ПДЗК1

ПДЗК1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2EEI, 2EEJ, 2VSP, 3TMH, 4Q2P
Идентификаторы
Псевдонимы	PDZK1 , CAP70, CLAMP, NHERF-3, NHERF3, PDZD1, домен PDZ, содержащий 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603831; МГИ : 1928901; Гомологен : 1964; Генные карты : PDZK1; ОМА :ПДЗК1 - ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	145,708,148 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	96,778,242 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	двенадцатиперстная кишка; ; правая доля печени; ; кора мозжечка; ; полушарие мозжечка; ; желчный пузырь; ; человеческая почка; ; правое полушарие мозжечка; ; тело поджелудочной железы; ; островок Лангерганса; ; яичко;
	Верх выражен в
	правая почка; ; человеческая почка; ; проксимальный каналец; ; выносящий проток; ; желточный мешок; ; семенной каналец; ; тощая кишка; ; сперматид; ; первичный ооцит; ; подвздошная кишка;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание рецептора-мусорщика; связывание белково-содержащих комплексов; Привязка домена PDZ; связывание белков; транспортерная активность;
Клеточный компонент	мембранный плот; мембрана щеточной каймы; плазматическая мембрана; внеклеточная экзосома; апикальная плазматическая мембрана; мембрана; мембрана микроворсинки;
Биологический процесс	пролиферация популяции клеток; транспорт карнитина; позитивная регуляция ионного трансмембранного транспорта; регуляция транспорта анионов; позитивная регуляция направления белка на мембрану; транспорт; позитивная регуляция активности трансмембранного переносчика ионов; позитивная регуляция трансмембранного транспорта катионов; Детоксикация ксенобиотиков путем трансмембранного экспорта через плазматическую мембрану;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	5174
	59020
	ENSG00000174827
	ENSMUSG00000038298
	Q5T2W1
	Q9JIL4
	НМ_001201325 ; НМ_001201326 ; НМ_002614
	НМ_001146001 ; НМ_021517 ; НМ_001355710
	NP_001188254 ; NP_001188255 ; NP_002605 ; NP_001358288 ; NP_001358290
	НП_001139473 ; НП_067492 ; НП_001342639
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Кофактор регуляции обмена Na(+)/H(+) NHE-RF3 — это белок , который у человека кодируется геном PDZK1 . [ ^5]^[6]

Взаимодействия

Было показано, что PDZK1 взаимодействует с:

АКАП10 , ^[7]
CLCN3 , ^[8]
Регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе ^[8]^[9]
ФАРП2 , ^[7]
ПДЗК1ИП1 , ^[7]^[10]^[11]
SLC22A12 , ^[7]
SLC22A4 , ^[7]
SLC34A3 , ^[7]
СЛК , ^[7] и
Натрий-водородный антипортер 3 регулятор 1 . ^[7]

