_001317898
NM_001317900

NM_001290527
NM_133948
NM_001347143
NM_001355203

RefSeq (белок)

NP_001121689
NP_001304827
NP_001304829
NP_066967
NP_150091

НП_001277456
НП_001334072
НП_598709
НП_001342132

Местоположение (UCSC)Хр 9: 15.46 – 15.51 МбХр 4: 83,37 – 83,4 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок взаимодействия PC4 и SFRS1 1 , также известный как фактор роста, полученный из эпителия хрусталика (LEDGF/p75), белок плотных мелких пятен 70 кДа (DFS 70) или транскрипционный коактиватор p75/p52, представляет собой белок , который у людей кодируется геном PSIP1 . [ 5] [6]

Функция

PSIP1 не был четко связан с определенным клеточным механизмом. Термин LEDGF/p75 (фактор роста, полученный из эпителия хрусталика) вошел в общее употребление на основе первоначальной характеристики PSIP1, однако это неправильное название, поскольку белок присутствует в большинстве тканей и не играет прямой роли в развитии эпителия хрусталика. LEDGF/p75, коактиватор транскрипции , приобрел известность как фактор хозяина, который способствует интеграции ВИЧ [7] и, вероятно, является единственным интерактором интегразы, нокдаун которого серьезно влияет на уровни интеграции ВИЧ. [8] [9] [10] Взаимодействие между интегразой ВИЧ и человеческим LEDGF/p75 является многообещающей целью для открытия лекарств против ВИЧ. [11] LEDGF/p75 рекрутирует комплексы MLL к генам HOX для регуляции их экспрессии. [12] Показано, что LEDGF/p52 привлекает факторы сплайсинга к триметилированному хроматину H3K36 для модуляции альтернативного сплайсинга, [13] также регулирует HOTTIP lncRNA , которая, как показано, регулирует гены HOX в цис-положении . [14]

Структура

LEDGF/p75 — это белок массой 60 кДа, длиной 530 аминокислот. [15] N-концевая часть белка состоит из домена PWWP, последовательности ядерной локализации и двух копий мотива связывания ДНК AT-hook . C-концевая часть LEDGF/p75 содержит структуру, называемую доменом связывания интегразы, [16] которая взаимодействует с белками лентивирусной интегразы, а также с многочисленными клеточными белками. N-концевая часть сильно взаимодействует с хроматином , что делает LEDGF/p75 конститутивно ядерным белком. Изоформа белка, LEDGF/p52, образуется путем альтернативного сплайсинга . LEDGF/p52 разделяет 325 аминокислот N-конца LEDGF/p75, но не имеет домена связывания интегразы.

