Миомегалин
Белок позвоночных, участвующий в образовании микротрубочек

PDE4DIP
Идентификаторы
ПсевдонимыPDE4DIP , CMYA2, MMGL, белок, взаимодействующий с фосфодиэстеразой 4D
Внешние идентификаторыОМИМ : 608117; МГИ : 1891434; гомологен : 66961; GeneCards : PDE4DIP; OMA :PDE4DIP — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

9659

83679

Ансамбль

ENSG00000178104

ENSMUSG00000038170

UniProt

Q5VU43

Q80YT7

РефСек (мРНК)
RefSeq (белок)

NP_001034465
NP_001276630
NP_001276631
NP_835181

Местоположение (UCSC)Хр 1: 148.81 – 149.05 МбХр 3: 97,6 – 97,8 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Миомегалин , также известный как белок, взаимодействующий с фосфодиэстеразой 4D, или белок, ассоциированный с кардиомиопатией 2 , — это белок , который у людей кодируется геном PDE4DIP . [5] [6] [7] Он участвует в формировании микротрубочек из центросомы . [8] Его название происходит от того факта, что он высоко экспрессируется в единицах трубчатых миофибрилл , известных как саркомеры , и является крупным белком, состоящим из 2324 аминокислот. [9] Впервые он был охарактеризован в 2000 году . [9]

Структура и функции

Миомегалин в основном состоит из альфа-спиральных и спирально-спиральных структур и имеет домены, общие с белками, ассоциированными с микротрубочками . [9] Он имеет несколько изоформ , по крайней мере две из которых были охарактеризованы, CM-MMG и EB-MMG. [8]

Миомегалин необходим для достаточного роста микротрубочек из центросом . Изоформа CM-MMG связывается в центросоме с γ -тубулином в AKAP9 -зависимой манере и на ближней стороне аппарата Гольджи , в то время как изоформа EB-MMG связывается с MAPRE1 в аппарате Гольджи и усиливает влияние MAPRE1 на рост микротрубочек. [8]

Миомегалин, в частности изоформа CM-MMG, является паралогом CDK5RAP2 . [8] [10] [11] Истощение миомегалина в клетках не приводит к снижению γ-тубулина или CDK5RAP2, в отличие от истощения CDK5RAP2, и, по-видимому, не влияет на митоз посредством различных дефектов закрепления веретена и ориентации, в отличие от CDK5RAP2. Это указывает на то, что CDK5RAP2 может в некоторой степени компенсировать отсутствие миомегалина. Однако клетки с истощенным миомегалином имеют более медленную миграцию , поскольку микротрубочки имеют решающее значение для подвижности клеток. [8]

Ортологи миомегалина наблюдаются у позвоночных еще у костистых рыб , около 450 миллионов лет назад. У млекопитающих , около 200 миллионов лет назад, миомегалин приобрел домен Олдуваи . Домены Олдуваи до сих пор были обнаружены только в генах NBPF у плацентарных млекопитающих , многие из которых соседствуют с миомегалином на хромосоме 1, поэтому считается, что эти гены произошли от дупликации миомегалина. [12] Увеличение дупликации домена NPBF Олдуваи у людей было связано с эволюцией размера человеческого мозга. [13]

Взаимодействия

Было показано, что миомегалин (PDE4DIP) взаимодействует с PDE4D . [6]