Проблемы, связанные с генами

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000174827 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000038298 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Kocher O, Comella N, Tognazzi K, Brown LF (март 1998). «Идентификация и частичная характеристика PDZK1: новый белок, содержащий домены взаимодействия PDZ». Lab Invest . 78 (1): 117–25 . PMID 9461128.
^ «Ген Энтреза: домен PDZK1 PDZ, содержащий 1».
^ abcdefgh Гислер С.М., Прибанич С., Бачич Д., Форрер П., Гантенбейн А., Сабурин Л.А., Цуджи А., Чжао З.С., Мансер Э., Бибер Дж., Мурер Х. (ноябрь 2003 г.). «PDZK1: I. основной каркас в щеточных каймах проксимальных канальцевых клеток». Почки Int . 64 (5): 1733–45 . doi : 10.1046/j.1523-1755.2003.00266.x . ПМИД 14531806.
^ ab Gentzsch M, Cui L, Mengos A, Chang XB, Chen JH, Riordan JR (февраль 2003 г.). «PDZ-связывающий хлоридный канал ClC-3B локализуется в аппарате Гольджи и ассоциируется с белками PDZ, взаимодействующими с регулятором трансмембранной проводимости кистозного фиброза». J. Biol. Chem . 278 (8): 6440– 9. doi : 10.1074/jbc.M211050200 . PMID 12471024.
^ Wang S, Yue H, Derin RB, Guggino WB, Li M (сентябрь 2000 г.). «Вспомогательный белок способствовал взаимодействию CFTR-CFTR, молекулярный механизм потенцирования активности хлоридного канала». Cell . 103 (1): 169– 79. doi : 10.1016/s0092-8674(00)00096-9 . PMID 11051556. S2CID 16697781.
^ Прибанич С., Гислер С.М., Бачич Д., Мадждпур С., Эрнандо Н., Соррибас В., Гантенбейн А., Бибер Дж., Мурер Х. (октябрь 2003 г.). «Взаимодействие MAP17 с белковым комплексом NaPi-IIa/PDZK1 в клетках проксимальных канальцев почек». Являюсь. Дж. Физиол. Почечная физиол . 285 (4): Ф784-91. дои : 10.1152/ajprenal.00109.2003. PMID 12837682. S2CID 25450845.
^ Silver DL, Wang N, Vogel S (август 2003 г.). «Идентификация малого белка, ассоциированного с PDZK1, DD96/MAP17, как регулятора уровней PDZK1 и липопротеинов высокой плотности в плазме». J. Biol. Chem . 278 (31): 28528– 32. doi : 10.1074/jbc.M304109200 . PMID 12754212.
^ Klopocki E, Schulze H, Strauss G, Ott CE, Hall J, Trotier F, Fleischhauer S, Greenhalgh L, Newbury-Ecob RA, Neumann LM, Habenicht R, König R, Seemanova E, Megarbane A, Ropers HH, Ullmann R, Horn D, Mundlos S (февраль 2007 г.). «Сложный паттерн наследования, напоминающий аутосомно-рецессивное наследование, включающее микроделецию при синдроме тромбоцитопении–отсутствия лучевой кости». Am. J. Hum. Genet . 80 (2): 232– 40. doi :10.1086/510919. PMC 1785342. PMID 17236129 .