Взаимодействия

Было показано, что PSIP1 взаимодействует с белками ASF/SF2 , JPO2, Cdc7-Dbf4 и POGZ , а также с комплексом белков менин / MLL . [17] [18]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000164985 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028484 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Entrez: PSIP1 PC4 и взаимодействующий белок 1 SFRS1».
  6. ^ Singh DP, Kimura A, Chylack LT, Shinohara T (январь 2000 г.). «Фактор роста, полученный из эпителия хрусталика (LEDGF/p75) и p52, получены из одного гена путем альтернативного сплайсинга». Gene . 242 ( 1– 2): 265– 73. doi :10.1016/S0378-1119(99)00506-5. PMID  10721720.
  7. ^ Черепанов П., Мартенс Г., Пруст П., Девриз Б., Ван Беумен Дж., Энгельборгс Ю., Де Клерк Э., Дебизер З. (январь 2003 г.). «Интегаза ВИЧ-1 образует стабильные тетрамеры и связывается с белком LEDGF/p75 в клетках человека». Ж. Биол. Хим . 278 (1): 372–81 . doi : 10.1074/jbc.M209278200 . ПМИД  12407101.
  8. ^ Вандекеркхове Л., Крист Ф., Ван Маеле Б., Де Райк Дж., Гийсберс Р., Ван ден Оте С., Витвроу М., Дебизер З. (февраль 2006 г.). «Транзитный и стабильный нокдаун кофактора интегразы LEDGF/p75 раскрывает его роль в цикле репликации вируса иммунодефицита человека». Дж. Вирол . 80 (4): 1886–96 . doi :10.1128/JVI.80.4.1886–1896.2006. ПМЦ 1367129 . ПМИД  16439544. 
  9. ^ Shun MC, Raghavendra NK, Vandegraaff N, Daigle JE, Hughes S, Kellam P, Cherepanov P, Engelman A (июль 2007 г.). "LEDGF/p75 функционирует ниже по течению от образования преинтеграционного комплекса, чтобы осуществить ген-специфическую интеграцию ВИЧ-1". Genes Dev . 21 (14): 1767–78 . doi :10.1101/gad.1565107. PMC 1920171. PMID 17639082  . 
  10. ^ Llano M, Saenz DT, Meehan A, Wongthida P, Peretz M, Walker WH, Teo W, Poeschla EM (октябрь 2006 г.). «Важная роль LEDGF/p75 в интеграции ВИЧ». Science . 314 (5798): 461– 4. Bibcode :2006Sci...314..461L. doi :10.1126/science.1132319. PMID  16959972. S2CID  24756699.
  11. ^ Christ F, Voet A, Marchand A, Nicolet S, Desimmie BA, Marchand D, Bardiot D, Van der Veken NJ, Van Remoortel B, Strelkov SV, De Maeyer M, Chaltin P, Debyser Z (июнь 2010 г.). «Рациональный дизайн ингибиторов малых молекул взаимодействия LEDGF/p75-интегразы и репликации ВИЧ». Nat. Chem. Biol . 6 (6): 442– 8. doi :10.1038/nchembio.370. PMID  20473303. S2CID  37421436.
  12. ^ Pradeepa, Madapura M.; Grimes, Graeme R.; Taylor, Gillian CA; Sutherland, Heidi G.; Bickmore, Wendy A. (2014-08-18). "Psip1/Ledgf p75 сдерживает экспрессию гена Hox, привлекая белки как trithorax, так и polycomb". Nucleic Acids Research . 42 (14): 9021– 9032. doi :10.1093/nar/gku647. ISSN  0305-1048. PMC 4132756. PMID 25056311  . 
  13. ^ Pradeepa, Madapura M.; Sutherland, Heidi G.; Ule, Jernej; Grimes, Graeme R.; Bickmore, Wendy A. (17.05.2012). "Psip1/Ledgf p52 связывает метилированный гистон H3K36 и факторы сплайсинга и вносит вклад в регуляцию альтернативного сплайсинга". PLOS Genetics . 8 (5): e1002717. doi : 10.1371/journal.pgen.1002717 . ISSN  1553-7404. PMC 3355077 . PMID  22615581. 
  14. ^ Прадипа, Мадапура М.; Маккенна, Фионнуала; Тейлор, Джиллиан, Калифорния; Бенгани, Хемант; Граймс, Грэм Р.; Вуд, Эндрю Дж.; Бхатия, Шипра; Бикмор, Венди А. (6 апреля 2017 г.). «Psip1/p52 регулирует задние гены Hoxa посредством активации lncRNA Hottip». ПЛОС Генетика . 13 (4): e1006677. дои : 10.1371/journal.pgen.1006677 . ISSN  1553-7404. ПМК 5383017 . ПМИД  28384324. 
  15. ^ Llano M, Morrison J, Poeschla EM (2009). "Вирусологические и клеточные роли транскрипционного коактиватора LEDGF/P75". Взаимодействие ВИЧ с белками клеток-хозяев . Текущие темы микробиологии и иммунологии. Том 339. С.  125–46 . doi :10.1007/978-3-642-02175-6_7. ISBN 978-3-642-02174-9. PMC  3093762 . PMID  20012527. {{cite book}}: |journal=проигнорировано ( помощь )
  16. ^ Черепанов П., Сан З.Й., Рахман С., Мартенс Г., Вагнер Г., Энгельман А. (июнь 2005 г.). «Структура раствора домена связывания интегразы ВИЧ-1 в LEDGF/p75». Nat. Struct. Mol. Biol . 12 (6): 526–32 . doi :10.1038/nsmb937. PMID  15895093. S2CID  20898124.
  17. ^ Ge H, Si Y, Wolffe AP (декабрь 1998 г.). «Новый транскрипционный коактиватор p52 функционально взаимодействует с основным фактором сплайсинга ASF/SF2». Mol. Cell . 2 (6): 751– 9. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80290-7 . PMID  9885563.
  18. ^ Хьюз С., Дженкинс В., Дар М.Дж., Энгельман А., Черепанов П. (январь 2010 г.). «Транскрипционный коактиватор LEDGF взаимодействует с Cdc7-активатором киназы S-фазы (ASK) и стимулирует его ферментативную активность». J. Biol. Chem . 285 (1): 541–54 . doi : 10.1074/jbc.M109.036491 . PMC 2804203. PMID  19864417 . 