История

Белок был открыт в 2000 году и получил такое название, поскольку он был высоко экспрессирован в саркомерах сердечной мышцы крысы (единицах трубчатых миофибрилл ) и представляет собой большой белок, состоящий из 2324 аминокислот. [9]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000178104 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000038170 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Seki N, Ohira M, Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Nakajima D и др. (октябрь 1997 г.). «Характеристика клонов кДНК в библиотеках кДНК с фракционированием по размеру из человеческого мозга». DNA Research . 4 (5): 345– 9. doi : 10.1093/dnares/4.5.345 . PMID  9455484.
  6. ^ ab Verde I, Pahlke G, Salanova M, Zhang G, Wang S, Coletti D, et al. (апрель 2001 г.). «Миомегалин — это новый белок аппарата Гольджи/центросомы, который взаимодействует с циклической нуклеотидной фосфодиэстеразой». Журнал биологической химии . 276 (14): 11189– 98. doi : 10.1074/jbc.M006546200 . hdl : 11573/1681344 . PMID  11134006.
  7. ^ «Ген Entrez: белок, взаимодействующий с фосфодиэстеразой 4D PDE4DIP (миомегалин)».
  8. ^ abcde Roubin R, Acquaviva C, Chevrier V, Sedjaï F, Zyss D, Birnbaum D, Rosnet O (февраль 2013 г.). «Миомегалин необходим для формирования центросомальных и Гольджи-производных микротрубочек». Biology Open . 2 (2): 238– 50. doi :10.1242/bio.20123392. PMC 3575658. PMID  23430395 . 
  9. ^ abcd Verde I, Pahlke G, Salanova M, Zhang G, Wang S, Coletti D, et al. (апрель 2001 г.). «Миомегалин — это новый белок аппарата Гольджи/центросомы, который взаимодействует с циклической нуклеотидной фосфодиэстеразой». Журнал биологической химии . 276 (14): 11189– 98. doi : 10.1074/jbc.M006546200 . hdl : 11573/1681344 . PMID  11134006.
  10. ^ Dumas L, Kim YH, Karimpour-Fard A, Cox M, Hopkins J, Pollack JR, Sikela JM (сентябрь 2007 г.). «Изменение числа копий генов на протяжении 60 миллионов лет эволюции человека и приматов». Genome Research . 17 (9): 1266– 77. doi :10.1101/gr.6557307. PMC 1950895 . PMID  17666543. 
  11. ^ O'Bleness MS, Dickens CM, Dumas LJ, Kehrer-Sawatzki H, Wyckoff GJ, Sikela JM (сентябрь 2012 г.). «Эволюционная история и организация генома доменов белка DUF1220». G3 . 2 (9): 977– 86. doi :10.1534/g3.112.003061. PMC 3429928 . PMID  22973535. 
  12. ^ O'Bleness MS, Dickens CM, Dumas LJ, Kehrer-Sawatzki H, Wyckoff GJ, Sikela JM (сентябрь 2012 г.). «Эволюционная история и организация генома доменов белка DUF1220». G3 . 2 (9): 977– 86. doi :10.1534/g3.112.003061. PMC 3429928 . PMID  22973535. 
  13. ^ Sikela JM, van Roy F (2018). «Изменение имени домена NBPF/DUF1220 на домен Olduvai». F1000Research . 6 (2185): 2185. doi : 10.12688/f1000research.13586.1 . PMC 5773923. PMID  29399325 . 

Дальнейшее чтение

  • Soejima H, Kawamoto S, Akai J, Miyoshi O, Arai Y, Morohka T и др. (Май 2001 г.). «Выделение новых генов, специфичных для сердца, с использованием базы данных BodyMap». Genomics . 74 (1): 115– 20. doi :10.1006/geno.2001.6527. PMID  11374908.
  • Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J и др. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных регионах». Genome Research . 14 (9): 1711– 8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC  515316 . PMID  15342556.
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R и др. (январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Research . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560 .
  • Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF и др. (май 2006 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок при наследственных атаксиях и расстройствах дегенерации клеток Пуркинье у человека». Cell . 125 (4): 801– 14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569. S2CID  13709685.
  • Shimada H, Kuboshima M, Shiratori T, Nabeya Y, Takeuchi A, Takagi H и др. (январь 2007 г.). «Антитела к миомегалину в сыворотке у пациентов с плоскоклеточным раком пищевода». Международный журнал онкологии . 30 (1): 97– 103. doi : 10.3892/ijo.30.1.97 . PMID  17143517.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Миомегалин&oldid=1193283430"