Дальнейшее чтение

White KE, Biber J, Murer H, Econs MJ (1999). "Белок, содержащий домен PDZ с гомологией с Diphor-1, отображается на человеческой хромосоме 1q21". Ann. Hum. Genet . 62 (Pt 4): 287– 90. doi : 10.1046/j.1469-1809.1998.6240287.x . PMID 9924606.
Kocher O, Comella N, Gilchrist A, Pal R, Tognazzi K, Brown LF, Knoll JH (1999). "PDZK1, новый белок, содержащий домен PDZ, экспрессируемый в карциномах и сопоставленный с хромосомой 1q21, взаимодействует с cMOAT (MRP2), белком, ассоциированным с множественной лекарственной устойчивостью". Lab. Invest . 79 (9): 1161– 70. PMID 10496535.
Ikemoto M, Arai H, Feng D, Tanaka K, Aoki J, Dohmae N, Takio K, Adachi H, Tsujimoto M, Inoue K (2000). «Идентификация белка, содержащего домен PDZ, который взаимодействует с рецептором-поглотителем класса B типа I». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (12): 6538– 43. Bibcode :2000PNAS...97.6538I. doi : 10.1073/pnas.100114397 . PMC 18651 . PMID 10829064.
Wang S, Yue H, Derin RB, Guggino WB, Li M (2000). «Вспомогательный белок, способствующий взаимодействию CFTR-CFTR, молекулярный механизм потенцирования активности хлоридного канала». Cell . 103 (1): 169– 79. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00096-9 . PMID 11051556. S2CID 16697781.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
Gisler SM, Stagljar I, Traebert M, Bacic D, Biber J, Murer H (2001). «Взаимодействие Na/Pi котранспортера типа IIa с белками PDZ». J. Biol. Chem . 276 (12): 9206– 13. doi : 10.1074/jbc.M008745200 . PMID 11099500.
Silver DL (2002). «Домен PDZ-взаимодействия с карбоксильным концом рецептора-мусорщика B, тип I необходим для экспрессии на поверхности клеток печени». J. Biol. Chem . 277 (37): 34042– 7. doi : 10.1074/jbc.M206584200 . PMID 12119305.
Sellin L, Huber TB, Gerke P, Quack I, Pavenstädt H, Walz G (2003). «NEPH1 определяет новое семейство белков, взаимодействующих с подоцином». FASEB J . 17 (1): 115– 7. doi : 10.1096/fj.02-0242fje . PMID 12424224. S2CID 17732086.
Gentzsch M, Cui L, Mengos A, Chang XB, Chen JH, Riordan JR (2003). «PDZ-связывающий хлоридный канал ClC-3B локализуется в аппарате Гольджи и ассоциируется с PDZ-белками, взаимодействующими с регулятором трансмембранной проводимости при кистозном фиброзе». J. Biol. Chem . 278 (8): 6440– 9. doi : 10.1074/jbc.M211050200 . PMID 12471024.
Хегедюс Т., Сесслер Т., Скотт Р., Телин В., Бакос Э., Варади А., Сабо К., Гомоля Л., Милграм С.Л., Саркади Б. (2003). «С-концевое фосфорилирование MRP2 модулирует его взаимодействие с белками PDZ». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 302 (3): 454–61 . doi :10.1016/S0006-291X(03)00196-7. ПМИД 12615054.
Silver DL, Wang N, Vogel S (2003). «Идентификация малого белка, ассоциированного с PDZK1, DD96/MAP17, как регулятора уровней PDZK1 и липопротеинов высокой плотности в плазме». J. Biol. Chem . 278 (31): 28528– 32. doi : 10.1074/jbc.M304109200 . PMID 12754212.
Pribanic S, Gisler SM, Bacic D, Madjdpour C, Hernando N, Sorribas V, Gantenbein A, Biber J, Murer H (2003). "Взаимодействие MAP17 с комплексом белков NaPi-IIa/PDZK1 в клетках проксимальных канальцев почек". Am. J. Physiol. Renal Physiol . 285 (4): F784–91. doi :10.1152/ajprenal.00109.2003. PMID 12837682. S2CID 25450845.
Gisler SM, Pribanic S, Bacic D, Forrer P, Gantenbein A, Sabourin LA, Tsuji A, Zhao ZS, Manser E, Biber J, Murer H (2004). "PDZK1: I. основной каркас в щеточных каемках проксимальных канальцевых клеток". Kidney Int . 64 (5): 1733– 45. doi : 10.1046/j.1523-1755.2003.00266.x . PMID 14531806.
Kocher O, Yesilaltay A, Cirovic C, Pal R, Rigotti A, Krieger M (2004). «Целенаправленное нарушение гена PDZK1 у мышей вызывает специфическое для тканей истощение рецептора-поглотителя липопротеинов высокой плотности класса B типа I и измененный метаболизм липопротеинов». J. Biol. Chem . 278 (52): 52820– 5. doi : 10.1074/jbc.M310482200 . PMID 14551195.
Inoue J, Otsuki T, Hirasawa A, Imoto I, Matsuo Y, Shimizu S, Taniwaki M, Inazawa J (2004). «Повышенная экспрессия PDZK1 в ампликоне 1q12-q22, вероятно, связана с фенотипом лекарственной устойчивости при множественной миеломе». Am. J. Pathol . 165 (1): 71– 81. doi :10.1016/S0002-9440(10)63276-2. PMC 1618545 . PMID 15215163.
Анзай Н., Миядзаки Х., Ноширо Р., Камданг С., Чайрунгдуа А., Шин Х.Дж., Эномото А., Сакамото С., Хирата Т., Томита К., Канаи Ю., Эндо Х. (2004). «Многовалентный белок PDZK1, содержащий домен PDZ, регулирует транспортную активность почечного урат-анионообменника URAT1 через его C-конец». Ж. Биол. Хим . 279 (44): 45942– 50. doi : 10.1074/jbc.M406724200 . ПМИД 15304510.