Дальнейшее чтение

  • Shun MC, Raghavendra NK, Vandegraaff N, Daigle JE, Hughes S, Kellam P, Cherepanov P, Engelman A (июль 2007 г.). "LEDGF/p75 функционирует ниже по течению от образования преинтеграционного комплекса, чтобы осуществить ген-специфическую интеграцию ВИЧ-1". Genes Dev . 21 (14): 1767– 78. doi :10.1101/gad.1565107. PMC  1920171. PMID  17639082 .
  • Van Maele B, Debyser Z (2005). «Интеграция ВИЧ-1: взаимодействие между интегразой ВИЧ-1, клеточными и вирусными белками». AIDS Rev. 7 ( 1): 26–43 . PMID  15875659.
  • Ван Маэле Б., Бусшотс К., Вандекеркхове Л., Крист Ф., Дебисер З. (2006). «Клеточные кофакторы интеграции ВИЧ-1». Тенденции биохимии. Наука . 31 (2): 98–105 . doi :10.1016/j.tibs.2005.12.002. ПМИД  16403635.
  • Freed EO, Mouland AJ (2006). "Клеточная биология ВИЧ-1 и других ретровирусов". Retrovirology . 3 : 77. doi : 10.1186/1742-4690-3-77 . PMC  1635732. PMID  17083721 .
  • Ge H, Si Y, Roeder RG (1998). «Выделение кДНК, кодирующих новые коактиваторы транскрипции p52 и p75, раскрывает альтернативный регуляторный механизм активации транскрипции». EMBO J . 17 (22): 6723– 9. doi :10.1093/emboj/17.22.6723. PMC  1171017 . PMID  9822615.
  • Ge H, Si Y, Wolffe AP (1998). «Новый транскрипционный коактиватор p52 функционально взаимодействует с основным фактором сплайсинга ASF/SF2». Mol. Cell . 2 (6): 751– 9. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80290-7 . PMID  9885563.
  • Singh DP, Ohguro N, Kikuchi T, Sueno T, Reddy VN, Yuge K, Chylack LT, Shinohara T (2000). «Фактор роста, полученный из эпителия хрусталика: влияние на рост и выживаемость эпителиальных клеток хрусталика, кератиноцитов и фибробластов». Biochem. Biophys. Res. Commun . 267 (1): 373– 81. doi :10.1006/bbrc.1999.1979. PMID  10623627.
  • Singh DP, Kimura A, Chylack LT, Shinohara T (2000). «Фактор роста, полученный из эпителия хрусталика (LEDGF/p75) и p52, получены из одного гена путем альтернативного сплайсинга». Gene . 242 ( 1– 2): 265– 73. doi :10.1016/S0378-1119(99)00506-5. PMID  10721720.
  • Ochs RL, Muro Y, Si Y, Ge H, Chan EK, Tan EM (2000). «Аутоантитела к DFS 70 кДа/транскрипционному коактиватору p75 при атопическом дерматите и других состояниях». J. Allergy Clin. Immunol . 105 (6 Pt 1): 1211– 20. doi : 10.1067/mai.2000.107039 . PMID  10856157.
  • Кубо Э., Фатма Н., Шарма П., Шинохара Т., Чайлак Л.Т., Акаги Й., Сингх Д.П. (2002). «Трансактивация инволюкрина, маркера дифференциации кератиноцитов, фактором роста, полученным из эпителия хрусталика (LEDGF)». J. Mol. Biol . 320 (5): 1053– 63. doi :10.1016/S0022-2836(02)00551-X. PMID  12126624.