Эта статья о белках — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000174827 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000038298 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9461128-5] Kocher O, Comella N, Tognazzi K, Brown LF (март 1998). «Идентификация и частичная характеристика PDZK1: новый белок, содержащий домены взаимодействия PDZ». Lab Invest . 78 (1): 117–25 . PMID 9461128.

[entrez-6] «Ген Энтреза: домен PDZK1 PDZ, содержащий 1».

[pmid14531806-7] Гислер С.М., Прибанич С., Бачич Д., Форрер П., Гантенбейн А., Сабурин Л.А., Цуджи А., Чжао З.С., Мансер Э., Бибер Дж., Мурер Х. (ноябрь 2003 г.). «PDZK1: I. основной каркас в щеточных каймах проксимальных канальцевых клеток». Почки Int . 64 (5): 1733–45 . doi : 10.1046/j.1523-1755.2003.00266.x . ПМИД 14531806.

[pmid12471024-8] Gentzsch M, Cui L, Mengos A, Chang XB, Chen JH, Riordan JR (февраль 2003 г.). «PDZ-связывающий хлоридный канал ClC-3B локализуется в аппарате Гольджи и ассоциируется с белками PDZ, взаимодействующими с регулятором трансмембранной проводимости кистозного фиброза». J. Biol. Chem . 278 (8): 6440– 9. doi : 10.1074/jbc.M211050200 . PMID 12471024.

[pmid11051556-9] Wang S, Yue H, Derin RB, Guggino WB, Li M (сентябрь 2000 г.). «Вспомогательный белок способствовал взаимодействию CFTR-CFTR, молекулярный механизм потенцирования активности хлоридного канала». Cell . 103 (1): 169– 79. doi : 10.1016/s0092-8674(00)00096-9 . PMID 11051556. S2CID 16697781.

[pmid12837682-10] Прибанич С., Гислер С.М., Бачич Д., Мадждпур С., Эрнандо Н., Соррибас В., Гантенбейн А., Бибер Дж., Мурер Х. (октябрь 2003 г.). «Взаимодействие MAP17 с белковым комплексом NaPi-IIa/PDZK1 в клетках проксимальных канальцев почек». Являюсь. Дж. Физиол. Почечная физиол . 285 (4): Ф784-91. дои : 10.1152/ajprenal.00109.2003. PMID 12837682. S2CID 25450845.

[pmid12754212-11] Silver DL, Wang N, Vogel S (август 2003 г.). «Идентификация малого белка, ассоциированного с PDZK1, DD96/MAP17, как регулятора уровней PDZK1 и липопротеинов высокой плотности в плазме». J. Biol. Chem . 278 (31): 28528– 32. doi : 10.1074/jbc.M304109200 . PMID 12754212.

[pmid17236129-12] Klopocki E, Schulze H, Strauss G, Ott CE, Hall J, Trotier F, Fleischhauer S, Greenhalgh L, Newbury-Ecob RA, Neumann LM, Habenicht R, König R, Seemanova E, Megarbane A, Ropers HH, Ullmann R, Horn D, Mundlos S (февраль 2007 г.). «Сложный паттерн наследования, напоминающий аутосомно-рецессивное наследование, включающее микроделецию при синдроме тромбоцитопении–отсутствия лучевой кости». Am. J. Hum. Genet . 80 (2): 232– 40. doi :10.1086/510919. PMC 1785342. PMID 17236129 .