  • Wu X, Daniels T, Molinaro C, Lilly MB, Casiano CA (2002). «Расщепление каспазой ядерного аутоантигена LEDGF/p75 отменяет его функцию выживания: последствия для аутоиммунитета при атопических расстройствах». Cell Death Differ . 9 (9): 915–25 . doi : 10.1038/sj.cdd.4401063 . PMID  12181742.
  • Черепанов П., Мартенс Г., Пруст П., Девриз Б., Ван Беумен Дж., Энгельборгс Ю., Де Клерк Э., Дебизер З. (2003). «Интегаза ВИЧ-1 образует стабильные тетрамеры и связывается с белком LEDGF/p75 в клетках человека». Ж. Биол. Хим . 278 (1): 372–81 . doi : 10.1074/jbc.M209278200 . ПМИД  12407101.
  • Мартенс Г., Черепанов П., Плаймерс В., Бусшотс К., Де Клерк Э., Дебисер З., Энгельборгс Ю. (2003). «LEDGF/p75 необходим для ядерного и хромосомного воздействия на интегразу ВИЧ-1 в клетках человека». Ж. Биол. Хим . 278 (35): 33528– 39. doi : 10.1074/jbc.M303594200 . ПМИД  12796494.
  • Maertens G, Cherepanov P, Debyser Z, Engelborghs Y, Engelman A (2004). "Идентификация и характеристика функционального сигнала ядерной локализации в интеракторе интегразы ВИЧ-1 LEDGF/p75". J. Biol. Chem . 279 (32): 33421– 9. doi : 10.1074/jbc.M404700200 . PMID  15163664.
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). "Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
  • Llano M, Vanegas M, Fregoso O, Saenz D, Chung S, Peretz M, Poeschla EM (2004). "LEDGF/p75 определяет клеточный трафик различных лентивирусных, но не мышиных онкоретровирусных интегразных белков и является компонентом функциональных лентивирусных преинтеграционных комплексов". J. Virol . 78 (17): 9524– 37. doi :10.1128/JVI.78.17.9524-9537.2004. PMC  506940 . PMID  15308744.
  • Черепанов П., Девро Э., Сильвер ПА, Энгельман А. (2004). «Идентификация эволюционно консервативного домена в факторе роста эпителия хрусталика человека/транскрипционном коактиваторе p75 (LEDGF/p75), который связывает интегразу ВИЧ-1». J. Biol. Chem . 279 (47): 48883– 92. doi : 10.1074/jbc.M406307200 . PMID  15371438.
  • Llano M, Delgado S, Vanegas M, Poeschla EM (2004). «Фактор роста, полученный из эпителия хрусталика/p75, предотвращает протеасомную деградацию интегразы ВИЧ-1». J. Biol. Chem . 279 (53): 55570– 7. doi : 10.1074/jbc.M408508200 . PMID  15475359.
  • Ogawa Y, Sugiura K, Watanabe A, Kunimatsu M, Mishima M, Tomita Y, Muro Y (2004). «Аутоантигенность DFS70 ограничена конформационным эпитопом C-концевого альфа-спирального домена». J. Autoimmun . 23 (3): 221– 31. doi :10.1016/j.jaut.2004.07.003. PMID  15501393.
  • Окамото М, Огава Й, Ватанабэ А, Сугиура К, Симомура Й, Аоки Н, Нагасака Т, Томита Й, Муро Й (2004). «Аутоантитела к DFS70/LEDGF повышаются у пациентов с очаговой алопецией». Дж. Аутоиммун . 23 (3): 257–66 . doi :10.1016/j.jaut.2004.07.004. ПМИД  15501396.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PSIP1&oldid=1245337848"